SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002521_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002521
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002428_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002521_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Forward
AAGAATGTCAAGCTGTCAGCTGAAGTAGAACCATTTATTCCTCAGAAGAAGGGTCCAGAA
ACACTAATGATCCCAATGGCGCTTCCTAACGACAGTGGAGGAATTAATGGCATGGAACCA
GCTCCAATCCCTAGCTACCTGATCACTTGCTATCCATTTGTACAGGAAAATCAATCCAAC
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GAAGGTGGCCTTCCTAATTTTGAGAGATTTTTTTGGGGCAGATGATCCAGAGGGGTACAA
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TGTGAGCCAGCTTGGCCTGTTTAGGTTTTTAGATGGAATTGTTAAATTGTTTTGAATCTT
CCTGTTTGGTAACTGTGGGTTTATTATAGAAAGAAGCTTGTGGATCCGTGTATCTGGCAG
TGTAGCAGTTCTGAATCTTTTTATAACCTGCTGTCAAATCAGAGGCTTTAGAAGACACTA
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TTTAAATTAGGTTGCCTCAGCCAAATTCACTGTACCTCAAGGCAGAATTGTCCTAGAAAT
TATTTTCTGTTGAAACTAAATTGGTATGAGATGTGTAGGAAATTTTCTTGAGAAATAGGT
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TCCACCAACCTGTCACATAATAAACAGAAGAACCCTTATACCACTATGCTGCTGTCTCTG
GTCTTTAGAGAATTGTGTGCATGGGCATTGTCACAAAAAATGTGTTGAAAAGGCAGTACC
TGCATGCAGAATTATTATGTAGTGGGAGAAAGTTCTTTGGAGTGATCATGGTTACAGACA
GTTCCTCAGGGTTCATGGCTGTTAGTCACCAGCAGCTCCTGAATTTCTTCATATTTGGCC
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TGCAGAGACCACAGTACATCTTCAGAAAGAATGCAGAGTTTGCAAAAACGACATGAAAAA
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GTACTGTTGTATGAAAGCTCTTTCCTTGCATCGTGTACAGAAAGAGACTTGTATTTGGGT
GTTGTGGAAAGTGCAGCAATTTAGAACACTGTGGCTGACAAATTAAATAAGCAGCCTTCA
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GGATACATAAATGCTTTCTTAATTTTTCATTATTTTCTGTTAGTGTCACAAGAGTCCTTT
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GCTTCTCATGTGACTTTGGTTCCATCCTTTTATTCTTAATTTCTGTATTGTTTAGGATGA
AGATGAGTTTCCAGAGCTAAATAGTGACAATGGCAGCAGCAAAAGTAGTAGCATCCAGCA
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CATTTTGTGCCAACATGAATGTGATTGATCTGAGCATCTTAAATGTTTTTCTTTCTGTCA
AGTTTTAGCTTTTGACTATATGTGTGATAAAAACCTGGAAATATTATTTTTAATATATTT
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TGAGAGTAATTCAGTGATTAAATGGATATGTGAAAGGAACATCTCTACTAAAGATGTTAT
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ATATTCTTCCCATTTCTGCTCTTTATAGTTCAAGGTCTCCTGACCCAAGGCTTACTCAAA
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TTTTTTTGGGATGGAGGTCTGCATTGGGTACTTTTGTTCTCTAACTCAAAATTTTGTTAG
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CTTAGGTGTCTGTCAGGTCTCTGAAGAGTCCTAGTCTATTTAGTTATTTAATTCTGGAAG
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TGCTAATGTTTGTGAAGTAGCAATGCTGACACTTGTCAATGTTGTTTTCAATTGACAGAT
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TGAGATAGGAGAATAGAAAATCTCTGCTTAAGAAAAGACCTGTGAAACTCTGGTTTGTGT
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TGGCCGCTGCGTGAACAAGCTGGTTCCTGTTAGTGTTGTGGGTATCTTCAACTACTCAGG
TGCTGAGGTGAGTAATTCCAATCACATAAGTGGCTGGAGTAAACAATTATGTAGTAAAGA
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GGTTTTCCAAATGCTGTTTGTTGTGAAATGTAGCTAAAGATGCAATCCTTCTTCCTAGTT
TACAGTATTCTACTATATCCAGGGGTAAGAAAAGATCAGTCTTCAGTTAATGTAATAATT
TTTTTCTCTGAACTATATAGGAAATAATAATTTCTAATCCTCAGAAGTGTTATAGGTATC
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CTGTGAGCAAAAGTGAGTTCATTTATCCAGTTGCTTATCCAGATGAAAAGGAATATAAAA
ATGGAGACTACTTGTTAGAAGTCAAAAGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTGTCTGAGAGTGAATTAAAGAGAATGCTGTCTTTTTAGTGAATACTTT
TGTGGTATCTTAAATTCATTTCAGGAGTTAAATATTTATAAGAAATCCTTAAATGAATGA
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CTTAGTGCTACATTTGTTGTTTACATAGGAAACTAAGTAGCACCAACTTTCAGCTTTGTA
ATGTCTGCTTTAGGGTACCATAAAAACCCAATGTTATTCACAGCTCTTTGTTGTCTCTCC
TCTTCCTTTCTTCCTCTTTTTAGAGTAGAAATTTTTATAGAAAGCATAGAATAATATTAT
TAACTCATTTTGCTATTTAGGCTGTTATTGCATGCGCAGGAGAAATATTTTTATATAGAA
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TGGTGGAAACATCTGATGGATTAGAGACCTCTGAAAATGAGAGAGAATCTGTGTGCAAGG
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AACCTCTGGCTACAACTGGCACTACCTCAGCAACAAATCATGGAAAATCCACCCCAGGTG
ACAAAGATGAGGTGAAACCAGATGACAATCTGGAATGGGCCTCACAGCAGAGTACAGAAA
CAGGATCCCTGGATGGCAGCTGCCGAGATCTTTTGAATTCCTCCATGACCAGTACCACCA
GTACTCTTGTGCCAGGAATGCTGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAAGATGATGATGATGAGG
ACTATGCCCATGAACCAATTTCTGTAGAAGTTCAGCTTAATAGCAGAATTGAATCTTGGG
TTTCAGAGACCCAGAGAACTATGGAGACGCTGCAGCTTGGGAAGACCCTTAGTGGTGCTG
AAGAAGACAATGCTGAACAAAGTGAAGAGGAAGAAATGGAGACCTCAGAGCAGGCTGATC
CCATCACTGATGGGGAGGAATGGACAAACGATAAGCACGCAAGTAGCACTCAACATAAAC
CCACCATCTGCAGTTCTTTGAATAAAGAACACACTGATTCCATCTATATGCCG
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