SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002829_2.0
Identity
TranscriptMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesVicugna pacos (Alpaca)
Transcript IDSPT00002829
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002736_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002829_2.0 # Transcript # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Alpaca (Vicugna pacos) # Full length # Forward
GCCAAACATCATGTCAATGGCAACAGAACAGTTGAACCTTTCCCAGAGGGAACACAGATG
GCTGTATTTGGTAAGATATCAACTCTGAAAGAAAACCCAAATTGTGTGCAAAGACAAGTG
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TGTTTGTTTGTTTGTTTTGAATGTGGAAAGGTCTAATGATAAGGGCAAAGGGGAAGACAC
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TTATAAATAAGTTCTTGTTTCGTTTTTTTATATTCCACATATAAGCTATATCATGCAGTA
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TGTTGCAAATGGCATCATTTTATTCTTTTTTATAGCTGAGTAGTATTCCATTGTGTGTGT
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CAACGTGATTGCCCTTGACAATATTATTCCAAGTGAAAGAAGCTAATCACAAAAGACCAC
AGAGTGTCTGAGTCCATGTATCTGAAATGTCCAGAATATAAAAATCTGTAGAGACAGGAA
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GTTTGTCGATGCAGATGGAGCCTGAATTTTAATGGTAGTAGTTTCTTTTAAACAACTAAG
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GGTGAGTGGGGCTCTTTTCTGACCCCATGCTGTGCCACGAAAGAAGAGCCTAATCCTGGA
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GTCATTGACAGATGAATGGATAAACCAAATGTGGCATTAAAGTGCAATGGGTATTATATA
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CCTGTTGAGGGAAATAAGCCAGTCACAAAAGGACAAACACAGTGTGAGCTGATTTATATG
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GAGGAAGACAGAAATGGGAAGTTAGGGTTTAATGGATATAAAATTTCAACTTTGCAAGAT
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GTTGATTTACAGTGTTGTGTTAATTTCTGGTGTACAGCATCTTGATTCAGATATACATAT
GTATTTCTTTTCATATGCTTTTTCATTATAGGCTATTACAAGGCATTGAATGTAGTTCCC
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AGTATCTGTAAATCCTGAACTCCCAATTTATCCCTCCCTATCTCCTTCCACCCTGGCATA
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GACTGACCAATTAAGAATAAAATACGAATAACCTAATATAAAAAGGGCATAAAAATTAGA
GCAAATAAAAATTTAAATGATTAATAAGCATGACTTTTTAACCTAATAATTAAATTCATG
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TCCTGATTTATGGTTCCTTTATTTCCCTGAATTTAGCCTTTCTCATTTTTTGACGTTATC
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