SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003212_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U (SelU)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003212
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003090_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003212_2.0 # Transcript # Selenoprotein U (SelU) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
GTACCTCCGACTTCTTCAGCCACATCTGCTGTTCCCATTGCCGAGGTAGAGGATTGTCTC
ATCTATGATCGAAACGGGCTTCGATTAACCTTTAAGAGCTTATATCAAACCCACAAAGCT
ATCATTATTTTTGTGAGGGTAAGATAACTGCTATTCTGTTTACTTTAATTTAGGTTTGTT
CATATACTTAAAGCTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTA
TTATTATTATTATTATTTAATCAGTGCTGTTTTTGAAATTGTGAGCAGGCATTGGGGTAA
GTGCCTGAAGTCATTACATTCGGTTTCATTTTGTTTTCCTACTCCAAGACCCCTTCAAGC
ACACAGAGGTTGATTAGCACTTGAGAGAAGGTAATAAACTGAAATGTGTGTGGTAAGGGA
CTCTGAATACCAGAAGCAGAACATATTCCCCTGAGCTCCTGTCATCTGACATTTTCTGCT
TTTCTCACACATCCTTTCCTGACAGTTAGTTAGTATACCCCTGTGGAAAAGGTTGTAGCA
CTAAAACATTGCTGGAACAGTTGGAGCCATGGGTTTAGCATCTTTTTTTTTTTGTTATGA
CATGGGTAACACAAATGATTTACGTGACACCATTAAAATGTGGCATAACTATTTGAGCAA
TACTATTAAACATTAGCAGTTACTGTACACTGGGTTGTTACAGCACACTTCTCGTGCTAC
ATGTTGAAAGTTTTAAAATAGTAAAAAACAAGATTATCCTTTTATAATGTCACACAAACG
TACTATTTATTTTATTCATTTCTGTTTACTTTTTTCCCCCCTGAAAGTGATTACTTTGAC
TTAATCATGGCAGGTTGACATTCAGCATTTCCTACACTTTGGTCACTTTGTTGCAGTCCC
AATTGCTAATGCTAACCATCAGGAGCGTATCCTGATCATGATCATTCTGATCCAGTGCAA
CGTATAGTTTATTTTTTATTCCCAATGTGATCAACATTTGCGTAAGTATTAGATGTGTTG
TGGAATTGAACATGTTACGTTTAATTATATTCTGCTGAAATGAACTAAATGACTCGGAAA
AAAAAGATTCGTTCATTTTGCTGAACAAGATTCAAAGATCCGAGTCAGTAAAATTAGCCG
AACTTCCCAGCACTACAACTGGGCCCATGTGTTCATTATGTGCCATATAAATCTGGGGAA
CATAGAGACCTGGGCCCAGTTGTTCAAAAAGTTTCATCTGGATCAGAATGATCAGGATTT
GGAAATCCCATGTTTGGCAATCCAGGATCAAGTAATCCATTTTAAGTCTGTGTCGGTTTT
TCAAAGCAATGTCGGATTGGATCACCCTGAGCTATATACAAGTCTTTCAAGATGACCAAA
TCCAGATTACTAGTGCTCTAAATCAGATTACATATCACAATGTAGGCTACTAGCTATGTA
AAGAACAACATTTAGATCAGCCAGCATGGGGTCACTTTAAGTTTTTTTATTTGAAGAGAC
AGAAAACAGCACAAGAAAACAATACAAACATCCCCTTCCTACAAACAAACAAATCTGCAT
TATTCGCAAATACACTGTGGATATTTTGAACACGTTTTAAAATCGTAAAAAGTCTAAATG
TCCAATTGTTAACGAAATAAGAATGTTCAGAGTTGTTCATGTGTGGAGAGCAATAATGGA
TGCAATTGTTAGAAACTACTTTTGCCTGGTTCATCACTGATGATTGTGTCATTGTAATTA
ATACACGGTGACGAATGACAGTTAAAATTAATTACTTAATTTTTGTTTGATATTGACAGC
TGTTTGGGGGATTATTTATGAGGACAAAATCTTTTTTCTTTTTTACTTTACTGTACTGAA
AGGCTTAATTGGTAGCCGAATGTATACTTTATCTACTTTATCACTGTAACGGGTAAACAA
ATCAAGTGTATAAATATAAATGAATGTATATACTACATTATACAAACGTTGTATTATTTG
ACCAGTCTGAAAGTTTTATTACATTTTGTTCCTGAAATCCTCCCTCAATCCACCCTTCTG
CAGAGATGAGGATAATCCTGATTTATTTTTCTGGATAATAGGTATCCCAACCCTACTAAA
AAGTTTTTATCAACACGTACTGAAGGTTTGATCCAGGTCAAAAGCAAGTTTGGATTACGT
GATATAATCTGATTTCAGAATCCTTTTTTTTTTTCTTTTGAACAACCAATTTTCATGATT
AGATCCAATCCGATAGCCGAAATCCGATCAGATTACTTCTGAACAACTGGGCCATGGTTA
