SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002396_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesSarcophilus harrisii (Tasmanian devil)
Transcript IDSPT00002396
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002303_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002396_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) # Full length # Forward
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GGGGGGGGGGGCCCCCGCCGCCCCCAGCNNNNNNNNNNGCGACTGCCCGGCGGCCCCGAG
CGGCCCACGTGGGTGTAGCGGCTCGCCCGCGGAAATCCGGTCAGTCACCGGAGGGGAGCG
CCTGCCCTCGGGGAGCTTCCCGTCTAAAGTGCCCGGGGGGAGGGAGAAGAGACTCCAGAG
AGCCCGGCCCGCCCCCACGCTGCCTCGCTGCGAATGGCCCTCGGGCTTCCCGGGGAGTGA
GTGACCCGCTGGCCGGCGCAGACACGCGGGCCTGCGCGACTGAATGGGGAATTTTCACAA
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CCAAGGGTCAGAGGTTAGTGGGCGGAGTAGGAGTTGTTCAAGTTTATTCAGTGTTAATGA
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CTCGCAGGAAGCCGATGACCACAGCTAAGTATTGGCTGTGCCCTTGGATGGGCAGCTGGG
TGGTCAGAAAAAACCTGTGTTCAGACTTGGCCTCAGCTGCGCACCAGCTGGGTGACCTCG
GTCATGCCACTTAGCCCTCCCTGCCTCGGTTTCCGTATCTTAAAATAAACTCAAGAAAAT
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ACGAACTTGCCATTATGGATAGTAACAATTTCCTGGGCAACTGTGGTGTGGGAGAAAGGG
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TGTTTTAAAGAGCAAATTATATGGTTGTCTCTATTTTCTAATTTAGAAGTTCTTTGAACT
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AAAAGTTTAAATTTCACTTGAATAAATTGAACTATTTTCTATTGACTTATCTTATAATTT
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AGTTTAAGAATTCATGGACCATTTATGTCTTTTGGTTTTAATATGATCTTATTAAAGTGT
AAAACATTGCTTTAATTTTAATTTCAATCTTATTTATATTTCTAAAATCTTTTCATTAAC
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AAAAAAATCAAGAAAAATAAAGAAAATGAAGAAGTTATACTTCAATTTTCCACTCAGAGT
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TTGCTCAGTTAGCCAAGTCTTTCACAAGTTGATTATCATTAATTACAACATTATTGTTAC
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CTCTTCTCAAGGGATTCTCACAGTTTAATTTGTTATTATTAATTGGCCGTTACTCTTTTT
ATTTTATTGGAGCTTAGTACTGGTACGTTCTGCTTTATCTCAGCCTGCTGTGTAGACTTC
TGGCTAGCAAATTCCCAAGTAATGTTAAGAGAAATTTTTTTTTTTAATTTGGTGATTTAA
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GATGAGAAATAAGACCAGAAAGGTATATTAGTGTTATATTGCTGTGGACTTTGACTATCA
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TGAGAAGTAACATTAATTCTATGCCTTAGGAAAATTATTTTGACAGTGGTATGATAGGTT
