SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003073_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesCebus capucinus (White-faced sapajou)
Transcript IDSPT00003073
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002949_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003073_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # White-faced sapajou (Cebus capucinus) # Full length # Forward
GAAAGAGAATGGTTAGGTTCCACCTACTGTTTACCTAAGATGAAACTTCAAAAGAAGACA
TAACCAATCCCTGCCTTATGTAGAGCTGAGAGCACAGCAAATCCAAGAACCAAGAATGGA
CACATCACTGGCATGCTTATTTGTGGGAAAGTTTGGGAAAGGGGGGGAGAAGGGAAGAAG
TGCTCGGAAGCAGACCATAGGATATAGAGCTCATTACCCATACCCCACCCCTGGAAGCAT
CCACTTTTACAGAGGGGCTTCCAGCTTTGAGGATAACAATAAAACAATTTATGTTTCACG
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AAGCTTCTAAGCTAACTAAACTCCCATAATAGGGGAATGATTAAGTGGACTATGGTATGA
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TAAAAACGTGCCATTAAGCACTCCAAGACATGATCGTAGTGCTGGTCTACAGATGAGGGG
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ACAAACGGACCCATATACACTCATCACATCTTTGTCGATGGATAAAGAAAGCACTCTTGA
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TGCCAATTTTTCTAAGGATTCACCAGAAACCCCTTTCTTCTCCTATCCTTTAAGAAAATC
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CTCCTGCTCTATTTTATTCCTTGAAAGGGAGAATGGTATCTTGCAAAGTATGTAGGCTTT
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TGGGAATTAAACCCACTGTCATTTACAGGAAACCAGAAACACTCAAGAAAGTATGAGCAG
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CAGTCATCTCCCTCTTTATGAGATTATTTCTTCCCCCACTCCCCCTTCCAGGTAGTAGGG
GCTGCCTAACTCAGAGGAGACTCTTTGCTGGAGAGAGCCAGGGTAGCAGCTTAATCTGGC
TCTGTTCACGCCTTTAGGGAAAATAACTCATTTTTTGGTGTTTCTTTTCCTATACCACCA
AATTGGTAAGATATTCTGGATCAAAAAGACCTTGTAGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCT
GCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCAGGTGGATCACCTGAGATCAGGGGTTCGAGA
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GGTGGTAGGCATCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTAAGGCATGAGAATCTCTTGAAC
CAGGGAGGCAGAGGTTGAGGGGAGCCAAGATCACGTCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAG
AGTAAGACTCTGTAAAAAACAACAACAAAAACCTTGTGGACTATTTCAGTATAGGCTGTC
AATGAACAATAATCACAACTCATGGTATCCATGGACCACAGCCTCTGTCTAGATTCTTCC
AGTATAAGATCTAACTTTTAACGAAAGCTTAAATGCAAGCTTTGTGTTGCGATTTCTTAA
GTATGCCCAGATATGAACTGTTTAGCAGCTAAAAACACAGTGCCAGCTTTCCATTTGAAA
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GTATGAACAATGGAAACAACCTAAATATTCACCAACAGAAAATGGATAGAGTATAATCAC
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CTTGCTCCTTCATATATATACACACATAACACAATTCTTCTTTCATTTTTTCTCTCTCTC
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TAGTGTTTACCACCCTCTCCCCAAAACACAAAATTGCAGAAGGAGAGGTACAATATGATT
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ATCTCTGCAGCATTTTATTTCTTAAGTAGGAATTGAGTTCCATGGCTGTTCTTTATATCA
