SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002485_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesSus scrofa (Pig)
Transcript IDSPT00002485
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002392_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002485_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Pig (Sus scrofa) # Full length # Reverse
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TCATTCAAGCACAAACTTCATTCAGTAGAAAGAAAGAAGAAAATCAGCCAGTAAATTTCA
CCACCACCAAATTAAATGAAGACAAAATGAAAAAGAAATAGAAGAAAATATCCACAACCA
TGAAAAGGTATGATCATAAAACAATAAGTCAAAGAGATTTTTATGTCTGTCAGTAAACCT
CAAAAATTACCCCAAGTCATATTAAGGGAACACATACTCAGTAAGGCATATATTATTAAA
ATTTTTCTTCTAGTGGGGAAGTGAGCAAGTTGGGGAAAAGAGAAAGGAAGGAAGGAAAGA
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CAAAGAGAGCCAGAATACTAGAGACTCTAAATATAGACATATATATTAGCTCTCTTAGCA
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TTCTTTCTGTAGATTACAGGCCAATATTCTTTTCTTCCATTCCTAGTCAATCCGAGTTTG
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TTTTTCTGGACTAGGATAGCTATAGAGCTAGATAGCTAAATCACTTCTAGAACGTAAACC
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ATAAAAAGTTGTTATCAAGCACGACAGGTGCCATTTTAAAAACATGTACGACAATGCAGA
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GTCACTCCAACATTTAAAGCATTCAAGTGCTTGAGCCAAGATATTTACATTACATCATTA
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ACAGAAGGCATTCTTCTACTGGGCTAAGTTAGTTTGGATAAAGATTTCTCCAACTTTAAG
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GCAAGGCATTCATGTTTTCAGATCTTTAAATCCTATCAATCAGTATGACTTGAGACAGTG
AATGTGTGTTCCAGACATGGAAATGTAAACTAGTGGTTAAGGTGAAAATAAAAACTTATT
AAGGGCCTGGCCTGAGCAGGAGCACAGGCTTCTTGGCTGCCAGGACTCCCGGGGTCTTTT
CTCAAACCCTCCCCATCTTTCCCTTCTGCCCTCTTGCTGGGCCACAGCAGAGAGGGGGAT
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CCCCTTTTAAGCTCCCTAATCATCAGATCTACAGCCATTTCAACCACACTATTAAGAATA
TTTAGAGCCTGAAGGGAATTATCCCATGACTTCTTTAAGAGGCAACCAAAACAAAACATT
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CAGGTTAGGAACCCAACACAGTATCCATGAGGTTATGGGTTCAATCCTTGGCCTCTCTCA
TTGGGTTAAGGATCTGGCCGTGCCTGCAAGCTGTGGCATAGGTCACAGATGCGGCTCAGA
TCCAGTATTGCTGGGGTGTAGGCCTGTAGCTGCAGCTCCAATTTGACCCCTAGCTCAGGA
ATTTCCATATGCCACAGGTGTGGATGAATAAAGAAAAATACTGCAAATCCAATTGGCTTC
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TTCTAATGTAAAATCTTTAAATTAAAATCTGCTTAGGCGTTCTCCTGTCACTCAGTGGGT
TAAGGATCCAGCACTGTCACTGCAGTGGCCCAGGTTGCTGCTGTGGCGTGGGTTTGATCC
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ATTTTTAAAAGAAAAACTCTTACTGTGATGTTGGCAAAGGCTGTTCCAACCATAAAGTAG
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AAAACGAAGAGCAAACATGGAGAAAAGAAGGGAACCATAGCTTCATAGACTGAATTGTGT
