SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002154_2.0
Identity
TranscriptGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesPetromyzon marinus (Lamprey)
Transcript IDSPT00002154
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002061_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002154_2.0 # Transcript # Glutathione peroxidase (GPx) # Lamprey (Petromyzon marinus) # Full length # Forward
CGCACGGAGACGATGGCGGTAGCAGCGTCGCAGGTTGCCGGCATGAAGTCGTTCTACGAG
CTGTCGGCTAAGACGCTGGGCGGAGAGCTGGTCAGCTTCTCGCGCTACCGCGGCAAGGTG
GTGCTCATCGAGAACGTGGCGTCCCTCTGAGGCACGACCACCAGGGACTTCACCCAGCTA
AACGAGCTGCAGGGCCGCTACGGCGCCCAGGGGCTCGCGGTGCTCGGCTTCCCCTGCAAC
CAGTTCGGCCACCAGGTATGCGTTGGCTCCACAGCGGCGGCGCTTGCTCTGTCCACTGCT
GGATGACGGCCTCCCCGCTCCGTCCGGGGCTTTGCAGGGAGGTGTTTGACGAAACTTTAC
GCGGATCGGTGAAGCGGTGGCCCTGGGCCGCTTCAATGAACACTCGCCACTGATGTTAGC
CGGACACGGCGCATCCGCGTCCACATCGATACGGAGACGTGTTATTGTTTTTGTATCTGA
CCAGATATTTGCCGATGATTAAATCGGCGGGAATGCGCCCGGTTTTATCTGGACAGGGCA
GCCGTTGTGCCATGACTCTCATCGGACTTGTCTGTTACACGTGACGCTGTAGCCTGGGTC
TTGGACTCCCACCCACCTTGTCTACATTAACTTGAGCCAAGCAAAGTTGAGCAGCGATTG
CGTTTTAATGGGTGACCACCACCTTGCTATGTGCTATTGTACAGCACTGGCTTGAGACTG
AATATACATGGCTGCCCAGAATAGGCTGCACCCTTTCCGGCAAGAAAGCAGGAGGTTTTA
AGATGTTGTTTAAACACAAAATAAACACCCACCGCAAGACATCATCTTGATACTGGCAAG
TGTCCCGTAGATATGACCACCTACTGTTCCAAAGAGATGTCACCATAAACGTAATGTTTA
CTTGTTACATTATGTGAACTTAGTTGTGATCACCTGCTCTCCAAATAGACGTTTTGCAAA
TCTCCTCCGTAGCACTTTTTAAAATGTTTAAGTACTGTACATTGCTATTTTAACACGGAG
TATAATTGTATCTTGTGTAAATTTAATGGCAGTGAATCTTGCACAAGTCATTAAACACTT
CACTGCATTTCACTGCAGCACTATTAATGGCAGTGATTATCGCAGAAAACGAAGTTCTAT
AACACCTCACGTCACTGTAGCACTGTATATAACTGACCTTAAATTTGTTAAAATTCACTG
CTCTGATACTTTATTCTCGTCTGCTTTCGGTTGCTGGGGTTGAAATAAATTGGAAGTCGA
TACAATATCTGGAAAATCACCGAGAAATGTCTATTTTACCATAATGTAGAAGCATAAATT
AAACTTACCTTTTGTCTTGTGCTGAAGAAATGAATAAAGACACCAAATCTATTTTGTTGC