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GGGGTCCTGGGAAGAAGGAAACATCACTTAAAGGAGAAAATTGTTTTTTAGCGGAATTGT
GAGGATAGGACCCCGTTTGCAAGTAATTGATTTGAATCATAAATAAATCAAAAATTAGGA
GTCTTTTTAGAAGTTTACAGTTAAGGGGAGGAAGGAGAGTTTGATAGCTTATGGGCTAGC
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TGAGAAGAATCTATATAGTGTCAGAACTAGCAGTTGAACCCAGTTTTCCTGGTTATGAGA
TCCAGTACTCTTTCTGCCATACTTCCAAGATTCAAAAATTACTATAAATTAAAATCTCTT
TTTATTGTATTACCTTTAAATTACTAATTTTTTTTTTTTGTATAGGTATTTTTTGACATC
ATTAGACAATATGGAGTATATGGTGTTTGGCTCTGTAGTTCCTTAATTTCATATAGAAAC
TGTGATTTGTACTGCCTACTTTAAAACAAAATTTTAAATTTTAATTATTATTATTATTTT
TTTTGCTGAGGCAATTGGGGTTAAGTGACTTGCCCAGGGTCACACAGCTAGGAAGTGTTA
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TTATATCTCAGTCTTCACTTTGAATCTGTAACCTCTCTTCTCAAGAGATGGAGAGTGTGC
TTTATCATCGGTCTTCTGGAGTCATGATGATTCACTGTGTTAATCAGAGTTCTTGTCTTT
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TTCATATAAAGTCTTCCTGGTTTTTTCTAAAACAATTCTTTTCATAATTCCTTGCAGTAC
AGTATTATTCCCTTCCATTCACACACATTATCACTTGATGGTCACTTTTTTGATTTCCAG
TTCTTTGCCCCCACAAAAGCAATGTCTGTCATTATTTTTGTACATTTGGACTTTTTCCTC
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TCTTATAATAGCACTCTAGCATTGTGAGACTTTGAACTGTGATAGTAGTAATGGAAGCTT
TTTTCATTGCCAAAGTTTGGACAGCATTGCTCTGTTCACATGTGTGATTTTTCTCTCAGG
TCAGTGGTCCCAATAAATCTTACCATACGGAGCTTAAACAAATCACTGGAGTAAAGTGCA
AATAGCTACCGTATGTTTGTACTGCTCACTTGAATTTTGAGCCTGTTGTAACACTTGTTA
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AGGTCATACTTTAAAAATGCCCTTTGTTTTGTTCTCACTTTTATTTTTATTAGATTATTT
CCTTCTTTTTCTATTCTAATCCTGGTTCTATTGGTAAGCTCCAGCAGCAAAGTAGCATAG
TTTTCTTTTATCTGGGTAGGAAATTGTACAATACAAAAAATTTAGGATGAAACAAATGTT
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CTGGATGTTCTGTGGACCCTTTTAAAAAAGCCTCAGATTCTACCCCTAAAAGCTAGCTCT
TGCTTCTGATTTTCTAGATTATCTTATTTGCATACATGTACGTGAATTATTTTGCATAAG
ACTTTTTTCCCATTCATTGACCCTTCTTTTGTTTAGGTTCATTCATGGGATTGGAAGATC
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TTTTTGCTGACCTGCTACCAATAAGGGAGTTGGGCTAGATGGCCTTTGAGTTCTTTCCAG
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TTTACAGGTGTTCGTTCAGTGGCTGACTGCTTTGTTGTGCCAATGGCAACTGGTATGAGT
CTAACCCTGTGTTTCTTGACATTACGGCACAAGAGACCAAAGGCAAAGTATATTATTTGG
CCACGGATAGATCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGGTCACTGCAGGTAATAGAATATAT
TATTAGTGTTTCATTAATGTTATAATATTATGATACAAGACAGCTCAAGAGATAGAATTT
TGCAGTTAGAGTCAGGAAAAAAATCATTTGTGATCTGGACTCCAACACTAGCCATGTGAC
