SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002503_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesSus scrofa (Pig)
Transcript IDSPT00002503
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002410_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002503_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Pig (Sus scrofa) # Full length # Forward
TCGCCGGGGCCGGGGAGGGGCGCCACTCCCAACCGCCGGCTGGGCAATGTCCGTGGCGTG
TCCGTGCCGTCGCCACCCGGACGCCGGGCCCGCCTCTCCGCCCCTGGGACCAGCCGCTCG
TCCTCCGCGGCCCGCGAGGAGCTGCGGCGCCGCCTGCTGGGCCTCATCGAGGGCCATCGA
GTGGTCATCTTCAGCAAGAGCTACTGTCCGCACAGCACGCGGGTAGGCAGGCAGGGGCTT
CTGGGCCTGCTGGTCCGTCCGCCTCCGCGGCCTCCAACCCCCGGACCCGGTCCGTTCTCC
GCCCGCGCCCCTAGACACCCCCCCCGCCCCGTGTTCGTCCGCTCAGCTCTCGCGTGGAGC
CCGTCCCGGGGGCGACACCGGCCCCGCCGGCTGCTCTCCTGGCTTCCGCCTCGGGTCGGG
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CTCCTCCCCGCCCCCAGGGTAACCTCTAGCCAGAATTCCTTGCTTTTCTTTAGGGTTTTG
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GCACATGTCTTGAAGCTGAGTTGCTAGGCCACAGAGGATGCATGATTTCTGCCTTAACTA
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GTAGAAAAACTCAGATAACATGAAGTTTACTGTTATAACCATTTTCTGATTAGTGGCATT
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TTTCCCAACTGAAACTGTCCCCGTTAAACAGTAACTCCCCTCCCCCAGCCCCTGGCAGCC
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ATACAGTACTTGCCCTTTTCTGATTGGCTACTTTCATTTAGTCTAGTGTGCCCAAGGTTC
ATCTGTGTTGTATTCTGTGTCAGAATTTCTTTCCTTTTTAAGGGTAAATAATATTGCATT
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TTGGCTTTTGTGAATATTGCTGCTGTGAATGTGGGTTTGCAATATCTGTTTGTGTCTCTG
TTTTCACTTCTTTTGGTGTAGACCCAGAGGTGGAATTGCTAACTCATATAGTATTTCTAT
ATATTTCTAATTTTTTGAGGAATCCCCACACTGTTTCCCAGAGCAGCCACACTTGTTTTA
TATTCCCACTAACAGTGCACAAATGTTCCAATTTCTCCACATCCTTGTCAGCACTTGTTA
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TGTGCTTGTTGTCCCTTTATTAATGCACAGTATCTTTTTTCATTTTTTAAAATTTTATTG
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TTTTGGTGTGTGCACAATGTTAAGTAAGGGTCCAGCATTATTCATTTGCATATGGACATC
CAGTTTTCTCAGCACCATTTATTGCAAAGACTTTCCTTTTCCCATCAAATGGTCTTGGCA
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TGTAGCAATGTTTTGAAATCAGGACATGTGAGACCTCCAACTTGATTCTTCTTTTTTCAA
GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTATCCAGGTTTCCTTTGGAATTCCATATGAATT
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TTGTAGTTTTCAGTGCACAAATCTTTGCCTCCTTGGTTAAATTTATTCCTGAGTGTTCTT
CTTTATGGTGTTTAAGTAGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTG
CTATTTCTTGGGCCGCTCCCGTGGCATGTGGAGGTTCCCAGGCTAGGGGTCGAATCGGAG
CTGTAGCCACCGGCCTACACCAGAGCCACAGCAATGCGGGATCCGAGCCACATCTGCAAC
CTACACCACAGCTCATGGCAATGCTGGATCGTTAACCCACTGAGCAACCTGCAGGGACCT