TGCATATAATTATTAGATTAACTTTCAATAAAGAAACGTCAAACTTAAAGCGAATTTGCG
AAAAAAAATATTTCCGCTCGACCTGCGTGAGTAAAAATCCACCCGCTAATGAATATTAAT
GAGGGGGGGGGTGCAGCATGTGGAGTGACGTCACTTGCGGGACACAGACATTGACTCGTA
ATAAATCAGGATTTATTTTACTGCAGGCATCTGATGAGTCCTTGCTAGAATAGTTCTTGG
CGGTTAAATTGTATTGTTCATACCAGTGAAGTATTTTCCTTTGCATATTATTGAATACTT
TTATTTGCATGCATTTACACAGTGGAAAGGCAAGTGTAACGCATGTTAAATACACCTTTG
GATAGAGTCAATGTTACCCAATGTCATTGCATTCCAGGTTGAACAAAGGTGTGGTTTATT
GACCACATAGGAGTAGCCTGGTACATTGCTAGAAATGCATAGTTGTGGTTTTACTCCTCA
GACCGCTGTCATTCGTGATGAACTTTGGAATGCCTTTTTGGTTCAAAGGCATATCTTCGG
CTCGTCTATTAATCATTAAACTCCTATGGTGGAGTTTGACAAGCCTTGGTTGTTCTTAAG
ACGTTTATTGAAATATTGGAGATAGGAGTAGAAGACCTGGTAAAAGGCCATTGGGACGAG
CCCCCTCTTTGTTAGAGTAGCCTTAGGTAAATTGTCTGAATTTTTAATTCCAACTCCGAT
TTAGCACAATTGGCTACGAAAGAGGTTATACATACAAACTTTTTTTATGTTCCGTTAATC
TTTTTCGTTAACGAGGTTTTGTACACTACAAGTACAGAGCAATAAAGCACAAGGCAATAT
AGAATGACTAACAGACTTAAAAGATAACCTGTTACAGCTGGATAATATATTTATTATTCT
TAAAATAATAAACCTTTAGGTTGAGGGTAAATGTCACTTCAAGGTATGAGTTTAAAGCCG
TTTAGCATCTATTACGATGTTGCTCTGCAAAAAAACCAGACACCATGCCTTACCAGGGAG
AGGTAGCTCCCAATGAAAGGAGTCATTCATTCATATCCGTATTTATTGGAATTTACAACT
TGTGTTTAAAACCTGCTTAAAGTTTTAGCCAGTTGATTTTTCCTCAGGTTGTTTATAGTA
AGTGTGCAATTAATAAACATGATGAAATATAATATCTTGAAGGCAATGTGCATCAAGGCA
GTCGTATTGTTGGTCCATCCCCTTGCTGTAATTGATGGTCGTTTTGGTAGACTTTCCACG
TTGTTGCGGTGAAACCAGCCTCGCCCACTCCCCCCATTGTATTTCAGAGGCCTCTGGGAA
CATACAAAATATATTATTAAATGCAAGTTCATAGGAGGTGAATACACATCGTAGGGGCTA
AAACACCTCTGTTGTTGCTAACCAGTACAGCAGTGTTATTGTATTGCCATTTACAGTGTT
GCATTATAATTCGTTTGGTTCTGTTGACCTAAAACCATCACATAATAATAGGTTTTTTAC
CCTTTTATCTGGCAACAAAACTGACACCTTTTTACTAGGGATCATGTTTGCATTAACCAC
AATACCTGCGGTCAAAATGCAAACAAAAAACAGCACTCTGATAATGTATGTGGCATTGTC
CTTGAAATTGATTGGTCCACACCAGAGGCAGCTTTTGTGAGAGCCCAGTCTCACGTCGGT
GTTAGACCAAAAGGCGCACAACTCAAAGACAACGCACCTTCAGAGTATTGAGAGCTCGGG
GTAAGCATTTACATCATGAGATCTCCTTTGCCAGTAGCAAAAAGGTGTCAGTTTTGTTTC
CAGATAAAAGGGTAAAAACCTTTTATATTTTGCTACTGGCAAAGGAGGTCTCATGATCTA
