SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003160_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Transcript IDSPT00003160
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003038_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003160_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) # Full length # Reverse
TGTGCGACGGCATGTTCCCTCAGAGTGAGTCCGCTCCGTTGCCGGTTTTTAGACGCACTC
TTCATTCAAGCGCTGCGCAACTTTAACCACAAACCATTGCCATGGCAACAGACAAACAAA
ATACCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATAAATTGTGAA
AAAATAAAAACAGAACGAATCAGCATGAAGACACGACACCTCAGAGGAAAGGGAGAGCTG
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TTACACCTCATTCAAAATCATGTATGAATAAAAAAAATTAGTGTCATTAACATTAAGCAG
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TGTGTGTCCTTACCACTGATACACCGTAGTGTATGTGTGCTAGTATGACAGCAGCTGTCC
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GCGTCATGGGCAGCAGCAGCCAGCTGAGCGCCTGGCAACGCGTGTTACTCATCTGACACA
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AAGTGCAACAGGATTGGCTGGTACCATGTTTCCACGCCGACCACAGCAGTGACCAAGTAA
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AGGTCAAGGTGGTGACTGTTCACAACCCCCCCTCCTCATCCCGAGAGCCCTTTCTCTTGC
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TAAGCTAAACAGTGTTTTAAATCACATTTTTGCTACCTAGCTCTACACTGTGATACAATA
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GGAAAAACTGACAGGTCTAGCAACATGCGGTCACAACAACCTAGAGCTTAACGTGTTTAA
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GGTGCGACGAGCCTGTTTGCCATCAACACCATCTACACATAACACAAAAGAGACATAGAT
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GAGAAGGAATTTGACAATAAAATAAATCTCTATTTATTTGACTGTAGTAAGAGAGTCACT
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CGAGCGAGCTATAAAACATCAAATTCAGCTCTCCCTGCTGGTACTTTTATTATAATTCCC
ATAAGCTTCGGAGCTTTAGCTCATATTTGTGAAGCAATGCTACAAGCTGCAACTGCCTAC
AGACGAGAGGTCTAACTCAGATGCTCTTGTCCTGAAAAAGTTTGGAACACATGCCCAAAC
ATTTGTCAGGCTTAATATTATAATATGCACCTTGCTGTGTAAATACTGATCTGTTTAAGT
GGTTAATCCTGCTTGGAGGATTGGGGTGGATCCTAATTCCTGGAGCGCAAACATCTCCAC
TTCACGTGCAATTAAAACTGCATCAACTGAGTGTTTGACTAATACCAACAGACACATTAT
TATTACGTCATGCAAGTCAGCAAAGAGTTATTTTAATACACAGTCTTGTATTTGGAGTCA
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GTTTTCTGTGTGATACACACTTGAAGTAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTAACCTAACCACAA
TGTTATCATGGCATTTCTTTAAAAAACTAAACAAAACACCTGAATTTATATGTTTTGTTA
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AGTTTGATCGCTGTTGTGGCATCCTGTTGATCCCGCAATCTGTATTTACCAAAGGCAAGA
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AATAAAAAACTACATTAATTACAACATCCGGTTGCACTGATGTGTTTATTTATCTTTTGT
TACTCTTTTTTTGTACATGCTGTGTTTATATATTTTGTATTTTATATTATTTTTTACCTA
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TGAGCTGATTGGTTTCTCTTGTCAAACACATTTCATTGTATTGTTGACCCTGTGTTCACC
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CTGTATGTCAGAGTCACTGTACAGAATACATTCCATTAACAAGAATTTCCCCTGAGCTCC
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GTCCTGCAGCTGAGACACAAACAGTGTAAATATGCAGCACGCCACACATACGGCCACAGA
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GTGCATAATTTGGTTTTGCTATGCTTGTAAGTACTGACTGCTGACAGCAAATATTCCTGT
GAGGACATTTTGACAGAGCACAGTGTCTTTACAGAGCAGCGTGTCAGTCTGTCTGATACT
GTTGTACATGTTAACACTAGCAGCTCAGTGTGTGTGTTTGTAGGATGTTATGGGTCATTC
ATTACCCTGAGTCACCAGAGCCAGGCTTGTTTCACCGAGTGTTGGACTTTGCCTTTTATA
AGCCAGCTCACTAACACACACCTCTATTTTGTTTCCTCCATTTTCTAAACAGATCGGATG
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TTCACTGAGTCACTTACAATCAACAAAGTAGTGGTGAGTTAAAAGTAAAACAACAACAGC
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GTCAAAGTCGTAGAAGGCCAACATAAGGAAGTTCAACACAAGGAACATGAAGCCTGTAAA
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TGTAATGTACCCTCTCTGGTGTTCATACAATTTAAGAAGTGTGTAAGGTCTGTGTGTTTT
GTTATGCAAGGCTTTCAAATTAAGATGTCGATATCTTCTATGAGGGATGTTTTCTGCGAC
TGATTTCAATTTTTAGATTTTTATTTCCTCCTGGCTCGCTTAGATGATTGGGATCTGCAA
TTCTGATGTCACATTATCGATCTTTAACCGCAGTTCTCATAGCACACTCTCGGGAGCTCA
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CAAAACTCTCTCTCATACACAAGCCTGCACTGGTTCTGCATAATTAAACATCTAATCCAT
CATTATTATTCTACATTAATACTGACAATACTCAAACACTGCTCGTGCTTGTCAATTTGA
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GCAAAACATTCAGATTAAAATGAATGAGGATTTTGAGTGTGTTGCTAAGTCTTAACACAA
GCTTTATATCAGCATCGTTTGTGTTGCTTGTCTGCAAACTGTGCCACATAAACTAATACA
TGACTATTTTTATATCCCCATTATCAAAACTGAATTGTCGTGTTGTTGGATTCTCCAGTA
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TGTGACATGGAGAAAAGGGTGTAGCTTTTAAAAAACGTTTAACAACACAATTTGTGGTCA
CTGGGGTTGTAATAAAAATGATTTCCTCTCGTTTATCTTTATTTGTTTCCCCATTAGTGT
ACTGGTTCAAGTTGAGTGCTTTCCCCTCACTTGTCCATTACAGCATTTATTTGGTTTTCT
TTTTCGGCTGTAGTTGAAATATTAGCAAATGTTAACGCAGTGGCATTCGTTACAAACAGG
AGACAGACAGGGCAAGTCTGAAATACGTGAAAGCACAAAGCACAGCCTTATTTCACAGGC
AAACTACGGTAGAGAAAGAGCAGCTAGCTAACTATTAGCACCTTTGCGCTAGTGTCAAAC
TCAGCGTGGTAAACGATGACACTTCCGGCCATCACTTTCAAAATAAAAAAAAGCGACATT
CGTCAACATTAAGTCTATTTACACTGATATGAAAGAGATATCTATGAAATATCTAAATAT
TATTTATCTATTACTTATAACAGCTTGTATAATGTTTATACTAGCGGCTACCAACTGCTT
AAAGTGTCTGCTTAAAGTAAATTACATTAACTACTTCCTATCGCCTTGAGTGCTTTTAAT
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