SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002137_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U1 (SelU1)
SpeciesPelodiscus sinensis (Softshell turtle)
Transcript IDSPT00002137
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002044_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002137_2.0 # Transcript # Selenoprotein U1 (SelU1) # Softshell turtle (Pelodiscus sinensis) # Full length # Reverse
TTTTTCGGCATCTGCAGCCTGTGGTTTTATCTTCTCAGCAGCTTCGAGGACTGACTGAAG
GCTCACTTTGTCTCCAAATTCTCTCTCTCGATGTTCCAAGAGAACACCCTAGGGAGAGGA
AAAGGAAAAATGTGCAGTGATTCCTTTTTTATATGGCATACATATTTAAATAGAACACAA
CATTTACAAACTCAAAAATGTTGCTTTTCACTTTCAATCTGAATGAGAAAGAAGGGGGAG
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CGTGCAGCGCCTGATTGCAGCTCTAAGGGGCGCTGTGAGGCTGGGCACGTGGTGCCCCTT
AGAGCTGCCATCAGGAGCCCCCCATAGGTTGGTGCCCTGGGCAGCTGCCCGGCAACCCAC
CCCCCCCTTAATCTGGCCCTGTCCAACAAATACATGAGTTTTCCCATTATTACTTACGTT
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CCTGCTCAAGGCCCCAGAAGTATCGTTAGGTTCTAAGCTGCTTGGTTAAATGAGGAAATT
AGAAGTTCCATACTGCCTGCAGACTGTATATATACATTTCTTGTGTACTTAAGTAAATTA
TTTATACCACCACAGCACCCAGTCTTTAGCATTTTCAAAACGGATGCCTCTCCCCCCCAC
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TCAGTTACCAAAGACTCAATTTCAAAAAGGTAACTCATGATTTTTTGGGTGCCCAACTTG
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AGTCCGAGGTTTTTGCCTTTTAAAAATCACAATTTATGAAATTTGCTACATATTTTTCTC
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GGAAGCTAGATCCAGACCAAGCCCATCTTTTAGGTACACTGAACTATAGTGTTTTTTAAA
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AATGAAATCTTTAAGAACATGAACAGATAGCAACGTTATTTAGGACAGAGTTTTCTCACA
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ATTTTTAAGTTAAAAATGAAAAGTCGGTACTAGGTGCACATCCACGAGCTGAGCAGAAAT
GTATGCGAACCATCAAATGTGATTTTTTAAGACAATGGGAGCTCATCAATGGAGAGCAGC
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CATTTGGATCTATAGGACCGAATGATGCCTTTAGTACAGTAATTCCTCATTTAACACTAT
AGATGCGTTTCTGAAAATGTTCGTGCTAAGTGGGGTCAATTTTCCCATTAAAAATAATGG
AAAAGGTGGGGGTTGCATTTCTGGTGTTGGTGGCAAAGTCAATTTTTTGTTGGTGCTGGG
TCATCAACGACAACATTAGATATGTAGCAACACAGGATAACTATCAACACAAGTTGCTGC
GGTTTGTTAAAACACAAAGATAAACATGTGAATGAGCAAAGGAGCACGGTGACCACGTGT
ATTCATCCACTCGTGTGTATTATCACTGTTTTCACCAACTTATACCATCACATGAAGTAG
TCTGCCATTTGATTATTTTCGTGTTATTTCGGGGACAGTCGTGTTATTCGAAAAACATTC
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GTTTTGAACTACTGGACAGAACTCCTGCTAGAATAGCTTGGCTTTTTTCATCCACTGGAG
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TTACGAGCTGCAGCAAGGCAAAAACTGGTTTGGACAGGGGGGAGTCCCCCCCCCTCACCG
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GTATAGAGGCGAGAGGCAAAGGCAGCGTCTAATTACAGATCTCGCGTTGTCAGGCCACAG
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TATTCCCTTTTCATGCCTCCACAGTCCCAAAACAATAAAAGACAAATAAAAGAATCATAT
ATCACAATTTCTAAACTCACCTCAGGATTCTGAGGTTGTGACACATGGTTTCTGACCTTT
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CATTTCTTGTTCTCTGTATTAGCTGCAGCGCAGCTAATGAACTTATCACACCCTTCTATT
TTATTTTTAGTCCTTTGTTTTAGTACCAGGATGATTAAACAGACAGTGCAAGACAAGATC
TTACAGTCTGTTTAGGTGTGTAGGGGAAAAGAATCATGCAAGAACATGTCAACAGTACAC
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AGCCACACTGTTCAGATTGCTTGAACAGGTTTGGTGGATACAGAGGCTGACTCAAGCCAA
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GAAATATTTCCCCTTTGAAATAATGCTGAAAATCCTCCACTTCATTCCCAATATTTTCTT
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TTGGCCCAGCAGGACAGGTGGGGAGAAACCCCAGAAAGCAGGAAGGCGAGTGGCAGTGGC
