SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003199_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein P (SelP)
SpeciesParus major (Great Tit)
Transcript IDSPT00003199
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003077_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003199_2.0 # Transcript # Selenoprotein P (SelP) # Great Tit (Parus major) # Full length # Reverse
TCACAATAAAAAGATTCAGGTTTTGTAGGAGTAGTAATTTCCCTATTAAACCATCATTAA
TTATGGTGTATGCTTTCATAGCAGTTTTCTTTTCATGAATATTCTTTTCTTCATCCAGGA
ATCCTTCAAACTGGATTTACTTCCATTCAGTTAATCAAACATTAGAAATGCTAGGCTACA
AACAGAGAAGTTATACAAGTTTAAGTGGTATATTTTGTTACTAATTGATACAGATTTATC
AAATTCAGCACTGTTACAAAGATCAACAGTACACCAAGATTAAACTTGTTTCATCCCACC
CTCTTTTTGATTCTGCCTGTCAGTTGTTAACACTACTTCTTGCTTATTGATTCAGTAGGA
TTTTACAGGCAGTAGCAGTATGTGTTAATGGACCCTCTTACTGTATCTAAGAGCCACAAA
AGTTAAGCATATCTATCTGTTACTTGAAAATAAAGCAGTTACTGTCTGTATATTACATTT
TTGTTGTGGAATTGTTCTGTCACATTGCTTAGGAGTAAGTTTTGCTTGTACGTGATTTGT
ATCCCCAGGTTAGAAAAAACCAAAAAGCTCAACTTCTGAATCTATCCCTTAATAAAAAAT
GATTAAAATATCTTTCTTGGTTATCTTCTGTTCTTGATTGCAAAACATCAAACAGGAGCC
CCTAGGTCATAGTTTATGCTCCTGTCCTCACAAATGCAAGCAGAATGTTAGAAGAGAAAC
AAGAAAGACAAATTAATCGAGAATGCAGACACCTTCCCAGCGGAACTGAAAAACAAACTA
AGGGTCAACCAAATTCCTTTAAATCATGAAGCTTTTCTCTGATGAAATTTGATGGATATT
CTATTATTCTAAGAGCCCTGCTCTAAAATTACACTTCTTTGCAATATTTTAAATCCCCAT
ACCTGTCAGTTTAATTTTGAATTTGGGGCAATGAAAACACTTAATTTGTTCATTTTTCTG
CTCTTGCAACTATAAGAACTGAGTTAGTGGGACTCTCTTGTTTCTGGAAGGTGCTTAGTT
TGTTTTTCAGGATCAGTTTCTCGCTTTTTCCTGTCACTGTCAGGTGTCACTAGTTTCACT
TGCTCCTGCTGGTGATGAATGTCAGGCAGCAGAGAGCAGACGTCACTGTCAAGACTCAGT
GATGTCCTCTGCTGCCAGTTGCCCATGTCACCTGCAAGAATTTGGTAGTGTACCACGACA
CTGTCAAGTGACAGAATTCCCTAGCTCTTCAAACAAAAGGTGTCGACAATGACAGGATCA
GCTACTAGAGGCTGAGCCTGATCCTGTCTCCCAATTTCAAGTTAACTGGTTTTTGCAGCT
GTTTTTCCCTTTCTTTCGTAGTTTTCTATCTTGTGCAATTTCCACAATTTCTCCTGGAGG
GGCAGTGTCTACGTGCTCCTGACTACCTATCTGATCATGTCTGTGACGGCCAAAAAGCCT
GTGACGCCAGCCGCCGTGAGGATGATGTCTCTCAGTTTGAGAAGCAGCCTGGTGGTCCTC
GTGTTTGGGATCACGACTGCCCATGTGATGGTGGTGGTGGTGGCGGCGATGGTGGTGTCC
ATGTCTGTGCAGGTTGGGATGGGAATGCTGACCCGTTGGCTTGGGTTCTATCTCTGACAG
CTCTTCACCTGCTTTTTTAGTGATGTTTTCACATACACCATCAATATCGGGTTCCTGCAA
