SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002893_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002893
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002801_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002893_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
TCTAAAGAAAACCTGTTTCAGAAACTTCTGGAAACTAAAGAAGATAACCCTGATCGAAGC
GGATATGACTACGACCTCATAGTTATTGGTGGGGGATCAGGAGGACTAGCTGCTTCCAAG
GTAAATTGTTAATAAACTATTTTTTTTTCAGTTTTCTCAACAAAAAAAAGTTTTCTATTA
GGCCCCAGGGCCAAACGATCGAATTAGCCTGGATTCTCCCGATATCGCCCACCCTTGGCG
ACATCGCCAAGCGAACGGATCTTAAGGTGTATGGGGACCTTTAGCAAGGTTGTTCCTGCT
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TAGCTTATACACTGTCTCATTTGCTGCTTGTGTTTCACCATTTATAATGTTACTCATTTT
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AATACAAAACTTGCCTTAAAAGTGTCTAAAAGTGTCATGCACCAGCATGCTTGTGTGAAA
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ATTGCCACTGGTGAACGACCACGATACTTAGGTATTCCCGGAGACAAGGAATACTGCATT
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AGGAGCGTATGCCGATATTTTCGGCAAGCAGTTACGCCATACGCTATGTGTGGCATCAGC
CTAAACACACTTATAGCAGTTTGCCTAGTGAGTTGAATGAATTAAGGTCTTCAGATCTTT
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AATGCATCAGCTATGTATATTTAGAAATGAAATAGATAACATTTAATGTTGCTGTTTCAC
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GGATAGAAGCCTGTATATATGTTCAGATGAGCAGAAATACATTAGAGATAGATGGATGTA
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GATGACTAGTAATGATTATAGTGTTTTGTGATATAGATGACTAGTAATGATTATATTGTT
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GCAAAATCATCAGTGATGTTTGTCTTTATTAATAAATATTCCCCTAAAACTCTATGTTAT
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CTAGGCTAGAGGTAAAAAAAACTGTTGTAATATTAGAATTACATATTTTGTATTGTTTTT
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CCTTTTTTGTCAGTGGGAAGCAACAAACAGTAATAATCACCAGGTGTTTGGTCACCTGAG
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TTCTTGCAGTGCAGTAAACATAAAGGGAGATGTACATTTCTGCACCAATTCTTAGAGGCT
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ATCTTCACTGTAGAGGTTTAGGGCCACACAGTGTTTATATATAGAAAAGGTCAGAGCTAA
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GGATCCGGCTGAACATTGGATCCTTTGTGAAAGATTTGCCAGAATACCGAACCAAATCTT
AATTTGTATATGCAAATTAGGTAAGGAAGGGTTAACATTAAGTTATAGTGAATGTGAAGA
GCGCAGTGAAAAATGTTCAACTTCTGTGTTTATGTTGCAAAAAGTTACATGATTTTCAGA
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TTTCTTCAAAATTAATCTTTATTTGTTTGATGCTCAAAAGACACAATTTGTTTACAGATT
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ATAGAGGTGAGAGAAATAAAGAATAGAGAAATGGGTTGGGTGTGAAGCTCAGCATTTACT
