SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003217_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003217
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003095_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003217_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Reverse
AGGCGCCTCCTGATCGGCCTGAGGTTCTGTGGAGCAGCTGCCCGCCGTTTTCCCATGTTT
CTTTAGAGCTTTCAGACATTTGTCGAGCCTCTTCATGCACAGCGTCACGTCGCCTCGGGT
GATGCCCACGGCCGAGGCGGCGTTGAGGTATGGGCAAGGGTACGACTCGGAGTGCGACAT
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GGATCAATTTTATCTCTCTACAGCACAACCCTCCCTCTACAAAGCAAAGTGCTTGCTCAA
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GAACTGGGCTCTCCTTCTACAGGATGAAGAAGCCATTTTACGTAAAAGGCAACAATACAT
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TTTTAATCATGTGATAAAGTAATCAAATAATTTCTAAATCTTTTACAAAGATTGTGTAAA
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GGATTTGAAACATGACTTCTGGTCGATGCGAGGCCAGATGATGTAGCGGGCCTTGGGTCT
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AGGGAGGACTAATTTGAGACAGCTGGGTCTTTACACTCCTCACCCTTTTTAATGACGCTT
CAGCAAGGACATAGAATGAGCTGAAAACTGCAGGATTTTTCATTACTGCTGTATCAAAAT
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GCTTTCGCTCCATCCCTCCTCCGGACACTTACCCTGTAAAAACGCAATGTGAGAAGACGA
TACATCTGCACCAAAGCAAAGCAAATGTATCTAACCCAACCTGGTCCAGTAAATGTCTGA
TGAGCTGTTCGTGGCCACGGCGAGCCTGAGAGCCCTGGCGGATATAGGAGGACGAGACGG
TTTTCTCGCAGAGGGTGACATTTTCGCTGTTCAT
Chart Advanced