SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003168_2.0
Identity
TranscriptMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003168
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003046_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003168_2.0 # Transcript # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Reverse
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GCTCAGGTACTGCTGGTGGTAATCCTCAGCGTAATAAAACGGTTTGGCTTCAGTGATTTC
TGTTGTAATTGAACCAAAACCTTCCTCTGCAAGAACCTGAATGAAGCAGAAGAAAAGAAA
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CTGTGGTTCTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTTCACATCTCTGGTTTAAACTTTTATTTCACC
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TGCTTACAGTTTTCGTTCCACCTTCCTGTCGGCTGACTTTGTTTTCTATTCATTCTAAAC
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TCAAGCTGCTGCTGAGTGTAGGCGTAGATGGCAGAGCGGTACGTTGTCCCGACATCGTTC
CCCTGACGCATTCCTGAAAACACACATGTTCATTTTTTTAAAACGAGGATCTCGATGGCA
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AGGTTGATTGACAGCACCCTCTTCCTGGCTCTGATTGGTTGTTATTGGTGCATTTCTTCA
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AACTCGCACCACCTCAGTGTGGCCGGTTCTGCCTGCAAAATACAACCATCAGCATCAATG
CTAGAACTTAAATGTAAGTAAATGCAAAATTATTTTTCATCTATTTAGGGAAAAGAAGCT
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CGCCCATTATGCAGCACATATCAGACAGACCGATGTTCATGGCAGTCGAATCGGCCCAAT
GCCGATCTTTTCTCCCCCTCAAAGAAATTGGATTTGAGCCTCTTCCAATTGTGGAAATTA
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TGCATCGTAATTCTGCACCAGACTCGGTAAATCAGGCCATAAATAATGGCTGAAAATTAT
CATTCTGAAATTATGAAACACTGAGAAGGGCATTTATCGCATTGTCATTTATCATTCTAA
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TAGCTTGGTTGTACAGATCACACGTTTTTGTAAGACTGGTGTCTGATGTATCACAAATGT
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CACTTTCAGTTCTGACTCCAAACCCAAACAGACCTCTCTGTTTGAACCAGAACCAAACAT
GGAGAAGCAGCATTCAGTTTCTACGCTCCACTAATCTGGAACAAACTTCCAGGAAACTGA
AAAACTTCTGATTCACTGAATTCCTTCAAATCAAGGCTAAAAGACCTGATTGCTTAGATC
TGCTTTTGTTTAATTAGAACTGGAACATTGATCAACATATTTCATGTTTATTGATTTTGA
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GAACAGAGACAAAGCAGCGGTCCGCATTAAATTAATGTCTCACCAGGCCAATCTCGCAGG
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TCTGGAGAAGTTTTAAAGCCTTTTGTGCCAGAAAATAAGTTTCACTGTTTGCAGCATGAA
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GTTTAGCAGAAGAGCTGCTCAAATCCAGGTGCTTTGCCATCCTGGAGCTCAATCAATAAC
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TGATAGTTTGATGCAAATATGAGTAAAACAGCTTTAAATTAAAAGTGTAAATGGCTTCAA
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ATAACATCAATGAAAAAAACAACCCACAAGCAAAACAATTAAGAAAGAAATGGAAACAAA
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AGAAGGAGCCAAACACACAAGAAATATGATTTAAAAACAAACCAAATCTCCTCGATTTGT
CCGGGGAGAAAACATCTACATGAGTAACACAGTCAACCGTGACTCTAAACATGACTCACA
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