SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002524_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002524
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002431_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002524_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Forward
ATTGTTATTATAATTATTATTAAGGGGAAATGTCCTGAAGATGGATGGGATGAAAGCACC
ATTGAATTGTTTCTTCATGAACTTGCTATAATGGATAGCAATAACTTCCTGGGCAACTGT
GGCGTTGGTGAGAGGGAAGGAAGAGTGGCTTCAGGTCTTGTTGCCCGAAGGCATTACAGG
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TTTTATTGTGGTTTTGTTTATCTAAGACCTTGATAGCATTTGAGAAAAATAATATAATGT
GATAATTGAATTGATACAGCTTTCTATATTAAATTTTCATTAATAACTCTATAGAAAGTC
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ACCTCAAAGAAGTGGAGGCCAAAATCAAGGCTCTTGGTGCTGAAAATATTCTTTGTGTGC
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GTGTGTTATTTGTTACTGTTAAAACAAATAAACATCCTCCCCACCCTAACAAAAACAACA
AAACCCAGCCAACACCTCCATGTTTTGACCATCCATCTTCCTAAAATTGCTTCTGCCAAC
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GGAAACATAATCCAGGAAATGTAGCTCCATAGCTAATGCCATTTTTTTGATGTTACTGTT
GCCTTTTTTACTCTTTCCCACAAGCATAGGAAAGAAATGTTATTGACTCTAAAATGTGGC
AAGTAAAAATATATTTTACTCTCCTCTCCTACCTTGAAAAAACCCCCGGTATTTATCATA
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AAAACTGAATGGTTGTTTTATAGCTTGGGTAAATGAATCTTCTCCTTATCTGCTTCCTCT
TTTTGACATGCTGCTATTGTTTTGTCCTCTATAACTAAGAGACGAATTATTAGGTAGTGG
CACTATGTTATAATATACCACAGATATAGGAAGATTTGAATGTAAAAGAAACTGTCAACT
GTTGAAGGCCATAACCTTCATCTTCTTATGGGAAGGAAAACCCTGACAGCGTTTCTGGAG
GGTGCAGTTTTAAATATCTGCTTTTAAATATCTGCATTTGTAAGGCTTTATTTAGTTGGG
GTGGTCATGTTTTAAAATTTTTATTAGCTTTATGGCTGCCTTACCAATGGCTTTCTTTTG
AAGTACTGTTTAACTCTATGGGCATAATTCTCTAGTGTACAAATCCTCTTTCTTAGAATT
CTATCTGCTGTTGCTGTAACATTTTTGTAAAACCTACTGTATTTAAGGAAACCAAAGAGT
AAGTGTTCCTTTTCAGTTGGTCTGTGTACTTAGCAGAAATCTGTATATTTTAGTAGTAGA
AAAAAAGAACAAAGATTTCTTTTCATTAACTTTAACAAACAGGAGAGAAAGAAAGGAAGA
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AAGCAGGTGCAGGTACATACAGGTGCTGTGCATCATTTGCTTCCCTTGCATACTAACACA
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TGACAGTGACAGGATCCAAGGAAATGGGCAGAAGCTGAGCTGGGGGAAGTTTAGGTTGGA
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TGGGTCCCTTCCAACTCAGAATATTTTATATTTCTGTGTTGATAAATGTGAAAAATTATT
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TGGTGTTTTCTAATTATTAAGTACTTTTGATTTTTTTAAAGGATAATATGGTGATGATGA
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TTTCAGTTTGTTGACGTCCATATTCAGACATTTTAGGTTTAGGGCTCTCCTTTCATTTTA
GAGCTCTCCATTCCTTTAAAGAATTTATTTTCTCTTAATCAGTTTACCTGAAGTACGCAA
GTGAGATTCCAGCCAAAGGCTGAAAATACTAGTTCTCTGAGATAAACAGAAACATGTAAA
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TTTTCACATTGAATATTAAAGAAAATTTAAAAATGACTAGCTAAAGCTACGTTAGTTAAT
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TGGTGTCCAGAGAAAACTTAAAGTGAAGCAAGAAAAATGCCAGACTAGATCAGCAACTTG
CAATATATGTAAAAGCCAATAGAATTTTCATCTTAACTTTATATCTTAAGATGACAAATA
CTGCTATGAGGTACTAATCAAAAAAGCTACTTTTCTCATTCTGACTCCCTTGTAGACCTT
TTAATGGTCTGACTTGTAAGATGAGCTACAGCAATCAACGCTTCTCTAAATTACAATTTT
ATGCTCACAGGCTGGAGGAGCTGGCTGTAATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATTG
