SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002117_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesPelodiscus sinensis (Softshell turtle)
Transcript IDSPT00002117
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002024_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002117_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Softshell turtle (Pelodiscus sinensis) # Full length # Reverse
GGTCAGTATTTCAGTAGTTGCATTCTTTTCTAATTCCAAGGCATAAGGGTTATACTCCTC
CTCAAGCTTTCTCTTCCAGATTTTGACTGTAAACAAAGAAGAGAATAAGGAAAATCACTT
TAATTTCTCCCAGGGTATCGTACAATTCTTCTTCTAAATTTAGTATTCATAGACAACCCT
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GTGGGGAAAAGAGCATCTAGACTGGCGCGATCCTCCAGAATAAAGCCCTTTTCCGGAGGA
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ATCGCGCCAGTCTAGATGCTCTTTTCCCCACGGATTTCCCTATTCTGACTTGCCTGCTTT
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TGTGCATATTTAGGACCTGTAACTATAAAAGGTGCTCATGATACAGCATTGGAAATTTGT
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GGGACTGCTCCAGGCACCTCCCCCTTCACCCTGTTAAATCACTTAACTGGTTAACTAAAT
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AGGAAAGGAAGAATCTTATGCAACTGAAGCTGCAGTAGCAAATTAAGAAACTATTTATCC
AGAGTTTAGCCAGACTGCTTGGACCAATTAGTCTTATAAGTGATGCCAGTGGATTTTTAA
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CCAGTCTTAGGCAAGCTCTTCTCTTCACATTGAGTGGATAAGATAATGCTCTGTTTTTCT
TTTTCACTTCCTCCTCCTTCAGCTGCCTCTTCCTCTAAAGCTGCTACCATATCTTTATAT
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GGGGGGGGGGGGGTGGGAGGGGAAGGAGACAGGCCAATGGTAAGAAAACATGAAACACTA
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GCTATTGGATATGCAGAAAAACTCTTGAGACAAAGATGGGCAGAGGAATTTTTATAGCAT
GTTGGAGGCCTTGGGGAGGGAGGGCGGTGGGAAGGTCAAGAATCCTTGGTTTAAACCATA
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GAGAAGGAGACTATTCAAAAAGTATAATTTATTCAATACAGTTATAATTAACAAGGCATT
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TTCAATTTTTTCAGCTTCAGGTGTTTCAAAACTTCTCTGAGCCCCATAACAAGTCTGCGT
TTTGTCTTGGCCTTCACTGGGTCTTTTTGATACAAGCGATCTTGGAAACGAACCAGTTCT
TTTAGAAGATCTGTCACACAACTGTCAACTTCTTTACTAAGTACCTGGCTACAGTAACTA
GAAGAAGGAATCAGTTGTTTAAGTGTTAAATATTCTGCAATTGCAAGCAGAATACTATAC
TCTCATATACATGTTTTGTATACTGGACAATAAAAAGTTATTCAGGTTTTCCAGTGGATT
ACAACGTATTTATTTCTTGATACTCCAGCTCCCTTATCAAGTTATGCTAAGACATGTACG
TCAAGACAAAAGATTGGTTTTGCTAATAAAAGTTTGTCAATGTATTTTCACTCATTAGAA
CCAAGAGGTAGCAAGCATATTTTAGTACTGGTAGTTGATTTGTATAGCAATCAGCTATAC
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TGTCCTTGTGATCTGTCTGTGGAGGGAGAACCACAGAAAGAGTAAGATTTACCTCATTCC
TCGTAGCACTGAGTGAAAATCAGTGTGGAAAGTTAAACTACATCTGCATTAGAGACTACA
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GGTAGATCTCAGGGGCTCTAAGAGTAGCTCTTGAGCCCTCTCTGAACTGCGCACCTGCGC
AGTACATTTACATTAGATGTCCTCATGTCCATCAAACTGTCCTCATGTAATGTAGGCGGG
GCTTCAAGGAAGGGGCAGGGCAGTAGATCTTCGCCTGTTCTGAGACTTAAAAAGTGATCT
TGGGTGTAAAAAGGTTGGAGACCACTGCTGTAAAGTCTCCCGCATGGTCACTCTATGAAG
TCAGGCAAAAGCTCTCCCATTGGCATAATTAAACTTCCCTCAACAATTCTCTCACCAACA
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GCACATTTTTTCCCAGAGTTATTTTGGGTCAAAGTCGGGGTGCGCATTATTGTTTAATTA
TTTTGGCAGTTCCGTGTCAGAAGACAACGAACCTCCGCTATGCCGATGCCACGCTAAGAT
