SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003160_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Transcript IDSPT00003160
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003038_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003160_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) # Full length # Forward
TACGAATACGTCACTCAGGAGCAGCTTGCGGGCTTCGACAAGTACAAGGTATGATTAATT
GATTGTAACGTTAATAGCCGGCTAGCAGCTAGCCATTGAGCCGACACTGTGTGTGTAACA
GCTAGCTGTCACGATCTTCAGGGTGCTCCCCTGGAGGAAAAAGAGCTAAAATCACACCAG
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TGTGCATGCGCGTACATCATTAATGAGGTTTCCAACCATCAGCCGTGATACAGTAACAAC
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AAACGTTCACCAGAAAATATGCTTCCTGGCAGTTCTTATTCCACGGAGATGCTTGTGCAT
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CGTGCCTAGTTGGGTCTGGGTTGCTGCAGGGATCTTCAACTTCTTGGCCTATACACTCGG
TGAGTCCTAACCCCCCACGACCCCTGTGTGTTGTTTTTTCTCTGGCCTTCTGAGGAGCTC
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ATAAATAAACACATCAGTGCAACCGGATGTTGTAATTAATGTAGTTTTTTATTATATTCT
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GTCTGTTGGTATTAGTCAAACACTCAGTTGATGCAGTTTTAATTGCACGTGAAGTGGAGA
TGTTTGCGCTCCAGGAATTAGGATCCACCCCAATCCTCCAAGCAGGATTAACCACTTAAA
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CATGTGTTCCAAACTTTTTCAGGACAAGAGCATCTGAGTTAGACCTCTCGTCTGTAGGCA
GTTGCAGCTTGTAGCATTGCTTCACAAATATGAGCTAAAGCTCCGAAGCTTATGGGAATT
ATAATAAAAGTACCAGCAGGGAGAGCTGAATTTGATGTTTTATAGCTCGCTCGCTGAGCG
TGCTGAAGTCACTTAGTCATATAGATGCCCTCAGATTTTCCCCTCGGGCAGTCAGTGACT
CTCTTACTACAGTCAAATAAATAGAGATTTATTTTATTGTCAAATTCCTTCTCTGTTTAT
GTGTTTGTTCGTGTGTGGACATGAACTCCGTGAACCAGACGTCATCCTGCTGACCATTTT
GTGAACCATTAAAATAAAACAACTTTTCCATGTGGACTTTCTTATGAGGATGCGTTTGCA
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TCTCTTTTGTGTTATGTGTAGATGGTGTTGATGGCAAACAGGCTCGTCGCACCAACTCCT
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GTTAGTTATTAGTGTTCAGAATCAGTTTGATTGGACAGGTATGTGTACACCAAAGATAAA
CGCAAACAGTTTGCATACATGACGTAGGTGGATATGACTGTATGTACAGGGTGTATGGAG
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TGGTGTAAAATTCCAGAGGCAGGTTGAGTTTCCTGAGATGCCGCAAGAAGTACATCCTTT
GCCTGGCTTTCTTGATGAGGATCCTGGGAGATTGTGGATCCCAGAAACCTGATAGTTTCC
ACAACACAGTGTTGTTTTGCATATGGCTGAAGTCCGCTGTCATCCCCACAGTTTTAAACA
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ACAATACAATCTCCAGCTAACTTTTTGATGTTTCTAACTGAGAAAAAGTTAGCACTCTCA
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TTCATAATATCAAGTTTATTATTTCACGCAGCGCTCTGAACTCTTCAGCCTCTGTGGTTT
TGCAGAGGTCACCGCAGTAACACTCTGAAGCACAGCAGCCTGTACGAAGCCTTCCTGCCC
TTCCTCTCTCCTTTCCTCCTCTTTATCTTGTCCACAATTTGGGTGGTCTACTCTCCATCC
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GTCACGGTGAGCGTTTGCTGATTTCTTTCCACACACACACACAGTTACACTTTGGTTTTC
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GATGAGTAACACGCGTTGCCAGGCGCTCAGCTGGCTGCTGCTGCCCATGACGCCAGTGGT
GTTGTTGGCGGTGACCGGGGTGTTCGCTAACGAGACCTTACTGCTTTATCTGTGGACAGC
TGCTGTCATACTAGCACACATACACTACGGTGTATCAGTGGTAAGGACACACATATACAG
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TTTTTTCGTTGCTACAGGTACAACAGCTCAGCGGCCACTTCAACATCCTCGCCTTCTCCC
TGAAAAAGCCCAACAGTGACTGACAGGAGGAGGAAGAACGAATCGGCTTGAAAGAAGCGG
AGGTTTAAGCTCCTCCACTCCTCTGCTTATCGACACTTCACTCTCATCACCACGGAAACC
ACATCCCCTCCCTGCTATCCATGAGGACACTGCAAGTGGAATGGACTGCGGCCCTCTTTT
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TAACCAACCAACCAAACTCTGGTCTCTGCGATGGGGCGGGCCCAGGGGGCTCTGGCTTCC
GTCATTGGTGATTGGCTAACTTGGTTGAGCCAACGAGGTGCAATTGTTTCCTACGGAAAT
GTGCTTCAGTCGTGAGGACAGGAGCCACGCAAACACACACACATATACACACATGTACAT
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ATGATATGCCTTGGGGAAACGTCATTTAAGTTTTATTATATTAACAGGAATGCCTCAAGT
AGTGTTTCAAATGTGACCCAGCCTCTAAATTCTGGCCAGATGTGGCTCTTACATCCACAG
CTGTGTCCAGAGTTTAAAGGTTTAGTCACTTTTTTTATCATCGGATGATTTTCAGTTGGA
AATTCCAGTGATAAATGTTAATAGCTACTGTATATACTGTATGTGTGAAGGGGTTTGGGG
CATTTTATTTTCAAACTGAAATGAAACTTTAAAAAAAAAAAGATGATTACTCCTGTAAAA
CATTGTATAAATCCCCCCTCTAATTAATGCCACACTCTGCTCTGAGGTGACACTTGTCAC
ACGTTAACAGAGTTTGATTTTAACTAACCAGGGCAAGAATTTACCAGGGTGACCTCTGAC
CTTTTGAACTTTGCTAAGCCTCCACTTTGACCTCTGTCTGAGCACTGGCCTCGCAGCTCT
CCCTTTCCTCTGAGGTGTCGTGTCTTCATGCTGATTCGTTCTGTTTTTATTTTTTCACAA
TTTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGTATTTTGTTT
GTCTGTTGCCATGGCAATGGTTTGTGGTTAAAGTTGCGCAGCGCTTGAATGAAGAGTGCG
TCTAAAAACCGGCAACGGAGCGGACTCACTCTGAGGGAACATGCCGTCGCACA
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