SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003212_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U (SelU)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003212
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003090_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003212_2.0 # Transcript # Selenoprotein U (SelU) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Reverse
ATCACCTGGGCCAATGATGAGTGCTCCTCCTTGCTGGAGAGGATCTCCTTGAAAATCAAA
GGCAGGACTGGTCATGGCACGCCACATGCTCTTTATACTGCCAACAAGCATGCTGGATTT
CACATGTGGGCTTTGAGAGGCTGAGAGCAATCAGATATCATTCATCACTATATGTACATA
GCACGGTTGCTCAAGTGGCCAACAGTGGCTGTATAGCAGTTCTGGGATTTAAACTCAAAC
ATAAAAAATAAATCAATGTTAACAAGTCAACAATAGTTTTTTTTTTTTTTCTTCAATTTT
TTATTTATTTATTATTTTTTTTACCTGTTTCCTCATAGATCTCCCCTCTTTTCATCCCTA
GTTTCTTATAAATATGTCGCTCTGGATCAACATAAATTTCATGTTGATAGCCTGTCAGCG
AGCAGAATGCCTACAAGAAACATCTGAACATGAACAATACATACTGCTATTGATTTATTT
AAAAACACAATCACATTCTAAAGTGTTTTGTGACTTACCTCTATATGGGAAAAGCCTGAT
TGCCCAATGACAATAAGTCGGACATCAGCATCCTATAGCAGCAAAGGGACATGACTTTTT
CATGCACATCTTTAAAGGATTACAAAAACCAAACCATATGTAACATATCAGACATTGCAG
TATTGCACTCACCAATAGCATTTCCTGTGGTATTTTGCTTAGGTCTTCAACATATTCCTG
ACATGTGTAGCACAAAAAATGCTGCCAAAAAAAAACAAACAACAAAAAAATAAACTATTT
GTAAATCTTCTGTACTTCCAATCAGCCAATCATGTGGCAGCAGCACAGTGGATAAAAGCA
TGCAGATACAGGTCAAGAGCTGTCAGAATGGGGGGAAATGTGATCTTTAACCATGGCATG
GTTGTTGGTACCTGGTGGGCTGCTTTGAGAAGTTTAGAAACTGCTGAACTCCTGGAATTT
TCACACAGTTTTCACTAACGTCTCTAGAATTTACAAAGAATGGTGTGGAAAAAAATTCTG
TGAGTGGAGGGTCTGCAGGTTTAAACACCTTGTTGATGAGAGAGATCAGAGGAGAATTAC
CAAACTGGTCTGAGCTGACAGGAAATCTATAGTAACTTAGTAACGTTTAATAAAATGTCT
TCCAAAATGTTTCATACTTAGTTTATATTATATATATTTTTTCAGGTGGCCTTTAAGAAT
GCGTTTGATAAAAGCAGAACGTATTGAAATCGTTCTCATGGCAGGAACAGGAAGCTGCCG
CAAGGTTTCAATGGACATGCGATTACATGCATAATACCAGCTGTGTTAACACAATTTCAT
CATGAGTTGGAGAGATGACTTCATGTGTTTACAAGGAAATGGCAATAATGTAGAGGATGT
TTCATAAATAAAGTTACATTTTGCTAAAAAGTGTTAATTTCCCCTATGTATTGAGACTTT
TGGGATGCACACCATTTATAATTTGTTTTTGTCATGGTCAACAAAAAAGCATCTCAGAAC
ACACAACACATCAGACCTTGAGTTGGATGAGCTACAACAGCAGAAGACCAAATCTGGTTC
CACTCCTGTCAAACAAGAACAAGAATCCGAGATTATTTTATTCATAGACTTGCCCAAACC
GGACAGTTGAAGACTGGAAAAAGACCAGGTGATTTTTTCCTAATCTTCTAAAGCTCTTGA
CCTGTATCTGCACGATTTTTTATGTATTGCTCTGCTGCCATATAATTGGCTGATTAGATA
ACTATACGTACAGTACTTCTAGTATAGTCTAAATTTCAACTGTGGCCAAGAATTTTAATT
TTGTGCATCATTAGAAACATCATAAAAGAATTCTTATTTTCTGTAATTATTATGAGTTTT
GCATTGTTTTCTCTAAATATTATTCAAAGTAGTCTCCTGTTGCAACATGGTAAATTATGA
TAGCCCACAGTATGGTCATCATCAAAAATGCAAAAGGTTAATTCATGCATACACCTTGTT
TTAGAAATGTTTTAGCTTGAATTTCAACCAGTTTAAAAATCATATGGGGAAGTTTCTTAA
TGTACAAAGAACATATTCAATAAGCATGTCAGAAGTCAACGTGTAGCTGTTCAAATGTTT
TATTAGCATTAGCAAATCCCAGATATCCCAGTTTCGAGTCTGACTTTGGGGAGGTGAGAT
TGAGTCCATGTGAGGTTTACCATGTTATATGTAATAAAATATTTTATAGGTTTTGTGTCA
CTTTATCAATCTTAAAGAATGCCTTTGAATAATTTGTTTTTGAGAAGTTAACAACTGAAC