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TTCAGTTGTTACTGCATAAGCTATTATCTTTCAGGCTGGCTGGCCAAAAAAACTTCCTTA
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AGAACAGATTGCTGTAAACTGTGTGCATTTGGTTATCTTTTGCACATTGAAAGCTTGGCC
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GGACAGTACCAGCAAGGGACAATAACAAGTGTTACGCAAAGATCATCTGTAATCTGAAAG
ATAAAGTAAGTAGGAATCCTTTCTAGTGGAAAACTTACCTTTATTAATATTATATTAAAC
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ATTATGCACTCATTATTATTGTTATTACTATGCTTTATATAGTCCTGACAAATTTACATA
GCGCTTAACGGAGACTGTTCATCATTCACATTAGTCCCTGTCCCAATGGAGCTTAGAAAA
GAAGGTCCCTATTAAGTTCAAACTAGGGTCAGATTGATCAGGCACCAATTACCTGGTCTT
CTTATGAGTTTCAAAAACATTAAATAATATGTGCCATTCATTTGCATAGTATTCATGGAA
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AAAATGGAGAGTGGCATTTGTATAGGAATTAAAATAAATTTCACAGCTTTATTTAATGAA
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TTCAGTTTAATTTAACCTAGCAACCAGACACTGATTTGAAAGAGAGACAAAAATGTGAAT
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GCCTCACTGAGCAAAAGTTTTTTGGCTTCCGGGTCAGTGAACCCCATTTGAAAGCTGAAA
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AAGTTTGGAGGAATAGGTCATTGAAGACCAAGTTGGTAAGAATAGGTCATTCTGTAACAT
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ATTATTATTATTAACATTTATTTATAAAGCGCCAACATATTCCACAGCGCTGTACAATAA
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ATTTAGGTGATATACCTCTGCAATCCTCAGATATTAGATGGTCTGCAGGAGCAGATGGGA
GTACAGGCCCATTTCACATAAACCTTAAACTAAATGCTATTACTTTCACATTGAATCAAT
AAAGTAGGGATTTTTAGCCCATGGGCTTAGCATTTGCACCATTGGTATATGTTATACATC
TGATATTAAGTTTTAGTTTGGCTGCTGAAAATAAAGGATTTTTTCAAGTTACCACAACTG
TCTGTATAAAGTAGTGGGAATATCTTTCCTTATTAGGGAATCAACCCCACATAGTCACAG
CTTCATTAAAAGGGTATTTCAACTATTATCAGGTCTGGTGTGGCATACAGTAATAGGCCT
TGGCATTTCCAGTACACAGAGGCCCAAACAGCCCCCTCCAGCCCTCTAAACAGTGACTGT
CTATGACATCTTTCAGCAGCCGCTCTGGCATTTGCCAGCCCAGCTTGACTTTTATACAAG
CTTGGATAGCGATAGCTGGTTTACAAGGTACAGTACTGCTCAGCAGGTAAATCTAACCCT
AGGTATTAAACTAAAGTTAAGATGTCCCTGACTTGCTGGGAAACCTGAGACAGTCTCTCA
AAAGAGATAGCACATAATAGATGCAATAGCTAGGTAATACATTTTATTAAGTGTATTAAG
ACATGCAAAGCACAATTAGCTATCTATCACCTTCACTTCTATCCTCTCGTTTCATTCTGC
ATGCAATATAAATTTCCAAGTCAAGCCAGGAGACAGAGAAATCAAATTAACATTCTCCTT
GGAAGCTGGCTGTCACCTTGCACAGCTCACCTGTGTTGGGCCTGATATGCTAATGTGACA
GGCCATAATCATAAAGATGATGGGTAGCAAGCAAGTGCACGGCATTAATTCTGCTCACCC
GACACCTAAAGGCTGCTGACCATGATAAAATGTACTGACTTTATTGGCTTTCTGTCTAGA
ACAGTGATTGCCTAAGCGACAGAATCATTTGCCTGTAATGGCCGACTCTGAATGATCAAA
TAACTACTGGGGTGCCACACAGTGACATAAGTTCTCAAATATTCTTCCCCTCTTCTTTAT
GATGCCATAAAGAGTAACTAAATACAGAGAAGCAGCTTGGCACTTGATTACTGTTTGGCA
AAGTATTCTCCTTCAGGAATAACGAGAAGTTGTTTCATATTGCTGCCAAGATTATTGTGG