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ATTCATGTGCCTTTTGCATGCTGCAGGTCAGAGGGTGCAATGCAGCTCTTATTACACAAG
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GGACACCAAGACAACAGGACACCACCAGAACTTTGCAAGCCCATGGTCTGCGGAAGCCTC
TCACCATGGCTAGTCTAAGTTATTCCTCCCCAGTGCCTCCTGGGGCTCTAAATCGAGATA
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TGTGCTATTTCGAAACAAGCTATTTTGGAATAACTATTTCCGGAATAGCTTATTTCTAAA
TTGATGTGCAGTGTAGATGTAGCCTGAATGTCATGGGGCTGCTTTATCCTTATTTATGTC
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CCCGGCAGCCGGGATTTTTTTGTTGACAGCATCCAGCCAGCCAAGCCACTTGCTCCAGCC
TGCGGCAGCTCTGCCACTCCCCCGCCCCCAGACCAATCAAGACCCGGGCATGGGGAACGC
GCCAAGTCTCCTCCCCCACCAGGGGCACGTGGCGGCTAGAGTCGCCCTGGCAGGACGGGA
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TGCCCGAGGCCCCACCCCTTCTGCCTGAGGTCCACGACCACTTCCAAAATTTGTGACGTG
GCCCCCTTCAAGACAAGTCAGTCCACCTACAGTTCCCTCCCTGGTCAGCTTACGGGGCTC
TGCAGCAGCCATACTCCACCCCTTATTCAGGGCACAGGGAACATTTGTAACATAGTCTAT
GGTCTTTTTGCCCACTTCCATTACTAGATAGCCATTAGCCAAACCAATAGTTGACCAGTG
TTTTCTCTTCCATGTCCATCTCAAAGGTAAGTCCCTCCCCACTGCCCCGTCAGAACCATA
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TCTGGAGAGGAGACCCATAGTGTCAATCCATGCTGTTGCCATCTGATGGCACACATCTTG
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GCACACCACCACCATGTCTGCTTAGGCTGGCAGGCTCAGCAGAGAGGCAAAAGTTAACTA
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TTTGAAAATAGACCCCCCCGCAGGTGACACAGAATCGTTGCCCTAGTGGTGGCTCCCCCC
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GCTCTGTCCAGGAGAATTAAATTCACAGAGGTGTACGATGTAGGGCTGTCAATTAACGCA
TCTTAACACCTGCGATTAACGCAGAGCAGAAATGAATGTGTTAATTTTTTTAACGCACGT
TGATCGGAGGCGTTTCTGCAGCGCTGCCCCTTTGAAACGCTGTGGCGGCATTTCAAAGGG
GCAGTGCAACGCAGAGCCCAGGGACAGTTAGAGTCTTAATTTCGTTTAACAGCGCAATTA
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GCAGGGATTATGAAGATCCTATAATTAAGTGGTTGCTAGCCTAATTGCTCTGTTTTATTA
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TAGAGTACTGAGCAGATTGTCTATGTGGGAACAGCAGGCTCTTCCTTCCTCCCTTTGAAA
GAATGATTTTCATGTCCAGAAAATGAAACACCTACTGGAGCAAATTGGTGATAACGTGTT
TGTCTCCTGCCAATGCTACTGCGTCAATGGACTGTACCTGAAAAATTCATGCTAATCCAT
GTATGTGCTTCTCTTGACCACAGTGTACCTACCCATCCAAGTTTATTTTGGATTTGTGGA
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ATTTACACCAGCTGGCAATCTAGCCCATGATATCGACAAGGGGGGACACAGATAAAGCAA
CGTTCATTTTCCAATCACAGTACCTCTCTGCACAAAAAGCATCCTGGTCTCCGCACAGCC
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TGGATTTCACATATGAACAGAATTAAATTGCGTATCACCTTGGGGGAAGGTTTTTAATTT
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TAAAAGTTGTGTGTGTATTAGGCAGAAAAATTATCTAGCTGCCAAGACGAATGATCTTCA
GCAAGTAGAGAAGTCTGCAAAAGGCAACACAGAACCACAAAACTATATTGGAGGCCACAT
GGCTTACTGGAGAGAGCCCTGGATGGGATTCAGGAGACCTGGTTCTATTCCCAGCTCTGC
CAGCCAGTTGAATGCGGGCAAGTCACTTCACCTCTCTGTGCCTCAATTTCTCTCTCTGTA
AAATGGAGGTAATAATACTGGCCTCTTTTGTAAAGAGCTTTGAGATCTATGTATGAAAAG
TGCTAAATAAGAACTGGGTATCATCATTCATCTGGCAGCCATTCACTTGACACCACAATT
CTCAAAATTATACGCAACTTATTTTTTCAGTGAAGTTTCTCACTTTAACCCCATCTTCCC
CTTCTCAAAAAGTGTCAGCTACTTCCCCCAACAGTTACAGAAGCAGGAAAAAACAAGAGT
AGAGTGGTTTGGTTCCCTTGTTGAACTTATAGCCTAGAACAACTCACTCTTACAAACACA
CTCTCCTTGTATCTTGGTTTTCAACCCTGGCCTTAAACAGTAAGATTAGCTCTACACGAT
AAATTTCATTGCTGTATAATGTGAGCTCGGATTTCTAGAGGAATCCAATTCTTACCTTCT
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AGAAACAAGTCAGTGTTAGCAAGAAGCATCCCCGTCACAGCTACGCCAATAGCTCCAAGG
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