SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002873_2.0
Identity
Transcript15 kDa selenoprotein (Sel15)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002873
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002781_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002873_2.0 # Transcript # 15 kDa selenoprotein (Sel15) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
ATGCTGCTGTGGTTAGTGACTGTGCTACAGGCGGTAAGTTCTGCAGCTTTCAGGCAGTTT
CTCTCCTGCTTCAGCTGAACTATTAACTAAGTGTTAATATCCAGAGCTGCAGTCTCCGCG
GTGCTGCGCCGTTTAGAAGGCGCGGAACCAGGTAACTGTTTGAGTTTCGTGAGGTGACGT
GGCCCAGAGCTGCTTCCTGTGTGTAGAGTGCGGCTCCTCGGCTTCATGTGTACCGGTAGG
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TCTAAGAGACTCGCACACTGAACAAGAAATTTCGTCCACAATGAATTTCAGCCTATGATT
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ATAACTGTGCCCCTAAATATTTTGTATAAGGGACTAGAGAGTGGCATAAATTCCCTCTGG
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GTGTGCCTCTAGTTTGAAACATGGGTGAGAAAACAGGTTACAGCATTACACAATTTACAC
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ATGGCATTTCAGAAGCTATCTAGTTGCTAGAGTCAAATTTACCCTAGCAACCGGACAGTG
GTTTAAATGAGAATCTGGAAGGTGAATAGAAGTGGATCTGAATAAAAAGGATAAGTAATT
AAAAGTTATTTGTAGCCTCAGCATTAGGGTTTTTTTGGCTGTGTTTGGTCAGGTAAATGA
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GTGCTCTATAACATCCCCAGACATATGAAAATAAATGCATTTTATGGACTATATGGAATG
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TCTTGTAACTTGATTGTTTGTCCCTATGGCTAAACAATTGCATTAGCCTGATATCACTCA
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TCTTATGTATGGCCACCTTTAGTTATAGGTGCTGAGTGTGGAGAGCTGCTTGCCAGTCAC
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GCTTATGGCAAGATCCTACAAGCCCAGCGTGAAGTGCTACACTGCCTGCAAATTATGGGG
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ATTACAAAAGCGCTCCTTATCGATTATTTTCAAAAGCGTTTTTCAGTGAGTTAAGTTGCA
TTTTCTTGACACCACTGACGAGCTTATTCTAAACTATTTCCTATCCACAAAATGATTATG
GAAGAACACTTGTGAAGGTGTACTTACCTCTGACACTGGATCCCTGAAATTATGAATTTA
AAGAGGAATCTCCTCTAAAGTATGGATTTGCTTCTCTGCATCACTATTATTGTACAAGAG
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ATTTGCACTGTTTATGGATTTCCTTTAGGTTGTCACATTTTCTCATTTGCTGGCTACCTT
CATTTACCAGTGACCATCAGTCTCTGAACTGACTGCTCTAAACATGCATATTACTGTACC
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GTTCTGACCTATTGCGTTCTGCCTGACAGCAGTGGTCAGATTCCCCACTCATTTACTTAG
GAGTTGCACTTGAGCTACAGGTGCAGTATTGCTAAACAATACATTTTACTACGTTTGGCT
AAAATGGCAAGTTGTAATTTAGGATTAATCAAAAGAATATGCCCTAATTTGCCTGGGATG
GTCCATTAGTGAATTTGCATCTGAGCTTGATTTTTAGCTACAGATCTAAAAATTCCTTAA
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ATTTGGCACATTTTTGTCATTGTTATGTGGTGATGTGGTGGCAACTGAAATAGGGATTTA
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CCATTCACGATTCTAAATAAAGCTGATTGAATCCAATTATATTGAGACTAAAAAGCCCAG
CTGCTAGTTGTATGAATCTCTGCCATTCTTATGACACAAGTACACTTGATTATCTTTAAA
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TGTGTGCTATCTGGCTGCAAACTGGCCGGTTTTACCATGCAAGTGTTAGATGTTGCTGGT
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GACCAGAGTGCTGCAAATTTAACATAACCGTATGTTAGATTTGTGATGCTGAGTCTGTTT
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GTGCTCTCTATCTTCAGTCACACTTTACTGCTGCGCTGCAAGTTGGAGTGATATCACCCC
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TGGGAGTAGGAGAAACAATAGGTTACCTGAAAGCAGTTCTAATGTGTAGCACTGACTCCT
GAAAGCTCAGACTCGGGCACAATGCACTGAGATGGCGCCTACACACCAATATTAAAACTA
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TAAAGTGTTCTCTCATTTTACACTTTTGTGGTTCCACCAAAATATAATGCATTTCCCTGA
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TCTCACATTCTCATCTGTTAGTGACTGAGCTACTCATTGCTTCACTTGAAGTCAGATGGT
GGTTGGGGCCAGTGCCACCAACTTTTCTTACTATAATGCTACCTTGAAAATGTTTACATA
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TCTGAAATGTTTATCTTTTATGATAAGGAACAGCTCGTTATACAGAGCCTTCTGTATTGA
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CAATTTGTATGCACACTCGTGGCTAAGATGGATCAGTGTCCCCATTCCTAGTTGCTGCAC
TCGCTGCTTTCACCAACATGGTAGCTGCTATAGCTGCAGTTGGAAGGGGGGCCAGGAGGG
CTGTATACTGGGTCTAAAGCCAAAGATTTGATTGGATTCTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAA
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TTGTTATTAAGAGAGAACTCCTGTTTGTTGTATTAGGTGTAACCCATTAAGGCCATACAC
GCTTGTGAAGACTACACAGTAAACCTTTACTGGGCTTGTGGATGTCTGATGTTCTGTGTA
ATGT
Chart Advanced