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CTGTGTATTTCCAATAATATTTGTAGCAAGTATAAGTAAATTTGTGATTGTAGACAACCT
AGCAAATTTTATCAGATGCTTCATAGGTTTGAGAGTAATCCCATGCATGTCTGATATTTG
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AAGTTTAATTTCTGTTGCTGTTTAGTTTGAAGAGGATATTGCTTGATATCTAAGATCAGT
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TCTTTTTTCTGTTACCTATTCAAAAGAATAGGGGATTATATTTTAATAGGATCCAGATGA
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TGATGTACTTAGTACATGTTTATTGTATTTAACTTTCTCAAGTTTAGTGAGAAACTAACA
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GTATTGAAAAAAGCTTTGTTAATGAAGCATTAACTTGTAGCCTTTTATTGTGGTGTTGTA
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CTTTTTGATTGTTGCCAAAATGGAGCCACACTTAGACTTGCAAGAACTAAAATTGATATT
TTAAATCACAGTAAAGTGGGAATTTGTAAGGTACTATGTTATGCAGACAATGTTTACTAA
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TGAGTCATCTCATTTTCTTGGAAGTAGAATTCTAAAGTGAATACAGCATTGTATTTTTAC
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TCTATATTGGTGCAGCTGCACCTACTCACACAAAAAAAAAATCAGCTATAAAAAACTTCA
GGTATATTTTTTTCTTTCTCTTTTTACCTAATCCTCATTCGCATGGGTTTGCTTCAGGTT
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TGGGAGTTGTGGAGTGTGCAATTGTCCAAGAGTATGAGATTAGATGTAGTGCTATGAAGT
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CTGATCTCAGTAGGCAATTCTAGGTCCTTTTGCAGGTCCTTTTTTCCTTTTTGCAGGTAA
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GTAGATACAGTTGTTGCACTGTGTAATGGCATAAACTGGTTTAGTTATCATCTCAAATTT
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ATACCTGCTATTATCCAATATGGTCCTTCAAATTCACTTAACTAATTATTATACTGGTAT
TATTGAAGAGGTGATGGTTTTGTTTACAGCAGTTATGGATTTCCTCATTAGACTTAACAA
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TTTTATATTGGTGTTCATCTGTCTGCATGCTTTGAGAGTAAAACTGGAGTTATTTTTATG
TCCTTATGGAGTATGTATCTAAAATATTTTAAATCATACAGAGTGGGAGGAAATTGTTTG
GGTTTTACAATTCAGTATAATACTGGGCTTGGGTTTCATGAGTTATCATTGATGTAGTTA
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AAGCAAGATAGATGTTTGTTACTCCTTTTTTTTTTCTAGTCAGCTTGTTACACTGTAGCA
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AAGCATGGGTCACAGAGGTCTCCCAACGCAAGGTCTCACAAGTGCTGAAGAGAAAGTGTG
TTGATTGCTGTTGTTAAGAAAGACCTTTAAAAAAATGTGAATGTTAGTTAGTGTTACCAA
ATCAGACTGTCAAGGCTTACTGGGCACTTTCTGTTAGATACTGATGATATAAAGATTTCA
AGGTTCTGTAATTAATTTCATGTTTTTAAAACTTTCTAGTGTAAATCCCTAACAGAAATT
TTGCAGTGGAAGAGAATCTGCTTAGGAAGGTGTGTAGTATATGCAGGTCACACACATACA
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AAGTGGTATGGTCAGATCACAGCTCAGAAGCAGCTGGTCCTCCTGAGGCACGAGGCAGGA
GAGGCTGTGATGGCTGCATTATAAAACAGCTGCTGCTGCTGCAGAGTAAGGTGGGAGCAG
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AATTACTCCTGCACAGTATCCCCTTCACACCATACACAGCTCTGTGACTGTTCCCTGGGG
ACAGCTCGTCTTTTCAGATAGGAGTGACACAGGGAGAAAGGCAGAGTGTTACAGACTCAG
TGTAAGCAAGCTGGGTGATCAGGCCAGCTAAGATAGTTTCAACTCTGCACAAAAACTTTT
CTGGCCTTCATCAGTTGCCTCTTTGTCAGCTGGTATGGGACTGATGGCTTATTCAGTACC
ATCATCTTCTTTTTCTCTCTAGTTTCTGGCTTTTTCCTTACTAGTTTCCCTCTTGTTATT
TTTGTTTGCAAGAACAGTGCCTATCACAATGGAGCAACAAATGAAGACTCGCCCGTATTA
GTTGAGGTTCTATTAAAAATAGTTTTATAGTATAAATATAGTATGATTCCAATATTTTTA
ATGATTGTTACAGCAGCACTTCTTGAAAAAATGTTTGTACATGTATGTGAAAGTAGACTG
TTTCATGCAAGCAATTGAGTTATTTGGCCTATTTGATGCAGACAGTGTTGTTGACTTGTT
GTTTTTTAAGGTGTTTTGTTGGCTTTGGTGCTCTAAGAACCAGAAGTGAAAGACACTGCC