TATGGTTCCTAGTCGGATTCGTTAACCACTGTGCCACGACGGGAACTCCTAAGTGGAATT
CTTTTTTAAATTTCTTTTTTGGATTGTTCATTGTTAGTGTATAGGGAAACAACTGCTTTT
TTCGGGGGCCGGGGGGGGGGGCCACACCTGCGGCATGTGGAGGTTCCCAGTCTAGGGATC
GAATCGGAGCTATAGCTGCTGGCCACAGCCACAACCACAGCAACACAGGATCTGAGCCAT
GTCTGCAACCTACACCACAGCTCACAGCAACGCTAGATCCCCAACCCACTGAGCAAGGCC
AGGGATCCAACCCGCAACTTCATGGTTCCCAGTTGGATTCGTTTCTGCTGCACCATGATG
GGAACTCCAGCAACTGCTTTTTTAAGATTGAAATATAGTTGATTTACAGTGTTTTGGGTG
TACAGCAAAGTGATTCAGTTTTATATATACACACACACTCTTGTTCAGATTCTTTTACAT
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GTAGATAGGTTCATTTGTGCCGTATTTTACATTCCACATAAATGATGTCATAGGAAGTTT
GTCTTTGTCTTTCTGACTTACTTCACTTAGTATGATAATCTTGAGGTCCATCCATGTTGC
TGCAAATGGCATTATTTCAAACTTCTTTATGGCTAAGTAATATTCCATTGTGTGTGTCTG
TGTGTGTGTATATATATACATATATATATGCACGCACATATATACATATATATATGCACG
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TACATATATATATATATATATGTATATATATATCTTCTGTATCTGTTCATCTGTCAATGG
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TGGTACCTTGTTGTAGCTTACATTTGCATTTCTCTAATAATTAGTGGTGTTGAGCATTTT
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ATATTTTGGAACTTAAGCCCTTGTCAGTCACATTGTTTGCAAATATTTTCTCCCATTCTG
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GGGCTCTCTATTCTGTTCCATTGTTTTTGTGCCAGTACCATACTGTTTTGATTACTGTAG
CTTTGTAGTATTTTCTGAAGTCAGGGATCCTGATTGCTCCAGTTTCATTCTTCTTTCTCG
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TTAACAATATTGATTCTTCCAATTCAAGAACATGGTATATCTTTCCATCTGTTTGTGTCA
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TTAACTTCTCTTTCTGATATTTCATTGTTAGTGTACAGAAATGCAATAGATTTCTATATA
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GGATTTGTTAACCACTGAGCCACAACGGGAGCTCCCTATTTGCTAGATGTTTTTGCGGTT
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AACAGATTTCTTGGTTGATTTTTTTTTTCTTTCAGGACTTTAAATATATCATCCACACTC
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GTTGATTATTTCTGTCTCTTTTATGGCATTCTAATTTTGTTCATATGTCATTTTCCTGAT
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TTCTCAGTCCTTTTCTGGACAGTCATATTCCCTGGGCCTGTATGTGTGCTTTTCACTCAC
AGGCCTAATTCTCCTATATACTTGGCTGCTTTAAAGTATCTGAAACCCGGAGTTCCTGTC
GTGGCGCAGTGATTAACAAATCCAACTAGGAACCATGAGGTTGTGGGTTTGATCCCTGGC
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GCTTGGATCCAGCATTGCTGTGGCTCTGGCGTAGGCCGGTGGCTACAGCTCCGATTTGAC
CCCTAGCCTGGGAACCTCCCTATGCCGTGGGACACGGCCCTAGAAAAGGCAAAAAGACAA
AAAAAAAAAAAAAAGTGTCTTAAACCCCTTAAGACACACACACCCCTTCTTCTCAGGGCC
TCAGCTGTTAGATTGTGTTCCTCTGCCTGTGTGCTCTTGCCCCCAAGTGTCTTCAGATTT
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TCTTTCTTTATTGATATTTTCTACTGGATAAGGTATTACCATCAAACATTCCTTCATCTC
ATGAAGCATACTTCTCTTCAATTCCTCGTACATATTTACAGTGGCCATTTTACCAATTTG
