SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002855_2.0
Identity
TranscriptIodothyronine deiodinase (DI)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002855
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002762_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002855_2.0 # Transcript # Iodothyronine deiodinase  (DI) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Reverse
CTCTGACGTAACTTCTTCCAGGTACCAACAGAGAATGAGTCTCTTTCAATGGAGCCCTTC
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GGCAGCTGCACAACGTTCTTCTTGGTTTCTGTGCTTCTTTACTTCATAGGATGTTGTACC
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GTGGCATTTTCCTACAAGTTTTCTTTGTACACTTTTACAAATTTTGTTTGACACTTGAAT
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TCTTTCCGTCTCCTATAATTTGCTTTTAAATTAAGTTGAGATTAAAACTCAGTTGTCTTA
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GGGGGAGTGGGTGAATTCGACCAATAAATGGGCAGGAAAATGGGCAGACTGGGAAGGGAA
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TTAGCGAAAAAATGTGAAACTTGGAAATTCGCTGCAAATCCAGGCCTGCCAAATTATTTT
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AATATTAACTGTCGGAATTTTGTGTGCACTGAAATTTACACAAATTATAGCTGCCACTAG
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TGCTGCACAGATGTCTGGCTGTTGCCCATGAGGGCGTTGAACTAAGCTGCCAATCACACT
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GCAGAAAAAACACAGCCGTTTAATCAGTCACATAAAATGGGCAAGGACTTTTTGAAATTG
TGGCATGCATGGCAGAAGACAGAGTTGAGTTAGAGCTAGCTGCATATATAACTATGGCCT
GGATGCTGTAAAAATTTATTCTAACCAAATCCTCTTTTAGTATAAAAATAATCAAGGTAT
AATAGCTCCCTTTATTTCAGCACAGGCACCAAACCCATATCTAGTCATGAGGGAGGTCTA
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GCTGATGTGTGATTAGTGGCTGCCTCTCCTCCCCCTGACAAACATTAACCCAGCCAGTGG
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CTTACAGCAGTAACAAGCCCAGCTCCCTGTCTGCTTCCTGTAATGTTTACAAACACCAGG
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TGTGCCTACAGAACAGATCAGCTTCCCAAGAGGTTGTGCAGCAGCTATCCTAATAATGAG
CCCTGACCTATAGATATCTGCTGCACAACCCAGGATAAACTGAGATAAAAACAAAATGAA
AGTAACAGCATTTCACTTACTATAGAACTATTCATCAGCACCTAATTCACTTACTATAGA
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GCATCCAATAGGAAGCTGTTCCACACACAGCGCAGCCCTTCTGGGGTGAGCATTCGGCGC
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