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TTCACACTTATCCCCTTATTTTTTTACTCCAAATAATCCCATGGCATAGGTAGAACCAAC
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TGCTACCCAGTGGCAGGGCCAGGACTAAAATGGAAGTCTTCAGACCGCTGGTCTCATGCC
CACCCCCACCCCCAGAATGTAAAGATGAATAAAACTGGGTCTTTGTTCCGGGATTATATT
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CTCTGAGCACACGGGCGGCGCTCTCCTACACGTCTGCTCATTTGAACAGGGCCCCCAATC
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AAGAACTGAGGAGAGAAAGTGGAAAAGACATGCAGGTCACATAGGTAAATTCAGTGTGGC
TGAGGCCAAATGCAAAGTGGATAAATCAGAGAAGGGAAACTCCGCTGGGGTGACTCGCCT
CCCAAGCCCTCCCTGACGCCTCGGGGGGCCTTTCCACATGGTACTGAGCAGAGTCAGCAC
AGGTCCAGGATTTGGTTCGAAACTATGTTCAGAAATTTTATTTTACGATCATGCTAACTA
AAATTACATATGATCAATTTATAAAAACGTATAATCAAGTTAGGAAAAGAAGGTAAGCCT
ATCAATACTGGACAGGAACAGGCTTCCTCTTGCTTGAGGCACAAAAAATTAACAAACTAG
CAAACTGTTTGGTGAGCTCCAAACTGTTACAAAAGAACTCTTAGTGTGGGACTAGGATTG
AATTGACCATGCTAGCCCCCAGAGATAACCAAAATTATCCTTGTGCCAGACTCAAAATAT
AGGTTTCAGGACCTTTCCAAAATGTCCAGATTCCGAAAGGAAAAGAGTTCCTAAAATTCA
TCTCAGTAGCAATTTCTAAAGATTTTTCCCTATTTCTAGACTGCTAAAAAAATAAACTAC
TTACCTGAAAAAGTTTAATAAACTCATTGGAAGAGTCACGCATAATGCACAACCTAAAGG
GAAGAATATTTAAATGATTATGAATTATTATTCAAGAGTGATTTTTATAATAATAGAATA
GATACAAAACATGTAATATTTTTAGACCAATAATTTTCAGATTCAGGTTTACTTCTGCAA
TGAAATTAAATACACTTTTTAAACAGCATTTACAACTGGAAGAGTAGCAGAACAGTTTGA
TGATGCAGAGCAGAGACAAGGAACCAAAGTGGGCATGAACCTCAGCTGTGCCACCAACTG
GTTATGTGACTTCAGGCAAATTAACTTCTCAATGCATCAGTTTCCTCTTTTGTAAGACAG
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TCCCCCTACCCTATACACTAGTTCTTTTCCCCTCAATCCAAAAAACAAGAATGGCCTTCC
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TCACTCACCAAACTTTTCTGTTGTCTTTAATTCCTCAGTACTCTTACTCATTCTGCCGCC
CCTCTGCAGAAACTGTACTCTTGAAGTATATCAAGCTCTCCTACTAATCAAATTCAGCAT
CCTGGAGTTCCCGTCGTGGCACAGTGGTTAACGAATCCGACTAGGAACCATGAGGTTGCG
GGTTCAATCCCTGGCCTCACTCAGTGGGTTAAGGATCCAGCATTGCCGTGAGCTGTGGTG
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CAGCTCCGATTAGACCCCTAGCTTGGGAACCTCCATATGCTGTGAGTGAGAAAAAAAAGA
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TGCTGCCTATCCCCTAACTGCAATTTTTTCCTCCCCTGGCCTTCATGATTCCATTCTCCC
GGTGTTCCTGCTAGCCATCCAACCACTACATCTGGAGCCCTTCATTGGCAATCTACCTCC
TGCATATTCCTTGAGCATCTGTTCTCCCTCACAGAACCTTCTCTTAAAGCTTTAACCATA
GCTACCTGCACAGGACTCCAAAATCTAGTTATGTACCCTTGGAAATCAGACAATCTCTCT
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TGTCACTCAACATATTAGCCCATTCCAGACTCCTGGTGACCAAACTTGGCTTGGGGGTGG
GGGGTGTCAATGCAGCTATAACCTTAAGGATCAAAGATAGGAGAAGAGCATTCCTTCCAA
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ATTCATAGCAACAGAAATACAAATTAAAACTATACGGATATATATAGTTTCTTAGCTATC