GGCAGCAAACATGAAATCAACATCAACTGAAATGGTAGAGATTCCCAGAATGCTTTAAAA
TATTTAAAAACAAATAATATGAAATAGTTTATAGTTAATTAATTGCTGACATTTATGAAA
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GTGCACATTATATATAGGAGTATAGATTTTTCCATTATGATAAAAGTCAGGGTGCGCATT
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GCATCGTCCTTACAGCAGGAGGTTGTTATTTGAAATACTCCAGTCAATTTCCCTTTCTCC
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CTTTACTAGATCCGCTCTATCAAATGCCAGAAGATCCAATGCTGCAGCGCCAATCTTCCC
ACAAGCGAACACATGGCCTTTAGATACACCAAGATCTCACACTTTGCAAGTCAGAACTTT
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ACCTTATAGACTAACTGAAGTGTAGGAGCATAAGCTTTCGTGGGCCAAGACCCACTTTGT
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GCCTGCATATGTGGACCTGCCTCTGGAAATTTCCACTACATGCATCTGACAAAGTGGGTC
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CTCTCTTTCGGAAGTACTAGCTGTAGCCTAGATGCTCTTTTTCGAAAGAGGCTTGCAGTC
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AATGGACTTGTCCATTAAAACAATACAATGGAAATCCAAAACAATTGTAATCCAGCTGCA
GAAAAGAGAGTCCTTCAGACCCTGAATGCCAATCAGTAGACGACCTCTATGATTGAGCGG
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CTACAATGGATATCTGACTTGTTATTCAAATATAATAACCAAAATGTCTCTGTTAAAAAG
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TCTCTGCACCTCTATCATCCTGTCTGGCAGCAGAAAAATGAAGGACATATTCTAACCATA
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TCCTCCTCTTCTGGCAATCATGATTTGCCTTTGTAATCTGAACAACATGTTAGTACTATA
TTTGCTTCTTACTAAGATGTTGCTTATCAGGTGCCAAACTGCTGAATAGTTGAAAATAAG
AATTGAAAGTGTAAGTCAGTCAGAATTTCACAGAATGATACTGTTGTAACTTAACTCTCT
CAAGCAATGCTAGTGGTATCATAATATAAAGGAAGTGCCAATACTAAACAAACACTTACT
CTCTGAATTTCCTGCTATGAATTTTCGGAAGGCTGGAGTTGAGCTGTGTTAGAGTGGAGG
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CTACAGCAACTGAAGTTATGGGAACATCTTCCACGAGGTCTAAACAAAGTTGTATTTATT
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CCTAACACAGCACACTAATAGTATGGTTGGTAGCAGTGCTTTTTTTCTTTAAAAAAAAAA
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TGCCAGCATTATGGTTTTACAACAGGAAATGTAAACTTCACATCAATGATTAGCATAGGG
GTTTCCATTATGGGTTCATTTCCTGATGTTCAGCAATCACTTTGATCATTTTGACACTGA
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GTACTTGATATAACAACAGCCATTTGGTACACTCTGGCACCATTAACTGGAAGCAAGAAT
ATCACAATCAGGAATAACTTGACCTTTGCATAAGCATATGAAATAGCTGTAGCTATAGCT
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AACCTTGAACCATGAGTTTCTTGCTGCTGTTGTGACTACAAGTAGCTATGCTGATAACCA
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AGGACTTCTTACTCCGACTCTGGAACCCTCATTTCACGAGTAAAGGAAGTTGGAGGAAGA
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GAAAAATAGCTGTTAAAACAGCTAAATAATCTCAATCTTCATTATAATAAATAAAAAAGC
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AAAAATTGAAGTACAGGCAGTCCCCGGGTTACGTACAAGATCGGGACTGTAGGTTTGTTC
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CTGTTCTAACAGGTGCTGTTTTCGCTGCTCTCTCTCTTTCAAAATAATCTTAAAAATTGA
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ACATTAATTTCTCCATGTCACTCATGGTTTGAGTTTCATTGTAGGCATATCCCCTCACAC
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CTTACTGCCAGCAGCCCACAGCTCTACCAGCCCACAGAGCTCCTAGGCATCAGCGCTCCA
CTGGGACTCACTGGTCCAGGAACATCCGTAGTCATCCTGGACCAAGGATGTTGCCAGACA
