SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002018_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesOtolemur garnettii (Bushbaby)
Transcript IDSPT00002018
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001924_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002018_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Bushbaby (Otolemur garnettii) # Full length # Forward
AAGAATGTAAAGCTGTCAGCTGAGGTAGAGCCATTTATTCCCCAGAAGAAGAATCCTGAT
ACGTTTATGATCCCTATGGCTCTCCCAAACGATAATGGAAGTGTTTCTGGTGTAGAACCA
ACTCCAATTCCCAGCTACCTGATTACTTGTTACCCATTCGTGCAGGAAAACCAGTCCAAT
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TTGGACCTGGAGTTTGCTTCCATTGTCAAGGAGGGGAGCCAGGAAAAGAGCAGGACTTAG
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GTTTTCTACAGAAGCCTGTCATAGTTGTGAATATTGGGTGGGACTCCTTTTGGCAGATCT
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ATGCAGGACCAACCTTTTGACTAAGTTGAAAGGAAGGAAGGAAGGAGGAAGGGAGGAAAG
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GGTAACTGTTTTTTATCTAAAAGGCTATTTTGCATTGGGCCCTTAATATCAAAGCTAATC
AGAATAAAAACCCTATTTCTAGTCAGCACTTTTGACTTGATTGAAGAGTGACTTCTTAGA
TGCATCTTAATGACTATATCAAAGAGTTTATGTTTCCCTGGATTCTGTTAGCCTAGCTGC
TTCAGTGAAGTCTCTGCTGCCTCCTGGCATAATTTTTATAAATTAAAATACAAACAAGTA
GCAGAGGTTGCTTTGAAAAAGCTTTTAGTCTTTGTTCTTGGAAACAGTCTGGGGCAGAGA
AATCCCTTTCGGAATTCTGAGAATGAAAAAAACAAGTATTGGAAATAAGATAACAGTATA
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AGGAAGTTAAAGAAAATTCAGAGTTCTATTGTGTGAATTGCTGTTGAGTGATGAATACTC
ATATTTTGAAAAGTGAAAGAAGGGATTAGCTTTTTACTATTTTCTTTTCAAACTCCAAAG
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TTACCACCCTTTTTAATTATCCTTTTAAATAAATTTACAATGCCTTATATGATATGATTA
TGTTTCTTTTAATTATTAAGAAAATAAAAAATTAACAAAAATGAATTAATATTTTATTAA
TCATAGCAGTGTTAATGGTTGTTTGAAAAATAGTTTGTAAATGTGTGTATAATACATTAT
TTAGGTAATTATGCTTGCTGCAGATAATTTCATGAAACCCTAATACAGAAATCCTATTGC
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TGATAATCGATCAAAAATTGTACTTCTTGTAGATGCTTCACAGCAAACCGGTAAGACAAG
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ATCTGTTGACTTACTGACTTTATAATTGTGATCTGTACAACTTTTCAGGATCCTGTATTT
TCGTCCTTTCATTTGTCCTGCCACTCTGTGAAATCCTCTAAGGATAAAATAATATGAGTC
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GGCCCGCCAAACAACAATGATGGCTGCAACCAAAAAATGGCCAGGCGTTGTGGCGGGCGC
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GGCTCAGTGGATAGGGTGCCAGCCCCGTATACTGAGGGTGGCAGGTTCCATCCTGGTCCC
GGACAGACTAAAACAAACAAACCAACAAACAAAAGTAGCCAGGCATTCTGGCGGGCACCT
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TTGCAGTGAGCTGTGACCCCACAGTACTCTACCGAGGGCAGTAAAGTGAGACTCTGTCTC
TAAAATAAAAATAAAATAAAATAAAATGACTTATACTTTTTTTCATTTGGGCTATGCCTT
TTCTTTGGGGGATCTCTTCATTTATCCTTTTACAGTTGATTAGATCCATTACGAGGAGAG