AAACCATCACGTTAATACTATTACAGTTAAACAAATGCATGTGTGTATTCATGCTTTATT
TGTGAATGAGTGGTGACTTGGTATTTCTTGTGGTGTGCGATTGTGTGCGTGCTATAGGAG
AACTCCCAGAACGAGGAGATCCTGAACACCCTGAAGTATGTGCGCCCAGGCAGTGGCTAC
GAGCCCAACTTCACCATGTTTGCCAAGTGCGAGGTGAATGGCAAGGATACGCATCCAGTC
TTTGAGTTCCTCAAGGAGAAGCTTCCCCTGCCATCTGATGATCCCATCTCCTTCCTGCAA
GACCCCAAGCACATAATTTGGAGCCCGGTCTCACGCTCTGACATCGCGTGGAATTTTGAG
AAGTTCCTGGTCGGGCCTGATGGGCAGCCTTTCAAGCGCTACAGCAAGAAGTTTCAGACC
ATCAACATTGAGGAAGACCTCAAGTTTCTGCTGAAGCAAGTTAAATAGGTTGTGGCTAGG
TTTACCTTCATTTTGTACTAGTGGTGTAGGTATTTTCAAGCCACTGGCAGTGTATGCCCT
ACTGAAGATATTAGAAATGCCACTTTGTGAAAACTTCCTTCAAAATTTTAACGAGGGAAG
TTTGAGGTCCTGTAGCAGATCTAATGTCTCATGTTCTTGGCATACCTGGTCCATACAAGC
TTGTCTTCTATAAGTGCCTAGCAATAAATGTAATGCCATTGTCTGCATTCTATGTGTAAG
TTTGTTTTGTTATCTGTTGGTGTCTGGTTATACATTGTTGCAATTTTATATTGGGAAATA
TCTGGGCAAGATTTGGAAATAATTGTATTGTGAAGCAGATGTTGGCTCCCAACGATGTCC
CGTGCTTTGATGAAGGCTGACTTGCAACATACCCAGCTGCCACAACACATCCCTGAAAAA
AACCAAGTACCTGTGCACAGACGTGTTCCTTTACAATGCTCCAGTTTCCAATCTGCTCCC
CCACAGTAACACCCCCGTCTGTCAACGTGCTTATGAAGGTTTTGTTATTCGCCCACTATG
GAGGACAGGGTGTAGCACTTCCACAGTTTGGTGCCCATTTGGATCAGACAGTGGCATGGT
TAGCTTAGTAATTTTTGTTTCTTGATAGTCTAGCGAGTCATGTCCGGACCAGGCTATGAA
CTAGAAACATTCCAATTGGGGGAAATGGCTGGGTGTTCACACCATGAAGGAATGGCAGCC
AAACTCAAGAGCATCTCGACTGAGGAGACATTGATGAGATCGAATTGTGTGCAGGAGCTA
TGCGGATTGTTGCATTGCAGGATTGTGAAACTCAGCCAAGCAGTGAATTGAGTGGCTGAT
CTTCATACCAAACGAATAAAATAAAATAAATAATTGTACAACATTGCACAACTATACAAT
ATTTGGGCCTTTCAGGATTAATTTTCTGGATGGTACTTGTGAGACTAAGGGCTGTGCTAT
CTATTTCATTATGGGATGCTGCTCCTTCACAATAATACATCCTGCTCTCAGCCACCAGTG
TGATCAATACAGTACACTACAGTAAAATAACTGCACAAGACAACGCAGTGAAATACACCA
ACATGATATCCTGTGGTAATATTTACGTTCATATTAATCTTATCGGGCTTCAGGGTTTTG
TCTGAGAAGACTAGGCCCCTGGTATCTACAACTTCTCATGCTGTTACCATGACACCTTGC
TACAGTCTAAGGCAAGTACAGCTCTGTCAATCCACTGCTGAATGATCTCTCCGAGTTGTG
GAGAGATTGCAGACGTCGACCATACTTCACCCACGCTGATCATTGCAAATTGGTGAAGGT