AACAGACACCTGTATTAAATACAGGGCACTGTATTCAATTAAACTAGTTGTAAAATATTA
ACTAACATTTTTGCAGAGCATGAAAGGCACTTTTAAATTATTTGTTCTATTTTGTTGAAG
AATGTATGAGCATATCAGAAATAGCCTTCTGTTGTCACACTACTGTCAACTAGACACGGC
TTTTTAGCAATTAAAATTTCAGAAATTGCCAATAACAAGTATTCTTATCCTAGATCCTAC
ATCTGACCTGTATGTGGTCTACATTTAGCCGGAACACTGCACATTGGGATCAAAAATTAT
TGTTCTCATTGAACTTCTATGATTATGTGTTCACATTTCATTATAATCCTTAAAAGCATT
TCTGATCTTGAATGATGCATTAGAAAAAAGCTTCTTTTACAGCAGCAACAATAGTTTGTC
TTGTACTGTATCACCTTTTTAAAAATAACTCTTGTAAACTGTGTTCAAATGCAAACTACA
ATGAATAGTAATGCAAACCAGCTTGAGTTTCATTCCCAGGTTTTAAAAAAATACTGTTTT
TTATGTACTTACCCATCCTACAAAACTAGAGTAGTTAATTGCTCACTACCTCTACTACCT
CTATATAGCTCTACAAATTGAATTACCCTCCAAGACTGAATTTACATTTCTGACAGTTAG
TTGCATTTCTATCGAGGACAGGAATTCAGATAATCAGTCAGTCTATTAGAAATCAAATCT
AATCCACTTAGAAAAATGTTTAAAAGCTGTCTGCCGAGATACATGAAATGTGAAAATTTG
AAATCTTTTTGGATTAATCACTGAAATATTTTTTTAAATACCAATCATATCCAGTTTTCT
TTTCTACCATACACAGAATGAGACAAGAAAATACCGTGTAGGAGCAGTTTCCACACTTGT
TCTCGCAGTATGCAATCTTAATAGATTCTTCCACATACTGAAAATGCAGGAAGGAGTAGG
GCAGACCGAGATGGTACACTAGACGGCCGCATCTAAGGAGAGAAATACAAATACCTACAA
TTAAACCTCACTTCTTATGATATCTCATTTTACTTGCATCAATCCACCCACACTGTACCA
GTTCCATGGGGAGTGTTTCTGTTCCAGTTCACAGCCAAATCCAGTGTCTTCCTTACAAAT
TCTTGCCTGCTCACCTGCACTGCCCAGTATGTGAAGCATGATTTCCAGCTGATGTGGTAA
CTGCACTGCCTCTCCCTTAGCGGCACTTATGGATGGCAGAGGTGCACTCATTGCAGACCC
ATTGGGACAATGAGATGGGTTGTTTGCATAGTGATTGCTGCATCCTTACCACGTGTTTCT
ATGAAACCTAAGGTATTTTGACTGGGATGGGCATTGTGGTGCAGTTAATCAGTAAATCAG
CATTACTGATTTATTGTGCATGAGGGGATTGTTATGGTGCCTGCTTGCCCCATGTTACAC
TTGAGTGTTCTGATACACACTTAACTATACAACTGATCTGCTCAAAGGAGCTGGAGTAAA
TGCAGAACCTGTACACAATGGCAGTTCAATGCCAACACACAGTCCCCTGGCCTTAGCTCC
CCACTGGGGACTGCACGTTTAGAATCAGCAGCAGACAAAGCTTTCACAGCTAAGGCACAA
TAACAACACAGACTCCTAGAACCATAATGGATCATGGCCATTAAAACAGTCCAAAATGTA
CATATGTCCTGTGTGTCAACAGCACAGAACTGGTCAACCTTCCAAATGCTCCCAGACGGA
ATACAGCCTTGCTCTGTTTGCCTGTTGTATGACACCAGCCTTTCTTACTTGGGCATACTT
GCTGCTGTAACATACAAGATCACTCATTCCAGTGTTAGTTTCATCCCACAAACTTCATCT
AATTTAAATTCATCACATTACAGAAAAAGAATAACTTTCTAACTCTTCATTAAGCTTATT
TATGGTTTAGTATGAGCTTGGAATGTTCCTAACAGTAATATAAAGTAACAAGGATAGACA
TGTTTGAAGTGCAGGATTTTTCAAGGAGTAGTAACTATTAGAGTCACTACCATCACATCA
AAATTGAAAAACTGGGATTTTAATTACCTAGTGGTGCTTCCAAAATATACCTGGGGAAAA
