SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002893_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002893
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002801_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002893_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Reverse
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AGGATCACTTACAGTGTTGTATTCTTCTGTTGTCTCTGCGCCATCAGATGCTTGTGATGT
TACCTTTAACCTCCCAGGTGTGCCTGCTTCTATTTGTTCTATCTGGCAACACAAACATCA
ATGGCAATGTTATTTTCAGGAATGAGCGCACAAATACTATATATAATGGAGGCTTTTCAA
TATTCCCTAATAGCAAGTCAAGTACATCCATCTATCTCTAATGTATTTCTGCTCATCTGA
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GTAAATCTAATCATCTTATGGTGTTGCATTCATCACAGTGCATGTATTGTGGTACCTAGG
GTCAATAGCAATCTCTTGCTGCTGCAGCTGAAATCAAATTTTCATTATTTCCTACAGGCA
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GGGATTCTACCCATTCAGGATCTAATAACTGAAGGGATTGGTTACATTAAAATCTATGTA
ATATCCTCATCAGACTGACCAGTGTCACACAAATGAACAAAAACAGACTTTATTATCAGT
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GACCTTGTACATCTGCTATATAGTGAAACAGCAACATTAAATGTTATCTATTTCATTTCT
AAATATACATAGCTGATGCATTTACAGTCATATAAACAGCTATGCAGGCCAGATACAGCA
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CTCCATGCTCTTCCATGTATTCACCAATCATGTTTGCCATTTGCTGGTCAAAACCTCTTA
AGAGAATGGAACGCACCATGACGGTAACATCTAGACCAAGTCCTGCCAAAAAGCCAGCAC
ATTCCAAGGCAACATAGGATGCTCCAACAACCAGAGTCTTCCCCGGACAGTAAGGAAGTG
AGAAGAGGTCATCGCTGAAATAATAATATAACATTTCTTTAGCACAGAAATAAACTGTAA
GTGGATTGATTTGACTGATTGATAGTGAGGCAAGTACTATGCAACTGGAACTTTAGTCCT
TCTCAGTTGAGCCAGATGCAGTTCCATTAAAGACAGCATACTAGTGTTACCCTACATACT
ACACTAATCTGACTGTTAGAAACATTTTCCTGACAGTCAGGAAAGCATAATGAACTGAAA
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GAAAATATCGGCATACGCTCCTACCTGTGCCTGCACCGGAATGAATGGAATATGCTCGGG
TGCAGGCAAATGTAGCCGAAATACGCATAAAAACGCAAGACTTTACATTCTCTCGCGTTT
TTATGCTGATATCGGCTACATGTGCCTGCACCTGAGCATATTCCATTCTTTTCGGTGCAT
GCACAGGTAGGGGCATATGGTGTGTATGGCGCATATTTTTGGCAAGCGTTTTTCAGCTTG
CCAAAAATATACGCCTGGTGTGGCATCAGCCTTAAACAACAAACAAATACTTTCAAGCGT
CCCTCTTAGCTTTGTACCTTGTAATGCAGTATTCCTTGTCTCCGGGAATACCTAAGTATC
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TACTGTTTGTTGACTTGAAAAAAAATAAAGAACAATATCAAAATTGTTTTAAATTTTTAA
TTAGCCCTTTTTTGAAAGAAAATGTTTGAAGAAAGCAATATATTGAGGTATTTACCAATT
TAATTTAAGTACAGTATGTTGGGTTTATTACTGTTACTTAATCTGTTACTTATATATATA
TATACATACATACAATCCTTTTCTTTCATGTTAGTTGAGCAAAATAAACTTCACTTATAC
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GACCTAATGCCTATTCTGCACAATGATAAACTGTGAGTAAGTAGGTTAAATTTTAGGAGT
GCAGGGACATCTATGAAGTGATAAATGTAAAGTGAAAGTAATTGACTGTCCCGCCTCTAT
GCCTCAGATTTACAGCTCCGATTTTTAAATACATTTATAACAGGTATGGAAGATTTAATA
AAAACATAACTTTATGTTTATTTTGCACAGAACTTTTATTATATAACTTTTTTTGTGTTT
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CAGTTCCACAAAAAGTAGCTGAAGCTAACTTGGAAAATTATTAGACTGCCAGGAGAATAC
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ATGAGATTTAATATAGGATCTCTCCCAATTATGGTCAGTAGACTTTTGTATGAACTGAGG
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