SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002123_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein K (SelK)
SpeciesPelodiscus sinensis (Softshell turtle)
Transcript IDSPT00002123
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002030_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002123_2.0 # Transcript # Selenoprotein K (SelK) # Softshell turtle (Pelodiscus sinensis) # Full length # Forward
ATGGTTTACATTTCGAACGGTGAGGCGGCGGCGCGGGATGGAGAGAGAGAGAGAGACAGA
GACTCGAGGGGAGGGTGAAGGGATGGGAAGCCGGGAGAGTCCAAGGAGTTGGGCGGGGCG
GGGGGAAACTTCATCCTGTGTGCAGGGGGCTTCACCCTGGGCCAAAGCAGCGGTGATCGC
TTCTAGGGGAGCGGGACCCGCCCGCAGCCCTGCCCCTTTCCGTCACGTCGAAGCATGGGG
GAAGGGTCTGTACGGACCGGACTGCTGCCTGGCTAACCCTGGCTCGCACTGGAAGGGGCC
AGCAAAAGGTCAATTGGAACTATAACTGGAAGCCAGAAGCAACACAAGTAACTGCAGATT
TGGTGCTGTGCCCCTGGTGACTGGTTCCGAGGGGTCCAGGACCAGGGAGGTTCAACCTGT
AGCATTTTAGGTAAATGTATTTTGATAGCAAATAGTGGTTTTCTAAGTCAAAGTATTTCA
TATATGAAACACAGAAACAAAACTGTTCTTCATTGTTAATTTACCTTGTGTGCAGTGCAG
TTTTGAGGAAGGTGTTTCACCTTTGTATAAGTGAATCAGCTTTTGCTGTTTTATTTCTAC
AAAGGTGTAATGTGACTATAGGAAAAGAAACTTGTTAGTGGCAATATTTGTAAAATGTAG
TTTCTCCCTGATATTTGCCAATTCGCTGTTTGTGATATTTGCTGTTTCTAGTTTTAAATA
TTATTGGTAGCTGATACATTAATATGCCAATCAGCAATATGAATAAGTTCCATTGTATTG
TATGCAAAATGGAAAAATATGTATTTACTATATCCTATATGTTATAGGACAAGTGTTGGA
TACCCAAAGTCGGGCTCCTTGGAGTTTGTCATTTATAACAGATTTCTTCTGGGGAATAGC
AGATTTTGTGGTTTTATTGTAAGTATTCATGTAATGCTTAAATATTGTCAAGTTACCAAA
TGTAGCAACAATTTGTTTGCCGTGAGGAAACAAACACAAAAAGTATATATTTTACAAAGA
AGTATTGTAGTGTTGCTCCTTCGTTGTTGATGTCCACGGTAGTAGCCCAGGCACATTTTA
GGTCTTCTGTTCCATTTCATGCAGAAGATTGGCTGTCTTTTTTAAAAAAATCTGTCTGAA
TCTAAAAAGCTGGGGGAAAACTGGTTCTAAGTTGTTATAGCTGAATTTTAATATTTTGTA
GCACATATCAAATAAATAGTTATCATTCTAGTCATGCTTACTTCCTTCTAATTCTTAAGA
TAGCTAAAAAAGGGGTGACAAGTATCAGGGGGTAGCTGAGTTAGTCTGAATCTGCATAAA
CAACGAGAAGTCCTGTGGCACCTTATGGACTAATGGATTTATTGGAGCATGAGCTTTTGT
GGGCAAAGACCCACTTCATCAGATGCACCCTAAAAAAGGGTTGTATATTTTGGTGGACTT