CAGAGAAATGTTACTTAAGCTCTTTGAACCTGAGACTCTAAAAATCATTTACTCTGTTTT
CTTCAAATTTTTCATTTCTAGGATTCCTACAGTTATATAAATCACAGATCATTTGATACA
GTGAGGTTAATTTGCAATTACATAGTCTTTTGGACTTGTTTAGAATCAGATGAAAAACAA
AAAAATTTATTAAACAGAATATAATAAAAAGTTGGACTCACACACACACACACACACACC
CCACAAAAAATCTAGTAAAACCATTACCATAAATCAAATAGGTATCCTTCCGAATGACTG
GATCTAATGGAAATAACTGTTGAAAAATTGGATAATAATAATAATAGTAACAATAATGGC
TAGCATTTCTAACTTTAGATTTTAAAAGTGCTTTACATATGTTATCTTGTTGGATCTTTA
TAACAGATTTGTGAGATAGGTTCTATCATTATCTCCTATTTTACAGAAGAGAAAATTGAG
GAAGAGAAGGGTTAAATAATTTGTCCAGAGTCTCATAGAAAGTGTATTAGACAGGAATTG
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CAAATAGTGTTAGAAATTTAGGTTGGGGTTTCTATATGTTTTATCAAATAAGGCCTAGAT
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GTACTGCATTCCTATAATTGAACTACTTATCAAGCCATCAAAGTATTCTACTTCCATCAG
AATTGATTCATATTGGTTGAAAGATGCAAAGATCATAGCCTTGAGAGCATCAGGGCTAGA
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TTATTATTACATAATTTTAATAAATGCCATTTCTTTGAAAGAATTCAAGATAGGCTTACT
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TGGGAAAATTATCTATTGACACAGATTTGAAAGACACGTAAAAGATGGAAAATGTGCTCA
GTAATGGAAAATGAATACCTAAGTGTTGCATTGTCCAATAAGAATAATATCAGAAGAACC
AAAACTCAGAATAAGTTGAAGTTGGTGCTAGCAGATAAAGCCAAGGATGACCAAAAGCTT
TTGTTAGCCATATTGGAAAGAAAAGGAGAATTGGACAAAAGAGAGGCCTGCTACTTGGAG
TGCATGGGATGATGATTATTAATGATAGAAAAAAATAGGGCTTTTCAGTTCTTCCTTGTT
CCTGTTTTTCTCTGCTAAAGACAATAATCTTTGGACTAGCAAGAACAGAATAATAGTAGC
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TCTGTTAATAGTTACACTTTAAGTCATATGAGCTTGGTGAGAGACTATTTGTTATCTGAG
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CCAGTTGATATTATTTTTTTAATCTTAGCAACCTTCTAAGATGCTTAGGAAGTTTCACTT
TCTGTCAGTTGAAATAATGGGTCACTAAAGCATATTTAATATATACTTCAGAATAAGTGC
CTAGTGATGAATGGCCTAGGAATCATTCTTTCCTCTCATCACCAAACCTCAGTTTTTATC
TTTCCTTTCTTTTCTTTCCTCCTTTTCTAAAGACTTGATAGTTGAATCTGGGTATTTCTT
TGCTTTAACTATTACAATACTCTTTAAACTTTTCTCATTCAAAAAATATTACTGTTTTCC
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ATGAAGTAGTAATTGTACTTAGGCAACAGGAAATTAGAATTCTTTTACATCTGTAGCTTT
CTAATGACAGGAAATAGAAAGATTAATGACACTAGCTGGGGTACTAGTCCATCTCCTCCC
ATGGGTTTGACACATTATTCTAAAGGTACCTTATTTTTTCTTGACCACTTACTGTCTCAC
ATCTTCACCATATGACCTTGGCCTTTCTTTTCCTTTTATGCAAGTTCTGTATGATATATT
TTACTCCTGTTCTTCAGATTTTGCCATTATTTATGTGTCAGTCTGCTAACCACTGGTACC
TCTCCATTGTATTGTATGGTATTCATGTTTAATTATTCAAAGGTCATTGTGTTCCATGTT
