SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002521_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002521
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002428_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002521_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Reverse
CGGCATATAGATGGAATCAGTGTGTTCTTTATTCAAAGAACTGCAGATGGTGGGTTTATG
TTGAGTGCTACTTGCGTGCTTATCGTTTGTCCATTCCTCCCCATCAGTGATGGGATCAGC
CTGCTCTGAGGTCTCCATTTCTTCCTCTTCACTTTGTTCAGCATTGTCTTCTTCAGCACC
ACTAAGGGTCTTCCCAAGCTGCAGCGTCTCCATAGTTCTCTGGGTCTCTGAAACCCAAGA
TTCAATTCTGCTATTAAGCTGAACTTCTACAGAAATTGGTTCATGGGCATAGTCCTCATC
ATCATCATCTTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCCAGCATTCCTGGCACAAGAGTACTGGTGGT
ACTGGTCATGGAGGAATTCAAAAGATCTCGGCAGCTGCCATCCAGGGATCCTGTTTCTGT
ACTCTGCTGTGAGGCCCATTCCAGATTGTCATCTGGTTTCACCTCATCTTTGTCACCTGG
GGTGGATTTTCCATGATTTGTTGCTGAGGTAGTGCCAGTTGTAGCCAGAGGTTGTTGTTT
ATTAAGAGTGGTTTTTTCCATTTGGCCATTACCAGCTTTTTCTGGTACTGCAGCCTTGCA
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CCAGTTTGTTTCTACAAATTTTGAAATAAGTTTAAGTAGGAAACATTAATTCCTTCTATA
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AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTTTTGACTTCTAACAAGTAGTCTCCATTTTTATA
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ATAACACTTCTGAGGATTAGAAATTATTATTTCCTATATAGTTCAGAGAAAAAAATTATT
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AAGAAGGATTGCATCTTTAGCTACATTTCACAACAAACAGCATTTGGAAAACCCCAGCTT
CTATTTATAAAAGTAAGCTTTAAGCTACTTACCATATTCTTTCTCATTGACCTCAGATAT
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ATTAAACAGATCCTAAGTACAAAGGCAGTTTTATCAGCAGTAATTCTTAATAATAGTTTT
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TGCGGCCAAGAGCAAAGACAAATGGAATTTCTTGTTCCCGTGCCATGGCTATTACATTAT
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AAGTCATCACATGGCATGATACAACTCTCTAATCCACTTTAACTGCAATTAGCCAGTAAA
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TCTGTATACTTCTGGTTGTGACAAAATGCCTTGGTTGGCTAACTAACACTTCACATTCCT
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TGTTTCACCCAGCCTTTTTGCAAATGAAAATAATTTCACTTCCTCAGAACAGTTAACTTT
TACTAAAGTCATTAAAAGGATTTGGAAATCAGACTGCAAACTCTAAGTTAAAAACACAGC
CATAAACCATTTGTATTTGTAGTAATATACCTTACTTCAAGAAGCCAATCAAAAATATTA
AAAATACAAAAAAATACTGCAATAAGTGCCTCAAGCAATTTTCTTCTTAATTTAGAACAT
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AGCATTCCTAAGTATTCCTTCCTTTCCCATCCAAAGTATACATAGCCTTCCTTCAAAAAA
TATTTTTCAGAGAATACTCCCACCTTGCTTATTTGCTGTGTCAATGAAAGAAAGTCTCAA
GTGAGTGTTTGTTCATATATACATACATTTGTGTGCAAATACAAGCGATCCATTTAGGGG
AAAAAAAAGAAAATACTTGCAGAACCTTCTATTTCTGAGAGGGAAGCTTATATTCATTAA
GCTCTTAAGTCGACTAAATCTACCCACACTTGAAACACAAGGGTGACTGAAGTACAAGCC