TTTAAAGCTGGAGTTAGGCTTCAGCATAAGTGAGAGCTGGGACATGTTCATACTTTAGCA
TTTTGTTCCTTTTATGTCGGTTTACTGTTTTATAATGTGCCATTTTTTCATGGTTACATG
TAATTTCCCAGTGCAAGGATGATCAGATGTCCTTCCTGTCTCCCTGTAGCGCTGTCTCCA
TGTAGCACTAAAACAATCACGATGTGTTAACATGTGTTAATAATCTTTATTATTTTAGCT
GCTAAGGCTTAAAGTCAGCTGTCAGCATCTGCTACCTGGGATGTTATTTGACCGATGAAC
ATAAGCTAATAATCTCATTACAAAATCAAAAACAGTCATAAATAAGAATAAGTTTAACTA
AAGGTCTGTTCATTAGCAAAGGAAAACTAACATTATGTAGGTTATTTTAGACAGCTAATT
TGCCTTGAAAGAGTTCAGTTGTTAACTTCTCAAAAACAAATTATTCAAAGGCATTCTTTA
AGATTGATAAAGTGACACAAAACCTATAAAATATTTTATTACATATAACATGGTAAACCT
CACATGGACTCAATCTCACCTCCCCAAAGTCAGACTCGAAACTGGGATATCTGGGATTTG
CTAATGCTAATAAAACATTTGAACAGCTACACGTTGACTTCTGACATGCTTATTGAATAT
GTTCTTTGTACATTAAGAAACTTCCCCATATGATTTTTAAACTGGTTGAAATTCAAGCTA
AAACATTTCTAAAACAAGGTGTATGCATGAATTAACCTTTTGCATTTTTGATGATGACCA
TACTGTGGGCTATCATAATTTACCATGTTGCAACAGGAGACTACTTTGAATAATATTTAG
AGAAAACAATGCAAAACTCATAATAATTACAGAAAATAAGAATTCTTTTATGATGTTTCT
AATGATGCACAAAATTAAAATTCTTGGCCACAGTTGAAATTTAGACTATACTAGAAGTAC
TGTACGTATAGTTATCTAATCAGCCAATTATATGGCAGCAGAGCAATACATAAAAAATCG
TGCAGATACAGGTCAAGAGCTTTAGAAGATTAGGAAAAAATCACCTGGTCTTTTTCCAGT
CTTCAACTGTCCGGTTTGGGCAAGTCTATGAATAAAATAATCTCGGATTCTTGTTCTTGT
TTGACAGGAGTGGAACCAGATTTGGTCTTCTGCTGTTGTAGCTCATCCAACTCAAGGTCT
GATGTGTTGTGTGTTCTGAGATGCTTTTTTGTTGACCATGACAAAAACAAATTATAAATG
GTGTGCATCCCAAAAGTCTCAATACATAGGGGAAATTAACACTTTTTAGCAAAATGTAAC
TTTATTTATGAAACATCCTCTACATTATTGCCATTTCCTTGTAAACACATGAAGTCATCT
CTCCAACTCATGATGAAATTGTGTTAACACAGCTGGTATTATGCATGTAATCGCATGTCC
ATTGAAACCTTGCGGCAGCTTCCTGTTCCTGCCATGAGAACGATTTCAATACGTTCTGCT
TTTATCAAACGCATTCTTAAAGGCCACCTGAAAAAATATATATAATATAAACTAAGTATG
AAACATTTTGGAAGACATTTTATTAAACGTTACTAAGTTACTATAGATTTCCTGTCAGCT
CAGACCAGTTTGGTAATTCTCCTCTGATCTCTCTCATCAACAAGGTGTTTAAACCTGCAG
ACCCTCCACTCACAGAATTTTTTTCCACACCATTCTTTGTAAATTCTAGAGACGTTAGTG
AAAACTGTGTGAAAATTCCAGGAGTTCAGCAGTTTCTAAACTTCTCAAAGCAGCCCACCA
GGTACCAACAACCATGCCATGGTTAAAGATCACATTTCCCCCCATTCTGACAGCTCTTGA
CCTGTATCTGCATGCTTTTATCCACTGTGCTGCTGCCACATGATTGGCTGATTGGAAGTA
CAGAAGATTTACAAATAGTTTATTTTTTTGTTGTTTGTTTTTTTTTGGCAGCATTTTTTG
TGCTACACATGTCAGGAATATGTTGAAGACCTAAGCAAAATACCACAGGAAATGCTATTG
GTGAGTGCAATACTGCAATGTCTGATATGTTACATATGGTTTGGTTTTTGTAATCCTTTA
AAGATGTGCATGAAAAAGTCATGTCCCTTTGCTGCTATAGGATGCTGATGTCCGACTTAT
TGTCATTGGGCAATCAGGCTTTTCCCATATAGAGGTAAGTCACAAAACACTTTAGAATGT
GATTGTGTTTTTAAATAAATCAATAGCAGTATGTATTGTTCATGTTCAGATGTTTCTTGT
AGGCATTCTGCTCGCTGACAGGCTATCAACATGAAATTTATGTTGATCCAGAGCGACATA
TTTATAAGAAACTAGGGATGAAAAGAGGGGAGATCTATGAGGAAACAGGTAAAAAAAATA
ATAAATAAATAAAAAATTGAAGAAAAAAAAAAAAAACTATTGTTGACTTGTTAACATTGA
TTTATTTTTTATGTTTGAGTTTAAATCCCAGAACTGCTATACAGCCACTGTTGGCCACTT
GAGCAACCGTGCTATGTACATATAGTGATGAATGATATCTGATTGCTCTCAGCCTCTCAA
AGCCCACATGTGAAATCCAGCATGCTTGTTGGCAGTATAAAGAGCATGTGGCGTGCCATG
ACCAGTCCTGCCTTTGATTTTCAAGGAGATCCTCTCCAGCAAGGAGGAGCACTCATCATT
GGCCCAGGTGAT
Chart Advanced