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TTCTCTTATGCAAGTGTAGGCCCAACTTGTTCATTTGTGTGTTTTATTCCAGGTGTGTGT
GAAAATTCTCATATTCTGTCTGTCTTTCTTTCTCTAGCTCTCTCATGAGCTCTCTAGGTT
GCCCATTCCAGTACATATAATCTGGGTAATAGATATTCTTTATCCTCTTGGTGTTTGTTG
TGAGGATGCAAGTGAAACTCTTTAAGTGTTGCAAAAGGCTTCTAGAAGATAACTCATCCA
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TTTTGAGCAGAGGGTAGTTGAACAATGGTATAGTTTTTGTTTTATCTTTGAAAGCTATTT
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GTAAAAACAATGGATTTTCTATGAGCTCTTCTAATTATTTATGAAACAATGAAGATTGAT
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TTGTATACTTTAATTGAAGGGCATATTCCTCTGAGTCTGTAGAGTTCCTTTTAGTCTTTT
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GGCCAGGGCACTTAAGATGAGTTTTTTTATGCATTCATAATTAGTCATTAAGGCAATTTA
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TGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGTCTTATGGTTGTACATCACAAATCTCTTTC
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TCATACCCATGGACCTTCAACTTCTGCAAAGAAGTGGGAGTGGAAAAAATCTTATATCTC
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GATTTAGTCTTGGTTCTTTCTACAAAATACAAATGTCAGAAGGTTTTTTTTCCCCTATAG
ATGGGAAAATGGGCATCTGGGTTGCTGGTGGTTTCTCCCCCTCCTGGGACACCTGTGTGT
GGGTTTTTCTGCAGGGTTTGTGACCTTCTTGTCCTCTGACTTGTCTTGCCTCCAAGCTTT
CCTCACTCGCCTTGTGATGTCCCTTTCCTCCAGGCCACCTCACGAGACCTTTGTCCTGGG
CCTTCGGGTCTGTCCCCTTTATTTCCCTAGATGATCTATCTCACCGTTTCTCACGTAACT
TCTCCAGACGGAAGATTATAGACGTAGGCAGGCCTGACTTCTGTGCTGGCCTTTAGCTTT
GTATCTCCACTTGCTTTTTACACATCTCAAAATGGATGCGTCAAAGACATTTGAAACTCC
ACACGTCCAAAACAAAATTTGTCCTCTTTTGTTTACTCCAAACCCTCCCCTCTTCCTGAC
TTGTCTGTTTTTTTGTTAGGAGTCCACGGTCCTCCCAGTCCCCCTTCCTCTCACCCTCTA
CATCCAGTCTATTGCCAAAGCCTGTCATTTTACTTTTCTGATTTTTATCGATCATTTGAT
TGACTGAATGTGGATCTCCTTTGTATATATTTAATTTTATTCAGTTCTCTTTTCCACCAT
TTAAACTCCCTTTCTTTGTCAACACATCTGACAATGATATTTAGTTGTGCTTATTTGTCC
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AAAACATAAATAATGCAATAGAATGAAATAAACATTGATTCAAAAAAGTATTTCGTCTTA
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GGCTATCCTGTCTCTTTAGTCCTTCCTCTGCAGTTTGCCAGATTTGATATTCCTAAAGTA
GAAATTTGACCATGTCACCTCCTTAAGATGTTTCAGTAGCTTCCTGTGGCATCTAGTATA
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GATTTTGACTTTCTCCCTTTTACTTGAGAGACTGAAGGGCATCTTATAAAGAGAACTAGC
TTTGGAGCCAAGGAAACCTCATTGCAAGTCTTGTCTCCATACCCAGCGATTGAAACCGTT
TTTGGCGAAGGTGTCGCCTAGATAATTAAAGGAATCTGGAGGTTTTATGGGAAACCTACA