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TTTTTCTCCAGTGAAACTCAAAACTTCTTATTTTGATTGAAGAAAAACATGTTCTTGGTA
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ATTCACTTTTGCTCCAGTCCTGCTCACCAGGCCCAGGGGTCACAGATAGGTCTTTAAAAT
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CTCTTCCCCTAAATCAGTTGTTCCTTCATTCTAGAATTTACTTCTTCCTTCTCCTTATCA
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ATCTGGATTAAGCGTGCTCATAAAGCCTTGAGCTCCTCATAGCACTTGTTACATCTCAAT
TGTAACTGCCCATTTATGTGGAGTCCATTAGTTCTATAGGGACGGAGGGTGACTATTTGG
CTCATTCCATTGTCCCCAACGTTTATATAGGCTCTGACAAAGTAGATAATCAGAAAATAT
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GGCACAAAAAAGTGGATATGACTAATAGATAATGTGCCTTTCCCATTTGCTTCCAAAAAG
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TAAGCATACCCATGTATGTCAGAGATGGCCTTGGAGCTCAGAGCTTTGTATATCTGCTTG
TTTTCTTATTCCCTTCCCTAGAGAATACACAGTAAGGTGAACAGTGTACTTCCCCCAGGA
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ATCGCTGATAGTTTGAAGTTCATAACTCTAAAACAGCATAAGTTTAGTGGAACACTAGTG
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TGAGATTACATTGAACAGGCTTCCTCTCTGCAGAACTTCTCAGTCTTTAATAAATTCCTG
TACACTATGGCTCTCTAAAACCTAGATGTGGAATTTTTCAGATATAACGACCTTGGAATT
CTTTTCTGATAAAACCTCTACTATCATGCAGATTTTGGCAGAATATGACTTAGGAAACAC
TGCTCTAAAGTGCAGTCCAGATTGTTTCATTTGTTTTGCCGCTTATTTCATTTCATTTCA
TTTTATAGCGTCCACAAATGTAAACTGCACATCTTAAAGATCTTGTCCATATTTTCATCT
ATGGCTTGCTTCTACACCTCATTCACAGAGATGTTGGGAGAGATAGGAATACATGAGTAC
ACTATGTGCACCACAGTCCCCCTGTTCTGCCACGCTACTTTTCTTCTGGTGAATGGCTCA
ACCCTAGCTATTATTGGTCATTGCCATTTTTCTGTAAGTGTGCACAAACAATACAAGTCA
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CTTCTAAAATCTTTCTCATCTTCAGCTTTTCTCAAAGATTACTGATGGGGTTCATACATC
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CCAAAGATATGAATTCATCTATGGGCAAATAGTGATCTCTTGACTCCTCATAATACCTTG
GCCCAGGTAGCTCCCTGATTCACCCTTTGTAAGTAACAGATAGGTGATGGAATGAAGTCA
CTAGTCCAAGAGCAGAGTCCTAAGACCTACCAGCCATGCTTTTCTTGGCTCTCGACATTT
TGTTTCAACATTCCCAGTATAAAAATCATTCTCTTTATAATGAGATATGCAAAATAACTG
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AGGAAAATGAAAATAAAATCAAATTACCACATTTCACTCACTATATTGTCCAAGATTAAA
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TAGAAAACAGTATGGATGCCAAAAATAGAGAGATGATAAATAAAATATGATACCCATATA
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TTAAATGTTTCATTCACAAAATATATACATAGTAATTCTTACTTAACAGTTAATAAATAT
TCTGAGGGTTTTACATGCATTAAGTCATGTAATAGCAGACAAGACTATTATTTCCATTTT
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TCCATGGGCTCCATCCTCTTGGCTGCTCCATTGTGCTTACTGAAAGAGGTTGCATACCAA
CGTGCACAGCATGACACTGGTCAATATCAACATACTTTTCCAAAGGAATGGAAGGAAATA
TGCTACACTCGTAATTACGTTGCCTTGGCTAGAAAGTTTGTAGAATGATCAGGATAGAGG
GAAGATCAGAAAAGACTGTAGCTTTATCTTCTAATTTTTTTTTTCTTAAGAAACAATATG
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GGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTTAACTCAGCACTTTGAATGATTATAACATTTTGGCA
