SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002866_2.0
Identity
TranscriptMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002866
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002773_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002866_2.0 # Transcript # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
ATGTTGGGAAACATTAGATTTCCTACTGCCCAGGAGGCTTTACCAGGAAGAAGTGATGCC
CTACAAGTAGCGGGTAAGTACTTGCATTATTCTGAAATAATAGTTCTACCCTAGGAAGGT
ACAGTATTTGATAGGATTTTGCTTCCCTGCTGGCAGTACATACACACAGTGTGCACACAA
TACTCAGTACTCACACAGCTCTGGTTAAAGTCTGTTAGGATAATTCAGCCATTTATCACA
TCATTGTGTACCTAGCTGACTGGGCTGGAATCAGGCATAAGTCAATCAGGTTCAACATTT
GCTAGAGCTCTTCTAAGCTGGTTAAAGACAAATAAACATCCCAGCATTTCTAATCCCATC
TCCAAATAGGGAGGTTCTACCTTTCCTGGCAGTCTGCTCACATTTTCACATCATTAAATT
GTTTGTGTTAAGGGTAATATGTTTAGCTTAATTGCAATTCAATTCTTTTATTCAGTCAGC
AACCTTTCTTGTATTAACAGCATGAATCCAAATCTCATCAGCCATGGCTGTTGGTTCTTG
CAAGTACTGAAATGTGTGTTTTTGGGACAAAATCACATAACGTTTTGTATAAAAACAAGG
GCACACCTCAGGGTGGGAATAGAGTGAGTGAAGCTAACGCAAACTATTTGAGGTGATGTA
ATAACAGGCACATTAGCGTTGCATGCAGTAACACCTAGCAGCCAATCAGAGGTTACTAGA
ACCAGTCAGCAACCAGTCATGATGCTACTATAACTGACCTATTATGAAAGAGGTAGTTGA
CCTAAAAATTACCTTTTATTCATGTTAAAAGTGATATTTTGAGAATTTTCAAATGCCCTT
TATGTTTTTAATTATTTTGCTTTATTTGTTTAGCTTCACTTTGGAATTTTAGCAGGAAAC
TGGTTGCTAGGGTCCATTTTACTCTAGCAACCAGGCAGTGGATTGAATGAGATTCAGTAA
GATGACTAGGAAAGGGTCTAGATAGAAAGATAAGCAATAAAATAGCAATAAAATAACAAT
TACAATAAATGAAGACCAATTGTGAGGTTGCTAAAAAAATATTCTATAACATACGTAAGT
AGTGAGCTACCCCTTTAAATGACCCACATTGTATGAAGCGTGTTGCAAATCTTTTTTTAA
CACATGTGGCACACAAATATTTCTCCACCAGTATATTTCAATCAGCAGAGAAATGTCTGA
TACCTCTTCATTCCACCTGTCATTCAGACAGTATCAGACAGAAAGAATGGAAGCTGTCTG
TCACCAATCGCACAGGTGGTTGTTGGTTTGAAAATGCACATTTAACGATAACGAAGCTTG
AATGAATCCGAAACTTTCATACTCAGTGCGACAATACGATTTTGTCGCACAAATTCGGAG
CGTTCGTGGATTAATAAATGTCCCCCTATGTGTTCCATTACCCTAAGGATTTCTTAGTTA
TTTGGATAATCCTAGAGTAAAAAGTACAAAAGTTCTTGGTACAATTAAATAATTTACCCT
GCTAGAAAGTCATTCCTCTGCTTCCTCTTAACAGATAAACATATGGTAAATGGGAATTCA
ACTCTGGAACCATTCCCAGATGGCCTAGAAATTGCAGTGTTTGGTGAGTTTTTCTCTAGC
TAATGTAGTTTTACTGTGAGCAATTATGTGGGGTGAATTATAGGGTTTAGCATATATGGA
CCAATTCCGGCTCATCTGAACAATAGCATAATAGCTGTAACATTGAGAAACTTTGTGGCA