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TGACATTTCAGAAGAAATTTTCAATTTCTCTCGAGAGAACTGGACGGGGAGCCAGAGAGT
CCTGCGTCTGACTCAGCGTTTAGCACCTGTCATTCTGGGCAAGTCACTTAATAGCTCTGT
GCCTTAGTTTCCTCATCTGTAAAGTGAAAGGCTTGATCTTGATGATCTCTAACACTCCTT
CTGCTCTAAATCTATGAAACTTTGATGCTGTTTTTACTCAACAAAACATCATTCATATTC
TTCAAATTGCGGTCAGGTATTTCCCCAGTGTACGTTCTGTGATTCAGTTGGTCTTGGCTT
AGATTGGCTACCCTTCTGTCTTGGACAAATTAACTTAATCTTTTTTGCCCTTAGTTTCCT
TAGCTGTAAAGTAAATTGGGCTATGTGATTTATAAAAGCTCATCTAACTTCTAAAATTCC
ATTGCCATATTACTCTAGTTGCATAGTTGCTTGTTAATTGTAACACTTTTTTACTTTTTT
TAACTCATATTTTGAAGGGCAATTTCATCACAATAAAAAAATTGTGCTTGTGCTTGATAT
GCAAACAGCCTTAAATTCATCACTTCCCAATTTATGTTTTTACCAGTCCTCAAGGCTTGT
ACTCATAATTTTTTTTTCTTTCCTTATAGTAGTTACCTTTATGATATACTTAAAATAACC
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TAATGATGCATACAAGTGTCTGAAACAGTTTTTCCCTCAGTTTAAAATGTGTTAGCTTTC
ACTGAATAGCTGTTTGTTCTAGTGTTAAATAGTTGTACTTAATGAGTAGAATTTGTATGT
GATAGATCAATCCACAGTGATTTCTGTATTTTAATTTCATTGTTTCCCCTAAAAACTCAT
CTTAAGTTGATTTTAAATCTTATACTGTTACTCGAATTGCTGTTTTACTTAATACTTAAT
TGAAAAAAAAAAACATTCTTTTTGGTCATCATTGTCTATATTTATATAAATAAGTTTACT
TTCATTTCTTATTTCCTACACTGCTTAGGGAATCTATCTTAAAAAGCAATAATCAGCCAA
ACTTTAGAAATAGAATAGGACTAATTCCTACTATTTTTATAATCTTTCCTTAGTAGGAAC
AGTTTCATGCATAAATACCTTTCTTTTTGTTTATCTTTGTCAGGTTTTGAACCTGTGGTG
ATAGAGAATGTGTTAGAAGGTGATGAGTTACGCACAGACCTGAAGGAAGTGGAAGCTAAA
ATAAAGGAGCTTGGGGCTGATAACATTCTTTGTCTTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCT
CCAAGGGTGCCTGATAAGTAAGTAATTCATGTATAGTGCTCTTTACACATTAACTGATTT
TGTTAATAAAGTGTAGATATCCTTATTTTAATATGTTTAACTAACTTTGGGGAATAATTA
ACTAAATTGATCTCTTTCTAAGAGGAGCTAGAGAATTCCTCTGAATTGTTGAGGAAAGCT
TAATGGAATATGAAAAGAATATACTGAAATAAGAGAAGGAGAGGAAAAGGAACTAAGACA
ATGTAAATGATTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTCACTTGAATAGATTCAACTCT
CTACCTTCTGCCTGTATTAAAATTATGATTGCTTCCCCTCCCCCAGTACTATTAGCTATT
CTTCATGAAAAGCTGCTCTTTGTCTTATTGTTTATAAGATGTTTTCCTGCAGTGCTGGAT
GTCATCTTTTTTTGTGTTCATTTATTTCTGCTGCCATCTCTAGTTCAGTATTCGTTCACT
CAGTGGGTTTTTTGTTTTTGACACTTCTGATAATCAGGGGTGGGAGCTACCAGTGAAATT
TGCTGTATGATAGATGAAGATTAGTAATGTTGATACATATCTAGTTTTTATGTCAAGATA
TAGCAGTGTTTAATTTTATACTTTAAACGTGTTAAGATACATCTCCCTTGGGAAAAAATT
TAAAGTTAAAAAAATCTTCCTTGGAAATTATTATTACTATAATAATATACTATTATATAT
TACATATGCTAATGCTATTAATTATTAGCTAGTTTTTAGCATTTATGCTAACAAAACTTT
GTGTTCCAAATTTTTCACTTTCCTTTTTCTCTTCCCCTAGACAATAAGTGATCCAATATA
GATTAAACGTGCAGTTTTTCTAAATATATTGAGAATCACTTTTTCAAAATTGATCGTATG
