SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002268_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein W (SelW)
SpeciesProcavia capensis (Hyrax)
Transcript IDSPT00002268
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002175_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002268_2.0 # Transcript # Selenoprotein W (SelW) # Hyrax (Procavia capensis) # Full length # Forward
ATGGCTCTCGCAGTTCGAGTCGTTTACTGGTAAGTGTGGCGGCCACAGTTCCCCTCCGCG
ACCCCATCCTAACCCCTCCTTTCTGCAGGCCGAGGTGTTTTCTTGGGACGCTGGGGGCGT
CAGCGGCAGCACTCATAGAGACCCTCTCGTGTGGGCGAAAACTTAAGGGAGGGCGCGCAT
CGTCCCTCCGTGGAACTATGTGCCTGTATATTTTAAACCCTGGGAGACTGAGGCCCAGCT
CTGGGGGTCAGTTTTATAATGGGAGGAGGAGCCTCCGCCTTTCTTCCCTTAGGGTTCCCC
TCCCCCAGTCTAAATTTCTGAAACATTTCTGGGTGCGGTTGGAACAGATATGGATGAGTC
ATTTCTGGCCTGTATTCAGTGGGTGCGCGTCGCAGTGAACCCTGCACCCTTTCTAGCCTC
AGTTTCCCCATTTGTAGCAAGAGGAAGGGTGAAGGAAGTGGTGTGTGGCGGCACCAAACG
TGTTTGATCCAATCCGTCTGCTAGAATGTAAACTCCAGGGTGGTGGGGAGTTTTCGCTGG
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ACCTTATTGAGCATTATTAGCAAGCTGACCAATCCCCATGATGAGGCCGCAAGCACTGAT
TTACTTAGTCCCACTCAGTCATTGGGTGGAAGTTACGAGACCACGGTGAGAAAGGCCACT
TTGTGTAAGAGAGATCCATCGTACTGACCGACTCGGTACATGCTGGAACAAGCAGCAACT
TCCAAATCAAGTGTCTCACCTGCGTTTCTGGGAACCCTGGTGGTGCAGTGGATAAATGCT
GTGGTTGCTAACCAGGGAGGTCAGCAGTTGGAATTCACCAGGCGCCTCTTGGAAATGCTA
TGGGACAGTTTCGCGCTGTCCTGTAGAGTCGCTGTGAGTTGGAATCGACTCAGCAGCAGT
GGAGTGGGGTCGCGCGATTCTGAAATGAATCTCCCAAAATTAAAGGAAAAAAGTTATGAA
TTGCATAATTTCAAAGTTGAATGAACAGAGTAGATTGTGGGCTGTTGCTGCAAGGGGTGA
GGGTGCCACCACGGTGGCGTTTGAATCCCTGCAGGTGGAATGGGGTCTCTCTTGGATAAC
CACACTGTCTATGCCAGTCCCAAACTGTCAGTAACTCAGAGGCGTCTGCTTAATTCAGCA
AGATGTTGATTTGGATTCTGTGGGGTCATTTTGGACTCTAGATGAATTTATCCAACTTCA
GCAAAAATGGGGTTTACAGAAGAAAGAGATGGGAGGGGAACTGCAGACAGCCTGGAAAGA
GGAACTCTCATTTACATATTTCATGGATGCAGTTTTGAGAGGTCCCCAGGAGTGTGTCGT
GGGTAGTTTTGAGAGGTCTCCAAAACAGGTGTAGTCAGGGTAACAAGCACCCCGGAGCAG
TCTCTAAGTTGCAGTCCCCCAGTTTGAAGATGAATAGATGCTGGTGGTGGTGACCCATAA
GCAGAAAGACCTTCCCCTCTTGTCTTCTTGCTTCAGGTGCCTTTTGTATTTCTGACACTC
TACAGTGTCACTTCACTCCTCCTCTGGTGCCCCCTTGGATGGACTTTTGCCCNNNNNNNN
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AAATTTTTTTGCATTGTTGTTTAAAGTGAAAGTTTACAGTCCGAGTCAGTTTCTCACATA
AAAACTTACCAACACTGTTATGTGGCCCTAGCTACTCTCCCGACACCGTGATAGCACACT
CCTCCTCTCCACCCTGTATTTCCCATGTCCCTTCAACCAGCTCCTGTCCCCTTCTGCCCT
ATCATCTCGCCTCTGGACAAGAGCTGCCCAGTTAGCCTCATGTATCTACATAGACTCTTC
ACCACTATCTGTTTATGTCTTACATACCAGTTCAATGTTTGTCTGAGCAGCTGGAGTTGC
TAATGGTTTTGGTTCGGGGCTGACAGACAGTCCAGGGGTCATGTCTTCCGGGGACCTTCC
AGCCTGTCAGACCACCAAGTTTTCTTAAACTAGAGTTCAAGTTCTGCACCCCACATTTCT
CCCACTCCATCAAGGACTCCTTTTGCATTGCCTGTAAGGGCAGTCATTGGCAGTAGCTGG
GCACCATCTAGTTCTTCTAGTCTCATGCTGATGTAGTCTCTATATTATGTGCCCTTTTCT
GTTTCTTGGGCTCATATTTTCCTTATGTCTTTGATACTCTTCATTCTTCTTTGTTCCAGG
TGGACTGAGATCAATTGATGATTCTTAGATGACCACTTGCTAGCTTTTAAGACCCCAGAC