GTCCAGTAGCCCGCATCAACCATTCTGGTATCTGCTTTTCCTTTATTATTTCAGCTGCTG
ACAAGTAATAGCTTACAGCTATTGTATCAATGAAAACTATGACTGGATTTCTGCAAAATG
TTTTGGCTCAATAAATAGCAAAAAGATAGATTCTTTTTTTTGCAGTCTAATGAAAGTGCA
TGTCTGATTTTGATATATTCAAGTTATCAAAAATGTCTTGCTATGTCCAACTATCTTCGT
AAGTAGTGGGAACACAGAAATACTAGTGGAACCTTTAGATGTTATCTTGATGGTAATCCA
GCACTAAAAACAAGATATAAAGAAACCTGAGGGTCTTACAATGACCCTTGGGACCTGATG
TCTCTTGCCCAGTCTCTACAGTTACTCACAACAGGATGAGTATAGAGTTACAGGCCAGCT
TGGTAACTTAAATAAGTACAATTCATGGGCATCAGCATCCACAGCTGGCCAAATCACATA
CTTCTGTTCATTCAGTCAGTTGACCAAATGGGCAGATTTAAAGGAACAGTAACACCAAAA
AATGAAAGTGTGTAAAAGTAACTAAAATATAATGTGCTGCTGCCCTGCACTGGTAAAAGT
TGTGTGTTTACTTTAGAAAGTCTATAATTTATATAAATAAGATGCTGTGTAGTATGGGGG
CAGCCATTCGAAGGAGAAAAGGCACAGGCACATAGCAGATAACAGATAAAACACTATTAT
ATTCTACAGAGCTTATCTGTTATCTGCTAAGCAAACCTGTGCCTTTTCTCCTTTTTTCCA
GCTTGAATGGCTGCCCCCGTGGCTACACAGCAGCTTATTATATAAATTATAGTAGTGTTA
CTGTAGCAAACACACCAGTTTTACCATTGCAGGGCAACAATGCATTATATTTTTATTACT
TTAAAGCTCTTTTATTTTTTGGTGTTACTGTTCCTTTAAGCTGGTGATATGGGTCCTTTA
GATTGATTCACCAGCTTATCTGCCCATGTGTGGGGCCCTCCGTCAGACCTCCCCGACTGA
TATCTGGGCAAAATTTCATCAGGCAGACTTGATTTTTCCATTGGATCACTGATGCAGTAC
TCAATCTGACTTTTCATATCCCCTTCATTGTAATGTGATTGTTATTACATTTGCATGATA
TCACCCACCCAAGGTGGCCATATCGGGGGAAATATTAACTCCTTTAGACAATCTTACTGT
ATATGGCAACATTAACACTGAATTTTATGAAAGGTTGCAATATGCTAAGATTACTAGGGT
GTAAAGTGCAAAGAGCAGGCAAAAACCACAATTTTTTCTTACTTTGTGTGCACTTTTTTT
GCCACAGGTATTTGCGGTCCATTTTGTGCCACATGAATACAGTGTACTTGGCATGGCTGT
GCTGATGGCAGGGGAACAAAAGCATGTCCCCTAGTGCACATTTAAAAAGCACTTGCATCT
GGGGTTTGGCTGTTCTCTTTACCTAGTGTCAAGAAAATTTCCATAGGGCAGGAGTTATGC
ATTGGGCTCTGATGCAGCCTGTGCAAATCAAACTTGTGCATCTAAATGACATTCTAGACA
CCTACACCCACTCCTCATGAACACATTGCTGCTGAACACAGGCAGAGTTGTATTTTTAGG
CAAATGTGCCCTATTTTAGAAGACTGAGACATTTGGCAATTTAGGGTAGTATGAAAACCT
TTTGGGTTTCAACTGTGTTTATGAATTTTGCACCCTGATTTGCTCTTTTTTGCTTTTCAC
AGATTGTTTTGCTTTTTTCACCTGTTTGATATAGTAACACCAGTCCTGGAAGTCTGTGGA
TTCTGGCAAATGCCAAAGGGCCTGCTGTAACATGTCATATTTATTGGGATAGTGGGGAGC
TGTTTGGGCCTCTGTGTAGTTGAAAAGCCAGGACCTCTTTTGATTCCCAGTCCATGCATG
GTTGTTGTCAATACTAATAATGGATCTATTACAGGAATGGGCTGTTTCTGGGGTGCAGAG
CGCTTGTTTTGGAAACAGGAGGGTGTCTACTCCACTCAGGTGGGATTTGCAGGAGGGCAC
