SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002349_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesRattus norvegicus (Rat)
Transcript IDSPT00002349
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002256_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002349_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Rat (Rattus norvegicus) # Full length # Reverse
ATTAGCCAAGCACCTTCTAACAAGTCAGGCAGAACACGAGGTGCACAGACCAGTTATCAT
CACATAACTGGCTCACCTTCCCGCCTCCATGATGGTAATCGATTAACCAGCATTTTCCAC
ATCAACTTCTCATCAAGTTTTGCTTCCATTGTTTTGTTTCAGAGAATGTCCCCAACACAT
GTAAGCCTTAGCACAGGTCTGTAAGCCAGCTCCTCCACTCACTTCCAACAGCCTGGATGC
CAATGATTACAATTTCAAAATGTTTCCGTGAAGTATCAATGGTTTTGGTTTTGTTTGCTT
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TGCACTGCTGACAGAGAACCTGCCCCAGTGAGACAATGAAATATGCCACATTGGCCAGCT
GTGGTTACAACCCGCTCTCTGCTAAGCAACAGCAGAGCATTTCACTCTAGAAGAAGATTA
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GGGAAGGCGAGTCACTGGAGAACAACCAGGGTTTGGCAACTGTACACTGTTCTGGAGTCC
CTGGCATCTCTGGCTGAAGAGACTTTTTTGACGATTTCTACATTAAATTTGGGCTATCAT
TCCCACAGCTATAGACCTGCCATAAATTATCAGATGCTAAGAAAGGCTGTGGCTATCTGA
ATGTTATTAGTGTTCCTGAATCATCTGGGGACTTTAAACATAAAAGTAAATCATCTTCAA
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TTAAGTTTAATTATTTATGCCTATGGGTGTTAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTTCACATGTGTTCAGTGCCCATAAAGGCCAGAAGAGGGCATCTGACCCCCTG
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AGAGTGGCCAGGGCTCTTAACCACTGGGCCTGTTCCCCTGCTCCCCATTTTCTTTTTACA
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TCTCACAGAAAGAACAGAACTGTTTTCTCAATTAAAAAAAAACTTACACAATGAGTTAGA
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TCTGGCAGTTCCCCACCGCGTGCTTCCTCCTTCTGTATTCCCAAGAGCAGTTCTGCCCTG
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GAGTGTGTAAAGGAGAACACTCTCAAGGCGGGAGGTTGTTGTGCCTACGATCACAGTTGC
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TTGGCAAACGATTAGCTGACACTTGGGAGAAGCAAGAAGAGGGGAGGAAAAGAGGGAGTA
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AAGCACAGATCTTGGGATCATATCAGAAGAGACTAAGACAATGTAGTAAGGACATCTGGC
TAATCTCCACTTCAACTTGACTAGATCTAGAATCATCTTAGAAACACACTCGGGGCTTAT
CTGTGGAGGAGGTTCCAGAGGTTTAAATGAGGAGAGAAAACCCACTCTGTATGAGGGCAG
CACTACCATGCGCTGGAGTCCTGGACTGAATGAGAGAAAGAAGTGAGCAGAGCAGTCCCA
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TGGTCAACTGTCTCCCTTCTAAAGCAGACGTCAAAGTGAACTCCCGTACATTGCTTCTAA
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ATCTCCCAATTTTAAAAGTCTATGCTATGTAAAGAACAATTTCAAAACAGCCTCCTAAGC
CTCGACACAACTAGGTTTCTTCATGGTGGTAAAGAAGAAACACAATCTCCAACCTCCGAC
CTCCAACCAGCAACGAACACCATTCAAAGCTGCTTTGATTCTTCTTTGTTTTGCTATTTT
GGTTTTCTGAGATGGTCTCACGTAGCCCAAGCTGACCCCAAATTACAGCGAAGCTATCAT
TTCTGGCTTATATGATGCTAAAAAAAAAAAAAAAGTCTTACTGTGATATTGGCAAAAGCT
GTTCCGACCATGAAGTAGAATATTCTAGGGTGCATTTCTAAAATATCTGAAGGTGACCGG
AGGATCCACACTGTCGACAGAGTGAAGAGCAGGCATGGAGAGAAGAAGGGGACCATGGCT
TCATAGATGGAATTGTGCTTCAGAGAGTTGCTTTTATAGCTTCTGAAAAATCAATACAGA
ACATTACATGTAGGACAGACATATTGTGGAGAGCTTTTGGGGTGGATTCTAGAAACTTCT