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TGGGAATATTTAGAGAAACTGCATATATCTGTCCTTTACTAAAAATTCTACTTTTAGAGA
TCTCTTCCAAAATACCCTGGCAAAAATCATGAAAAGATATACACATATGTACAAGACAAT
TTACTGCCGTAATCTGTGTGACAGCAAAAGACTAGAAATAACCCAAATGTCCATCAGTAG
AAGGCTAGTTGACTGTGGATATGGTACATCCGCACAACCAAATACCAGGGAGCTAGAAGA
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AAAAAAGGGTGATAAAAATCATACACACACACACTTTTACTTATATTAAAAAACAATAGG
AGTTCCCGTCTTGGCACAGTGGTTAACGAATCCGACTAGGAACCATGAGGTTGTGGGTTC
GGTCCCTGCCCTTGCTCAGTGGGTTAACGATCCGGCGTTGCCGTGAGCTGTGGTGTAGGT
TGCAGAAGCGGCTCGGATCCTGCATTGCTGTGGCTCTGGTGTAGGCCGGTGGCTACAGAT
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TCTGTATCATCAAATTGGATTTGGAATGATCAGTATGAACTTATGAGGTATTTTATCAAA
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AATTTATAAATTACAAAGAAAACTATATGCCTATTAAAATACCCACATGACATTCAAAAA
CCTACCTCATATATCAGAGATTCCGTTTTAACATGTTCAATTAACATTTAACGATAAAAT
GCAGCAAACCTGCCACAGGACAAGCTATATAAATCAAGATTTCACTCATGGTAGGAGATG
AAAAATAGCTAGCTTTATCAAAGTGAAGAAATCACAGTTCATATAGGGACCCCCAAAAAT
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TTTTAGGTAAGGGAATGGAGCAACAGCCAGCGAGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGTCTACAA
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TTCTATTTGCTAGAGGGTGTGGGGGAGGAGGGAAGGGTGCTGTTGCTTGTTATAGTCAAA
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AATCATTGTAGTGATAGGTCTCTATATAAGAAATTAAACAGGAAAGGTTCATACCAGGCC
TCAACTCCCACAACTGCAGTCACTATGTAGACAATAGAAATAGTCTGGAAGGAAAACGCA
GACAAAAGCATACGGAGCATTAACGGCAGGAAAGATCAGGGCGTCAATAACGCTTTCTGC
GGTCTAACATACAGCTTTAGTAAAAGCAAGCAGTATGCTTAAAGTCTAAATCTGTGGCAA
GTCTTCTTGCCATTAAGATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTAGCCAGCAACA
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TGGGTTGATCCAATGAGCCCACTCAATTACTTTCTTCAAATACACCCCAACTTCTGACTC
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TATAAAATCAACAGTTCCAATGAATGTTTATTAAGAAACTGCCAGTTTTTTGGCATAATA
ATGTCACTGTGATTATGTACTTTAAAGAGAGCTCTTGCCATCTAGAGATACACAGTAAAA
TATTTATCATATAATGTCAGGATTTTCCTTTAAAATAACTGGGAGGATGGAGCTCCCACT
GTGGCTCAGTGGTTAACGAATCCGACTAGGAACCATGAGGTTGCAGGTTTGATCCCTGGC
CTTGCTTAGTGGGTTAAGGATCCGGCGTTGCCGTGAGCTGTGGTGTAGGTTGCAGATGTG
GTTCCGATCCTGCGTTGCTGTGGCTGTGGTGTAGGCCAGCGGCTACACCTCCAATTAGAT
CCCTAGCCTGGGAACCTCCATGTGCCGCGGGTGCGGCCCTAGAAAAGGCAAAAAAGAAAA
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CACTAGATTGGCCATGTGTTAACTGCTGAAGCTAAGTAATAGGTACATAAGGGTTCACTA
TATTATTCTCTCTGCTTTTGTACCTATTTAAAATTGCCCATAAATAACGGAGAAATAATA
TAAAAGAAAAAAGAAAAAAATTTAAAGCACCCATCAGTTCTAACCAAAAAAGCATAAGGT
