SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002404_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein N (SelN)
SpeciesSarcophilus harrisii (Tasmanian devil)
Transcript IDSPT00002404
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002311_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002404_2.0 # Transcript # Selenoprotein N (SelN) # Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) # Full length # Forward
GCTCTTCTCCAGATTTCTGACGTTATTCTTTCTGGGCTAAAAAACTGGACAAACCCTGCA
CTATCATCCAATGTGTTCTCTGCCAGCCAATTCAAAGCTTTCCTGCCCCCAAGGAATGAC
ATGGAGCTGGGTGAGGTCTGGTGGATCATTCCAGACACGATGATTAATAAGACATGTGCA
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TTCCTATTACTCAGGCCTGACTTCTTACCCATTTACTATTCCCAACTATCCCAGGATTAA
GAGCAGCAGAATTGTCTCCTTTCTTCCCCACTATCAAGCTCTTGCCCTGAGCTTAGTTCT
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GTGGGAAGGGGGGACAAATTCCTCACCACCTAGTACAAATGTGCCATTGAGGTTACTTCC
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TCTCCCACTTCCTTCCTATTGAAGAAGTATTACTTTCTTTAAACATGCTCATGCTATGTG
GCTTTCCCCTCTACTTCCTGTGCTTTTTAATGTCTCCATTCTTGGTGCTTTAACAAAACC
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ATACCACTTCTCTCATCAGGTCTCTGAACGTGGGTTTGCAGTGGTTGCATGGACCCCTGA
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TGTACGAACTGCTACAGCACAAACTTTGGCCTTTTTGCTCTTTCCTTCCTTTTCCCCTTG
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TCCTCCTCTCCCTTTCTTTCACTCACTGAAAAGACAAAAAGAAAACTCATTAAAAATATA
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TTCATCACAAATTCTTTGGAATTGTGGTTGATCACGATTAAAATTCTTGAGTCTTTCAAA
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TTATTCTGCATTTGTTCATGAAATTCTTCTCAGATGTTTCTGCATTCATCCCCTTTCATC
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TTCTCATTGATTTCTTTGATATTCTTGACCTTGTTCTCCCAGATGAATTTTGTTGTTACT
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TTTTATTGGATGCATCAACATCTTGCAAACTTTGTTAGTAGACTTGAGTTAGGAACCTCC
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CTCTTTTGACTGCCCTAGATTAGGCACTGGGATCATATTCGTGTCATAAAAGGAATGTAA
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AAAATTAAACAAGCCATAAGTGAACTAAGTTAGGGATATTTATGCATTCTATCTCCTCTT
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TATTCCTAATTTAACAAAAAGGTAAACTGAGGCATGTTCCTCTGAGTATTTATTATCATG
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AGCAAAGGGACATCTCCCCTTATATAAGTTTAGAGGAATATGAAACAAAGAACAGAACAG
GATAAGTGACACCATAGGGTTAAGAGAAACATGATTGGGAACATAGGTGATGTGAAGAGA
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GAGGATATCGTGTGGCAGCAGGAGCTGAGCATGGAAGAAGCTGCCCAGCAGCTAGAAAGG
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GTATGAGGAGTTGAGGTTCTTGGGGTTCAACCTATTTTTTGAGTGCCTACTATGTGGAAG
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TGTGGTGGCTTCACCAAGGAAGGGAACTAGAGACATAACATAGTTAAACAGAGTTCTTGT
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AGGAATCTTGGCCAATTCCTGGTAGAGTTAAGGGTAAAAGATGGTGGTCTCATACCAGAT
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TTTTTCCCCTCTCTCTCTCCTGTCTTCTTTTTTTTTTCCTCCTCTCTCTCACTGACTCTC
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TTCCATATCTGTGATGATAGTGCCTAAAAGTAGCAGAGTTCCTTCTGGCCATGTGACATA
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GTTTAAGGGGGCATAGAACCAAATTGTCTTTTTGCTTCTTGGTAATAATCTCATTCTCCA
ACCTCCCCCCTGGGCCACCTCTAATGCATCCACAGAAACAGTGACCAAGACCAGTACATA
TCTGCAACCTCATTATGTATATGTAAAATATAATTAATTGAATTCAATATTCCACACAGT
CTGGAGATAATTTTTGATAGCTCCACACTGAGTAGGAGAGAGAGATTCTATTTACTCCCA
GCGACTATGCCTTATGATGGCTGGATCTTAAATCCCAGATGGATCAAGCTTGATATCTTC
ATAGTCTC
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