ACATAGGTTAGAATTCATTTGTCCAGCCTAATGAGGTTTTGTGATAAGTTTCTAAGGTAA
AGGAGTAAAGTAAATAATGAAACTTATCTGACATTTAGTGCTTGAGTTGTTCAGTGTAAC
TTCAGCATAATATTTGGCTTCTTTGGAGAAAACTTGAATGCCTGCTACAGAAAATCTATT
ATGTAAGAGCTCAATTATATATAATTGCTTAGGGTGCTTATAAATTTTCCATGTAAGAGA
AATATTTTATAATGGAGGTTGGTTATAGATTTGACCTCATAAAAATATTGCTTTAATCCT
TTTTTTTTTTCTGGAAAGGCAGTTAATCTATTTTGCAACAAACTTCTGAAACTTTAAAAT
ATCTAGAGGGCTTCCAATGGAAAGATACAAAATAGTGCTGTTCATAAAAACAGGAAACTT
TGAATTTGTGTTCATGTAGCTTTAGTCAAACTGATGAAAATACATACTTAGATTTTTTTG
CCATCTTTCCATTCTCCTTTGTTTTAATGAATTCCTATATATGTAAAGGCTCATCTAGTA
ACCTAATTTCATTGAATAGATTTAATTAAATTTAATATATTTATGCGGTGGGTAACTTTT
TATAACAACTTTCCGTAATACTTCCAGTATTCCTTTCAGCAGTCCTTTCAGTAATACTAT
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TGTTCCAGTATATTTTTTCTCAGTACTAATTTCACCAAAAATATCTCCAGAATAGGTACA
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CAAATTAATTTATGATTTGTATTCCAAAATAAATACTAATAAAAAAGCTAGTATATTAAT
GATGTTTATTATGGAAAGTAACAAATTAATAATGTGCTTATATACCATGAGGGACCAGAG
GAAGGGCAGAAGTGTCTGAACATTTGAAACATAGATACTTTTCAGCTTCTGTGGATGAAC
TGTAGATAAACTCTGAACTAAAACCATAAAATCACTTGATTTACAAGAAATAAGGATGAT
TTTTCACAGATTTCAAGTTCTGATAATTAAACATAGATACCTCCCAAATTTCTGGGTTTT
TTTTCAAGCTTTGTGTTTTTGTGGATAGTTGTATCAACAGCCTAATTCATTTAGACAGTA
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GAACTGTGTTCATTTTGTTGCTCATGAAGGGAGGTGAGATTTCCTCCAGTGGTTCAAGAA
AACCAGCTGTAATATTCTTCTAACTGGGGTACCACAAACCTCATTTGGTTTCATAAGACC
TTGGGGAGGTTCTGTTCAAAAGCATAATTTGGATCACAAGCTATAATTTATATCTGTCAG
AATTCATAGTTCAAAGCAGGATACTGGCCTACAAACAGAAGAGGTAATTCTATTTAAAGA
ATGAAAAATCACTTGTCAGGTCCAGAAATTGATGAGGATGCTTAAACAGGCAGTCACACT
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CTTTTAAAAAGGCTACCCAGTGTCTGTATGGTATTGCTAGTTTTTATGAGAGATTAAAGC
ATTAAAAAGGATGGAAAAAACGCTAAGGCTTACAATAAGAATGGTGTTTATTCTCACTCT
GCCCATAAGTGTTTTGAGCTGATATCTGAAGAGGAACATATTAAACAGAGGAAGAGCATG
AACAATTATCACAGCTTACTACAGAAGAGGGAGGATATAAAATACAGATGAAGTAAGAGA
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TTATGACACTTTCACAGTAAAGGTGCAATCCAATTAAGTGATAGCAGAAATCCAGATAGT
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CAGAGCTGAGTATTCAGGAGAGTGTATATTGTGTGAAACAAACTACAGTCAAATGTGTAC
TCATAGCCTCTTTAAGAGACTGGGTTTTTATTCTCATACAGAAAAAGAGATCTCTGCACT
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TATTAAAGGAGAGAAGACAAAGTAAGGAACAATTTGCCAAAACGTGACCATCTGTGATGG
TAACAGTTCACTCTCAGTGGTTTAGGGGGATAGGGCATGGGAAGGCTCTTGAAAAGTAGT
CTGGGGATTAGACCTGCTGTGCAGTGGGAATCTCTTCAAGATTTTCTACCTCCCTAGGTT
TCAGGGCCACAGAGAGAATGAATGCCATCCCAAGCACATATCTTAGACCAGATAGAGACT
TTTGTATCAGCTTGAGAGATAAGAGCAGTGCTCAGGAAATGGAGTTGTTCCCTTATAGAA
TTATTTCAGAGAATTGTCTGTTTCACTTACTTGGTACACATGAAAAGAGAATGAGCTGAG
CACTTGTAGGATGTAAAAGAGACATAACAGTTTTGTGAAATAGGTGCTATTTTCTCTGTT
TAATAGCTAATAACAAAAATATTGCATCTTTTTTTCAGGAGATGTTTTCGTATCTTTCAA
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CCATTTCCTTAGGTAATTGTTGGGGGTTTAACTTTTAAAAAAATCTAATATACTGTGGAT
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TTTTTTTCCTCTGTATGTGAACACAAATATATTACTAGATTCTTGCTGTTGGAAAGCAAC
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TATGTTACTTTAGCCATGTCACTGAAGACTCTAGATGAAACTAGTGATGTTGCTGTTACC
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