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AAGAACACATACTTACCACCTGGCTAACGTCATATCCCCATGGCAGGAAAAGAATCCCTG
TGTTATACTTTTCCCAGTGGGACAGGATGAAAGAAAATAAAACTACCCATAGCAGGAGAT
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TGGAATTGGTTCTACGGGCTTGCTTTCCATCCACACCATCTGCAACAAAAACACATTACC
ATAAGAAAAGGTCACTCTCTACACCCGCATGCACAAAGTCTTCTGCAAAAAAATGGACAA
GAACAAAACAGAACATATCAGCGTATCATAGGAATCTTAATTAACTAAAGTATAATTAGC
AGCCAGTACTACAAAAATCCCATCTTTCATTCCTACAATGCAAAGTGCTCAGAAACAAAA
TCCATAGTTTCTCAGTTTAATCTAAAAATTAAAATATGTTAAATCACACTGGGAGCTCCT
GTTGCGGCACAGTGGAAACGAATCCGACTAGGAACCATGAGGTTGTAGGCTCGATCCCTG
GCCTCGCTCAGTGGGTGGAGGATCCAGCATTGCCGTGAACTGTGGTGTAGGTCACAGACA
TGGCTCAGATCTGGCATTGCTGTGGCTGTGGTGTAGGTCGGCAGCTGTAGCTCCAAATCA
ATCCCTAGCCTGGGAACCTCCATATGCCACAGGTATGGCCCTAAAAAGCAAAAAAAAAAA
AAAAAAAACACACTGAATGGTGTCAATTTCAGATGTGAGAAAGAAGCATTCCAGCTGGGC
TTTGAATTCCTCCAAATCTGCTTAAAAACTGAGTTGTCCCACTAGCCACAAATTCTTAAG
CCTCCAGAGAATGTTCAACAGTTGTTTTATAATTTATCTGACCACTCTTTGCTCTAGGAT
CCAAAAACACTCTGTACATCCGTGATAACACCTGTTTCATCTTGTTTGTCATCAGCCTCT
TTACAGACGGACCACCTTATTAATTTTAAGTGCTTTCAAAAAAAGCTTTGGACATAGTAG
GTGTTGAGTAACTATGAGAATTAAATGAAATGAAACTGTGCCATGCACTATTCTTGATGC
CGTGAAGATTACAAACATCTTAGAATAAATTAAGTTTGTGCCCTCATAGAGTGTCTACAA
CTGGGGAAGGAGGCAACACATGACAATTACATAAAGTGTATCCCAAACCACAGAAGAGCA
CAGAAAGGGACAAGTTCTCTTCAGACTAAGATATGCTACACGGGTTTCCAGACAAGATGA
AATCTGAGTAGGGACGCAAAGAATGAGTTGGATTTCAGTAGATGGGAGATAAAGGGAGTA
CGTCATTTCAACAGAAGGAATGGCTTTCAGCAAAAACACTGAGATGGAAAAGCACATGCA
TGTTCAGAGAAAGCCACGCACATAGTTTAACTCAGCGAGAAACTGGTATGCGAAGAGGGC
AGTAGAGGTCTGAACCAGTTTAAGAACATTAGGGAGTATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTG
CCATTTCTTGGGCCGTTCCCGTGGCAATATGGAGGTTCCCAGGCTAGGGGTCGAATCGGA
GCTGTAGCCGCCGGCCTACGCCAGAGCCACAGCAACGCGGGATCCGAGCCGTGTCTGCAA
CCTACACCACAGCTCACGGCAACGCCAGATCCTTAACCCACTGAGCAAGGGCAGGGACCG
AACCCGCAACCTCATGGTTCCTAGTCGAATTCGTTAACCACTGAGCCATGACAGGAACTC
CAAGAGTATTAGGGAGTATGAAGAGCTCCTGAAACTATCTGAGCGGGGGAATAAGAAGAG
CAAAAGCAGTGAAGTGCCTCAGGAAGACCCACCCGACGTCAGTGTGAAGGACAGGCTGGG
AGAGGACCCAGACTCAGTAGGCCTAAACAGAGACAGAATGCAGTGGGAATGAAAAGCTGG
AAGCAGGGGAGGCATGAAGAAAATAAAAATGACAATGCAACGAAAGATGAGAGGGGAGGC
CCAAAGGACAAAAAGACCATCTCCACAATTTCCCGTGTGGGTAACCGAGAGGGTGGCAGT
GTTACTAGAAATGAGAAAGTCTGAAGAAGGCACAAGACTGAGAGAAAGGATGCTGAGTAC
AACGTTAGATGCTGAAAGGAAGGGTTGGGAGGATGTCCACCTGGTAACGTCAAGCAAGTC
AACCTAAGCGTACTTACTAGAAACTCAGAAGACAGGTCGCGGCTAGATGTTATCACGGGA
GCCAACTCAAGAGTGTTAAGGATCCAGATTAGCAAGGGAATAAGGAAGGAGATCGAGAAA
GAGAAAGAGCACCTTCATTTGGGAGTAGGAACTGGGGGAAGGGGGTGAGCAAAGTGGAGG
AGGGGAGAAGAGAAAGAAGGGGGGAACATGAGAAGGGAAAAACGGGAAGAGGGAGAGGAA
ATGGTACAACCTAGTTAAAAAGGAAGGAGAGTCTGAATTATAAAAATTCCTCCTCCAGGA