ACCCCCAACCCTACTTATAAGGAGGTCCGCACAGGTAACGTTACATTTTTGTTTATCTTG
TACTGTTTCCTCCCTTACCCACTGCTCAGTAACAGATGAACATGCAGCCTTGTAAACTTA
CTATTTGAGAGTGTGAGGAGAAAGGTAGCCATACATGGGCCGATAAAAGCTGCCAACGGA
CCAATCGGCAGCTTATCAGCCCATGTATTGGGCGCTCAAATGGGCCTGTCTCACTGCTAT
CTGGCTAAAAATTGATCAGCAGGTTAAAAAATCTCGTTGGGACATTAGCGCATTGATGCG
GTCCTTGTCCCGATGTCCTGTTTGCCATCAATGTGATCCGATCATTTGGCACATGCCACA
GACAGTCACTATTTATTGGGCTGGTTGGGGGCTGTTTGGGCCTCTGTGTACTTGAAATGC
CAGGGCCTATTTTGAATCCCAGTCCAGATCCCTGTTCCCTAGTCAAAGTGGATCCTGACA
ATTGATTTATACAGACAAAGCTGGGGTTTACTACTGGACTCTGCCCAGACTGAATTTGGC
TGCAGCAATAGCCTGCATCATGCTACTACCATGATTTCATAGTTGTGTCTGCTTGCAACT
CATGACCACCAAGATGCAGCTGACAAGAGACAGGAACCAATGTGATGCTGGGAACAGATT
AGTAATATGTATATATCAGAGGGGCTGTTTTAAGATGCCATAGACAGTCAATATTTATTG
GGCCCTTGTGGGCTGTTTTGTCTTCGGTGTACTTGAAATGCCAGGGCCTATTTTGAATCC
CAGTCTGGACCTAGCTGGCAACATAGGGTATTGGGGAGATGTGTAGGAACCATAGAAAAC
ACTTTTTTGCTTTTACCAGAATACATTAACATTGTGTGATAATACCATTAATTTATTGAA
TCCAAAATCAGGAGGTGTGGATTAATCCCTGCTGTTTTTATTCTTTGCTGATTTGCTCTC
ATTAACCGAGGCAGATAACAATTTTATAATACCAAGCTTGAGTGTTATCTCATTAGTGAC
CAGAACCTGTAAACACAAACATTCTCACATAAAGACAAATGCAAATATACCAATCTGCCT
CCTGGAAAGAGTATACATTTTAAAGGCCAGGGGCACATGGAGTGGATCATCCTCTTTCTT
CTGACTGCATTATGTTGCACTCAAAATAGGCCCTGGCATTTCAAGTACACAGAGGCCCAA
ACAGCCCCACTAGCCTACTACATAGTAACTGTCTATGGCAGGGATCCCCAACCTTTTTTA
CCCCTGAGCCACATTCAAATGTAAAAAGAGTTGGGGAGGAACACAAGCATGAAACGTGTT
CCTGGGGTGCCAAATAAGGACTGTTATTGGCTGTTTGGTAGCCCCTATATGGACTGGCAG
CCTATAGAAGGCTCTGTTTAGAAGTACATCTACTTTTTATGAAACTAGAGCCTGCCTCCA
AGCCAACATATAAAAAATAAGCACCTGCTTTAAGGCCACTGGGAGAAACATCCAAAGGGT
TGGGGAGCAACATGTTGCCCCAAAGCTACTGGTTGGGGATCACTGGTCTATGGCAATGGC
AGCCCCTCTGGCAATTGCTAAAATCTATGGATTTCCAATCGGGGCCTGTAAGCCACTAAT
ATCTTCATGCATTCTAAATAAAATACCCGTATATACTCGAGTATAAGCCGATACGAATAT
AAGCCGAGGTACCTAGTTTTACCTAAAAAAACTGGAAAAATGTATTGACTCGAGTTTAAG
CCTAGGGTGGGAAATGCAGCAGCTACTGCTACATTTCAATAATCAAAATAAATACCAATA
AAATTACATTAAACGAGTGGGGTATGTGTTTTTAAATATTTATTTAAACAGTAAACTAGC
TCTAGTGGAGAAGAGGGTCAACAAAAACAATATGGTATCAATGATGATACCTTAAGAGTA
CTACCCTCTTAGCTCAATCAGCAACCAAGCTAAAACACAAAGAGTTAAAATCCTTCAAAA
CCATATATAGTTTATATCGAATATAAAGTGCAATGTCTAGTGTAGAATGGGTAGATGAAG