ATCTTATATTGAAAAGCAATTTTCTTCTGAAGTTTTAAATTTGACCGGAAGACTAATTTT
CCTTATGTCTATATGGCATTTTCAACAACTCTCATCAAAAAGTTTCCATGAAATAAAAGA
TAAAACTTTGACATGCATGAATGTAATAAAGTTATCTGAAAATAAAAACACTATAAAACC
ATGAACATGTTACCAAATTTTACGCGCATTTAATGATCATCTAAATCCATGTTAATTATA
AAAAAAAAAAAAATAATCCAAAATTACTCATGCAAAAGCAAACTTAGCTTTTGTAACTTT
GTTTTTCCAATAAATACTAGCACTTTACTTAGTTCAACTTAAACGCTGAGCATGATGTCT
TTGTTATTTGCACATCAATGAAATAATACAGAGATTTACGGATCATTACTCAAAATACAT
GTGAATGTTTTCCCATGTTTGTCTGTAAGCGCACACCTGTCATAGATGAGAAAGTCATCC
TTGTTTCCATTTAAAGTAGTCCAGACATCCTCTTGCTGCTCATCTTGCTGGTAGACGGTA
ATGTAGTCTGAAACACGTTCTTTTAGTAGGTGAAATTCCCTCTGGGATTGAGGTCCCTGA
TGGTTGACAACCACATACGAGATGTTGACCAATCCTTCATTCTCTAACTTTACGCGCAGG
TCCTCCAAACTAATGGGAATGCAAAGAAGCAAGACCATAAACCATTAGAGAATCATGAGA
CAAATTTGACATAAGAGTTAATATGCTCCATCTTGCTTTTATTATAGATGTATGACATGG
AGTTTCTTCCTTTTCATTTGTATCTTTCCTGTGGAATTGCTCTAGAAAACTATTTTTCAG
TTACAGGAAATAGTTTAGAATGTGGAAGATTCTTTTAATTTTTTTCTAAAATGTAAGAAC
CAAAACCAACGACCTTGAAAGCCAAACAGAAAGCCCACTTTTAACTCTGACAGAGACACA
GATTTACCACTATGTTTTTAAATCCAATTCTTAATAAACTTGCAAAGCTTATTATGATAT
GTAAGTCATGCAGCCTAGAGAGGAAAACTAAGGTGCGCTCACTGTGACTAAAATCCAAAT
CTAAAACTGGTACTATGAACTTTTAAACCAAAATAATTTTGCAATCCCTAAATGAATCAA
AAATAAAACCTTTATTCAATTCCTATTTGGGTCAGCTGAAAATTATTTTGTAACTACTGT
TACTGTCATGCTAGCTATTTATTTGCAAGGATTAAGTTCTAGAAAATAGAGCATCACTGT
CCCAGTTCGTGGATGAAAACCTAAAACTAATGACTTCCTTGAATGCTTCATCAATTTTTT
GAAAGGACAGTATTTAACTTAACTTCTGGATTTTTTAAATATATGTAGGATCTCTGAACA
CAGGCTGAAAGGCCACATTAAAAGCACAAGTTTTGATTAATTTTTTCCCCCCACAGATCT
TACATAAGAAATCAGTGATAACATCTCTATTTAAGATGATCTAACCATGTTAAAGAATCG
TGACGTTTCTTGGCTTCACTATTTTTGCTACATTAATCATCTATTGCTGTTTCTGTTGGT
TCTGTTGCTGTTCTTGTGGTTTGGGTTTCATTAATGTCATTAAAGTTGATCATACAATTA
TGTTGTAAACATAATTTGGAGAAGATGATCTATTCCTGAAAGTCAGGAATAGGTCAAGAG
ATAATCTTACCCACTGGCACAGAACCCTTCTGCTGATAGTGAGCCTGGTCACTGGGTCAC
ACATGCCAGCAGTGATGGTGGCATTTGGGGTAGCTAGAGTTGATGGAGTGCATCTGTGGC
AGGGCACACGTAGTATTCTCAGCTGGAGAGCAAAATCTGGGATGAGACACACTTACCTGG
AAGCCTGCCGCAGGCACAATGATCAGCTAGCCTGGAGGAGAGCCACCACTGTCACCGAGC
CTCTGGAGTTCCACATTGGGTCCTCCTCCCCAATACGCCATTCTGGGGGCTCCTGGCAGT
TCTGGATCTCTGTCCCTCCTCCTGGGAGGACACAGAGGGCCAGAACTAGCCCCAGACCTG
CCCACAT
Chart Advanced