SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003217_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003217
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003095_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003217_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Forward
ATGAACAGCGAAAATGTCACCCTCTGCGAGAAAACCGTCTCGTCCTCCTATATCCGCCAG
GGCTCTCAGGCTCGCCGTGGCCACGAACAGCTCATCAGACATTTACTGGACCAGGTTGGG
TTAGATACATTTGCTTTGCTTTGGTGCAGATGTATCGTCTTCTCACATTGCGTTTTTACA
GGGTAAGTGTCCGGAGGAGGGATGGAGCGAAAGCACCGTAGAGCTCTTCCTTAACGAGCT
GGCCGTGATGGACAGCAACAACTTCCTGGGCAACTGCGGTGTCGGAGAGAGGGAGGGCCG
CGTGGCGTCCAGCCTGGTGGCCAGGAGACATTACAGGTTCAGATCGCTTTCGTAACGGGC
CAAACGTTCATCTTGAGAATGATTGTTGTGGATATTTGGGAGATGTGAGGTGAAGATGGT
TTTGAGTACAGATTTTTCTTGCTCATTGGTTGTTATTTTGATACAGCAGTAATGAAAAAT
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TTTTCCCTAATTTCTCAGTGTGTGTGAAGTCTTTTTGTTGGGAGTTAAACTTTTTCTATC
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CAACAAGCTCACAAACTCTGTTGTTCTGGACATCTTGAAGATTTCAGGTGAGAGTGCTGC
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TATTCCAGGTGTTCGCAGTGTGGCAAGCTGCTTTGTTGTTCCCATGGCAACAGGAATGAG
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GGCCACTATGTGTGCCAAACATGACATCCCTCACATCGTTAACAATGCATATGGAGTGCA
GTCGTCCAAATGCATGCATCTTATACAGCAGGTATCAGCAGCTAAGACTTGACTGGAGTA
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ATATTTTCTTTAGTGTCATTTTTACTGTGTATTCCCTAATCTACACAGTGGGAAATACAA
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CTTTATTCATTGCACCACAACTGCCACCTACATGCTTGACAATTGGTACAGTAATCATGT
GCAATATTCAAGGTTTGAAAGTCTTAATTTCGGTCTTCTAGATCTTCTTCCTGTTTAATT
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TGGTGATGTGAATCTCATTCTACCTGGTGTAGTCACACTGGAGTTCCTGCTTCTTCCAGT
TCACTATAGACTGGAGCCTTGCTGTCTCCTGCGTTGATCCTGATCATCCTAATCAAATTA
TCTTCACCTCAAGATGCTACCTCTAGTCAGATGGCTGGAAATCTGATAGAGATACAAATG
CATATCAAAATAGATTTTGAAATTAGTAAAGCAAACCTTCAGCCCTTTTGGGAATTTAAG
TATTATTCTTAAAAGGTAAGAGAAGCCGGTGATGTACATGAATTCTACAAATCCTGCTAT
GAAGAGCGGTCAAATATTCAACCAGAGTTATGCCACGAGTTGTTAGTGGCGACAGAAAGT
GTGTAGTTGGGATGTGTTATATATTTTAATCTGTGTGTGTAATCCAGAATTTTTTTATAC
ATAGTGTTTGTTGTGTCATCATTGGTCATTGCAAAAATAACCCCCTCAAATGCCCAAATG
TTTTAGATTAATTTGTATGTGTTTATGTAAACATCTGACAGCCATGGAACTTTTGAGCCC
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AGGGGGCTCGCGTGGGAAGAATCGATGCCTTTGTTCAGAGCTTGGACAAGAACTTCATGG
TTCCAGTAGGTGGAGCCATAATCGCAGGTTTTGATGAGTCTTTTGTGCAGGAGATAAGCA
AGATGTACCCAGGTGAGCAACAAACCAATCATATCTGAATCAGAATGGCCTTACAGAAAC
AGCTGATAAAACGGTGTTCATTTCAGAAGCGTTTTCTTTAAAAAGATGGGGCTTTCCCTT
TTCCTGTTATGACTGCAGCTTACAGATACATGCTCTAGTTTTCTTGATAAAACCAACTTT
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CGACTCTTTTGACGAAACATAATTGGTTCTCCTGGACAGTAAATATAGAACATCGTACAG