TCTTTCAAGGCAAATTAGCTGTCTAAAATAACCTACATAATGTTAGTTTTCCTTTGCTAA
TGAACAGACCTTTAGTTAAACTTATTCTTATTTATGACTGTTTTTGATTTTGTAATGAGA
TTATTAGCTTATGTTCATCGGTCAAATAACATCCCAGGTAGCAGATGCTGACAGCTGACT
TTAAGCCTTAGCAGCTAAAATAATAAAGATTATTAACACATGTTAACACATCGTGATTGT
TTTAGTGCTACATGGAGACAGCGCTACAGGGAGACAGGAAGGACATCTGATCATCCTTGC
ACTGGGAAATTACATGTAACCATGAAAAAATGGCACATTATAAAACAGTAAACCGACATA
AAAGGAACAAAATGCTAAAGTATGAACATGTCCCAGCTCTCACTTATGCTGAAGCCTAAC
TCCAGCTTTAAATAACCATGGCCCAGTTGTTCAGAAGTAATCTGATCGGATTTCGGCTAT
CGGATTGGATCTAATCATGAAAATTGGTTGTTCAAAAGAAAAAAAAAAAGGATTCTGAAA
TCAGATTATATCACGTAATCCAAACTTGCTTTTGACCTGGATCAAACCTTCAGTACGTGT
TGATAAAAACTTTTTAGTAGGGTTGGGATACCTATTATCCAGAAAAATAAATCAGGATTA
TCCTCATCTCTGCAGAAGGGTGGATTGAGGGAGGATTTCAGGAACAAAATGTAATAAAAC
TTTCAGACTGGTCAAATAATACAACGTTTGTATAATGTAGTATATACATTCATTTATATT
TATACACTTGATTTGTTTACCCGTTACAGTGATAAAGTAGATAAAGTATACATTCGGCTA
CCAATTAAGCCTTTCAGTACAGTAAAGTAAAAAAGAAAAAAGATTTTGTCCTCATAAATA
ATCCCCCAAACAGCTGTCAATATCAAACAAAAATTAAGTAATTAATTTTAACTGTCATTC
GTCACCGTGTATTAATTACAATGACACAATCATCAGTGATGAACCAGGCAAAAGTAGTTT
CTAACAATTGCATCCATTATTGCTCTCCACACATGAACAACTCTGAACATTCTTATTTCG
TTAACAATTGGACATTTAGACTTTTTACGATTTTAAAACGTGTTCAAAATATCCACAGTG
TATTTGCGAATAATGCAGATTTGTTTGTTTGTAGGAAGGGGATGTTTGTATTGTTTTCTT
GTGCTGTTTTCTGTCTCTTCAAATAAAAAAACTTAAAGTGACCCCATGCTGGCTGATCTA
AATGTTGTTCTTTACATAGCTAGTAGCCTACATTGTGATATGTAATCTGATTTAGAGCAC
TAGTAATCTGGATTTGGTCATCTTGAAAGACTTGTATATAGCTCAGGGTGATCCAATCCG
ACATTGCTTTGAAAAACCGACACAGACTTAAAATGGATTACTTGATCCTGGATTGCCAAA
CATGGGATTTCCAAATCCTGATCATTCTGATCCAGATGAAACTTTTTGAACAACTGGGCC
CAGGTCTCTATGTTCCCCAGATTTATATGGCACATAATGAACACATGGGCCCAGTTGTAG
TGCTGGGAAGTTCGGCTAATTTTACTGACTCGGATCTTTGAATCTTGTTCAGCAAAATGA
ACGAATCTTTTTTTTCCGAGTCATTTAGTTCATTTCAGCAGAATATAATTAAACGTAACA
TGTTCAATTCCACAACACATCTAATACTTACGCAAATGTTGATCACATTGGGAATAAAAA
ATAAACTATACGTTGCACTGGATCAGAATGATCATGATCAGGATACGCTCCTGATGGTTA
GCATTAGCAATTGGGACTGCAACAAAGTGACCAAAGTGTAGGAAATGCTGAATGTCAACC
TGCCATGATTAAGTCAAAGTAATCACTTTCAGGGGGGAAAAAAGTAAACAGAAATGAATA
AAATAAATAGTACGTTTGTGTGACATTATAAAAGGATAATCTTGTTTTTTACTATTTTAA
AACTTTCAACATGTAGCACGAGAAGTGTGCTGTAACAACCCAGTGTACAGTAACTGCTAA
TGTTTAATAGTATTGCTCAAATAGTTATGCCACATTTTAATGGTGTCACGTAAATCATTT
GTGTTACCCATGTCATAACAAAAAAAAAAAGATGCTAAACCCATGGCTCCAACTGTTCCA
GCAATGTTTTAGTGCTACAACCTTTTCCACAGGGGTATACTAACTAACTGTCAGGAAAGG
ATGTGTGAGAAAAGCAGAAAATGTCAGATGACAGGAGCTCAGGGGAATATGTTCTGCTTC
TGGTATTCAGAGTCCCTTACCACACACATTTCAGTTTATTACCTTCTCTCAAGTGCTAAT
CAACCTCTGTGTGCTTGAAGGGGTCTTGGAGTAGGAAAACAAAATGAAACCGAATGTAAT
GACTTCAGGCACTTACCCCAATGCCTGCTCACAATTTCAAAAACAGCACTGATTAAATAA
TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAGC
TTTAAGTATATGAACAAACCTAAATTAAAGTAAACAGAATAGCAGTTATCTTACCCTCAC
AAAAATAATGATAGCTTTGTGGGTTTGATATAAGCTCTTAAAGGTTAATCGAAGCCCGTT
TCGATCATAGATGAGACAATCCTCTACCTCGGCAATGGGAACAGCAGATGTGGCTGAAGA
AGTCGGAGGTAC
Chart Advanced