GGGAAGTATAGATCAGAATATTTCTACTGAAGAAATCCGATGAGGTATACATCTCGTTTT
CACAGATGTCCACAGCACTGCTCAGATGATACAAGGTCATTAATGCAACACCAGGAACCA
TGTCACTAGACATTTTACCCAGCGTTAAGCATAGAAAACTAAAGCCGGATCCTTAACACG
TCTGAAATCCCCTCAAATAAAAATCTGCATCGAGTCCTTGTCCCAGAAAGTCGAGATTTG
TCACTGATCACTGACATTTCGTCTCGAGAGAAATCCAGAACGCCTTTATATCGAGAAGCA
CAATGGCGAAGGTGGGCAACATTGAACGCCGCTTCCTTTGCTGCTGGTTGCCACATAGGT
CAATGCTCCCTTTCTGCCCAATGCTTCCCACTGATCATTGCTGTCCAATGCTACAAGTGA
CCCTGTGATTTTTAACGCCAAGACCCAATAACACCAACAAAAGCATGGAATATGGGTATA
TAATAGAACCGATTTATGTCAGAATTGGTGGGTTGATAAACTAACGATGCGCATAGAGTT
CTCGGGGTGTGCGTGTTTCATCATTGCGGAGTTATGCAACGTGCAAAGTTCGTCAACATG
CATAAATGCGCGTACGCACTCAGAACCTGCTGCTTGGAAAGAAGTAATCATTGCAAGCAC
TTTCATGGCATATAGGAACTAATTCGAACATGTCTTTGTCCTTTACGTATAGTATTTAAT
TCACTTCATTATAATCAATGACCACGTTTTTTTTCTGAGCAATGTGAGATAAAATTTTGA
TTTAAATCTTTAGTGACTGCAGGGATTCATATTCTTGGTTCTTTCGATAAAGTCACGTAG
AAGGGAAACCATAAAATAATAAAAATATAAAACAATAAAATTCTCACGACGTTTCGACTG
CAGTACAAGCAATCGTCAGGTGTGAAAACCACAACAAAATTTGAAAAAGTGGCGGTTGTT
TTTAACGTTAGCACCACGGAGAGATTTGATAGTTTGTTCAGATGGACGAGTCCATCTATG
TTCGGAAAAGAGGAGGGGGGAGACAAAATAATGGATGCAGTCTGAAAGCCACCTTAAGCG
TGATCAATCAATTAAGACCCTAAATGGTTTATCAAATCCTTCCAATGATTGCTAAGCCAG
AATCCATCTCGGTTGAATTTGTCTCTGTATATGTGAGATTAGTTTTTTTTATTTCACTGG
GCACATCGGTAAACGTATTTTCATGGCCAAGATTAAATGGGTTTGGCACCAGTCATGTCT
CAGCAGCGGAGCGAGCAGCTCGCAATCTGAAAGTCCGAGTTCACATCCTGGTTGGGTGCT
ATGCCGGAGCCAGGATTTTCAGGAGTTAGTAAGCAAGGACTTGTGCCTTGCTTTTTATTC
GACGCGTGTGCGGCGATGGCGCAGCCATCGATCGAGGGTCGAATTCGAACCGTGTTGTGA
TCGGCATCGCGCTCGCTGGAGGTGAATGCCTTCAGGAAAGTCGTGTACTGTATATGCAAC
TGCGCACAATTCTGAGTCACTATTAACTGCTTTGCCGTTGCTTATTGCCAATTATGGACT
CAAACTATTGTCCTATCTCATATAGTCCCTGGCACGTAATAATATGCTTCGCAGTGGGGG
TCGCAAAATGCTGATTTATTACTAATAAATCCCAATTATCCTATCGAAATTAGGGATTTC
GATCGGATCATTGGGGGGGGGGGCACTTGCCGCCCCCCAGCCAGTGGTTGGGGGGGGGGT
AACTCAGCTCATCGTCCTTCCTATAGACCACAGTGACCCACTCCTGTCCAGTCTGCGCTC