ATTTAACCCTTTGGAATCTTTCTGAATGAACAATTAAACAAAAATCAAGAATCTGATCTG
GCTTGCTCAGCCAGCATTTTATATTTGACACTTTTTTGAAAGTATATTCTACACATTTTT
TTTCTTTGTCTATAGAAGATGGTAAAATCTCACACATTTTTCTGATGGGAGGTTCATTCT
GTTTTCTTGCCATAATGTTGAGAAAAACATATAACTCATTCACAGGCAAGATGAATGATT
GGTATAAAGATAACTTATTTTCTATTTGCTGAAAGATATTTAATAAATAAGATATGAAAT
AAAGTATTTTTCCTTTTTAGTATTTGGCATGCCAGTCATGAGTCTGAACTGATTATGGGA
AGATTTTGTTTTCTAGTTTGTTTTAACTGACCCACAAAATCTCCTTTGGTGTTCCTACGT
CCAGGTAGAGCGTCGGCTTCACCTTCCCTCGATGTCCTCATTACCCTTCTCACTCTGGGA
TCCAACGGCTACAAGAGGTACCTATCGGAGAGAAAGGTGAGAACAGACACTACCCTTTCT
AAAGCTAAAAATAGCATGGCTTCTTCTTGTGTCAAGGTGGGATTTCTGCTAAGTATTTTC
AGCAACAGTGCTTTGTTTTTTTTTCAAGTTTTACCATGTTAAAACCACAAACCTTTGTTT
TATTTAAATTGTACGCGACAGACCAAGGCAAAATTTCCTTCTGAAGATAAAAGTCTGAAA
AGTGGGACATGTGCAACCAACTTTTCTCAGAAGGAATGAACCTTTTAAATAGTCATTGTG
TGTAATTTCATCTCAGTCTAAATCCAGCGTGTAGATCTCCCGAGTTTTCTTAAAGGAAGT
TAGTGAACAAACATCCTAAATCCCATTTCATCCCTTGTCCTGAAGCTTAGTTTCCAATGG
TTATGGTGGTTTTTAGTGTGCTGACAAGACACTATTTGTGTTCAAGGCCAAACACTGCAG
GAGGAAAAAAATTAATCTGGTCAAAGTTCACGATAAATGTAGATAAATACACAACAACCC
TGGAAGCAAACCATCTGGAGCATACAGCCAGAGCTACAATAGAAGGGCTTCAATCAGGGA
TTCCCAAGTCCCGTCCTCGCGATCTGCTATCCTTTTAACTTTTGGATACTTCCCTGTTCC
AACACACCTGAATTAAATGACTGAAATCCCTCATTAGCATGTTAGCTAGCTCTACAGAGA
CCTGGTAAAGAGCTATTAATTTGATTCAGGTGTGCTGAAATAGAGATTCATCTAGGTTTT
GCAGGATAGTAGCTCTCAGGGACTGGACTTGGGCACCTCTGGCTTAGATCAAAGCATATT
CATGTGTTACAATGGCCCTGTCAAAATCCAAGATTCTGGTGGATTTAGGGATTTAGGTCC
TCTCTGGTGGAGAAACGTGTTTTTGATTATTTGATGTCTTTATCACCTGACAAAGGTGGA
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GAGTGTTGTTTTAATTGCAGTATAAATTGGCTTTTATAAAGTGTTGACTTAGTGGGGCTA
AGTACAAAGGCATGCCACACTTTTCAGAATTTTTTTTACACAATCTTTGTAAAAGATTTA
GAAATTATTTGATTACTTTATCACATGATTAAAATATATTTACGTTTGCAGTTGAAAGAT
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ATTGGTATAAAATGATTTTTTTTGCTGATGTTAGATGTATTGTTGCCTTTTACGTAAAAT
GGCTTCTTCATCCTGTAGAAGGAGAGCCCAGTTCCAGCTTTAATGATGCGTGTGGCTTTG
GCCATCACTCTGACTGAAAGTAGGGACTCTGCTCTTGAGCAAGCACTTTGCTTTGTAGAG
GGAGGGTTGTGCTGTAGAGAGATAAAATTGATCCAGAACTTTTTGAGTTGCTCACAATGC
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TTTATTTGACCTTAGATGAATCACACTGAATTAAAATTGAGACTAATTTAGTTAACAAAA
ACTAAGCCAATGTCAGACAATCTACTTAAGTACAATATATATCAAAGGTTTCCATAAACT
CATTATGGGAAGCTCATCACTTTTTTAATAATTTTTTAAAAATGATTTATTTAAAGTCTC
TTTGTTTTGGTGGAATAACTATATACCATACAAAGTCAGCTGCAAACAGTAAATTGCTTG
AATATATTGTGGATTTTCTCTAAATAATATAATAAAATAATACATACAGTTGAAAGCAGA
AATGTACGCAGGGCAAATGAAAAGACCATTTTATTTTTCACCATCTGAAGTAAAATCAGA
CCAAATGTGTTTTTAGTCAGTCAGAATTACCAAAAATATTTCTATGTACTAAATGTCACA
ATAATGAGAAAAATAATATGCCACAGATTTATTTACTAATGACTCCAATATCAAAAATTT