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TTATGAATTTGTTCATCACAAAGAGTTGTCACACTTTGCTTGCCTTTGTAGATTTCCCAT
CAGATATTGCTAATAAGTCTTTGTCAGAGACCACTGCCACAATGCTCTGGAAATCCAAAG
GCAGGAGGAGAAGAGCGTCCCATCCCACGGCGGAATCTTCTAGTGAGCAGGGGGCTAGTG
AAGCCGACATTGACAGCGATAGTGGTTACTGCAGTCCCAAACACAGCAACAACCAGCCTG
CAGCTGGGGCTTTGAGAAATCCTGATTCTGGGACCATAAATGTGTGTAACATTGCCTTGA
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CAGGTGGAATCATCTATGTGTACAGGTACTTATTTTCTATATTGCATTTTTGCCATATTT
CTTTGTTCATGTTAGGATTTTCCTTTTAAGCATGAGGTTTGCTGATACTGGAAAAAAGAA
AAATTAGAAATTTTCCAGTGATTCAAGTTAGTTTGCAAGTAGCTTTCCAATCAAATTGAG
AAATTGCTAGCTTGGAGGTATTCTACAAGATGACACCTGTTATTACTGGGAACTAGAATA
CCACTTAGAGTTTATACAATGATTTTTCAATATTACATTTATAGTGACTGGATTTCAATA
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GGGACTACAGGCACCTGCCACAATGCCCGGCTATTTTCAGAGATGATGTCTCGTCTTGCC
CAGGCTGGTCTTGAACCTGTGAGCTCAGGCGATCCACCTGCCTCGGCCTCTCAGAGTGCT
GGGATTATAGGCGTGAGCCACCGCACTGGCATAGGTGTGCTCTTTAATCCCATTTCTCTG
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TTTTTTGATCTTAAGGATTATGGTCTTGTCCATGTGTCTTTACTTGACTATAAATACTTT
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CAGCTTTCTGAAGGCCTTGAGAAACAAAATCTAACTGCAGTACAGAAGACTGGGCTTTTT
ATTGCCATGAGCTTCCAATAGCTGTCTTCCTGCATTGGTTAACTAGGCTGGCTGTGAAAT
CAGGGAGTTGTTTATTTGTCATCACTTTTCTTTTTCATTTTTTACGTAGCCTTCCTGGAT
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CAGTGGTCACCTTTCTGATTCATACATGGAAGTTTCAACTTGTTAGCTTATGGCTGTTGC
TGGGAGGCCTCATTTGTGTCTGTCTGTGTAGCACTCAGTTGACATCAGCTGTGGAGCTAG
GAAGAGAGCACTTTTCATGTGATTATCTATGATTTTAAAAGTAGGTTAAATGAGTCTCAC
AGCCTTAATTGTATGTAATAGGCTTTCAGGGACCTTATTCCTTTCCATGTAACAATTTTT
TGGTGGTTTCAAGAATTTAGAAGAGGTTGAATTTCACTGAAAGATGAGAAAAGTGAGTGT
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GATGAGTGCATCCATGTTGAATAGTGTGAAGAAATGCTGGTCAGATTTGATGCAGGCAAG
TCTAGATGTGTTTCTGGCAGTGTAACTAGTGATGAACCTGGATTTACCAGTGTGGTCCAG
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CGGCCCTAAGAAAGTGGTGGCAACTTTCTTTTCCAAAAGTGGTCATGTGGCAGCTGTTCT
TCTGGTGGAACAAAGGATCATTATTGTTCAGTGATACACAATAGTATGCCTGCCAAAAGT
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TGACAGTGTGTTCACCCGCTCAGCCAACATCACTGTTCCCTTCTCGCGGTCCACAGAGGT
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CCCTGCAGAAGATTACATGTGCAGAAGAAAGTTCTCCAGCCTGAAGAAGATGTTCATGCA
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TTTACAAGAATGTAGAAGTGCATAGAATGTTGTGGAGATTATTTTGAGAAAATATAGTAA
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TGAGCTATGGGGTGCCGAGCCTGTCTTTTTTTTCTAAAATGGCTTCTGGGTTTTAAATCA
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AATATGTTTATGGTCTTATTTTTTTACATTTAATTCTTTTATTACATTTGGAGTTTTTCT
TGGTGTATGGTATGAGATATGTGTCCTCTTTTTTTTTAATTTTTCAAATCTTTCTACACC
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ACTAATTAACCCTCCTCCACTCATCCTTCCCCCTCCTGTCCCCTCCCTCTCCCCTTTCTC
