SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002438_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesSorex araneus (Shrew)
Transcript IDSPT00002438
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002345_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002438_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Shrew (Sorex araneus) # Full length # Forward
AAGCTGATTGTCTGTCAGATGAGCTCGACACGCTGTCCACGTGAATTGGTGCTGCTACCT
CTTTCTTGGTATCACAGAGTCCACATAGGGGTCCCATCCCACACCGAGAGCCTCCTGCTG
TACGCGCTAACAGCCGCCTTCACCCTGGCCCACATCCACTATGGAGTGCGAGTGGTGAGT
GAACCCGAACAAATTGAATCCCACTGGAGTTTTATAAATGTTGGAAATGAGATGAGGGAG
GCCTGCAAGGAAGCTGCTCCGTGTAGATTGAGCACAGTCAGAACCTAGCCAGAAGCACGT
AGGGACATTCTTAAATTCTGAGTCTTTTACTCATGCTGTATAATTTTAGATATTGCTTCT
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GGTGTTTGCCTTGCACGCAGCAGACCCGGGTTCAATTCCCAGCATCCCCATATGTTCTCC
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GGGTGTGACCCAAAAAGCAAAAAACAAAAACAAAAACAAAACAAAACATGGTTTTGTTTT
GGGGGCATTGAGGTAGTGTAGAGAGGCATTGAGGTAGTGTAGAGAGGCTCAGAGAGGTGA
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GTGACCCCTTGTACGGCTCCCCAAAAAGGAACATCAACAACAAAAAAGTAGAGGTGGGGA
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TGTTTTTACTGCTCATGAGAATAATTAGGAAAGAAATTAAATTTATTCCTTCAGTACTTC
CTGCCTTCCTGCTTGCCGAAATCTAATAATGTGGTAAGCAGGTTAGAACTAAAGAAATAC
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TTACTTAATTAAGCCTGACCTACTTATTTTAATCATCTGAGTTGTTTGCAGCTTTCCACC
TTTATAAATAATGTTTGAAGTGAACAATCAGAAGCAAAAGTTTTTTCCATTTGGTTTATT
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CTTAAACTACTTGTACTCGATAGATTGTTTTGAAAGAGACCTGCTGTGAGCCGGTTGGAC
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CTGCTTCCCTGAACACTGCTAGGAGTGACCCCTTAGCGCAGAGCCAGGTGTAGCTAGGTG
TGGCTTCATGACCCTGGGTGTGGCCTCCAAATCAAAAGCCACCCCCCACCAAAAAAAAAA
AACAACCCTCCTAAAAAGTAAAATGAACTTAGGCTTCCTCCTTAGTGGCTCTCCCCAAAC
CCCCATGTTCAATAAAACTTCTAGATGAGTTGATATTGGTGTGGGGGGTTCCCCGGCAGT
GCCGGGGGGTCACCAGGGCCACACGCAGTGGTGCTAAGGGAGGCTGTGTGGTGCCGGGGA
TCAAAACTGGGCACGGCAGGCATGAGCTGTGGTCCATTGAGCTCTACCCAGCCCAACATG
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TAGGGGTTACTCCTGGCTCTGCACTCAGAAATTACTCTGGGGAAATTGCTCAGGGGACCA
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CAATTTATACAGGATAAAGACGTCAGAGGAAATCCTCTCTCCCAGCTTTCCCACTCGGGA
GCGTTCCCGCTATCTCTGCCTTACTCACTGGGGTGCCCTTTCATAGGACCGGCAGTAATC
CTGAGGTTTACTGACAAACATACAATTTCCTTTACTTTAATGTGATTGTTTTATAGATTG
TACCTTTTTCACGAATGTGGATATTTTCTATTATTTTCTATCTCTTTTTTACCTTATCTT
TAGTTTGGTGGTAGTAAATTTAACATGCCGGTTTCCTTTTTATTTTCCACTGAATGAAGT
TTGTGCTTGAATGAAGAGTGTATCTTAAACCCTTTATTTTGTTTTTTTGGACGGATTACA
CTTGGATATAATAGGCACCAT
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