SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002157_2.0
Identity
TranscriptSelenophosphate synthetase (SPS)
SpeciesPetromyzon marinus (Lamprey)
Transcript IDSPT00002157
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002064_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002157_2.0 # Transcript # Selenophosphate synthetase (SPS) # Lamprey (Petromyzon marinus) # Full length # Forward
ATGTCTGTGCACCGCTACTTCGACCCCGAGGATCATGACCTGGACAAGAGTTTCCGACTG
ACCAAGTTCTCCGAGCTCAAGGGATGAGGGTGCAAGGTCCCCCAGGAGACATTGCTCAAA
CTCCTGGAGGGACTGGAGCAGGACGGGCCGTACCAGGACGAACACCAACAGTTCATGGGG
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TCAGTGCAGTTTTAAGCATTTTTTAACCTTTAAATCAAACTGTCAAATTGCCAATGACTC
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TTTTCTTCACAGGAGTGGATTTGGTGGCCGTAGTTACATCGCACTTATATTCCTGTCGTG
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TGGTCGCTTATCCAGTTCCGTCTTAAACATTGCCACGCGATTGTGTTATCATTAAAATGC
ATTATTGCGGGGAAAGGTTTACCCCTTGATGTCACGATTGCATGCGCTGATCTGAGCCAT
CTAATTTCTGTGTCCTCTTTTCATATGCAAATGTATTTCTATTTATGAGATGGGAACCAA
TGTTTAGTGCATATGTTGAATGGTTAAGGATTGATGTGTTATTCGATGGGTTTTTTTCTT
AAAAAAGGAAGCATGGTGGCCAAGTAATGATTGATGATAATATATTGTCACATGCACTAC
ACTTGCACCTAATGGTACGTGTAAAGTAATTGAAAATGTTAGCACATTGTGCAATGTTAC
CATGAGGTTAATGGAACGAACAAGACGGGACAAAACGTGAGATGTAATACTAAAAAACCT
TGAATTGAATCATCAACCGGAATCGTTATAATCACAGGAATGAGAGTTGGTGACTTGTTG
TATGCCTAATAGCTTGTATTATATTTAATGTGCAAGCTGAAACATGTGCAAACACAGAAT
AGAGGTGCATGCTTTGAAGCACATTGCGAGACAGCAAGGTAAACACATGGATCTGAGAAC
GTATGCAAAGTTTCCAAACAGCATGTTTGCTATTAAGCAAAACAAGTGGGCTTGGGCAAG
ACATTCCCAGAGGGGTGATGACCAGTAGTCAATACTAACGATAGTGGCAACCAAAGAAGG
GAACATGGAGCAACGAAATCAGTTTGTATGTAGATGCAAGATGGATTGTTATATCTAGGA
CCATGAGGAATGGCAACAGCTTGGAAGGGTCATCATCCAGCATGGATTGATCATAGCTGA
TGATGATTGTACACAGTGATATGGTCTGCATATGTATGTTAAATCCTAGATTTTGAGCAC
TGCTTGCTCGTGATTTAATCAAGTGGTGGCAGAAAACTCATTAACATCATGTGTGTACGT
GTGTTTGTGGTAGGGGAAGATCGCTTGCGCTAACGTGCTGAGTGACCTGTACGCCATGGG
GGTGACGGAGTGTGACAACATGCTCATGCTGCTCGCCATCAGCCAGAAGTTATCCGAGAA
GGTTTGTCCATCCATTACATCTTTTTCGCGTAGATTCAATAAAACTCGTATAACAGACGC
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GACTTATTAAACAGGCTTCAAAGCTTAATAGTAATTCTAAATTCTGGGCAAGGCTGCAAT
TATATTTTCAGTTTCACGTACAAGCAAGAGAGTGTTTTTTATTGTGTTTAAGTCACCCTT
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GCAGTCATTCCCCTTCAAAGATTTCTGTTGCATTGCGGTGTTCGTGTGTCAGGAGCGAGA
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GGTGACAGGAGGGCAGACAGTGGTCAACCCCTGGATCGTCATCGGGGGCGTCGCCACCAC
CGTGTGTCAACCCAACGAGTTCATCATGTGAGCCACCAGCCCTTGCGTGCGTGTTCGTTA
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CTTTTGCATCGTGTCATTTGATTTTGTCTGCTGTGGGTGTGCTCAAGGCCCGATAACGCG
GTGCCAGGAGATGTGCTCGTGCTGACAAAACCGCTGGGTACCCAGGTGGCCGTCAATGCA