TATTTCTAAGTACTCAGTCAAATATCCATATCAAGTAAGCCTGGGGCAGCAATGCCCCAG
TCAGTAGCTTCTAGCAAGTAGTTAGAAATAGAAGAATAAGAGGAGATTGGAAATTCAGAA
GTAACAAGTAACTTGAAAAATAGTATTATCCAAGTTTCAGAGGGGTGTTCATGTTAGTCT
GTTTCAGCAAAAACAATGAGGAGTCCAGTGGCACCTCAAAGGCTAACAAATGTATTTGGG
CACAGGCTTTCTTGGGCTGCAGCTTATACCCAAATACATGTTAGTATTATCCCAAGTATC
CTTTCTGGTGCTAACTGTATAGTGCTTCCATTATTGAACAACTGTTGCTTTTGCATCCAG
TGTTTTGACATATATTTCAGCATTTCTGGAAAACAGTTAATTTCTAGCATTCAACTCCTA
TCACTCTTGTTTCTTTTATTTTAGCTTCCAGAGCATCGTTCAGCCAAATTTGAGAAGGAG
AGGCTATACATCTTCCTCAAACTCAAGATATGATGATGGCAGAGGGTATTGCTTTTCTTC
AACTTCATATGTTTATATTTTTTAAATATGAGGAGAATGTTTTAGCATAAACTGATTAGA
GTTGTAATGTTTTACTTTAAAAAACAAATTGAGAAGTCATACCAAGAAATTTAAGACATG
TAAGTTTCTATAATACAGGACCCTCACTCTCTTAATCTGTTGCATAGCCTAAAATGAAAG
AATACAAATCCTAATTCATATTTAAAAGCATTTTCCAAGTGTACGTAATGGAAGGTATAC
TACATTTTTCTTGATTTTATTTGGCTGAAATCTCGCTTATAATATCATGTATCAGACATT
TAGCTTACACGTAGATAACCTCTCACTACCAAGTGGAATGGAGGACCTGGGTGCCCACAA
ATATGAAGATAGAAACCTTCCTATATATGCCATTTTTTGGAGACTATGAAGAGTCTGGAT
CTGTAAGCAGTCTGTGTCTTGGGATCTCTTCATGGTCCTAGCCTATTATACATCACCTGG
TATCTGTTAATTTGAGGGCAACTTTACTTCTGAGGGGAAGGAGTAATTTGGAGCAGTCTT
CACCAGGGCATTCTTGTAGAGCTTTTTCTTGTCAAAAATTTCCTCCTACAGCTTTTCACA
TGGAAGGGGTCAATTTGGCTTTGTTTTTATCAGCCAGACATCTACAGGACAAAAAAAAGG
GGCAAGCTATTATAATGGAGAGCTTAGGAACAACATATTTGAACCAGATGAAGACCATTG
CCAGAGTTGCATAGTGATGGACAATATTTACTGCTGTTTTCCCCCACTCTCTCGAACTAG
GCCTCCAGGAAATCCTCGCCGTAGAATGGGTCGGATAAATCACGGTGGTGGTCCCAGTCC
ACCACCCATGGCTGGAGGAGGATGAGGAAGGTAACTTAAAATTTGTTACATCACACTTAG
AACTTACTTCTAAAGCAATGGAAGTATTTTAAGAATTAAACTTACAGGTAGAATTCATAA
TGATAGAAGAATAGTGGGCAATTTTACTCTGCTTTTGCAAGGATTATCAAAAATAAACGA
GAGAACTTAAGGGAATCAGAAAATTACATGATAGCATGAAAAGGAGATCATGCGCATTTC
ATCTGTATCCATTTGGACAAGTGACTAGTTCACGTCACGACCACAACATTTACCATGGAT
TGCAAACTTTATAGGCTGTCTCAGCAAAGGGATAGAAGATGTAGTGATGAGAGGAGAGTT
TAGTCTCTGTTGCCCAATTGAAGTTGTATGACCATATCAGGGATGAAACACATTAGTGTG
