SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002890_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U (SelU)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002890
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002798_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002890_2.0 # Transcript # Selenoprotein U (SelU) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
ATGGGATTATGGTCCATCAGCATTGGAGCCTTTGGAGCAGCAGTGGCTGGAATCCTGCTT
GCCAACACAGACCTGTTTCTCACACAAACTGAAGAAGCCACCCTAGACTACTTAGAAGAG
ACAGAATTAAAGGCTATTGGAGATGGTAAAGGAATATGATGAACCTATTAATAATGGTAG
TGTTGGAATGTGCAATAATCACTGAATCACGAGCAATGTAGCTAACGGTATGGGTCCAGA
CAATTATTCTTGAGATTGGTCACTTCTGTTTTCCCTGAGAAGTGCCTCCCCTCTTGAGTT
TAGAAAAAGATAAAATGTTAACAGAATTTGGAGGGGTGGTGCAGAATATATACTATATAA
ATATAAATACAGGTATTGGACTCCTTATCCGGAAACCCATTATCCAGAACGTTCCGAATT
ACTGAAAGGCCGTCTTAAATTGGTTCAGTGACTTGCCAACACAGTACTTTATTTTCCAAG
GAAGGCAACTTAAAAACCATACGAAATACACACAAAAAAGTTTTCACATTTAAAGGGATG
GTCCACTTTTAATTAAACTTTTTGTATGTAATAGAATGGCCTTGTCAAGATAGAAATGCA
TCCAGCAGCTAGGTACACTAGATCTAATTATTGTAGTTTTTCTTTCTTTGACTCCATTCA
CCTTGTCTGCCCTTGCCCTAACCATTGCTTACTTTTGGCCAAGTTTTCTAAAATTTCTGT
CTGCATTAAACTAATTTGAAGCTGATCAGGCCAGGGCAAACCAGATCAGTAATCTCTGGC
CAGTATGTGAATGGGAAGAGATGTCCGTTAGACTTCAAGTAGTTTGGGTAATAGTGAATA
TAGTGGTTATTATAACATGATCTGTTTTCATAAATGTGGTTATTTGATATCTCGGGGGTC
TAGGGAGCAGGGGCTCTTTAATTTGGTCATAAAATGAGTTTGACAATGTAAATAATGTGT
TTGTTTTGAAATAAGATAGTAAACTTTGCAAATTATAATTTGACTAAATTGGAGAACAAG
GAAACAAATTTGAATGAAGTTCAATTTTAATAATTTCAAGATTTTACCTTTGGGCAAAAC
ATAAATCTCAAATATACCCTTATTTAAACTGTGTCAGGGGCCTCATTAATTAAAAAAAAA
AAAATGGGGGGTGTTATTGTGGATAACAGACTTTGAAACTCTAGGAAGTGTCAGTAACCA
CCTGTATTATAAAACCTATTTCTTTATCATAGTTTTATTTTACAGATATGTATCTATAGC
AGCCGGTATTAAATATATACCTGATTTAGTGTTATTTTCTCTTTTACAGAGCCAAAATCG
TTTAAGGCAAAGGATTTGTGGGAAAAAAATGGTGCAGTGGTTATGGCAGTTCGTAGACCT
GGATGTTTTTTATGCAGAGAGGTAAAACTGTGAATAAAGTTTATTCTATTATACATTTAA
AAACTACTAAAACACTAAGGGGCATATTTATTATGCTGTGTAAAACTAATTCGCCGAAAA
AACGGAGTAAAATAAATGGAAAAGATCGCCGTCTGAACACTGGATATTAAGCCGGATATT
ACGCCGTTATTTTCCAGAAGTTCCGGCGGAAGAAAAAAACGCCACAGCAAAGCCTGGCGA
TGTGCGGCGAATTTTCTCGACGTTTTTTACACAGCATAATAAATATGCCGCTTAGAACTT
GCACAACTTTAATCAGTGATAATGAGGGATTTATGTTATATTTCTTACCCTGTTTTGTCA
TAATTACAGTGAGAATTGCTTTTCCTCTGCTTAAGTGTATGTCTTATTGTTACTTTTTAA
ACCAACACTTCAATCTTTTATATTTGATTAAAACTTGTCAACTTCTCCTTTGCTTATTGT
GGCATTATTCTTGCTTCGGACACACAGTACGTATATGTGCCCAGAGCAAGAATAATAAGC
TGGGTTTAGAGAATCAGAATTGATTACGCCAGGAAAAACACAGAAAGGCAAGGGGAGGCT
AATCTCACTACTTCAAAAGTAGCTATGGTCATAAAAATTGCACCACTCCCCCTTCCACTA
AACTGTATTCGCATCCTCCTCTGGATATGGTATAGAAATAAAGTAACAACTCTGAGTTGT
TTTTGTCGAGAGGAAAGCACAGAATCAAAATTAAGAGGAATATATTCTGCAGGGCCTTTT
