SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002475_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesSus scrofa (Pig)
Transcript IDSPT00002475
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002382_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002475_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Pig (Sus scrofa) # Full length # Forward
CCCTCCTGTGTTGCAGTCGGGGCTGTACCCGTCCTCTCCAAAGACTCCGTGTCAGGGAAG
AAGGGACACCGCTTTGGCCAGGTGAAGACCCCGCACAACCCCTTAGACTCCAGCGCCCCC
CTGATGAAGAAGGGAAAGCAGAGGGAGGTCCCCAAGGCCAAGAAGCCAACCTCACTGAAG
AAGGTGTGTAGTGGTTTTTGTTTGAAATTGGGTTCAGAAAATCTACAGCTTCTCCTGTAT
CTGTGTTACTCCTGTCAACTCTTAGGTTTTTAGATTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGGGGG
CTGTGCCTGCAGCATATGGAAGGTTTCCAGGCTGGGGGTTTAATTGGAGCTGTAGCTCCA
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GCAGCTTACGGTGACACTGGATCCTTAACCCACTGAGCAAGGCCAGGGCTTGAACCCACA
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AAAAAATTACGGGTTAAGTAAGCTCTTTATTGAATTAGACATTCAGAACAGTATGTACAT
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AAAAAAAAACTTACTGATAGGAACTTCAGTTTAAATTTCAAAATTAAAAAAGAGATTTGG
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TCCGATTCGACCCCTGGCCTGGGAACCTCCATATGCCGCGGGAGCGGCCCAAGAAATAGC
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GTGGTTGTTCCCTTGGTGGGGGGGTGCTCAGAGGGTGGGAGGCCTCCCTGGCATACAGGG
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TCTTGTGAGGGGTCGGATGCCGCATCTTACCTGAGGTGTGCTGGGAGCGGCGCCCTAGAG
TGTCACAGCCAGTGGAAAGCTGACTGTCTGATGTTTCTTTCAGTTACTGCAGCCAGATGC
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AAATCCAGTCTTGCGACCTCTGCCCCTTTGTTCACCCTCTTCTGGAGGCCTACGAGAACT
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ATAGTAGTGACATGAAGCTTCTTCCTCTCTCTCTGCACAGCCTCCCTTTCTAGGTGGTTT
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TGAGCTGCATTGAGGCCTAGGAATCTGGTGAAGACACAGATTCCAGAATTTCTTCCTGAG
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TCTAGATTTGGCTACTGTGTCAGGAAAGCAGTACATGCTTCCAGCGTCCTCTCCCAGGCA
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TGTTAGCTCCTTAGAGATGAGCACCCAGGGTTTTGGGGGGCACTGGTTACATGGGCACCC
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TTCCTTCCCGTTCAGGTGTTGTGTGTTCCCTATGGGAGGTGGTCAGTTTGCAGAGCAGCA
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AGGGGGGCAGGACTCAGTGCTTGTTGCTTTCCTTGGGGGAGTAAGTCCCCAGATTCTTGC
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CCTTGTACTGCATTCTTGTGGTTTCATAGCAAGCTTTAATACCTGGCGATGCTAATCTGA
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CCACCTAGAGTAAGTTACAGTATAAAAGGTTTCAGGCTAACATAGGATTGACATGTGGGA
GTTCCCGTCATGGCACAACAGAAATGAATCTGACTAGGATCCATGAGGTTGTGGGTGGGA
TCCCTGGTCTCACTCACTGGGTTAAGGATCCAGTGTTGCTGTGAGCTGTGGTGTAGGTCA
CAGATTTGGCTTGGATTCTGTGGCTGTGGCTGTGGCATAGGCTGGTAGCTGCAGCTCCGA
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AAGAATTGACATGTGATCATCCTGGGTCATTCCATCCAAGAGCACAGGTGCATTTTGTTT
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GTACATTTATCCCCACCTGTCGAAGTCCTTGGTTGTAGAGGCGTTTCTTCTGTTCACATC
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TGCCTGGGTGTGATTCTCTTGTTGGTAGTAACTCGTCACTGTTGCTGGGTTCCTGGCATG
GCAGGCGTGTTACTCACACACAGAGCTCTTTCACCCTCTCTCTGTTCATGGTGCCACTGC
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GCAACTGCTCCCTAAGACTGCATTTCCCGCCCTGCACGGTGCCAGCTGTTGACTCTCCGT
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TGTCGCCAGCATGTGCACGTGATGCAGTTTCTTGTCATTTTCGTCGTCCTTTGACCAGGT
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CTGGCACTGCTCCCGGGACAGTCAGGAGACACAGTGCTTGTCCACCCTTCCCCAGCAGAG
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GTGGTTGGTTCCAAGTGTAGCTGTAAGCTCACTGCTGCCACAGGGGAGCTCTGGGCAGAC
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GGGACATCACCTCTGCTCTCGTTTCTGCCCAAGGACCAGTTCCACAAGATGGTGGAGCTG
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GCGGAGCCTGGGGCCCAGGGTGCTGCCAGCCCGCCTGCACAGGGCCCCAGCGGCCCTGAG
GAGGACGGCCCCCCGGGCCCTGCCGGGAAAGAGGAGCCACACTACAGTGAGTGCCAGGGG
CGTGGAGCCGGGGCTGAGCATCCTCTGGGTCTCCTCAACTCTGATCACAGAGTCAGGGTG
CCCAGGAGGGTGGCATGACTGCTGTAACAGGACTGGCTGCAGGAGGTCCTGTCCAATCCC
GGCCCTTTCCTAAGAGGTGGTCCCAGGCTTGGGAGGGCTGGTCAGTGGGTGTCTTAGACA
GACGTTGGGTCAGGTGGCCCCAGAACAGAGAGTGGCCCGGAGGACAGCTGTACTCCGGTG
GGCGGTCGTCAAGCTGGTGCTTGCATAGGTGTTCGATGCTGCTCACGAGGGGTTGAAGTC
GGGGGCTCGCGGTTGAGACCCGGCCGGGCCCCATCTAGAGGTCTGCCAGGCAGGCTGTGA
GCTGCATGCTTTTCTGAGAGTCTCCCGGCTGTCCCTGCGTGTCCCTCAGCTGTGTGCTGT
CTTGTTTGCAGTTGAAATCTGGAGAAACCATCTGGAAGCATACAGTCGATGTGCCCAGGA
GCTGGAGGAATCGCTGGAGGTGTCAACCTCTCAGATGATGAACTTGAATTTA
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