TTAACTTTATACATAATAGTTCTTTTTCTTTGTTTTTAGTGGGAAGAGACAGTATAATGC
ACAGATGTAAATATTTTACTTTCTAGATGAAAGCAAATATAAATTTTCTAGTCCAAATTT
TACTTTGCCCTAATTTAAAGCAGTTAAGCATTCAGTGAGTGCCTACTATGTGCAGACACT
GTTGCTGGACATTGGGGACACAAAGGCAAAAATGAAACAGTTCTCTTCTTTGGTTCTATT
GAGCAAAATAACATGCTTATGTAAGCATATACAAACATAGTTAATTGTGGGGTGAGCACA
AGGCAGTAGCAGCTAGAGGGATTAGGAAAGGCCTCCTTTGGAGGTAGAGTTTGAGCTAAG
CTTTGATGGGAGCTCAGGATTCTTAGTAGAGGTGATGGTAAGCAGCCTCTGCAAATGCAT
GGAGGTAGGAGATGGACTGTCATGGGTGAAGAATATCAAAAAGGCTCCCACAGAGTGGGA
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TTTGTATTTGATTCTGGAGGTCATTGGGAGCCCCTGGCATTTATGAATCAGTACAGAGAC
ATGGCCAGACTTGGGATTTAGGAAAATCACATTGTTGTCTACATGGAGGATCATTTTCCT
GGAACGAAAAGATTTGAGGTGATGAGACCAGTGAGGAGGCTTCTGCAGGAGTCCAGGTAA
AAGGTGATAAAGGCCTAAGTTAGGGAAGTAGCTGTATTAAATAGAGAGAAGGAGATGTTG
TGGAAGTAGAGTAGACAAGACGACCTCTGAGGGGCTATGTTGGGTCAAGGAGTGAGGAGG
ATGACGTTCATCTTGACAGAAACAGTGAAGTTCAGAAGCAGAAAATCAATGAGTTTTATT
ATGGATTTGATGAATTTGTAATCCTTACAAGACATGTAGCTTCTTAATTATAATGTATCC
AGTCTTTTTAAATTTAATTTTATTTTTAAATTTAAAAAAGTCTATTCTTCCCTGCCTCCC
CTTGACATAAAGGCATAATATGCACAGTTGAGTAAAACAAATTTCCAAAATTAGCCATTA
TTTTGCATTCAAAGTCAATGACCTTTTTGTCAGTAGATGGATAGGAAACATCCATCCTTA
GTTTCTTAGAATTGAGATTGGTCATTGTGATGATCAGTTTTTAATTATTTCAGAGTTATT
AGTCTTGATAATGTTATTGTTTAAATTATTTTCATGACTTTGTTCACTTCATTATTCATC
AGTTCCTTTGAGGCTTCTTAGGTTTTTCTTAAAGCACAATGGTAGTATTCCATCACACTC
ATATATCATAATTTATTTAGCATTGTTCTTTGTGATGGGCACCTCTTTTAGTTTCCACAT
TGCCACTATAAACATTGCTGATATCCGTGTATGTATATGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATTTATTTATTTATTTAT
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AATTCTTTTCTTTGATTTCTTTGGGGTTTAGTTGTATAAGTTATTGCTTAGATCAAAGAG
TATTCATAGTATCAATTATGAGTTTGGGGGCATAGTTCCAAATTGCTGTCTAGAATGACT
AGATACATTTATAACCCCTGAATAGGCATTTAAATTGCCTGTTCTCATAGTACCTTGAAC
ATTTATTATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCAGTGTCACTAATCTGATAGATAATATGAGGT
AGAACTTTTCATTTGTTGGGACATATCAATAACATTGTTCACATATGAGTATCTTGGGAT
ATTTCATGTAGTTGGGATATTTCATACTTTGTACTTTTTTTTCCTGAAAACTATCTATTC
ATATTTTTTTTTGACAATCAGTTTGAGAATGGTTCTTATTCTTAAAATTTGTCTTATATA
TCTTGGAAATGAGAAATTTGTCAAGCTTTCCCCCTCTATTTCCCATCTAATTTTAGTTGC
ATTTGTTTTTATTCATGTATAAGTGAATTCATAAAATATATAAAAAACATGTATAAATGT
TTTAATTTTATGTAATCAAAATTGTCCATTTTATTTTCTGTTATCATTTCTCCCCTTGTT
TGGTTATGAATTCTTTTTCCCTATCCATATGTCTGAAAGGTAATTTTTTATCCTTGCTCC
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