CTTCTTGGGCTATAATTGAGTTATAGCTTATGAAAGCTATAAGTTGGTTTCATAGTAGGG
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CTTCTTCCATGACTTAGCAATTATGAATTAGGCTGCAAAAAATGTTCTGGTACAAATACC
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ATATTAGTTTGCATTCCCACCAGCAGTGCGGAAGTGTTCCCTTTTCTCCACATCCACACC
AGCATCTCTGGTTTTGGGATTTTGTGATGTGGGCTATTCTTACCAGAGTTAGGTGATATC
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TGCTTGCTTTACTTACTGTGTTCTTGGCTGTGCAGAAGCTTTTTAGTTTGATCAGGTCCC
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GAGGTTATTGGAATACTTGCATATTTGGTTCACATGAACTTTGTTGGGACCATTACTTTG
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TGGCATCACAGCTTACAGTAACCTCAAACTCTTGGACTTAAGTGATTCTCTTGCCTAAGC
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TCTCATTGTTGTTTAGCTGGCCAGCCTTGGTGTATGTGGCTGACGGTGTAACCCCTGTGC
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TTTTTATGTGCATATGTTTGATTTCAGAATCCAAGCACCTTCTCTCTAGGTTTAGTTCGT
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ACCTCCCAAAGGCCCCATCTCCAAATACTATCTCACAGTGGGTTAGGATTTCAACATGTG
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GGAATTCGGTTTCATTGTTTTTTTAAAAATAAACTATAGGCATCAAGAGACTTATATTAA
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CCTTATCTCCTAGGATCCACTAATCTATTCTGCCTTTCTATAACTTTGTCATTAAGAATG
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TGGTTCTCTTGAGATCATCCAGGTTGTTGGGTTTATCAGTACTGTAGTTTGTTCCTTTTT
GTGGTTGACTGCTGACCTCCGTGCTGTAATATGAACATACTACAGTCAATTTAACTCTTC
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TAAATGTTCTTGTACAGGGAGAAATAAGGAACATGCATAAATTATTTCATTTTCATATTT
TCCTTATACGTAGTAATTTTTGTCAGATGTTTTGACCTTTTAAAATAAATTATGTACTTT
GTGAAAATTTATTGAATTGTATACTTTTTTGTGTGCTTTTCTGCAAATACATTATACTTT
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TTCAGATGCCGAGGACACAGTACTTCCTCAGAAAGAAGACAGAATTTGCAAAAGAGACAA
GATAATAAGCATTTAAACCCTAGTCAATCCCATAGAAGTGACCCAAATTCTGAGTCTTTA
TATTTTGAGGTATTTTTTTCAAACTCTATTTGTAAACTGTTATAGCAAATACTGCCTTTA
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CTTGGTTATATATATTTAATCTAACAATCTTATTAATATTTATTTTTATAAATTTTTGCC
ATGTGAGCTCATCATTTTGAGGTAATGTGTAGAGGTAGAACTTGATTTCATGTCAACTTT
AGTATGAAACCTTTGTTTTTAATTTTTGTTGTTATTCAGTAAACAAAAATTAATTTGTGC
TGCCAGCCAGGAGGGTTTTGGAGAAGAAAAAAAAAATAACATAAAATAAAAATTATTTAT
GGGTGGAGCCTGTGGCTCAAGGAGTAGGGCACCAGTCCCCTATGCTGGAGGTGGCAGATT
CAAACCCAGCCCCAGCCAAAAAAATAAAAATTATTTGTGTGATTTAATAAAAATATTATT
CTCTTAAATCTGTTTTCTTGGAAATAAGATTTTTATTAAATAGTTTCATTACTCTTGTTT
TGTTTTGTTTTTTTTGGAGACAGGGTCTCAGTCACCCAGACTAGAATACTATGGCCTCAG
CCTAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGGTGGAAGTGAGCCTGCTGCTTCAGCCTCCTA
AGGAACTGGGACTACAGGCACCTTGCCTTCACACCTAGCTAATTTTTCTTTTTTAATTTT
TTTTTTTTAAGAAACAGAGTCTCATTTTGTTGCTCTTGGTAGAGTGCTGTGGCATCACAG