CTTCAACAGAGGATGAGCAAAACTACACCAATTCTCGCTTGAAGCCCTCTTGTGGCGAGC
AGACCCCGACATTGTCTTTTAACTCCTGAACATATTGCCAGATGAAACAGCATCATTCTG
GGAACTCTGTTTGATAACATCAGTCGCATATTGTAAGTCAACGGTGGTTGTCTTATTCAG
ATATTTACACCACTTGGAACTGTAAACAAGAGATGATCGCCACCTCATTACTCATTTCAG
TTTCATTTATTTGGTATATCCCTGTGAGCCATTCCGCTCTTGAATCGGGTGCAACCGCAA
CAAACAAAAAACTAAAACATGAATAAGAAAACATCTTAAAGTCACTATGTGACCGTGCAA
ACAGAAAATCCAGGAAAAAACAGCAAAATATTCCTGTAAAAGCACCATACACCAACGCTG
TGTGCAAAAATCCCAGTGGGATGCAAGTTAACAACAACAACCACAAGACAACTTAGATTA
AGGCCATCAGTCTAACTCCGTACTACAACAAACAAACATGGCCAAACCAAAAAACGTTTT
CGAAATCACCAAAATAAAGCCTTAAAAGCTTTATTTTGGTGACAGTGATCATAGGAACTG
TGACCGAATTTTCACAATAAACGACATAAACAACATTTGAGCAGAAGGAAATCACTTTGG
CTTTATTTGATCTACATGTAACTTACCTGGTAAAATAAAAAGTTTTAGTTCAAAATTTTG
CTCTGGTGAATTCCATAGGAATTGTCCCTTTCCAACCGGAAATGGCCCATCCCTTCCACC
CCCAGTCCATCCCCAGCCCCCCCCCCGGGTCACGTGGCTCTGTGCCCGCCTATATAAGCG
CTCGATGCGACACCGCCCTCACTTCACACGGAGATGATGGCGGCAGCAGCAGCAGGTGCC
TTGAGGTCGTTCTACGAGCTGTCGGCCAAGACGCTGGGCGGCGAGCTGGTCAACTTCTCG
CGCTACCGCGGCAAGGTGGTGCTCATCGAGAACGTGGCGTCCCTCTGAGGCACGACCACC
AGGGACTTCACCCAGCTAAACGAGCTGCAGGGTCGCTACGGCGCCCAGGGGCTCGCGGTG
CTCGGCTTCCCCTGCAACCAGTTCGGCCACCAGGTATGCGTTGGCTCCACAGCGGCGGCG
CTTGCTCTGTCCACTGCTGGATGACGGCTTCCCCGCTCCGTCCGGGGCTTTGTAGGGAGA
TGTTTGACGAAACTTTACGTGGGTTTGGCGGATTGGTGAAGCGGTGGCCCTGGGCCGTTT
CAATGAACACTCGCCACTGATATTAGCCGGCACATAGCGAAGTAACACCACAGCCACAAG
ACACTCACTATTCGCCCCTCGCCTCACACGACTCGCCATGCATCACACCCAAACTTGCGG
CTTAAATTACCGCCTCAGGTTGCCCGTTGACCTCCCCGCTGGACTCTTTCCAATCCGCCT
GGCTAGGAACCAGTTTTACGGACAGACTACAGTACCTGGTATGTGTACATGAAGTGACTT
TGAATTAGGAAATGTAGAACATGCTCAATGAAAAGTATGGGGGAGTTGATGTACTTTATA
TTTTATGCGTTGTCATCCTTTCATTATGTTCTACTGAGTCTGAACACGGCTGTGATTCAT
TAACTAGAGTGGCCAACAGGTTCACTTGGAATGTTTAGACCATTGTGGTCCTGTCTTAAC
AGATACTGTACTCGTAATAACAGGCATTACTCATGATCCTGGGAATGTTGCTTTGTGTCA
AGCCATGTCTTTGGGCTTAAACCAAGAGCTTTTGATAATTCGTTGGTAAAACGTCTTTTA
ATGAA












Chart Advanced