AGGAATTTGACATTGGGCCAGGACAAAGTAGGCTTCAGGCAAGAATCTGACTTTGGGCTA
GGACAGGGAAGTAGGCTCAGGTATCTTGGCCATCCCGATAAGGCCTTAGACATGGTGATC
ATGGGACTTTGTTTAATGCCTTGCTTGTTCCTTAACCTAGAACTGACCTTTTACTTGCAT
GTAGTTAAAATGTTATAAAAGCAGACTTCGGAAAAAATAAACCTGCTTCAGCCTCAGAAC
TGGCTGGGGTCATGCTACATACAGTGTTGTCTGATCGTCTTTTTGTCTTTTTAATTCCCG
CTCCCTCCCTGGAGAACCCGTTGACTGTCTGAGCTGGCTTGGTCAGCATATGCCTGATAC
TTATCACCAGACTCTGCCCACAAGCATCCTTACTGTATATCCACAATCTTACCGAATGCA
CAGAGAACAGTGTCATTAGCCCCACTTTAAAGAAGGTTAAGTTAGAATGAAATACTCTAA
ATTTATTATTGCTACCAGTTCTGACCCCATCAATCCTCCCCGATTCTATTTCCTCCCCAC
TTCCTCCTCCCTTTCTCTACAAGGTCTCACCATGTAGCCCTGGCTGGCCTGGAACTCACT
CTGGATCCACCTGCCTCTGTCTCCAGAGTGCTGGGATTAAAGTAATGTACTATCACTCCC
CACTCTTTCTACTTACTTTTTAAATAGCTGTGTTAAGAATAGACGGATGGGGCTGGAGAG
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CTTTCTCAGGGGTCACATATCAGATATCCTCCATGTTAGATATTTACATTACAACTCCTT
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AACAGTGTATACCACTTCTATAAATGGCCACCAGCCTCAACGGAAGCTACGTAGAGCTTG
TCTTGACATGGGTAAAATTCTGCAGACAGGGCTAAGTGCTAAGGACTAAGTAGGAAAAAC
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ATCTCATTATCTAAATCCTTCATTAAAAGAATTTGAGCAAATCAGTATTAACAAGAATAC
ATATCGATTCATTTAAAGGAGGGACAAACTTGAAGACTGCTGAGCCCAAAACCTTAACAA
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TTATCCTATCAATTATCACTCTGGATCTGAACTACAGGCTTTTAAACCATTTCAAAATGT
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GAGCGAGCCCCAGCTGGGTCAATCTGCAGACTGGAACCTGCCTGGCTTTGATCTCTGCAT
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TTTTGTAGGAGAAAAGTAGTGGTCCCAACTGCACCGTCCCAGCTGAAAACTGCATGGATC
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AGACGACACTGGGATCTGCTGCTTCCTGTTTGTCTTTAATCTTCCTAGCCTCTCCAGTTT
CTTTCCTCCCCGCCCTGTACATGCCATGCTCACTTTCCCACAAGCCTACAGTGACATGCG
GCTGTTCTAAGAAACCCTGCCTCTGTTGCCGGGCCACTGTGGCCCAGCTTACCCTGTCAC
ATTTTGTTATTTGCTACCGTCTAGTACTTTCAGTTCTTAGCATCCACCCGCTCTTCCTGT
CCTCAGAAACTATACTCTTGAGACCACCAAGATTCCCACTGGTGAGTTTTGTGTCACTTC
TGACTTTGAAGGTGACTTGGTTCACTCCTGGGTGACTGTGGCTCCTCCTGCATTGTTCGG
GGACACCCGGCCTGCTTATGCTTTTCTTTGCCTAAACTAGGTGTTTTCCACTTCATGGGC
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TGTTCATGACCGGCTCTGCTGGCCACAAGTCACTTTTATCTCAGTGGCTCCCATACTAGA
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GGAATCTCCTCCACACCAGCCCAGAAGACACACGCACAGACTACACTACAATAATGTGTA
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CTACTTGTCTGCCGAATGAAGGGCTATAAACTAAGACCATTAACATCTAGTCCTACTAGG
TGAAGAACACACATTAAGTTGGAATTGACATACAATATCTGAGCCCTCTCATCACTATTT
ATATCAGAGACAACTAGATGGCATTGTGGCCATGTTAACCTTCGATTTAGCCAAAGAGGG
TGTCTGTAGGGCAGCTGACCAGAACAGGAAAGCAGTAAAAAGCAAAGGATTCCAGGTTAT
TATTTTAGGGGTCCTAGAAAAAGTACTAAAGACCTAAGGAAAATAAAAGGCATACTTGAA
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AGAGTAGACTAGAAAAGGCTTAGAAACTGATGGCTACTGTAGTAGGCACAGCCTTTCTGT
GGTTCTAGACCACACACTTAGGAACCACACTGTTTTAGCTACCAAATGTTTATTTGTATG
GAGTGGTTTTGTCTTATGTTGTTTTTTAAAACCTTGGAAAATTCACCTTTCCCCTACCAT
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GT
Chart Advanced