SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002445_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U1 (SelU1)
SpeciesSorex araneus (Shrew)
Transcript IDSPT00002445
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002352_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002445_2.0 # Transcript # Selenoprotein U1 (SelU1) # Shrew (Sorex araneus) # Full length # Forward
GAAATGTCTTTTCTCCAGGATCCCAGTTTCTTCACCATGGGGATGTGGTCCATCGGTGCC
GGGGCCCTGGGGGCTGCTGCCTTGGCCCTGCTCCTGGCCAACACCGACGTGTTCCTGGCC
AAGCCTCAGAAAGCCACCCTGGAGTATCTGGAGGACATAGACCTGAAAACAATAGAGATG
AGTAAGTGGTGAGCCCCTCTGGGCCCGGTACTTTTCCAAGCTTCTGGACTCTGCAGGCTT
TTTTTTTTTTCTCCCTTCCAAAATAACTCTTTTACTGGGGGGTGTGGTGGGGAGGGTGGG
GGGAAGTATAACAGCATCAGGAAAATTTTAATAGCACTTTAAAAATTACTGATGATTCCT
TCACTGGGTAAACATTGTCATTTTTTTTATTTTTCGCACATCCCTCTTGATGCATGCATA
TTATCACGTAGTTGTGATTTTGGTGTACAGGGTGATTTTTTTCCTGTTTAGCATCTCATC
GGAAGCATTGTTCATTTTTCTGCTGTTGTCTCTTCTACCTATAATGATAGGTATTCTATT
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TTCTCTGCCCTCCCCCAGAGAATACTGTTGGTAATATATGGAGAGTCAAAAGTATTTTGT
AAGAACCTCTGTTGAGGGGCTGGGGAGATGTCGGAGGGCTGGAATGCACCCTTTGCACGC
CAGAGCCCTGGCTCTCTCCCTGTCAGCGCTGCACACTTCCCAGAGTGACCCCAGAACACT
GCTCCAGGAGTAGCCTTGGATCACTACTGGCTCTGTGTGCCCCACCCCGTCACCCAGTAA
TGCTCAGGGGTTACTCCTGGCTCTGCACTCAGGAATTACTCCTGGCAGTGCTCAGGGGAC
CATATAAGTTGTTAGGAATTGAGCCTGGATCGGCTGCATGCAAGACAAGTGCCCTCCCTG
CTGTACTATCTTTCTGGCCCCGCAATTATATTTTTGCAACAAAAACAATTATATTTTTGT
TGACTTAAATCTTTTTGACTTTTTTGGGGGCTTCCCAAGCTGCGCTGAGGGGCCGTGGAC
CTATCTCAGTGCTGCTTGGTCCAGCAGTATGACCCTGGCATTTGAGAACTTGGACCTGGT
GATGCAATTTTTCTTGGACCCAATGGTGCTATGAGCTACCAGGGCACCACGGCCAGCAGT
GGTCAGGGGCCACCAGCCACCTGTGGCTGGGGGGTGGGGCACACGATGCCCGGGGCTGAA
TGTGGAAAGCAAAGCGTGTAGTTCCTTGGAACTGTTACCTCTGGCCCCTGAAGATGGTTT
CAGGAGTTGGGGGTTGTGACCAAAGAACCACCTTCATGATTGTTACAGTGTTCATGAATA
ATCAGCAAAGTGATTTTTTCTTTTTTCCAGAAATGTTTGAGTTTGGAATGTTCATGTTTG
TTTGCAAGTTAGATTTATATTGAGGAGTGAGTGAGGTCGTCTTCGATATATATTAGGATC
CTTAATCCATATTGGTTTTACTCAGAAACACACACACACACACACACACAACACACACAA
CACGCATACAAAACAAAAACGTGTTTTGCCCTTTGCTCTTTGGCATTTCCATTGCGGCGC
CGTGATTCACAGTGCCATTCACGGTGGACTTTCTTGCAGGTTGAGTTCTCTTCGATTTTT
CTCACCTGTGAAACACCTTCACGTCTCTCCCTGGCCTGGTGCCATTTCTGAGCTGCTGAG
GGCTGGGCTGGGCTGGGCAGAGATAACGGAGCTCCCTTTGCTTCTCCGCAGCACCAAAGA
CTTTCAAAGCGAAGGAGCTCTGGTCGAAGAGCGGAGCCGTGATCATGGCTGTGCGGAGGC
CCGGCTGCTTCCTCTGCCGAGAGGTGAGTACCCCCGAGGGTCTGGCAGAGCAGAGTCCTG
GCAGGTGGGGCCCTCTCCTCACAGGGACCAGAGACGGGTAGGCCCATGTTAGCCTTTGAT