TTGAATTTATATTAATAAAGCAAAACTCTTACTCTCTGAATCTCTTGCTGTGAATTTTGG
TTATTGCAGAAGATGCCATTGGACTGCCTATTCCAGAACTAGCAGGTGAACCCTGTGACA
CTGGGGTCATGCAGTATGGAGAATTCTGACTTGCTGGAGAAAGTGAAGTATCACTAGGCA
TACTCAGACCAGTTTCTGAAAGGCAATTTTTACACATTACCAAATACAAATACATTTTTT
ATGTGAAAGAAACAGAACTACACAGCTTGCATTATCACTCGCTTACTTTGTCCAAATTCC
ATTTTGAAAACACTAAGCATTATTCTTCCCTCCCCTTCTGGAGGGGGAGGGAAAGGGGAG
AAAACAAGCTGAACACACACCCACCACTCAGCATGGACTGGATAAATGAGCAATATTTGA
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TGTTTAAATGTTATTACTCCTTCCAATAATTCCTTACTATTTATATATATAAAATACTCA
ACTAACTTATTCCTAGAATGTCTAGGATTTTCCCACTCTAGTCAGACAGGTCATTCAGAA
GAAAAAATTATGAAGCAGTACATGCAGAATGCTGACAGACACCTCCTTCCCCCATTCCCA
CTGCCCCAAACATGTTGAAGACATTGAAAATTCTCTGGAGTTTCTCAGCTGCTCAGGGCT
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TATTTACAGTTTGCAGCTTCTGTATCTGGAAAACTTTCAGTATGTTCATCATTAAAAAGT
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GTACTGAGAACCCACAGTGTTCTGAGCCTTCCACAACTGAGGGAAAGACAAGGCATTTTA
GAAGACAGTTTCCATTGCTAATATTTCATGAAGTCAAAAAAGCTAAAAGATAACATCTTT
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GGGGAGTGATGGGCATCTAGAGACAGACCAACCTTCCTGAGAGGCCAGTTCCTGAGATTG
GTCAGCAGTCAAGTTTAAATGAGCCTCTTTCTGTTCATCAGAACCCAGAAGGCTGTGGTC
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ATAGCTGTCAGCATCTGAAAATTAGATATACCTGTAAAGAAAAACATCCCTTTCACTGAG
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GTATACTCAATACTCACACACTTCTACATAAATAGTACTTTTAATAGTTTAAGTACTTTC
ACAGCTTCCTTTCTGATACATAACATTCACTTATTACCCATTCCTCATCCCCACGCCTGT
AAAAGAATACCTTATGCAGGCATATTAGTCATCTTTATGAAGCACCTCAATAAAGACAAC
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TTTTAATAGCAACAACATAAAAACCTTGACAACAAAGAGTTTAGAAAACTTTTCTGAACA
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CACTTTTTTATATCTTACCTTCTGATCTCCATATATATACTCGATTCCTTCTGCACATAC
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GAAGCTTTTCCATGTGTTCTAGTGCCTGCAGTTAAAAAAAGAAAACACCCTTGGCAAGCT
GTATCAAGATACATTTTTATTAACTTCAACTGATTATTCCGATATAAAAGTTATGTTACA
TGTCTAGGTCCAAAGGAGAGGGCATCAGTTTAGCAGAACTGGAAGCAGAAGCTCCTAATT
CCCTTGCCCTGCGTTCATGACAACCAATCCTCAACTCAGAAAGTAACAGGGTTTTTTAAA
TGTTATTTTTCAAGTATGAGTGTGGGTCAAAACACTCCAAGGTTGGCATGTTTACCTTTT
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GGGCAGTTGAATCCAAAGGATTAAGGCAACCCATAGAGGGCTGTCCCTTTGTTATGGACT
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ATATTAGTTTCACCAAAAGACATGTCAGCTTTATTTCAGCACTGTTTTCAGAATTTCCAC
TGATGAATTCTCTAAGTAGATTTTCCTTCCTTGGAAAAAAAGCAGTTCATAATGACAGGA
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TAGGAAACTGTGGATTCCAGGAATTATTTTAATAAATAGTATGGGGTCTCTCTCAAATGA
CTACATGTAGCTTTATTAGTTAGATGATTATGGCAAGGCAAATTGCAAATATTTATACAA