ATGAATTTGGGAGCAGGCCAGGGCACTGGAGGGTCTGGTTGTGGGTTGCCTAATTTGCAC
ACAAAGGACAGAGGGTGCTAGTCTGGAGGGACCCATGGCACCCGACTCGAGTATAAGCCG
AGGGTGACTTTTTCAGCACATTTTGGGTGCTGAAAAACTAGGCTTATACTCGAGTATATA
CAGTAAGTAAAAAGTAAAAAATGTGTGTACCTCAAAATATTTCCAATAAATTAGTTTATA
AGGAAATTAAAAGTAGGTCATGCTTATAACTCTTCATTGCCCTCTTAACAGGCCTCACTG
CACATGCTGAGGTTGTCAGAGTTGTATTTGACCCCAAAGTGATAACTTATAAGGTGCTAC
TGAAGCTTTTCTGGGAAAACCATGATCCTACAGAAGGTAAGTTACCTATCAAGTCCACAA
TGGCTGTGGGGCAACCTAAGATTGAAAATGGGAACAGGAAAAAGCAGAAAATGGCGCAGT
CTGGCTTGATTTTGTTGTGCTGCAAAATCTTTTATTTGCCTGCAGTTTTACATTTGGCCA
CATAGTGCCCTTGTAAGACACACTTGCAAAATTTGGCACTGCAGTTAGCTTTTTTTTTTA
AATTTGCACCCTGGGAGGATTTTGTGTTGTAGTTCACCATCCTGTACACTCCTAAGAAGG
ATTTTCACTAGATGTTGAAACATTGATTGTCTACTCACATCTTAGCAAATCCATTCCCTA
TGGACCTTGCTGTTTCTATGAGGGCATTATTATTCTGAAACCTAGGCTACCCCAGCAATA
ATAATGCCATAGTATGTTGAATCATTAAGGTAGCCATACACGTACCTGTTCCCAGTTTCG
ACCATTGGTCGCAGAAAAGATTGTTCATTCCCTCCATTGACATTAAGGGCAGAATCGTCA
GCTATGAAGGTGGAAAAAATAGTTCAGCCCTAAACGCAGACCTTACTCAAGCGTCTTAGC
TTTTGCGATATCGGTCAATCCGCCATACACGCACGAATATCATACAAAACTAGGTTTCAT
ACGTGTGGTAAAAACTAGGACCCTTCCCAAAAGAGCTCAGAATCTTGTGTATGTATATAT
GTATTTATTGTATAGCGATATTGCTATATGCAGTGCTACACATTTTTGCAATATATTTTC
TAGTATAGAGAAAAAAACACAAGGTAAAATAAACATATGCAGTTATATTAATGATCAGTA
ATTCATCTTTACTTTATATCTTAATATATTATTAGTAGTAGTAGTAAAGCTACAAATGTA
TTGTTACTTTGTAATAGTTTTCTTTGTTGATATATAAGTTTCATTTTTCATCTTCTCAAG
TCTCCCTGGAGCAGTTCTGGGAGCGCGGGCAATAACCCTGTTCTAATTTGATACATTTGT
TGATACATTTCTTATCTTTGGCCCTGCTGAGCATAATGCTTCATTAAAGGCAGCTGTTAG
AATTGATACAATAGTTGTTAACATTCCACAGATGCTGGTGAGAAATGTATCAACCAATGT
AGCAAAATGGAACAGTTCAGAGACTTCACCTGGATCAAGTCAATTTAAATAAAGCCTTCA
ACCCACATCCTAAAATCTCACTTACTTTCTGAACTAAGGGGCTCCAAACCTAATGAATCT
GCCAGTGTAACGTTTTCTTACAAGCCCAGACACACGTTTTTTGCTTTACAAATAATATAT
CTAGTCTATATTTACAGGTATGAAGCAGGGAGAGGATGTTGGCACTCAGTACCGTTCAGT
AATATTCACCTATGGAGAAAACCAGAAAGATGCTGCTCTGCTGTCTAGAGAGGCCTTTCA
AAAGGTTTGTACATTAGTGCTAAATTCTAACTACAGGGGGAGCTACCTGCCTACTACATA
CATTTTAAATATATTGTAATACAGCAATATCGTCTGTAGAGGGAACACTTGAACAACAAT
ATCCATTCCAAAAATGTAAAAGCATGGCAAACCTGTAGGCTATCAAGCTGTGTTTGTCCA
TTACAATAGAATATGCTTCTGATTATAGTTCATAATTACTAATGTTTGCATGTTTTAAAA