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AAAAATCAAGGATCTCTAAAACTGAATTTGAGCAAGGCTGAAATCCAGATTAATAGATTT
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CTTTACCAAAGGTGCGCTGGAGTCCAATGGATTATGTGGTGTCTTCCCTTGATTCAATTG
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GGTAAGAGAGAGTTTTCATCACACACCTGTAACTCAAAGTTAACATCTGAACAAAATCTA
GGCAAGTTTAGGGTTTATCTATCATCAGTGTAAATCCCACAATTCCCTATCAAATAGAGA
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CTCAATCCTGGGAAATTTTAGGAAGTTCTACGAGACCTGCCATTTGGGATGTTATCCGCC
CCCCCCACCCTCTATAGTTTCTATGAGGGATGTAACATTTCAATTAATCAGCTAATAGAG
TAGTCGATGGAATTTCTATCAACTACTCAATTAGTCAATAAGGGATGAGAGCCAGCGCTC
GCTATCCCACCTGCGCCTCTGTCTTTTAAATGTAGTAAGAGCCGCCCGTGCTGCTTACTA
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CTCCCCTGCCGCCCCCCATGCCCAGCGGAGACAGTGCTGGGGGGGAATTGGCTTTTAAGC
CGGCTCCCCCCAGCACCAGCTCCTGCTCCCCTGCCTCTGATATAGAGGCAGCAAGGGGGA
GGTAATGGGGGGGAGAGAAGCAACTAGTCGCATCCCTAGTTTGTATCTTACCTTCAATTA
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TTTCAGGAACAGCACAGAAATCCTTTTACCTTAATATTTTGCCACATATTTTTCTGAAAA
CGTTGCAAGCCACTTTTTGTATCTTTCAGATGCCTCTACTTAGAAATTTTAAGGGATCAA
GCAAGTTACTCAGAGCTGATTAGCTCCTGTGCATTCAGATTACTTAAAACTGCTACAAGA
CAGCTTCTCTTCTCAAGCTAGACTTAAATGAGAACTCAGTTGAGAACACAGCCAAGGAAA
TTCCTCAATATAAACGCATATGTAGGTAGAGCTAAAGATTATATGTTGCTTCAAATTTAA
TAATATGCATAAAATCCTTAAGCTCCAATATGTCTGTAACTATGTGTACACCTGTGTATT
CATACCCTGGAGAAAAATAATTGAATTTACAATACTGAAAAATTTCTTACTGAGCCCTTG
CTAGTGCTCATGAAGACAACAGTATTTTCATTTTGGCTATTTATATATAGTTACATCATT
TCCACTATTAGCTTTTAAAAATCAAACATTTTACCTTCATACCTTAAATAAATCCAAGTG
TAATTGTCTTACCTACTAACAATTACCAGTTATAATAAAAATAAAAATACTGCTCAATGT
AACTACTCAAGAACAAATTAGTTGATGATTTAAAACAAACTAGGATGTAAGGCACAGCAT
TACAAGAGATTGCTATTTGCTGTTTCTAGGACAAATTAACACATTTAATAACCTCTACAG
TGTCAAACAACTCAGTAACTTAACATAATTAAGATATGATCTCCTTCCAATTCTCTTTAA
GACGACAGACGCCTTTATATAGAAACATCTTTATATATAAAACATCATTTTAAGTTTAAT
TACCATGACTGAGCAACTCTCTTGCTTTTCCTGTACTTTGCAAAAGAAGTAGAAAAGCAA
TAATGTAGATAAACATGATATTCATAACTATTAGAATTCTTTGACTTTTCCAATTTTTTT
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CCAGGCTCAAATTTTGGCTCAGTCTCAAGAGAATTATTGGGAGCACTTAAGACTCAAAAA
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CTCTCTTCCATGACAATTGCAGACACAAGTATTCCAATGTAATTACTACTACAGAAACAG
AAGCTATGAGTTCCCATAATAGAAGAACTAGAGGACATCAAATTAAATGAATGGGTAGCA
GGTTTAAAACTAATAAAAGAAAAGTTCTTATTCACACAGCGTGTAGTCAGCCTATGGAAC
TCCTTGCCAGAGGAGGCTGTGAAGGCTAGGACTATAACAGAGTTTAAAGAGAAGCTAGAT
AAGTTCATGGAGGTTAGGTCCATAAAAGGCTATTAGCCAGGGGATAGAAATGGTGTCCCT
GGCCTCTGTTTGTCAGAGGCTGGAAATGGATGGCATGAGACAAATTGCTTGATCACTATC
TTCGGTCCACCCCTTCTGAGGCACTTGGTGCTGGCCACTGTCGGCAGACAGGCTATTGGG
CTAGATGGACCTTTGGTCTGACCCAGTACGGCCATTCTTATGTTCTTATGTTATGAGTCA
AATGTTCTACCTCCTGCTTCATCATTCACCCTGTCCCCTTCCCTCCAAGCCACTCTTAAA
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AATTGTAGCTGCCCTTGGTTGAAGGAATAAGATGGAAAGATTTGAATCTATACCAGAGAG
TTTTATTCTCAAGTGTTTGAGGCGTTTCAATCAATATTCCAAAAAATTAAACTGATTGAA
ATTCCTCTTCACTTTCATTTGCTCAGGCTCCAATTTCGCCACTTGCAAAGGAAGACCAAA
CTGCTTTTATTTTAAAAACAAAACCAAAATGCCAAGCTGAAATACACTTTGGCCAAGTCT
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