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CTCTTCCGTAAAATGGGTGCAGTAACATCACTTACTGACCTGTGCAGTTGAGATTCTGGA
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TACCATGTCACACCTCGCCTTCACGTCTCTTTAGGCTCCTCTCATTGTGACAATTGCTCA
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TACTGTTAAGGAAAGGTTTGTTTTAATATTCAGTTTCTTTTTTGATAATGCTGATTTTGG
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AATTATATTTAAAAACTCAGGGTAAAAATTAATTGGCTTTAGCCAGGCCTGGTAGCCCAC
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CAGATCAGCTTGGGCAATATGACAAAACCCTGTCTCTATTAAAAACAGGAAAATTTGCCG
GGCATCGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCATGAGAATTGCT
CAAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAAATCACACCACCACGTTCCAGCCTGAG
TGACAGTAAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTAATTGGCTCAAAAAGTGAAAAGAG
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TTTAGATTGAATTTCATTCTTAATTGAACACAAGGTATATAAAACTCAGGTTCTGTTGAG
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TCCTGGGATGTGCATCCAGTGTCATCCTACAGGAATCACACTTGGGGTTTCATGTTCTTT
GCAACTTTCTTGAAATTCTTAATAATGACCTTGGAATTTGTGTTTGATAAGCAAAGTCCA
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TCCAGATCCTGCATTCTTTTCATTGCATCTAACTAGAAAATAACATGGAAGTTTGCTGTG
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TGTCTTCAATATAGCTTGTTTCCTACAGGATAAGATGCATTTGGTTAAAACATTTTCCAC
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TAGTTACATCTTGCAATACAAAGAGCTATATATATTCTATATAGAAATATGTAGTGTGGT
GGAAAATAAGTAAGTCCAGGGCAATTAAATGTTCAATGATGCTACTGGGTCAGTTATCAA
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ACTCAGCTTTCTTAGTTTTCTCATCTGTAAAATCACGCTAAAAACAAGCTCTGTCAAAAC
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TCACAAAATTCATGAAAGTACACAAATAACCTATCAGAAGATAAATTTAGTCTTAAACTA
AATCTCAAAGAATGTCCAGGATCTAGCACTTACTACCTGCATGTGACAGAAAACAAAGGT
GGGGTTAGGATTGACATTCCAGAGTTTGCTAAAACATTAGCCTAAGTTTGAAAATAATAT
ATAAAATTCTACATGTGTCTACAATAAACAGCAGGTACCTAAAACCGGGAAGAAAAAAAT
TTGCAGAACAATTACTCTCTTGTAAGCAAGTTAATGAAATTAATGGAATGGATGTTACAT
CATCTCAATGAGAGAAGGCTGTGTTAGGAGTCTCTTAGTGACTCAGAATAACAAGCCCTG
CATGAATACTGATGACCCTTAGCAAAAAAATTCTTTCAATTCAGAAAATTCAGATTTTTC
CCCAAATATCCCATGAAACTGAGGTATGAAGGCAAAACCATATTTACCTGCAAGAGTGAT
TATAGCGAGCTTCAAATGAAATGGAAGACTAAACTGTTAAATATCTCTATTTTGATCACA
ATGTTATCTTTCTAAAAAACTATTAATGTACCATTTATTTAGAGCCTATAATTTCCAGAT
ATTATAATAAGCACTTGATTTGTATTATCTCATGTACTTTTGGCAACAATGTAAGAGGTA
GGTTTTATTATGCACCAAGTGCCCCCTTTTATTGATGACAAAATTGAGGCTGAGAGAGGT
TAAGTAACTTGCCTATAGTTACACAGCAGTGGAGCCAGGATCTGAACCCAGGTTATTTGA
TCTCTGCATACTGTCCATGAATCACAATCTCTCACAGCCTCTATACTACTTCCCCCTTTT
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ACTGAGCCTTGTTCTTTCCAGTTTCATAGAAATGACAAAAGATTTTTCTGTTTCTAGCTC
ACTTGGCAACACTCTTTTCTCCTGCTGGCTTCCGAGAAAAGTAAGNTGATACACATCAAC
AGATGCCACCTTTGACTAGGGCAATTCAGACTTGAATGTACCTGGGCTCGAAATTCAGTC
