SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003161_2.0
Identity
TranscriptMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003161
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003039_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003161_2.0 # Transcript # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Reverse
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TCCCTCCAGGATCTCAGTAGTGATTGGACCGTAGCCTTTCTTATCCAGTTCCTAAAGACA
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AGGCTTCGTTTCTGCCACGAAAGTCTTCCAGACCCCGAACGCAGGAGCAACGCCTTCATC
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GTTAGGTAATTTTCTGGCACTAATTCAAGGAGAAGCTCTAGCTGTAAACCCAACAGTGAT
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CAATCTCCCCTGAAAGCCATTCCGTTTGCAGAAGTGCTAGTTTTTCAAAGTGGTAAATTG
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GTAACATAGTTAGTGTTAATGTACTATAAAATGGTACTATGTGCCTGTAAAACACATAAT
ATTGCCCCTTTAATAAAATCAGAAGGACGGAGGTAGCAGTGATGTAAGACTGCTCTGTAG
CTCTGGCTCTCTCCCCAGAGACGAGTCAGCACTTCACACATTGGGACATGTGTCCAAAAC
TGCTCACATGGCATTGTTAGCGACAAGCAACAACTTCCCAAACGCTGAGCTGTAAAGTTT
GGATGAGAGGCGAAAGGTGAAAAGAAACAGGAGAAAAGTCCAGCTGCATCCTAGTAAAGC
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TGTGCAATTTCATACAACAGGACTTATGTTGACCTCAGTGCGATTTACTCTGAATCTTAA
AATCTGGCATGACATTTGGCAAGCCTGGGAATTACCCAGAGGATGCACTAAGCTCTTTAA
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GGATCAGTTGTGATCACAGTACTGTAAGTTAACCCTGATGTAATGCATCAGCAGTACTGC
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CCTACAATTATTTAAACAAAACAACATTAACTTTTTAATTATTTTGCCATCAGTAACTTT
GTATATCTTTTTGCATAAGAGCCAGAGGAAATATCTCATTTAAATATCAATTGCTATTGA
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TTACTTCACTAAAGTTAATCTGTGAAAGTTTATATATTCTCAGTGTAGACAGTTCTTAAA
GAACAATGTCACAACTACTGTATGTTCCAGCAAAAACAAAACAAAACAAAAAAAAACGTT
AGCACAGTGATCAGACACCTAAATTAAAAAATAAAAGTGAGCTGCAGTTTGTAAAAATTT
TCTTATCCTAAGATTTATTTGCTTTTAGCACTTTTCAACAACAAACCTAATGCTGTTCCA
TTAGGTTTTAATTGATAGGCCAACAAACATAACGCAAAATTAGGAGGACGAAGGAAAAAG
GTCTTCAAAGATTTTTACAAATAAGTCTAAAATTTGTGGCGCGCACATATTCAGCCCCTT
TACTTTCAAACCTCAAAATAAAATCCAGTGCAGCTTATAGCTTTCAGAAGTCACTTGATT
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AGGCAAATCATTTTGGCCCGACCCAGGCCAAATTTTGGGTCTAAATTATAGCAAAAAATC
TATCTTTTAACAAGTAATTTGATAAAGCATTTGAAGACTAAACTATCTGCGACAGTGGAG
AGGAAAAACTCTGCTTTAGCAGAAAGAAACCTCCAGAAGAACCAGAACTTGATTCAGTAC
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TGTTTAGTTGTTGGCAGCATTATCTCAGCTGATGCGCTCCTCCTGGGAGCAACCACAGGT
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ATATGTCCATAATTGTCTCTATAAGATCCTCGTCTCCATGACTAAAAAATCAAACAAAAC
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GCCTTGAGGGGTCACTGACCTACGCCCACCGAGCTGAAAATATTAATTAATAGCCCCTCC
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AGACAGTCAAGCACAAACCTTAGGACACAAACGTACACGCAAACACTTTTGGTTGTGTTC
AAACCCGCTGAGAATTGCTGCAGCTCTGTAAAATCTCTTCCAGTGTTTTTGTTGCAAGGA
GGGAAAAAAATGGCTCCACTCAAGTTGTCCCTGCTGGCTGTCGGGGATAAAAGCCTGTCA
TTTTCCCCCCCATGTCCAACTTTCCCTTCAGGTCTCTGCTTCCAGATTTTGCTCTAATTC
TCCATTCTCCTCCGGCTCGTGGCTTGTCGTTTGTTAATATGTGTCCTTCTAGACTCCGTT
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GCAGAAACCTCTGTTACTAAAAAAACACCGCAATACAGCACAGCAGAGAGCAAAATCCTC
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CTCCTGGAAGCCGCCAGAACAGCTTCTCAGCTCCCCAGAAACAGCCCATTCCTGCACACA
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