TAGGTAAGTACTAGGCAGCGTTTCAAAGGCTGGCACACTAAGCAGCAATAATTATTCCCA
GTTCACTGTGCTGTTGACTGTGAATGTAGTGAAATATGTAAAATAGTGAAATATCACTTA
GCTATGACCTTTTTTAAGAGGAACTATAAACTGTTTGTAAAATGTACCATTTCATTTGCC
TTTATACACAGATCAATAAGACACTAGCGCATAGATTGCTTTACACAGTGCCTATACACT
GGCTGATGCCCAAGGGCAGTGATCCCCAACCAACATGTTGCTCACCAACCCCTTGGATGT
TGCTCTCAGTGCCCCCAAACCAGGTAGTTATTTTTGAATTCCTGACTTGGTGGCAAGTTT
TGGTTGAATAAAAACAAGATTTACTACCAAATAAAGCCACCTGTGAGCTGAAAGTGTGCA
TAGAGGCTGCCTAATAGCCAATCACAGCCCTTATTTGGCACCTCCATGAACTTTTATGAT
GCTTGTGTTACTCTCCAAGTCTTTTTACATTTGACTGTGGCTCACAAGTAAGAAAGGTTG
GGGACCCCTGCCTAAGGTATTCCACTGGCTGGCCAAATGGATAGAAACATACAGTTGGCC
ATTCAGAAGTGCTAAGATTCACAGGAAAAAAAGCCTTTCTTTAAGTTTCTAAAGAATAAA
ATAAAACTATGACTATGAATTATAATTATATTAGCTGCTAAATATCTTATAAAATGACCC
ATCTTGTAAAATCGCCCATAGACTCCAGTGAAACAGCAGTCCAGAATGGAAAACACTGGG
CAAAAAACAAAGATGGAAGTAGAGCTGTTAGGACCAAGGCTACAACCTAAATTAATTAAA
TATGTAATTAGGGGTGTCCATTAATACAGATTTTTTGTTTATTAAAGGCTTGAGCATTGC
AGGTTAGACATCCCTGATCTATATTCTAAAAATATGTTAAACAGCAATATTTCCTTTGTG
ATTTTATTAGCCTTTTTCCCAAGCGGCCCTTGTGTGCTGTGATCTTGTGCAGTCACCGCT
ACTTCCAGCCTTCTAAAGGCAGCAAATTGGCATGAATGGGGGTGACTGAAAGGAAATTCT
CACTGCTCACCAGAAGAGAATCACAAAGTTTCATTTTCAGTTGTACTGGATTTATAGAGG
TTTCATCTGGCAAACTGTACTTTCTCCCTTTGATATACTACTATACATGACCCAAAGATT
ACAAACTCTACTGTCCCTGAATGGCCAATGTAGAGATGTCTACAGTTTGTAGCACTATGA
AATGATAAGTAATAATAACCACCAAACCATTACATATATCATCTATTCCACCTCTCATGA
ACAAAGCCCAAAGTGTGAGGGAATAAGGAGGTCAACACAGGTTTAAAATATGTTCAAGGC
TAGGATATAGTGTTGGCTGGAGCCAGTACATAAAGATGAGCTTTTGCAGTTTTCAGACTC
AGAATATCAGTCTTTGTATAGCTCCGCTTACAAATTTTTCTGCATAATCTGCTAAATATT
TGGGACAGAACTGTATTAAAATGTTCTTAGGATACCTTGGCAAATCTGGGGCCACATTTG
GCTTTTAGGTATTCAGGTGTACATCCTTGATATATAGTAAATGTTGGCATGGTACAAGGT
ATGCTTGTATTCCAGTATTCTCTGCCTATCTGTCTTTATGACACTATGGGGCAGATTTAT
TATGCCACATAATACAAGGTGTAATATTCTTTTTTCTCTTAGAGCAGCTTCTGCCGGAAT
GCAGCATAAAATAACAGCGTCCAATCACTTTTGGACAGCATAAAATAAACCTTGATAAAT
ACACCATTTTTTTACACAGCTTTCTATCTGTTTTTTTCAGCAAATGTTGTTTTACACAGC
ATAATAAATAGGCCCCTAAATCTGTCTGTTACTTTATGCATGCAGGAACTCAATGCCCAT
GGCCTAGGAATCACCACTACAGAGATCCGTGCAGCACCTACCTTTTATTATGCTGAGGAT
TATCACCAGCAGTATCTGCACAAGAACCCAGAGGGTTTCTGTGGTCTGAGGAGGACTGGT
GCAACCTGCCACTGA
Chart Advanced