ACCACTCACCCAAGTGGGATGCAGAACATTTTCTTAATAAACTTTGTTATGCCAGTTGAC
CTAGATGTCCCCTGAAACCACCATCCGCAGGCCCCTGCCCCTGCTTTTCTGTCCCTTGAA
GTGTTTGGTTGCAATCAGGAAGCGTCCTGAATTTTGTTTAGTCCAGTTGTGCTGACCTCT
CCTCCACTGTGTGTTGTCCCTCCCTTCACCTAAAATAATTCCTATTATCTAATTAGTGAA
TACCCCTGTCTCTCACTTCCCACCCTCATAACCATCAAAGACTGTTTTCTTCTGTGTTTA
AACCTTCTCTTGAATCCTTATAATAGCGGTCTCATATAATGTTTGTCCTCTTGCAACTAA
TCTGACTCAACATAAATGCCTTCTAGATTCCTCCACGCTTCCCAAATTCATCATTATTCT
TGATCATTGCCTAACATGCACTGTGTGAATATGTCATTGCTATCCACTTATCTCATATTT
TAAGAGACTGATTTATGACGTACCCTATACTAATACTGCCCAACTTACATAACAAAGAAA
ACCCATTCCCAAATGGGATTATAACCACAGATGTTAACTCATTGTTATCAAGTCAATGGC
TATTCATGTTGACCCTAAAGGACAGAGTAGACCTGCCCCATTGGGTTTCCAAGGCTGTGA
TCTTCACAGAAGCCATCTGCCACATGTCTCCTGCAGAGAAGTGGGTGGCTTCAAACTGCC
AACCTTTCAGTTAGCAGCCAAGTGCTTAACAACAGTTATTTTTTAAGGGGGAACACAATT
CAGTCCACAGGTATGTGTTAAAGAATTTAGTTAACTTATTAATGAGGAAACTAGTGAGGT
GTTATAGCAAGATCAAAGGGGAACCCAGAGAACAGACATATTCACAGACGTGAAATATTG
AGATGAATGTGGAAACGCTTGGAGGCAAAACATTGCAGGGGGCATCCTTCCCCCAGAGAA
GTTCATTCATGTGTCTGTGGCGAAGAATTATTCTGCATTGCAATCACTTAACTATGCTTT
CTAAAACCCACTGCCAGTGAGTTGATTTCAACTAACACTGACTCTGTAGGACTGCATAGA
ACTGCCCTGCAGGGTTTCCAGGCTGTAATCTTCATGGAAGCAGACTACCACATCTGCAGT
GGCAGAGTTGGACCACTGACTTTCCATCAGCAGCTGAGCATTTAAATACCGTGCCACCAT
GGCTCCTCTCTGAGAAGACTACAGACAAGGAAACTCTATAGAGATCAGTTTTACTGTGTA
AACACATGGAGTTGCCCTGTGTCAGAATTGCCTCCACAGAGTGGGGATATTAGAACTGAT
TTCTGGAGGATAAGGAGTAGTTAGGCAGCAGGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CAGTTTTGATTCTAAACCAGCTTTCTGTTTCCCCTCCCCTGGCTTTCTCTCTGTCTCACT
CACTGTGGTCTTGTGCTGGCCTTTGTGCTGCCCCTTCTCTGTCTTGCCCTGTGGCTTTTC
CTCTCTGTGTGGGTGTCCTCTTCCTTGTTGGGTCTCCGCCTCCCCCATTTCCCTGCCCTT
CCACGACATTCGGGTGTGTGCAACATCTGTGTGTCTTTCCTCCCTGTCTGCCTTCATCTC
TTCCTGGCTATCCCCTCCTGTTGTCCTCTGTCCTTCCTTTTCTCCCTGGCTCATCCTCTC
CATCCCTTTCCTTCTGCCTGCCCTCCCCATCCTCCTTGCTCCCCCCCATCTCTCCCCGTG
CCTCCTTGGTCCCCCTCTTCCATCTCTCTGCTTTTCCTCCTGGTTCTCCTGGCCTCCGTT
TCTCCCCACTTCCTTCAACTCCCCTGTCTCCATCTCCCCCTCCTCTGTCTGTCTCTCCCC
GGCACCCATCTCCATTTTTCCCTACCTCTCCTTGGCTGCCCCATCTCCTTTCCTCTTCTT
GCTCTCCTCCCCTTTCCCATCCTCCGGTTGTCTCCACCCAGTGGCGCTTGAGGCTACAAG
CCCAAGGTAAGCTGAGCATGGGCAGCCGAGGGTATTCTTGGAGGGGAGGCATATTGTTGG
GAGGGCTGGCTGTCACAAGCGTTTTGTAACCTGCCACCTCATTTTCAGTATTGTCAACTC
AAGAAGAGGTTGGAAGATGAATTCCCTGGCCGCCTGGACATCGTGAGTCTTAGACATGGG
GAGGCAGGGCCAAGCCCAGGTCACCTTGTCCATCCCTTAGGCGGTGCAGGGTGGCACTGA
GAGTGATTTAGATCAGCCCTGCCCTCCACCCCTGTTCTCCATTCCCTGGGAAGGGGGAGG
GGGTCCCCAAGAGGATATGTCAGCCCCTCCTAATATTCTTCTCTACCCTAGAGCGGTGAG
GCCACCCCCCAGGCCACCGGCTTCTTTGAAGTGATAGTAGCAGGGAAGTTGGTGCACTCT
AAGAAGGTAGGACTGTCTGTCTGTCTTTGTCTCTGTTTTGGGCTAGCAGGAGGTGGGAGC
TCAGATTGGGGTCCTGGTCGCAGCTCACCCCTGCCCTCTGCTTCCCGTCTGCAGAAAGGT
GATGGCTACGTGGACACGGAAAGCAAGTTTCTGAAGCTGGTAGCTGCCATCAAAGCCGCC
TTGGCTCAGGGG
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