CAGTAGTGGTCCATTCGCTGTTGTTTGGTCTGGGCTTTTTCTTTGGATCCATTCTGGATC
CCTCTTTATTTAACAGTTCCACGTATCCTGGGCCGAGCAGGGCACCTGACTTCCTTTGGG
TACTCCCAAGCCCATTCACTCTTCTGTTGGCATCCTGGATGGTCTTTCTAGTGTTTTGAT
TTAGGAACATACCCACAATGCTCAGGGTATACTCCTGGCTCTGTGCTCAGGGATCACTCT
TGGTGAGCTCGGGAACCCAGGTGCTGGGGATCATCGCACCCAGATCAGCTGCATGCAAGA
CAAATACCCTATCCACTATACTGTCACTCCAGCCCACAGCCCTCCCCCTTGCTCACGGAC
AGGGCTCAGTCCAGTTCTGTGTTCGTGATGGCCAGCACAAGAATTGGCTTATTGAACGGG
AGTGCCTGGCTGTTCTGAAACGGGCCTGGCCAGCCCTACCTGGGGTTCAGCTGCGGCACC
TACCAAGGCGCACAGTTGCCATCTCAGAAGGGACCCGCCTGTCTACCTCTTGAGGACCTA
CGTGGAGCCCTTGGCAGAGTGCAGAAAGCCACCCATGTGAGCACTGTGGCCTCACTGTGA
ACGCGTGTCCGTGGGTCAGTAACCCAGTGTAGTCGGCCAGGCTGGTGGTGGTAGTAGCAA
GGGGGTTGGTCAGAATTAAAGTGATCGCCAGCTTGGCCCCTCAGAGGGAAGCCAAGGTAT
TGGCTTCCACCTCGTTGCCTTAAAGACAGGCAAGCTAGGGTAGGCACAGTTATGTGGTCT
GTCCGTGTCTAGGCAGGTGGCAGTGGCCGAAGTCCCAGGTTCTGAGGACATTGCATCTGG
CGGGGAGCTGGTAGCATGCGCTGCCACTCGAGGTTTTACTTCTGGGCCATGCCCACCAGT
GCTGACGTTTCACTCCCGGCTCTGTGCTCAGGGATCACTCCTGGCAGGACTCAGTGAACC
GAAGGCTGTGCCAGGGATTGAGCTGGGGTCAGCCACAGGCAGGGCAAGCTCCGGAACCCC
GGTACCATCTCGACAGCCCATAGGCCTTTTCTATTTGTAAGACCAGCAGTGGTTGGCCAA
CTTTTTCTCCTCGTTGAGTCACTACGACAGACTCTTCTGCGTTTCTCTGTCACGTTCATA
TGGACCCTTACAATTCTAGTTAGGAACCACCCTGATAAATCCAGAATAATCTCCTCTAAG
CGCAGATGAGTAGCAACCTCAACTGAACCTGGCCTTAATTTCCCCCTTGCTGTGTAGCAG
AACTTCCTCGCGAGTTTTTGAATGCCACATGTGGGGTGTTTTTAGAGGGTGTCAGACCTC
CCGAGGAGGCCAGACCCACGGCCTTCGATTTCCAGCATTTCCAAACACCCACCTAGAAGC
CTGTTGTGACTTGATTTCCCAAGGTCGTTTCCCAGAACGGCCCAAGAGCCAGTTTCCAGT
GCCCTGGTCTCTGCCCTGGCAGAGTGCTATGTGGAAACTTGCAAGCGTGGCTGGATGATG
GCAGTCAAGAGTTATTTTGAGTGGCCCAGTATGTGACTCAGTTTCCACTTGAGGGCTTTG
TGCCCTGACACACCCAGAGAGTAAAGAGCCCGGGAAAAGTGAGTAAAACCTTTCAGAGAA
GTTAGTGAGGAGCCAAGGCTGCGGCTCCACGGAGGTATGCACGCCTTGCACGCGCGGGGC
CTGGGTTCCCTCCCTGATGCGCTCCTGCATACGCGTCAGACCAGGAGCCTTTCCCACTCT
AGGTTGCTGCTCAGCGCCAGCCTTGATAAGTGCCTTATCGTGGGTTCTGCTCAGTCCAGT
CCTTTGCAGTGGAGCTGCCACCCTGTGGCAGTGTGTTTGTATTGTGACGGGTGGGCTGCA
TTTGCACAGATTTCTTGCTCTTTTGTTTTTATTTTTTTCCCCCCCCTTTTCATTCTGACA
CTCCTGGGAATAAGGATTTTCATCTCTAACAGCAGGGCTTTCCCTCGTCCGTGCGGTGCA
CAATCCTGAGAGTCGTGTGTGTCCACACTGGCGAGCTTGGCCGCCCCCTCTCTGTTGCTG
AACTTCGCCTTCAGACCTTCCCGCCTGGTGCCTGTAACTCAGCCGCATGCCTCACCCCAA
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CCCTCCCCGCGCCCCTCCCCCCAGCCCCGGAAGCCATCCATGCACACTGCTCATCCAGGA
CCTGTCTTTCTCTCACAGAAAAAGTTCTTCGGTCCTCAGAAGCGCAAGATGATGCTGATG
GGATTTGTCCGCCTCGGTGTCTGGTCTAACTTCTTCCGGGCCCGGAAGGGAGGCTTCTCT
GGAAACCTGGAAGGGGAAGGCTTCATCCTTGGGGGAGTCTATGTGGTGGGAGCAGGAAAT
CAG
Chart Advanced