SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003205_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003205
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003083_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003205_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
GGGAAGATGCGCTGGTTTCCGCTCTCTGTGTTACTATTACTGGCCTGCTCGCTTTATCGC
GCCGGTGGCCATAACAACGGCGTCAGGAAAACGAAAATGCAGTTTGCAGCCGGTCCGCTT
CTTAAATTTCAAATCTGGTAAGAAAGTAAGCACAGCGTTAATTATTTATTTATTTATTTA
TTTATTTATTTATTACATACCTTTCTTTTGTAGTGCTACAGCTGGCTAATTCTAGGCTTA
CTATAAAATGCGTCTTTAAAACTATCTAAACATCTTTATTTACATCATATTTACTAATTA
AACCTACCCCCGATAGGAAAAGACAGACTTATTTCCCTTTACTTCGTGTTTATTTACATT
TCGCAATGACCCTAACGACTAACGTTACTGAGTTCCAAATCACTTGCTCTTCACTACATA
AGTGTACTACATAAGGTGCGAATTATTGGCGTACTTAGTGCACTAACTGTCCATTGGAGA
GCCGTTTGGGATGCGGCCCATCTGTCAGGCCTTTACTAGCTTCCCATTAAGCTGTTAATT
AGATTAGAAACATAGAAAATTTTGAGGCTGTTACTTATACTACCACAATGTAGTGCACTT
TTTTAGGTAGCAGAAAGACATTTTTAGGATTGAGCAGTGGTAATTTGTTGTCCAATATAG
AGGATATTTTGAGGATTAACAACTCGCCTAAACCTACAATTTATTACTGGGATTAAATAA
TTTATATGGCTTGTACTGGCTTGTATTTTATTTAATGCATGCCTTCAGAGTCGGTACATA
ATCTGGGCTTTGGTCAAATTGCACAAGAGGTCGAGGTCTATAAAATATTCACGATTTATC
ACCTACAGTAGTACTGGAGTTGCTTTTGATGCAGTTAACATGTAAGGTGATCAGTGATGT
AAATAATATTCTTAAAAAGAAACATGGGGGAGGGGAGCTCCTGAGTTAATGAATAATATT
CAGAGGTCGTTTGATGATGTTTGCCTACTGTTTGGGGTGTGTAAATTTATGAGCAGCACT
CAGATTGATGCTTACCCTTTACCTGTTCCCTGGCACAATGACCATATTACACGTGAAAAG
CAGTTTTTCTGGTTTGGTGTTTAAAATTTTTTATCATATCTTTTGAATGAGTTTTAAATG
TGTTTTGCGTTTTGATCAGCTTCTTTCTTTGCATGCAGGTTTGTTTGACTTTTGCCGAGG
CTTGGCTCTCATTTCGCTTGTCGTACCCATCAGATCAGTGACCGTAGTTGTTTGTGTTCT
GTTCCAGTATCTCCTGAGGGTACAAGCGGGTGTTTGAGGAGTACACGCAGGCCTTATCCC
AGCGGTACCCAGACATCCGCATTGAGGGGGAGAATTATCTCCCGCTGCCTATTTACAGGT
AAGACTTGAAAGCCTGCATTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGT
ATGTGTATAAGCAAGCTAGCCAGCCAGCCACAAGTTACACGTGATCTACGGGGTCCAAGC
ACCCTTTGCAAATAGCAGTTCTAGTCAAGTTGCACTAGAAAACAAACATGTTCAAGTTTC
AATGTCGATAGGTCAGTTCTAATCCTGTCAAATCAATCGACTGACGAACATTGTTTTTTT
TATTTAAAAAATCACTAACATGTAACTACAAAAATTTCAGGGACCATGCTCCAAACTTTG
CAGATCTACTTAGAATCTTGGCAAATTTGTCTGAATCGATTCATCAGATCATGAGTTATG
TAAGGAACAACATGCTGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTAACGGCATGTAGTTGGATTT
GACGTAGTGGAACATCCGAGAGACAAGTTATCATTTGCGTCGTTCCTTCACCATCTCTTG
CTTTCTTTATCCTGCTTTTGTCAGAAGTTATCCGCGGCCGTGATATCTGTCTTGCGGCTT
AAACTTCTGATATAGCATACCCTTTTCTGGTGGCAAAGCTTCAAGATCTTACAGGTTGCA
GTCTGATTGCTTTCTGTCACATATGTACACTGCAGAAAACGTTGTACCCTCCCGAGATGT
TATAAGGAAGACCGCCGCAAGTGCAGAGGTTTAACGAATAGGGGTTGTTACAGTTTTGTC
TTTGGTGTGTGTGTTTTTTTTTTTTCAGGCACGTCGCTTCCTTTCTGTCCATTTTCAAAC
TGTTCCTGATTGGGCTGATCGTCGTAGGCAAGGATCCGTTTGCGCTTTTCGGCATGGAGC
CACCACGACTTTGGACTTGGAGTCAAGAGAACAAGGTGAGAGTCGACTCTTTATCCCTGA
TGGGCTGACAAAGCTTTTTGTGAAACTCTTCATAAATTGGAATTCCACAAATTTTCAAAT
ATACTCACAAAGCTAACCCTTTTTGTTTTCGTGCTGTTATGACTAATCTCCAAGGTAAAG
TAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGACACATCTGGGA
CTAATAAAACCTCCAGAAGGGAACTGTTGTCGGGGGCTTAAGTCCCAGAAGTCATTAATC
CGTGGACTCCCTGACTAAATTTAGTCTCCTGAATGCTAAGGTGTTACTCAAGATGATGTG
TTATTTAGAAAACTCAGCAGCTAGACGTTCAGGTGTGAAACATTTGCTAGTTTTTATGTC
TGAGAGTTTAAAACAGTCCTGTCTTCTTGTTCTTGGCAGATCTACGCCTGCATGATGGTG
TTCTTCTTCAGCAACATGCTTGAAAACCAGTGCATGTCGACGGGGGCATTTGAAATCACG
TTCAACGGTGAGAAGCAAAACGGGCAGAGCAGTGGTTTCAGTACCTGAAAAATACATTCA
TTCTTAGTTACACTAGAGTGCTGTCGAATTCTCAATTCTGATTGGTCAGAAGGAGTTGGT
TAATTTTCTGTAAGAAGAATCGCAGGTTTATATTAATTAATGTTATCGTTTCTACAGTAA
CAAAAACTGAAACGTCTGTATAGTCTTTGTTATGGCAAAGTTTTCCATAAAGAGAAGTTT
ATTTCATGTTTACGGAAGGAGTCTCCAGTGTCAGTGCCAATCAGAAGTGCCGTTGTGATT
TTAGATGTTCCCGTGTGGTCAAAGCTGGAGTCAGGCCACCTTCCCTCCATGCAGCAGCTG
GTGCAGATTCTGGAGAACGAGATGAAGATGAACAGACTTCCACAATATCACTCTTAACCC
AGATCTCCAGTTCCTTCCAAGTATGTGTGCACACGCAGGATGGTGAAGGCCGTGGTTTAA
GATTCTTTCATTAAATTCTTGATTCACTTGTTCGTAACTATTTCGTTTCTCTTTACGTCA
GGTTTATGGTGCGACTCTCCTGCGGTCGTGAGGTGACGTTTTATGAAGGTCTGCACTGAA
AGTAGTCCTGCTACCGGTGCAGGCTGGATGCTCCGCCCACTGC
Chart Advanced