SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002888_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U (SelU)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002888
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002796_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002888_2.0 # Transcript # Selenoprotein U (SelU) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
ATGGCTTCGGTGGATCTGGCTAAGGTGGGCACGATCCTGGTGAAAAATGCTCTGAGTGGA
GAGGTAAGGAATGGGGTAACGTGACTTTGTACTTCTTTCCTTGGAGACAAACAGGGCAAT
GTCCCCTGAGCCATTGCATCAGGGCTCTCTATGCAGCTCTCAGTGTGTGGGACAGAGCAG
CTATTCCCCGGGGCGAGTGGAGCCAATGTAAAGCAAATATCTGTATGGGTAGGTTGTACT
GGGCATTCAGCCCTGGGCACACTTTCCTACAGGGATGGTACCTGGGTTACTGTACAGATA
TAGCTCCACCCCATCCCTATCCCAGGCCTATGAAAAATGTTTTATGTCAGTGTATATAAA
GTTAGAGGGCCTTGTAAGGGGCTCCAAGGAGGCAAATGAGTAAGTGCCAGTATTTTGCTA
CAAGATTTTATTGGTACTGACTGCTTGGGAATTGTGAGTCAAATATAAATGCAGCAGGTG
CGATTGCACTAAAATGGACCTAATATTCTGTATCCCAAGGCCATTTATTAACACTAGTGG
TGTCTAACATGTTTAACATGCTCCTTGCACTTCTGTGTAGTTGCACTAAGCCCAATGCAT
TCACCCAGTCTGCTCTGGTGAATAGTGCCTTTGCCTTGTTGATGTTATTGAACGCTGGAG
GAGAAAATCATGGCAATATGTGTCCAAAATTGCACTCTGCACTGCATTAGTAAATACCCT
TTTTATTTGAGCCCTCTTAATCATTGCAGCGGGTCAGACTGGAGAGCAGCAATACAGCTG
TCTACTTGCATCATTATTAGCTGGCAACACTAGAGATCCAGCCTTGTGCCTGCATTTGGC
ACATTTCTTTGCTAGAAGTCCCTGCTAATAGAATGGGTACTTGTAGCAATAGAGACAGAT
TCTGTAACTGCTTATCATGCCAGTGAGTGAAACATATGGTTGGATAGTTGTGAAACAGTT
TGCAGACAGATTTACTGATAAAGAAACCTCTGTTGTGCAATGGTTGTGACCAGCTAGTTT
AAACCTCAATTTGATTTATACATTTGATTTGCTGTTTAATAAGTATGTTTTCTATAGGAT
TTCATATGAATTGTTTTGAGATTTTATATTTCAATTGTGTTGAGGATTTGTGGCCCTTTT
CGTGCCGCCATGCTGCTGCTTCCCGCTACTTCTCATAATCTGGTTTTGCATTCGCTTTGA
AGAAATACTATGGAGACTGTCACATTCATTGCAGCTCCTCCTTCTCATTAGATGGTTGAG
TTAAAGTCCTTATGGAAGGAGAAGACCACTGTCCTGCTTTTCTTGCGGAGATTCGGCTGT
CAGATTTGCCGTTGGATTGCAAAGGACATAGGTAAATTGAAGGCATCCTGTGATGCTCAC
CAGATACGCCTCGTAGGCATCGGACCGGAAGAAGTAGGACTCAAAGAATTCCTGGAAGGC
AACTTTTTTAATGGAGGTGCGTTCGCAGTTAAAATAAATGTCTTTTAATGTTCATATCCA
TTATTACATACGGAATATGCATTTGTACCAACAGTGTTTCTTCATATTAGCAGGAAACAA
AACTCCTTATAAAAATGCCATTCTGCACAACACTCTCACAAATTTAAAGAACTTGGCTGT