CAGTCTGTTCCATGTTACAGTTGAGATTTATACATGCAGTGTGGGCAGGGGGGAAGGGGG
GGGGTAATTCCTATCTAGTCTTCATGATCGATAGCTCTATTTATCTCAAATTTGCCATTT
TTTACCCAAGCCAGCAATCATTTTTTCTCTGCAAAGCGTTCTCGTTAGATATATGTAAGC
AGAATTACTTTTGCAATTCCTATTTTTTTTAACTTACTACTACCTTTAACTATTATATTA
TATATTATACACAATGACAGTAACAATATCTAAATAATATTCACTGGAAGTGGCTTTGCA
AGTTTCAGTTCACTGTTAAATTATCTGATGGAGAAAATGTGTGCTGATATTTTTATTCAT
TCCAATGTACAGTTTACAGTCAGGGTTTTTACTGGGCCGCTAGACCCGATCCCTGTTACT
ACATAGTAACATAGTAACATAGTAAGTTGGGTTGAAAAAAGACATACGTCCATCAAGTTC
AACCATAATGCCTATATATAACCTGCCTAACTACTAGTTGATCCAGAGGAAGGCAAAAAA
CCCCATCTGAAGCCTCTCTAATTTGCCGCAGAGGGGAAAAAATTCCTTCCTGACTCCAAG
ATGGCAATCGGACCAGTCCCTGGATCAACTAGTACTAAGAGCTATTGCCCATAACCCTGC
ATTCCCTCACTTGCTAAGAATCCATCCAGCCCCTCTAAAGTANNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAATCTCATCTGCCACTTAGCTGCC
CAGATTGCCAGTTGGTCAAGATCCTGCTGCAGGGATGTCACATCCTGGATAGAATTGACT
GGTCTGCAGAGTTTTGTGTCATCTGCAAACACTGATACATTACTCATAATACCCTCCCCT
AAGTCATTTATGAACAAATTAAACAAAAGTGGACCCAGTACAGAACCCTGAGGGACCCCA
CTGAGAACCTTACTCCAAGTAGAGAATGTACCATTAACAACCACCCTCTGTACCCGATCC
TGTAGCCAGTTTTCTATCCATGTGCAAACGACTTCACTAAGACCAATAGACCTTAGCTTA
GAAAGCAGTCGTTTGTGGGGAACGGTATCAAATGCTTTGGCAAAATCCAAATAGATTATA
TCTACTGCATCCCCACTGTCCAGCTTCTTACTTACCTCATCATAAAAAGCAATTAAATTG
GTCTGACATGACCTGTCCTTCATAAAGCCATGCTGATTACTGCTCATAATGGCATTCTCC
ACTACATAATTTTGAATGTGATCCCTTAACAAGCCTTCAAATAACTTGCCCACCACGGAT
GTCAAACTTACAGGCCTATAATTGCCAGGCTGAGATCTTACTCCCTTTTTAAATATGGGA
ATGACATTCGCCTTCTTCCAATCCCTAGGTACCATACCTGATGAAAGAGAGTCTGAGAAT
ATCAGAAACAAGGGCCACTGCAATTCTGCCCTAGCTCTCTCAGTACCCGAGGGTGTATTC
CATCTGGCCCAGGTGCCTTGTTTACATTTATCGTGTGTAACCCTTTAAGCACCATATCCT
GTGCTAACCACTGTGAAGTTGGAGCTGAGGCAACAGTGCAGCTATTGGGTGGGACTTGGC
CCACTGGCTCCTCTACTGTATACACAGAAGAAAAGAACTGGTTAAGCATATCTGCCTTTT
CTGTATCCGCTGTAACCATATTGTTACTATAACTCAATGGGGCCACACCCTCAACCTGCA
TCTTTTTACTATTAATATACTTAAAAAACTTTTTGGGGTTAGTCTTGGCCTCTGCCGCGA
TGCGCTCCTCATTTTCTATCTTTGCCTTCCAGATTGCTGTTTTACAACACTTGTTATAGT
GTTTATAATCATTAAACGCATCTACTGTCCCCTCTGACTTATATTTCTTAAAAGCTTTCC
TTTTTTTCCCTATTAACTTCTTTACCTCAGAGTTAAGCCACATAGGTTGATTCTTAACAC
TTCTACTTTTTCTTATTAATGGAATAAATTGAGAACAGTAATGATTTAATATCATTTTAA
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GAAGCGCTGCCCTTAAGGAGCTAAAATTTGCCTTCCTAAAATTCATTGTCTTTGTTGCCC
CCGTGTAAATTTGTTTCCTGCACCAAACATCAAATGAAATAACATTATGGTCACTATTAC
CCAGGGGTTCAACCACTTGCACATTTGCTATACGTTCTGGGTCATTAGAGATCACTAGAT
CTAGTATAGCATGGTTCCTGGTTGGCTCCTCAACAACCTGTGACATAAAGTTGTCATGCA
GCAAGTTTATAAACTTGTTCCCATTTACTGTCCTGGCAGTACTACTCCCCCGGCCGCCGG
TGTCCTCCCCTGACATGTTTCACTTGAGCGTTCAGTGGAGGATGTCCCCTGCAATGGCAG
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