ACCCCTACCCTACTCCAGTGTGCGTTCAGCCAAATGCCAAGTCTGATCTCATCTTCTCCA
GAAATGTCTCTGGGTGCCAGGCCCTTTTTTGTTCCCACTGCCATCACCTGAAACTATTTC
TCAGTGGCGTGCATTGATCTAACCTAAGACAATTTTTCTTGTTTCCTTCTTCTACTTATA
ATCCCTCAAAGTCTCCCTCCCCATGACCATCAGGATAAAGTGCTTCTTGCTGATATTTGG
CAGTCTCTGTGAAACCTCACCTCCAGAGGCCCCTCTACAGGGACCTCCTTTCCAGCCAAG
CCGCTTTCTTTCTTGCCTTTTTAACTCTTCATTAGAGTAAATCACCAAATTTCTCTTTCC
AAGATCTCACCCTTCCTTAAAGGCTTAGGAAATGTTTGTGCCCCTCATCCCAAGTGCACA
ATCACTTCTTTATGCTTTCCACTTGGCATTTGATGCTGTGTGGAAATAATAACTGACTCA
CACAGATTGATTTGTCCTTAGTGCTCACCTAGTTAAACTCCCTCACATGAGAGATAAGCA
AAACCTAGAGGCAAAGGGAGAAAATCACTCACCTGAGGTCACAAAGGTAGTGGAGGCTGG
TCAAGAACTCAAGTTCCTAATTATCAGGTGTTCTATATAATTCCCCTTGCTATGAACATA
ATGTGGGAATTCAGTTCTCTGTTTCTTGCAAAGTCAAAGATTTGCTCTGGTGCAGTCAGC
AGTTAGTCAATACCACTCCTAACAGCCTACATTTCACCGTGCTGATCCTCCTTCACTTGC
TCCGTTCTCTCCATACGCTTTCTAAATCAGTGTTTCTCAATGAGTGTTCCTTGGATCTCA
ACTCCAGAATTTCCTGGTGATTCCTTCTTATAATGTAGTTCCCTGGGCTTTACCTAAACC
TATTAAATCAGGTTGTCTTACAATCTGCCATTTCAAAACCATCTCAGGTGATTCTTAACC
ACAGAAAATGTTGGAACCATTGATAAATATACAGCCTAATTTTTTGTGAATTATAACTTT
TCCCTAAATGTGTCTGCAAATTCACATTTACTCTATAACAAGACACTACTTTTGGTTGAT
ATTAAAACTATTTGTGGATTCTCAAGCTATGAAGTGCTTTATAAAGAACTTTAAAGCCCC
ATATTTTCCTGACCAAATCCCTGCCCCTAATCCCTTCCCACAGCTGTGGGGACCCTATTG
CCAGCAGTCCTGAAACTACGTGGAAGATAAAGCCAGGATCTCTTCTGGGATCACTCTGAT
TCTCAAGCTGTTCCTCTGCAAGGTAAGTTCTGTCTCCTGAGAGCCATGCACCTTTTTTTT
TAAGGATTAAAAAAAATCAGTCCAAAGTTCTGCAGTCTTTCTAGTTACATTAACAGTTTA
ACAGCTACCTCCTGTTCTCTCCTGACAACTCTTCTCCCTAATCCTGCAGATGACAGGGCC
TGCAGACTCACATTACCTCCCAGGCCTGGGCTTTACTACGGACTCTCAGAGTCCAGGAGT
AGGCTTCCTGCCTTGGGTAATATATAGGGTACATTAATGAATGTATTCTGCAATTGTTCA
CCTCAAGAAAATGCCAACAAATCCTGGAGAATGGAATATACCTTGGCCATTATTTCCAAG
TCACATTTAGGGTTCTTTCATATTCCACACCCAGGGCTAACTCTTGGTCATTTTCCTCTG
CTTAGTTCCTGCCTCCCCGGGTCTGAGTAAGTTTCTGCCTAAATTCTCTTCATGCCTCAT
CGTCTTCCCAAAGTGAAAGGAGGATAGTTATAATTCTGCCATTTTGATACCTGGCTGAGA
TTACTTTATAAATATTACGGAAGAGAACTAGAGGACCCCATCTTCAACCCCAGATCATTA
GGGACCAGCCCCTTTGGTGTACAGAAGAGTAAACAGACAACAGAAAGGGACAGTAACTTG
TCCGAAGACACACAGCTAATTGGTCGCAGTTCTGGAGGCCAGATCCTCAGCCCCTTAAAG
CAACGCTCACTCATTCCTGTGAAAGCCACACAGGACAGATGTTCTCCCACTTAGAAACCA
TTGTTGAGGACATTTGTCTGTTGACTTCCTGGACATTCTCATGAGCTTCCAGTGAATTCA
GACTTCTTACTGAGCTCATGAAACTAGGAAGCACCAGCAGACTTCAGACCTCTTTCTCTG
GAGGCCCAAACTCCCCTACCTGAGCAGCTCAGAGTGCTGTGGCTCACCTGTCCAAAGTCA
GAGAGTTTCCTGCCCAAGCCTCGGTTTTCCAGGACTGCTGTGGACATGCTGGCTCCCCGG
GAGTGAGGTCTCTGGCTTTTTAGGGCCTCAGGCAGGTTTGCAAACAGCACGTGGGGCTGA
GTGTTTTAACCTGGCATTAGGGTGGAGAGGAGAGTTACAAAGGGTGTCTTTTGCGCCGCG
CATCCGGCACAGTAACGCCCCTGGTGGGCGTTGTCCTGACGCAGGAGGCCAGGGCAGCCT
GCCTGATCCTCCAGGTCACCTGCCCTGGACGGGCCGGAGGGGAGGGGCCGAGGGAGGGGG
TAGCAGACGCGGGAGGCACCACTTGGCTGCCCGCCCTGGGTGATGGGAAGAACCCAAGGG
CAGGTTTAGGCACTTCCGGGACTCTCAGAATCCTGGAAAGTGGGTTCTCTGCAATTGGAA
TAAGCCTGCGACCCTCTGGTATAACAATTCTATGAATAATCCCCTTCACCTGCCCCCCCC
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