GCATTTAGGGAAGTTTCCCACTCCTGCTGTCTGTACAATACCTATTCTGTCAAACCTCTG
GCTTTTAGTGGTTTTAGAAAGGAGTATGTAAACTTAATTTAATTTCCAGCTAAAATGTTT
TTAACAGTTTGGGTGGCCACATTGCTTAAAAGATGTTCTGACTATGGATGTGAATGATTA
GAACTGTCTGATAAGCAAATGCTTATCGGATAGTTGACACGCTAATTTGCTAGTTGCTCC
CCCCCCTTGCTGCCTCTGTCAGAAAGCAGCAGCAAGTAGGGGAAAAGCGTAGAGGGTGCT
TCAAAGCAGCCATGCCACATAGAGCCTGGGTCCAGACCCCAGGCTCCATGTGGTGCTGCT
GCTTTGAAATGCCACATGCAGCCCGGGGGCAGCAGGGCTTCCCCCATCAATCCTAGGCTC
CATGCAGTGCTGCCGCTTTGAAACGCTGCTGGGAGCATGGGGCCAGCAGGGGACTCACCC
TGTGCTCCCCGCAGTGCTTTTGCCTTTGCCTTTGAAGTGGGCTGCTGCTACGCTGCAGAG
GCACCCTTATCAACTAATCGAATAGTTGATGCAAACTGCATCAACTATTCAATTAGCCAA
ATAATTGAAATTTTACATCCCTAATTTTGACTGGGTAGTTAAAACTCTTTTCTTTAATGT
GAATAAAAACCCTGCATTGTCTCTGTATCTTGTAATGTTTTTATTACAATTACATTGCCA
TATAAGTTTGTACAACATAGTTATAATATAGCTTAACAAAATAGTTAGAAGTAGTAATTT
AAAGGCTTAATATAATTTTATTCCAAACCTGTTGTATGATCCTATAGCTAAAAATGGCAC
CTTTATTCAGTATGACATTTACAAACATTTGTGAATCAAATTAATCTTGCTGCTGTTTTT
CAAATCTAATCCTGTATCTATACATTTATATTATGGTATTTTAAAATAATTGGACAATGA
AACTTCTCCAGAATTAAAATATTACTTTTTTTTAAAGACATTTAAAAAACCATGGTAGAA
TTTGTAAGAGTAAAGAACTTTTAGTGCTGTTTTTATCTGAGGATTACTATATATCTGAAC
GTAGTAAATAGAAGACTTTCAACAGTAATCAAATTTAAAGAATGAGAATTTTCTTTTCCT
TTTATCATATATAAAAATTTTGAATGGCTTTTTGCTAATTTATGTTGAATTTATGAATGA
CCAATTTTAAAACATGAACATCCTTTTAATTGGTTCTAAAAACAGTAAATGTTTGTCTTA
AAACTGCATTTTCCTTTTTTTTTTTTTTAGACCCTTTAGTACAGGGGTGTCCTTTAGTAC
ATAGACAAAACTAAATAAACTTTTTTTCATTTCATTTTGTTACTATTTTGGGATTTCTTT
CTGCTTCAACAAGAGGAGAAGTGAACAACAGTTCTTTTGTATCGCAGCATAATGAAGTAT
ATTAAATGTATAAGATGTAGATAACTTGAATATTTTTGGCATAACTCAAAAATGGTGGCT
ATATTTTAAAAGGATCTATGCAACACTAATTTAGTCTGTATTTCTATGAATTGCTATTTT
CTTTCTTTAAAATGGCTGTTTTATGTAGTATAAATGCAAAAACTTATTTTTATCATTTAT
TTGTAGGTAAATGCCTGCTTCTTATGGCAGGCAACTGGACTTACACATTTGCATGACTGA
AGGGAATAAGCATTAGATGGTGGACCAAATGAGTTTGAATACTGTGAATGTGTATGTCTA
ATGGAAACTGCTCTGCAATTAAGCAGATAATGAAGTTGTGCTGGGAATTCCTTCTTCCAG
GATCCAGTGTAACTGAAGTGCAGTGTTATTAAATGCA
Chart Advanced