ACATATAATGATTATTGTCTCTTTAAACAGAAAGGGAAAACTGAGGTGATGATGGCATCA
TGGCTTACATTTGTGGCTGTTATTCCTGCTTGTTTGTAGATTTAAGTCTGCTTTATTATT
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TGACTCTCTTCGATTTGGAGGATTTTTAATAAAAGTGAGAAACCATATTGTAAAACTACA
TTTAAAACCATTGTTGTCCAGAAAGAAGTGGTAAATATGTGCATATTTATGGCACAATTT
GTAATTTAATTAGTGGGGCGCAATGTTGCGACTAAACTTGAGAGGATGTCAAAATTCTGA
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GTTTTCAGTTGTAGAACAATTTGTCTGTTTTAGTCATGATAAAGATTGTCTTAGAGACAA
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TTTTTTAATTACATCCTGAAACACAAAGCCTTAAAATCGAACCTTATCTGGCCTGTCGGA
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TCCAAAATAGGTTTTTCCATCGTGTCTGCAGATCCCGGAGAGTTCCTCGCATCTCTCCAG
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TCCCTCCTCCTCCTCCCTGGGAAAATAAAGTTGCTCTTTGTTCCTGAGGAACAAGGGTCA
CACGGGGACTCTTGATGCGGTTGAAGAACTGTTTGTGTTTGACTCTTGAAGGAGAAAACA
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AGGGACTCCAATGCGAGCAGAAGGAAAAAAAGAAACTGCGCCCCGTTGTTGTGCAGGTTT
GGTTCTTGTAACATCTGTGTCCTGATCCCATTTGGCCTGATTTAGTCCTTCAGAAGAAGC
TTCACACTCCTTGCTAAACACTCTGTCAGCATCTTTTAAACATGCTTCGTTTAAAAGCCT
GCTTTCTTCCTGTCCTGCTCCTCTAATTGATCCCAGAGGTGGAAGTGTGATGCAAACAAA
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AAAAAAACAGAAAAAACACGGACTTATTTCGGACACAAACTTAGCCCGTTGCTACTAAAT
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GTTGCTATATATAGCTTCCTGATAGTCTGAATGTTTCCACCTGCAGGAGATTTATTCCTT
CCTGGCTGAGGAGCTGAAGAGTCTTGCTTCTGCACACGGAGAGAGATTGCTTCACACCCC
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CTCGCTGTCGCTCGTTTCTGCAGAATTTATGTTTCTAACCTTTCCAGTTCACCCTTTGTG
TGTATGGGTGTCTGTGTGTGTGTTGGGTGTGGTACCTCTCTCCCCTCCTTCAGCCATGTC
TCTAGATGGTCTCCAGGCCTCCAGCAACCAGGCGGTGACTCAGCTCGGCTCCATGCTGTT
CACCCGACAGGTGTCGGGAGCGAGGTATGAAAACTGGTTTGTCACCCCTTTGTCTATTTG
TTTTTTTGGCACTACAACCACAAACTTTGATGTAATTCAGGGTGTTTAATCTGACAGAGA
TTTTGGATTCAGAACCCCTTTCCTCTGATACTCCTAAGTAAAATCCACTGCGACCTTTTG
TCTTCAGATTTGCCTAATTAGTAAGTAGTCGGCACATATGTAACTTAATCTCGATATAAA
TGCAGCTCTTCTGTGAAGGCCTTTGAGGTTTGTTGGTGAACATTAGTGAGAAAAACTACA
TCATGAAAACCAATATCCCACATTTTGAACATATCCACAGAGTGATTTGTAAAAAAAAAA
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TAAATAATTAAATGTGTAGAAAACCATTTCAAAACAAAACCAAATTAAACCACTCAAAGC
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TCATTTCAAAGCTTTAAGCAATTAATTTTAAATATATTCTGTGCATATATATTTTGCACA
AAATATATTTGCATACTGTATATAATAAAATAATTATATATATCCATCAAATTCAACAAA
AATAATTTGATGGGTAAATTATTTAGATTTAATAGGCCATAATAGCTGTATACAAAATAG
ACCAGCTTGTATTTGCTCATTTATTGCAAGAAAACACAATATTTTGACGAAGTAACGCAA
AGGAAAACAATTTCCCCCACGACCTCTAGGGGGCTCCATGTATTCCTACTTTTTGTAAAA
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CTCCACAGAACCTCAGGCCGATCAGGAGGCGCCT
Chart Advanced