ATAGACCTAAATGTGCAGGCTATGAAAGTCAGCTGTCAGCTGGGCACATGGAGTATTAAA
AAGTTATCTGGCCAAGAGTGCATTGGGACCTTAATCTAAAGAAGCTGGATTTGCCACCAG
TGTCTACACTGGTCAACAATATGTTTAAAAGCCCATAACAATTAGCCAGCCAGGTACATT
AGCAGATGATCTGAATATTGGAGATACACTACCCTGTTATATTAGCCGCCTCTGTAAAAA
GGATCTCCGATGTCTTGATAGCTTGATAGGTTAAAGAGTAGTGGAGACTAAACACCACTG
CCTATTTTTACATCCCTAATATAGGATATATATAAAGATTGTTGATCCAGACTCATTAGG
TGGTGTGTTAATTCATGAATTTCAACCATTAAATTAAGTTAAGGCTAAAAGTGTCAGCAG
GGCATTCACTTAATTGTATTTTAAAATATAATACCTCTCTATTTTAATTACAGGAAGCTT
CAGATTTGTCTTCTCTTAAATCTCAACTTGACCAGCTAGGTGTTCCATTGTATGCTGTAG
TAAAAGAGAATATTGGCAATGAAGTTGAACAGTTTCAACCCTACTTCAATGGCAAAATAT
TTCTTGATGAAAAGGTAACCTGACTATTTGTATAGCTAAAACATATTTCCATTTAGAGTT
TAAGATTTAATGAGTATTAACATTTTTGTTTTTGCAGCTTTATCATTTTGTGTATTTTTT
TAGGGAAAATTTTATGGTCCTCAAAAACGTAAGATGATGTTTTTGGGTTTGGTACGACTT
GGTGTGTGGCAGAACTTTCGTCGTGCTTGGAAAGGAGGCTTTGAAGGAAATTTGGAAGGA
GAAGGACTGATACTTGGAGGCATGTTTGTGATTGGATCTGGGAAACAGGTTAGCAAAGGC
ACATTAATATGGTGTCTTACTCTTTGCACCCATGTTTTGCACTTTGCACTCTGCCTCAGA
GGGCATAAGTGGCTTTCAATCATGTGTTCAATTACTTAACATACTTTTCTCATCTATCTC
TGCCTTTGTCCTTTAATAAAAGTTGTAATAGTTAATGTAAATAAAGAACAATATGTCTAG
TTCAGTTGTATTATAATCTTATGAGATTTGCATGTAGTTGGCCATCTGGCCACTTTTATT
CCAAGTTCCTATGCTTTTGCTGCTAGTAAATCATGTATTTTAACCCTTAAATTGAACATT
ATTCAGGTGTTTATGTAGGTGTAAAAGCCTAGTAACCCATAGAAGCATTTACTTGTCAGC
TTTCAAGTTCAAGGCAATGTTTTATTATTACAGAGAAAAAGGAAATCCTTTTTAAAAATG
TGAATTATTTGATTAAAATGAAGTCTATGGGAGATGGCCTTTCCGTAATTCGGAACTTTC
TGGATAATGGGTTTCTGGATATAGGGTCCAATACCTTTATAATATGTGCATATAAGGCTT
ACACAGGCCTGACCTGCACATGTTGCAACTATTCGGCCAATGGGCTTAATTGATTGCATG
CCATCCAAGAGGCCATACTCATGGATGGCTTTCTTTGTATTCTTCGATTTGTGTAAGGCA
GCTGCTCAAATAATCGGAACAGCAGGAATTGGCAAAGAGCCATGATGGTCAATAATCCTT
AATCCATTTGGATCAAAATTTGCTCCTCTTGCCTTTGAGGCTGAGCATTACCTAAAGATG
TTTCTGTTTAGGTCAACATGTGAGTGAGTATAAATAATAAAAAGCTTAAGAGAAATAGTG
GTGGTTTACTCATAAACAACCTATGAGTAATTTTATCATAAACCTAACAATGACATTTGT
TTAGCTGCCATAATGTCATTATTTTTCCACGTTTAAAATGTGCGTACTCATGGAATCACT
CAACCACTGTATTAGTATTTATGCATTATGTTCCTTGAAAAGCAAAAATGTTAGTCACTC
TAAATAGAATTTCTTTACGCCACTATTTCTTGGTGATGACATCAAAGAACTGAAAAAATA
GTTTACTATTTTTAGATGTTGTTTCTGAAGTTGATGTAAAGAAAAAGCCATACTACTATA
AGGTTTTAGCAGCTCATTAGGCTGCAACTCTTTAGTCATCAAGGTGCAAGACAACCTTTG
TTGACTGTCTCTAACTTTGTGTGCTAATATGAGTAACACAGGTTTATTAATGACAACATT
GAACAAACATTAGCAACTGTTTCTACAATAATATGATTCAAGCTGGGTTTGGGCCCACCT
GCTTTGTAGAGGATGTGCTACAAACATTTAGCCTAAGGCTTTACCTTTGTTGCTGGGTTT
GGTAGAAGCAGAATTCAAAGAGAAAGTTGCATGCCATGCTGATTAATTATGCTCTGTATG
GCCTTAATTGTTCATGATTCATGCTAAAATATGTCTTTCTATTTTACACATTACAGGGCA
TTCTTCTTGAGCACCGGGAGAAGGAATTTGGAGATAAAGCAAATCTGACTGCTGTCCTTG
ACGCTGCTAGAAAAATAAACAAA
Chart Advanced