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GATCCACTTTCCTATTTCTTTGTATGTCTGGTAATTTTTTTTGTTGGAACTGGGACATTT
TAGGTAATATATTATAACAAGTCCAGATTGGACCCCTTCTTCTCTAATGCTTGTTTGTTT
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TCAGGGGTCAAATCAGAGCTGCAGCTGAGACCTCTACCATAGCCACAGCAACACAAGATC
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GCAAGGCCAGGGATTAAACCTGCATCCTCATGGAGATGCCAGGTCCTTAACCTGCTGAGC
CAGAGTAGGAATTCCTCTTGTTTCTTTAGTGAGTTGTCTGGATTATTTGGGGAAGTTTTT
TGTACCTGAAGATGGAGGCTCTGACACTCCTCAGAGGTGCAGCCTTGGGTCTGCCCAGTC
TCTGGGGGTTGGCAGGTCTAGCAGGTCTCTGACTAGACAGACGTCTGTGCTCTGCTGTCT
GACACTGACAGACTCATGCCTGGATGTTAGGCAGCTTAGTTGCGCTGTTGTTTTTGACAA
TGCCCTGGGTATAAATGGTGCTATACCCTGATCCAAGTAAATCTGGGCCCCTTTGCAGCA
GAGTTTGGAGGCATTTGTGGTTTGCTCTGATGCTGGAGCGTTGTTCTGCCTGTCTCCCCT
GGTCCTGCTGAACCAGCTTCCTATAGTTTAGGCGGTCCCTGGGATGGAGCTATCAGTTAT
CAGCCTCCTAAGTGCTCAGTGCTGAAAACGCCTTTATTTTCAGTTGCACATTTAGACTTG
AACTTCCCCACAGTCCGTTTCAAATAAAGTCAGTTCCTCTGGGCAGAGTTTTGACATTCT
CCGATCTTGTGCTTTAACTCTTGCCCTGAGTGAGATCTCTGAGACCAGCTTCTCTTAGCA
GCACAAGCTTGCTTTATGAGCAGACTCTGGTGGTTGTGGCATTCTCTGGTCTTTCTGAAT
TGCTGTTCCCAGCCTGGAGTCTTGCCCTACAAGTGGGCTAGGGCCAAGGTGATTAGGGGG
CTGGTATTTTCACCTAGTTAGAGACTTTGATCTATGAGTGCGTGAGGAAGGGAGGGTGCC
TTTCCCGTGTTGCCAGTCATACTCACCAGGAAAACAGCCTTTGCCATCCAGAACTGTGGG
TAGATTGAGAAATGACAGTGGCCTAACCCTTCTGGTGACTAGGATTTCAGGGGACGAGGA
GCCTTGTTGTCTTGACCACGTTCAGTTGAAGTGGAACATCCATCATGCTGCCCTGGAGCA
GGTGCCTCAGACATGTCTGCTCTTATTGACATCTGGTAGATTTTCTTGAATGAACGTTTC
CTTACTTGCTATGTGCTGTCAATTTCCAGAGACTAAATGGCTGTTTTTAAATAACTTTCA
CCTGTTTCAGATGTTTACCGGGAACCAAGTTCATCACGTGTCCACCCTGGAGTCAGAGCC
TCTGGGCTTTATCTTGAGGTCCGAAAGTCTTGGAGGGTGTGAAGAGTGGGAAGTGGGCTT
TGACAGTCCTCTTTGGCTGTAGTTTAGAGAACCAGAGGGAACACAAGGATGCAGAGAGAA
CTCTTAGGATGTAGCTGAGAGATTCAGTAGTAGAAATTAATGGCTCATGATAATAAGCAT
GGGAATTGGGCAGGGGAATTGGTTCAGCACAGGGCAGTTACTTGGACAGATGGGGAGTTA
TCATGGATGGGAAGATGCCGGGAGAGAGGGAGGCACTGAAGACTCGGAATCAGTGCTCAG
TGGAGCTTTCCTGCTTCAGATGGCATCTAGGGCCCCAACTGCAAGTCTGACCAGCTACTG
GTGAGGCGGGTACTGCTGGTCCTCCACCTCATTTGAGCAGCAAGGACTAGGATTTAGTGT
TCAGGCAACTGGGTGAACTTGTCAGTTTCCTTGTCTGTTTCAGGGGGATGGTGGCAGGGG
ATTGTGTCTTTGTCCTATCTCCAGTAGATAGAACAAGGGAAGACACATAGTCGGTGTTTG
ATCAATAAATATTTGTTGAGTGATTTAATGACTATTGAGAAAAAACACAAAGAGTAAAAG
GAATGTGGAAGAAGATGATTTTTATTTGGGGCATGTTGCACGTGAAAGACCTGTGCTCGC
TCAGGTGGAGAAATAGTGTTTATCTGAGTTCAGAAAAGGGATTTGGGCAAAAGTTACAGA
TTTAGAGGTTGAGGATGTAGATTATAAAAGAAAGAAAGAGATGGGCCGAGATTATTCTGG
GAAGATGCATAGAGGGAACCAGACCAGAGTTCATATTCCAAAGAACACCGGTTCTGAACA
CCCCCTGTTACTATGCCCATACTTCATTCCTCTCTTGAATCTTTGTGAGAGTAAACTTAG
CAAAAATTTTTGTTGCAGGTTAAAGAGCTCTTTTCTTCTTTGGGAGTTGAATGTAATATC