GTTCCCGTCGTGGCGCAGTGGTTAACCAATCCGACTAGGAACCATGAGGTTGCGGGTTTG
ATCCCTGGCCTCGCTTAGTGGGTTAAGGATCTGACGTTGCCGTGAGCTGTGGTGTAGGTC
AAAGATGCAGCTCAGATCCCGTGTTGCTGTGACTCTGGTGTAGGCCGATGGCGACAGTTC
CAATTAGACCCCTAGCCTGGGAACCTCCACATGCCAAGGGAGCGGCCCTAGAAAAAGCAA
AAAGACAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCCTCCTCCAAAGAAACAGTTTTGTAAA
TTAAGTGCATCGGAATTAGGCTAACTTTAAGGATTCGGATTCAAGGCATGAAAAATTCCT
TATAATTACTATGCTCATTTTGCTCACCACAGCACTATCCCCAGTGCTTAGCTCAGTCTG
TGGCAAAGAGGGCTGTTAAAAACATTTGTTGAAGGAAACATGAGAGGATGAATTTCAAAC
TCTTGCCCAAATACTTCAGATCTCTGTTATTAAATGGGGAACCTTTCTGGCTGTGGAGAA
AAAGGAACCCTAGTACACTGTTGGTGGGATTGTAAATTGGTGCAACCACTGTGGAAAGCA
GTATGGAGATTCCTCAGAAAACTAAACATAGAACTACCATTTGATCCAGAAATCCCACTC
CTGGGCATCTATCCAGAGAAAACCACAACTCGTAAAAACACATGTACTCCGATGTTCACT
GCAGCACTATTTACAATAGTCAAGACATGAAACAAGCTAAATGTCCATCGACAGAGGAGT
GGATCAAGAAGATGTGGTACATATACACAATGGAATATTACTCAGCCATTAAAAAGAACG
AAATACCGGCATTTTTAGCAACATGGATGGACCTAGAAACTATCATGCTGAGTGAAGTCA
GCCATACAATGAGACACCAACATCATATGCTATCAACTTACAGGTGGAATCTGAAAAAAG
GACAGACTGAACTTCTTTGCAGAACAGATGGTGACTCACAGACATTGAAAAATTTATGGT
CTCCAGAGGAGACAGTTTGCGGGGTGGGGGGATATGCTTGGGCTGTGGGATGGGAATCCT
GTGAAATCAGACTGTTATGATCATTATGCAACTACAGATGTGATAAATTCATTTGAGTAA
TAAAATAATTTAAAAAAAAAAAAGATGGGGAACTTTTCCACCCCTAAGCAGCTAAAATAG
TTCCTAAACGTCTTTTCTCATTATTTGCTGGCTTAATTTCCCATTCTCAGTGCAACGTGT
GTGCAGCTATTACAAATTCTGAATTCTTTCCTGTCATGGCTCAGTGGTTAATGAACCCAA
CTAGTATCCATGAGGACTTGGGTTCAATCCCTGGCCTTGTTCAGTGGGTTAAGGATCTGG
CGTTGCAAGAGCTGTGGTGTAGGTCGCAGACACGGCTAGGATCTCACATTGCTGTAGTTC
CAATTCGACCCCTAGGCTGGGAACCTCCATATGCTGCGAATGTGGCCCTAAAAAGCCAAA
AGACAAAAAAAAAAAAAAAGTAAGAACAGTCACACTAGCAGAATAAATGAAGATTATAAA
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GTGAGCTTTGGCGTAGGTCGCTGACATGGCTCGGATCCAGCATTGCTGTGGCTGTGGTGT
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GCAGCCCTAAAAAGACAAAAGACAAAAAAAAAAAAAGTACCAGTTCAAGAAGTTCCCACT
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CTCGGATCTGATCCCTGGCCCCCGGGAACTCCATATGCTGCTGAGTGGCCCAAAGGGAAA
AAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACCCACTCAAGATGTTTCTTTCAGGAGTTCCCC
TTGTGGCTCAGTGGTAACAAACCCGACTGAAAAAAAAAAAAAAAAAGATATTTTGGGAGT
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CCTGGTCTCACTCAGTGGATTAAGGATCCAGAGTTGCTGTGAGCTGTGGTGTAGGTCGCA
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CTGTCTCTGCCAACTGCAAAAATAATTCTTTCTATGAGACATTTGTAAATCTATATCTAA
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TGAAGTTTTCTTTGTTTTAACTCCATGTCGGAGTTCCTGCTGTGGAGCAACAGGATCAGC
GGCGTCTTGGGAGCGCTGGGTGGCAGGTTCGATCCCCGGCCAGGCACACTGGGTTAGGGA
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