SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003168_2.0
Identity
TranscriptMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003168
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003046_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003168_2.0 # Transcript # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Forward
GCAGCCAAACATGATGTGAATGGAAACAGGACCATTCCACCCTTTCCAGAGGGGACACAG
ATGGTGATGTTTGGTAAGTGTCAAAATACACCAGACGATTCGTGCTACATAGGAAATAAT
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GTTTTCCTGCTTTACCGGAGCAGTTGGAGGTATTTGCATACCAAATGAGCAATCTACCTC
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CTGACGTCAATTAAGCTACAGTGGTTTTCAAATAATTACCTCTCTCTACGTATTAGAGCC
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GAATTTATTCATGTTAGATTTTTTCTCTCTGATTTTAGTGCATTAAATCCACAACAGAAG
TAACTTTTCTCTTTCAGAGAAAATTCCCCTGTTGTAGTGAATCGTAAAGTTTTTCCTTCA
TGCATGACGTTGCTAATCAGTGCTTGGACGACTCTTTCATGAAGTCATGACCATATATAA
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TGTAAATTGTTTTCACACATGATAGACCGGTAGACTAGGTTTGATTTGCGACAAAAATAG
TAATATTTGTTACATTTCCACCTGCTGCGATTCTCTGTCACGCTGCACTGTCTCATAAAC
CTGTTCCCCTCCTCGCCTGTGGGGGCGCTGCACCAGGAACCACTGAAGGAAACGACACAG
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GAGTGGCGTCAGACTTTAGAAGCTTTAGGATTTCGCTTTTGTCTTTGGCTAAAGACCACG
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GCCCTGTGCTGTAGTTTGCTTTCTGCTATTGGAGTCGTCTCCAGTCGACTTGGTGTTCAC
GTACGCATTCGAACCGCACCAGAGTTCACTTTAACCGAACCCAGACCGAGGTTTTTAGTC
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CATTTCCTTTGGTAGTCCTTGGTACAGTGCCCCCACAGGTAGGGAGTGGAACAGGTTTTG
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GCTCTGAATTATAGCACGCAGTTTGTTTCCAGTTGAGTACCTCCTCTAAATCAAACGAAG
CGCCAACCTCTAAATAATTAACCTGGATGCCCAGACTGTCGTTACATTCACATAAAATTT
TTACTGAGTAAAACCGGACCGCCTTCGTCTTCTTCATTTGATGAAAATGAATCGCTGATC
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