TTGGAACTTGACCAAGTTGGTAAGTAGCATGGTTAGTACATACTGTTGTTTATCATAAAT
GTTATCAGGATTGACCTCTTTCCATTTGCCTTGTTCACTTCAATCTACTCCTGCATCTTT
GGGTTAGATGAGCTGTTTTCATCTACAATCAACTCCGTAAAAAAGTGACTCTGTACAAGA
AAATAATTTTTGTGTAAATTTTTTGGTTATGCTTTTTGTATCTGAGGGGCAGGAGTAGAA
GGAAGGTAGATAAGCCGGTAACATGGAAATACTTCGGGCATTTCAGATGTGTCTGACAAC
TTTCTAGCAAAATAGATTAAGCTGTAATAGATGAAATGAGTCTGCCCCTATTTCCTGAGT
GTATTACCCATGAGGGGCAGCGCATTCAGTTTTCTGCTTTATACGTTTGAATTCTTGTCG
TCCCTGTACTGCACATAGGCATTTTTTTTGCAGGATTGGGGATGTTGTGGCGAACAGAAA
AAACTGACCTCTGCCTTCACAGGACCTCACCCCTCCTTTTAGCCAAGTTTAATAAGTGAA
ATATTCTTCAATCTTTGAGACTTCTGTAAAGAGAATGCCCAGTTAGGACTCTGAAGGACT
TACAGCCAAGTTTTATTTTTCAAGATGAAGGATGCATTTTGATCTATAGTGATAGAGATT
TTTCAAATGTGATTGTAGGAAATATTTTCTGTGTTGTCTACCGTTGAAGTAGAGTTTATC
TTCTATTTGCTCTTTAAAGAGGGTTCTTATCTGTCTCGGCCTCGTCATTGAATTTTTTTT
TCTCAAATGATTTTTATTTATTTATTTTTATTATATATATATTTTTTCCTCCTATACAGC
ATGGTGACCCAGTTACACATACATGTATACATTCTTTTTTCTCACATTAAGTGTTCCATC
ATAAGTGACTAGGCAGAGTTCCCAGTGCCACAGAGCAGGATCCCATTGCTAATCCATCCC
CAAGGCTGCATTCTGCACCTGTTTACCCCAAGCTCCCTGTCCCTCCCACTCCCTCTGCTC
ATCACTGAATTATGAATCAAACTCTCATTTAGAAGGGTTTACTGTGAAAGGAGTCAATGG
CCTGGTCTTTATTCTTTAAGGTTGCCTTTGGACACCTGAGTAGTGCTCTCCCCTCTTGAG
TGGTTATCTCATAACGCTGTGTGCCATACCGACCTCGCAGGTGTGCACACGTGGGTGGTC
TGGGTGTCCTAATGCTGTGCTCAGCTCACGGAGGTGTGGCACCTGGCAGAGCTGTACGTG
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GACTTTCCAGGTAGTGACAGTGCCATGTATTCTTGAGTGCTGTTTGTTCAAGTTTTATTT
TGAAAAAGTATTTAAAAGGGGAGGAGATGCATTTTAGGGCTATTTGTCTTTTGAAGCTTG
TGCAATGAAAAGCATGTGGTTATCAGATAATCTTGATTACTTTAAGGGAAATTAGCTTTC
CTACCAACTCAAAGTTCAGAAGCTGAGCAGGAGTGGCTTTGAGAGAGGGTGCAGGACAGG
TGGGTGGGCTGTCCCTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTGGGCTGCTCCCGCAGCATATGGAG
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AACCCACTGAGCAAGGGCAGGGACCGAACCCGCAACCTCATGGTTCCTAGTCGGATTCGT
TAACCACGGCGCCACGACGGGAACTCCTGGGCTGTCCTTCTGATGGCACAGAAGCGGGGC
CTCCCCTCCTTGAGGGAAGTGCAGTCGGGACAACGCTGACATTCAAGTCCAGGAACTCCT
GTCAAGGCTGCTGACCCTGGGAGCTTTGCAGAGCTTTTATGATTTGATTCCTAGGATGCT
AAAGTGAGCAGGGATCATTCAGTTAAGTAGGGATTGATGAAAATTGATACTTATTAAATA
AGGTCCTTATTTTAAGTAGTTGCTTTTGTTAAAATTCTGCTCTCTATCCTTTATATACAT
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TCATGACTAAATATCCTCTTTTTATGTGGCCCTGCTTTACTAGCTAACGTTTGTTAAAGA
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GCAGCCCAGACTCTAGAGGTCAAGGTTTATCCTGAGGCCTCTCTCCTTCCCCTGTGTGCT
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CAGGGTCTCTCAGCCAGAATGGGTCTCCTTGGGAGCCGCAGCAGGCCTGGTTCTTGTTGC
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TGTTGGTGATAACGTCTGAGTCAGCAGTGACCTAAAGAAAGTCAGTGCTAGAAGTTCTCA
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