CCTGTATGCTCTACTTGGGCTACATCCAGGCACAATAGTGCACCATGTACTGGGTGAGAC
CAGGGCAAAACAGAATATTCTGCAAGTGCACAGCATGTAGGGTGTATACATACAGTGCAA
ATAAATTACACTGGCAGGATATTCTGCTAATCCCTGCTCACCCTCATTCCTACAGATATA
CACATATAAAAGGCATCAATGAGAATCATGGTACCATTGTGACTGGATCATTCCTTCTTA
CACCTGTCAGTTTCTGCCAACACCTAACTGAATAAGTTCAGTTGATCCATTGTGATTGGA
TGTCCGAGTCTGTACTACCCTTTAGGGTTTAAATGTCTGAGAATTACCTACCATTCGGAT
AAAATGAAGAAGCAGCTCGAATGAGTGGTGCCATGTTTTCAAAGTCCAGTTGCTTTAGAC
TTAATTCTACTAGATACTGTATAAAATGACCTGGATGAATGAGAATCTTTATAGACATAC
AACAGGGATGGATATGTGTATGTAAAAGCCAGAAGAAAAGCCCTTTATGAATGAATGGTT
TAAATAGTGCAATAACTGTATTGTGTTTTTGTCTCAGAACTTTATATAGATGAATCCAAG
GAGAGCTACAAAACCCTAGGTTTCAAAAGGTAAGTACTAAAGTAGTATTATTGTTTCTTT
GTTAACTGCATGTTTCTGAGCCACAGAAAACAGGGCTCTGCCCTGTGTCCAAAGTGATAT
AAATGGCATCCATGTGTCATTGCCCTGGTCCTACATATGGCCTTGTGACCCCATGATGTG
ACCCTTATAAACAAATTCTCTGAAGTGTAGTATAGCAGATTAAAAAAATGACACTTCTTA
TGAATATATAACATTTCTGCTTTGCCAGGGGAGGGAACTGTCACGTGCTCTAGCCCACTT
GGCATTTATGGGTAATGTAATAAAAGTAGCTATGTTTGTATTGGGTCTTGCAACCCATAA
CAACCAGAAGATAGTATTTACTAGTCACCTATCTGAAAGCAGTTGGCTGCTCTTGGTTAC
AAGATCTGGTACAAACTTTGCAACTTTGACATCATCCCATTTAAAAAAAAAAATAAATCA
ATTTGTCTTTCAGGTACAGTGCGCTGTCTGTAATCCCTGCCGCTCTAGGGAAAAAAGTTC
GAGATATTGTCACCAAGGTCAGTGAATGAAGCAAGATCAAATTAATTTAAAGGAAAACTA
AATCCTAAAAATGACTATGGCTAGAAATGCTTTATTTTATATGCTGAACTAATTGAACCA
GCCTTAAGGTTCAGCATCTCTATAGTAATAATTATCCAGTACTTCAGATTAGTCACAGGG
GGTCACCATACTGGAATCTGTTAGAAGTGTGAGTAACACTGCAAATACTACTGGGAGCTA
CTGGGGCATTTTTGGGAGCACAGATTTTCCCTGCTAAAGGCCTGTGGGTGCCTCGGACTG
GTACAGAAGCCCAAAACATAATGTATAACATTTCTAGCCTACTTCTTTAGTTAAGCTTTA
GTTTGAGCATTTTCTAGATAAAGGGGATCTAAAGCAAATTTGGGCTGTGTTTCCTTCAGT
TTTTCCAAAAGAAGAAAGATATTGCTTTAATAGAACCCTGCAATTAAAATTTAAGGGACA
TATTTATTAGTGTGTAAGCCAACATCACTAGTGATGTTGCCCATAGCAACCAATCAGCAA
TCGGATTTGAATGGTCACCTTCAAGTTAGAAAACAAAAGCAAAGATCTGATTGGTTGCTA
TGGGCAACATTACCAGTGATGTTTGCTTACGCAGTATAAAAAAAAATGCCCCTTACTTTT
TAGACAAAATAGAAACTGAAATAATTCTAAAACAACTAAAAATATCTTCATGGTTTGTGT
ATTGCTACATTGTACATAACTATTTGTTTACTTTGTAGGCAAATGCTGATGGAGTGCAGG
GTAACTTCAGCGGGGATCTTCTACAGAGCGGTGGGATGCTAATTGTCAGCAAAGGTACAG
TAAGCAATGAGAAGTGGAAGGACACGCTATATTTTTGCAGTTTGTTTACTGCTTTTCCAC