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GTGCCTTGCTGTCAATCATAATGGGGAGTTTCCTGGCTTAAATGTAGACAATCATCTCGG
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GGTATATTTCTAGCCACACTTCCTCCACTTGTGCCTTGTTGCCCTTAATATGTGTTGGCT
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GTGGCGTGATTTTAGCTTCCTCGCCTGGCATGCAGGAGGTCGTCGGTTCAATCTCGACCC
TGACACCTGTATATTTGGAGTTTTGCGTGTTCTCCCCATGGTCGCATGGATTGTTCTCCG
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TAAATTTACATGTGATTAGCTACTTCATTTATTTATCATTTGAAGCCAGGTCAATTCTGA
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TTTTGTGGTTAAAGTATCGGTACTCCCACCTCTTCTGAGATGTCTGGCCAGTGTGACAGT
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GGCAGTACGCTCGCTGAGGTTAAGAACCAGGCTACAGTCTACATTATAGACTGCCAGTAC
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TCTGGTGAAATGCCTATCCTTAGGCACAAGCCGTGAGCATCTTTGGAGGTCCCCCTGACT
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TGCTTGGATATTGGCTTAAAGTAAAACTATAATTTTACGTCTGATGTGTAAAAATACATT
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GGGCAGAAGCAGTAGAGGGAGACTGGGTGAGATGAAAGGATGTGGAGGACTGGTTGTGAC
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CCCATGCAATAATGGAAATTTCCAGCTTAGAAGGAGATGCATAATGCACACATTTTACTT
GGTTACATGCTGTGTGTACTTCAGATGCTGACATTGTTCGCTTCCTGTTTTATTGCTCAC
CAGGTGGGCTGCTGATTTGCCTGCCACGCGAACAGGCCGCGCGATTCTGTGCCGAAATCA
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GCCGCACGGCCCGCATAATCGACAAGCCCCGCATCATTGAGGTGGCGCCGCGTGGGGCTA
GCCCCACCGGCGTGGCCTCTCCCGACACGCCCACCGGCCCCCCGCTCACATAGAGACGCG
CGTACGTGGGGATGGGGTGGGGCACATCACCGCACACAGGCACCGCCAACTGACGCACAA
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GCACAAGCGCGGGGCTGGGTGTCTTGCACTGTCCCGGTTAACAAACAGCAGCTACAGACC
CCTGAACGGATGCGTCTTGCTCCGCATGCACTCACGATCGACTGTGCACGCCATCGCACG
CTGGGTGCACTCGACGCATCCCACGCTAGCCCGCAGCGCGCCTGGCGTTGTAGCCCGGTG
CACGCCGCGCACGCACGCACATATACCTTCACCCCATGACTACCTTGCCGCCTCCCCGCG
ACACTTGACAGCAACCCCATTGCTGACAGTTCATTTCTCGGCGAAAAGCAAACACTAATG
TTCTGCTAGGACAGCATCATTCTGCCGATTTAGGAACGGAGCCTTTGTGGCTGGGCGCAG
ACAGAAACCCCATCATGTGATTTGTCGGTGCACATAATCTACTTATCAGAATTAAGAATG
AATTTTTTAGACGGCTACATCTCTGCCGCAGTGAAAGCGATCTGCCGAAAGATGTAATTG
TCCATCAGTGTTGCAATTTGGCCCCTTTTTAACGTCGAGCTGCAGTCTCAAATTGAGGAT
TAGCCTCGACTATGACCGCGAGAGGTCATGTTTTGCAAAATACTTCCATGGCTTCAGTGG
CGGCTTGCTCATCAGACATTATTTTTGTAAGGCACATGCCCTTTAACTGTACCTTAAATT
GCCTTGATTTTTCATACGCAAACGTTAACGTTATGATCGATTGCATTGTCCTCGTACGCG
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CAACCTGTGCGCCCGTGAGATTTGAGCAGCTCATGGGAGTGCGGTTGGAGGGAGCAGACT
TGAGTTGTCTAAATGTGAAAACCTATTTTCTTTTAGGTGTTTTAACATTTTTACAAGCTC
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CACAGGGGACGG
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