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GAAATGCCAACAGTTCTTTGCAGAGCTTTGTTTGATATAACCTTGCCAACTTGAATTGAT
GTTTGAACACTGCTGAAATTCAAAGCAGGTAAAGGAACCAACACACCAGAAAGAAAATGG
TAACTATGTGCATAATGATGGACTCCAGACTACATACAAGAGCTCAGGAATCAGATTGGC
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AGCTAATTTAATGTTGTGTCATACAGACATGGTAAAAAAGCATAATTAAGCCATTGTATA
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GCATTGTCAGGCACATCAGAAATACCTGTGTATGAGAGAGGCCTGGTGTTGGTGATCTGA
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TGTCGTTTTTGCAAACTCTGCATTCTTTCTGAAGATGTACTGTGGTCTCTGCATCTGAAA
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GCACAACAGGCACGTTTATCCAAGGCTCCCACATGGAGCTCAGATTTCTTGTGTGCAATA
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TCCAATGTAAATTTTAAAAAGAAAGTTTTGAAGACAACAGGAGTGAGAACAAAGGATTCT
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TTTAATTAAATAGTTTTTGTATGTTAATTTTATAATTCCCCCCAAATTCCTTATTTTCCC
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TTTCTTTGCTCAGCTTGTCTTCCACCTCTAGAAAAGGTCAGAGTTTTTTCAATCCAAGGT
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CCATCTATGAAAAATAGAATTAGCATCCAGAACATATCATAATGATTCATATGCAGCAGA
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TGCCAAAAATTGATCACCACAAAGCAGTGAGAAAGGAAATCTCACGTTCACATCCCTCCC
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TTAGTCTGTAGGCTACAAATAAAGTCACTCAGTTATGTTTACATACATTCATTGCACATG
AATCTGTATTTCTTGAAGCCATAGCTGCAGCCTGGTTATTGCCATGCTTAGGACTACAAT
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CAGAAAGTGACTTATTGGCTATATCTGAAGGAAAGTCTTCAAGAAACAATAAAAATAAAA
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TATTGATAACAAACTCCTTCAAGAGTTGGTACTCTGCAAGAGTATCATGTCACTGCAACA
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GAACTGGTCTCCTTCTGAGTGGCGACATTTTTCACCGGAGGACGTTTACTTTTTATGTGC
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TGTTGCCATCTGATGTCATTGTTATATAACGGAAACTGTCTATTAAAAAAAACACAAAAG
GAAAGAAAACTGCTCAGTAAGTCTTCCATCTCTCAAAGAAAACTCATGTCTTGATCACCC
CTTCAAAAATAACAGCTCCGTTATAAGAAGTTCCTAAACTCAACATATTCTTCACTAGAA
AATTGGGTACAGCTACATGGAATACTGAATCAGCTACATGGCACCATGTTGTGTTTCACC
ATGGCAGGACCCAAGCTGGACACCCAAAGCTTTGCTTCATTCAGAGATTCAGACAAAAAA
AACCCTGACTGCCCTAAACAATCCAAGAGCACAGCAGGTGACTTTGGGAAGGATTTGTAC
CAGACCTTCATATCCAGGAAAAAAAAAAAGGTAACAAAGAATATGATAGGAGAAAAGCAA
AGGGAAGAAAATAGGTAAAAGACAGAGAAACTTCCTCCTCATACATGAAGGGTTGAATAT
GAACAAAAACCTTAATATACAGCCCACAATCACTGACTCGCTCTCAAGCCTACAAGTTCA
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TGATTTTCCTGTACAAATGGATAGCAAGTGATCAGGTAGCTAGGGATTGGAGCTGGTTCC
ATGCCATTAATTCCTCCACTGTCGTTAGGAAGCGCCATTGGGATCATTAGTGTTTCTGGA
CCCTTCTTCTGAGGAATAAATGGTTCTACTTCAGCTGACAGCTTGACATTCTT
Chart Advanced