AGATTTTGGCATAGGACTTTGGGAAAATGTGTTACATTTTGATTTTGTTAAGTTTGAGAG
TTTAGTACAGGACTCGTAAAGAAAAAATATACCTTTTGGACATCTCATTCAGTTGGGCTT
ATGTAAAAAGGAGCTTAAACATGTTAACTTCCAGAAATATATGAATGTATTTTTTGTTGC
CAGGGGTCAGTGACCCTGACTACCAAATAGAATTTTTCCCTGAATTTGTTTTATTGTTCG
TTGACCTTTTGAACAAATGTTTTATAGGTGGCGAAAAGGTGTTGTTGCACTTTATTCAGG
ACTCTCCTGGGGACTATGTGCCTTTGGAAAGCATTGTTCAGACTCTTGGAATCACTGCTA
ATGTGACCGAAAGCCAACGCCCGCAGGTTGGTATATAACGTTACATATTTATAACAGCCC
ATTCTTTTCAGCAAGTGACCTCTAGAGTGTGGAGTATAAATTAGTTTTTATGTAATGCGG
AGCATACATAACAATGCCCTGTGTCCCCATGAACATTATATAAACTGGGATTTGTATTAT
TTCCATCATTATCATTATAAGCTTCTCACATATATGTACTGTAAGCACCACAATTCCCTT
TCACTGTAACGTGGAGCAAAGAAAAGAGAATGGCAGCAGCAAAGCACAGGCAGTTGAACA
TGTGATTATCATTGCAGCCTGACAGATGCCATTAGGATATAGAGGCACAGAATTTCTATG
CAATAAGAACTTCTTTTGTAAAATGCTGGACAGGGAAAATCAGAGCATTTCTGCCCAGTG
TTCCTGTAAATTACAAAGAATATTAGGAAATGTGAATTTTGAAATTAAATGGTTACAATT
TTTGCTGGAGCATAAATGTGTTTAAAGCCCAGATGCAACAACAAGCCACAGATTTAGCGC
TTCTCTCAGGGTACCCAGTACCTGCCCAAAAGATAATTGCCTGGTCTGCCTTTTAAAGAA
CATTTCCTTTGGCACACTATTTATCTCTTAAATTGGGGGCTTTACTTGAAATATATCCTT
TTTTCTGGGAACATATTGACCAGTACTGGTGTGCTGAGAGGTGATGGTGAAAATATATAT
ACACAACCTGATCCTTACTGAACATTTACAACCTGACCCGAATCTTAGCCCATCAGTGAC
ATCATATAAGGGAATGAGTAAAAGAAAAAGGTTAATATAATAATAATAATAATAATAATA
GTAGTATGTGCCATAATGACAACCTGGCCTGTTTGGGACAAGCAAGGGAGTAGATTATAG
ACAAGGGAGCCAAAAGCAAGATTATGTGTAGGGCATGGGCTCTTAGGGTGCACATATGTC
CTCCAGCCCTGTGTAACGTTAATGAGCCCTCTTGTTTTAAGCACAATGCTGTGTATTTAG
CAGATAACAAGGTTAAAACTGTGGCCAGATTTCTGTTTCAAGCTTTGTAACATTTTCACA
ATCAAGCAGACAGGCTGTTGGCAAAGAGATGGCAACAGCAAGTTGTTGTACACATGAAAG
CCTATTTCACAAGCAAGCTGTCGCCCCCTAAATGATCTTTAGTGCCAAATACCATAACCT
TTTGCTCTAAGGCTGGAGTCCTACAGATGTCTGTTTCCCGGTGTGTCCAAGTGACGGCAC
TTGAGTGGGGAACAGCAGAGGGGGCCCTATATTCATTTTTATTGTACAGGTATGGGACCT
GTTATCCAGAATGTTTTGGTCCTGGGGTTTTCCAGATAAAGGTTCTGTAATTTGGATCTC
CATGCCTTAGGTCTACCAAAAAATAATTTAAATATGAATTAAACTCAATAGGATTGTTTT
GCCTCCTATAAGCATTAATTATATTTTAGTTGGGATCAAGTACAAGGTACTGTTTTATTA
CTACAGAAAAAAAGAAAAAAGTTTTAAAAATTTGAATTATATGATTAAAATGGAGTCTAT
TGGAGATGGTCTCTCTGTAATTCAAAACTTTCTTGATAATGGGCTTCTGGATAACAGATC
CTAAACCTGTATTAATTCCACTCTTACTTTATCATTTCAGTGCAATGATGAAGTTTGTAC
AAGA
Chart Advanced