CTCACAGCAACCTCCAGCTCTTGGGCTTAGGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAG
CTGAGACCACAGGTGCCCACCACAATGCCTGGCTATTTTTTGTTGCAGTTTGGCTGGGAC
TGGGCTTAAACCTACCACCCTCAGTATATGGGGCTGGTGTCCTACTCACTGAGCCACGGG
TGCCACCCCCTAGCTAATTTTTCTATTTTTAATAGAGCTATGATCTTGCTCTTGCTCAGG
TCAAACTCCTGGCCTCAATCGATCCTCCTACTTGAGCCTCCCAAAGTACTAAGAACCACA
GCACCTTGACCTTCATTACTCTTAAGCTTTATAAAAAAGCTGTTTTGGGGGATGGGGGGA
GTTTACCTTTAAGTCTGTTTTACTTAAAATACCTGTTTCAGGAAGAAGATGGGTTTCAAG
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GTTGAAAAGAAATACTAAAAGTAAGGATAAAAACACATAGGCAGCATGGTAGATAAGGGG
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GTATTAAATCCACACTTGTACTATCAGACAAGAAAATACCATTAAATGACATACAACATA
GAGTCTGTACTTAAATTTCCCTAATTGTTGCCAAACTTTTACTTTGTAGGTATTTTATTT
CCATCAAGGATATAGGCAAGTGTAACTCACTGCATTAAGCTGTTTTATCCCTTTATTATT
TCTCAGTCTAAAATTATCCCACTTTCTTACACTGTTCTTTTATGATGTTGAATTTTTTAA
AGAGCCTAGTCCTGTTATAATGTAGAGCAGCCAACATTGTGGAACATTTTTCCTTATGGT
TAAATTTTAATGGGAACACTAATGAATTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGTTATCATAG
TTGGATGATTTACCCGAAAACTCACCAATCAATATAGTTCAGACTCCAATTCCCATTACC
ACCTCAGTACCTAAACGTGCAAAAAGTCAGAAGAAAAAAGCTTTAGCAGCAGCCCTTGCT
ACAGCTCAAGAATATTCAGAAATAAGTATGGAGCAAAAAAAATTACAGGTATATATTCAT
TTGTATGAACACATGATTGTTTATTTGTTAGATTGGGGGAGTGGATTGAAGGAGTGATAA
GTATGGTCATCTTACACTTTCATACTGTACTAAAAAATAAATGTTTTCCTATTCACTCAC
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GAGACATGTTAGCTGCTTTGGAAAAACAACAACAAGCAATGAAAGCACGGCAAATTACTA
ATACCAGACCTCTGTCATATACAGGTGATATCATTAGTCTGCATGATTTGCTATGTGGCT
TTGGTAATATATTTTAGATATTGTTAATCTAAATTTTTTAAGTTACATATATATTTTTTC
CAAGTTAGCTCAAACCTGAAGTTGTCCATATGCCTTCTCTTTCCATATCTAGTCCTTCAG
CCCACACTGTTGTCTCTTAAAAACATGTATGTTCATAATCTAATTACCAGATCCTCTCCT
TTCCTGACACTATAGTGGTCTCCTTGCTGCTACCTGCCTTTCTCTTTCTCTAACCCCCAG
TCTATGTTCAAATGAGCGATTTTTAAAAACTACAAGCTGGGTTAGATCACTGCACTGCTC
AGAACCCTCTAGTAGATCTTCATTTCTCTTGGAGTCAAGTCGAAGTCCTGACTAAGGAAT
GTTAGCTGACCCTGTTGCGTCTTTGTCGCCATCATCACCCTTCTCTCCTGACGCATTCTG
CTCTACCTGCATTGTCTGTCCTCAGACACACCCTGAGTGATCCTACTTAGTATCCTTGGG
CTTACTGTTCTTTCTTGGAATGTTCTTTTCCTGGGTATCAGTATAGTTTGTTCCCTCAGG
TTCTTCAGATTTCTGCTTCAGTGTTACTTGATAGGCTTTGAATCAACCAAATTTTTTTCT
TCTCCAGAGGTTGAAATGAAAATCACAAGTAATTTAACCCTCTTCACTGTTAAATTATCC
ATTATGATGATGGATAATTTTTGCAAACTAAATGGTAAACAAGAGTTTTGAGCAAATTAT
GTGTAAATGTACATGCACGTATGAGAAAGTAATCTGGCTTTTTATTGAAGCGGTAATTTC
TATATTTCTATTTTAGTAAATCTTGTCAAATTTAGAGCTCAGCTGTTCTTATATGCTCTC
TCATTTCTTTTCTTCATGCCTTTTTTTTTTAAAGCAGTTTTTGGCTGGGGGCTGGGTTTG
AACCTGCCACCTCCGGCATATGGGGCCGGCACCCTACTCCTCCCTACAGGCACTGCCCTT
TTTTTTTTTTTCTTTAAAGAGAATGAGGAATAGGACAAAGGAAAGGGAAAGGTACCAATA
AAAAGCACAGCTGTTAAGGCAGTAAATGAGCTAATACTCACTACTCATGAATGGGGCAAG
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