SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003250_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesMus spretus (Western wild mouse)
Transcript IDSPT00003250
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003128_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003250_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Western wild mouse (Mus spretus) # Full length # Forward
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TGTGCAGGACAGCTCGAAGTAAACTAGGGCAAATGCCTTGATATATATTTAAACACATTT
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GATAGTGTGCACATAAAATGTCTATCAGAGCTCCCCTCTCCTAACCCCTTTTCTACAGCC
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TCATAGGGGTTGCCTAAGGCCATTGGAAAACACAGATATTTACATTATAATTCATAGCAG
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TGGCCTGTTTCAAAAGAAGTCACCTAGGAACTCTCTGCCATTGTGACCTGCCTCTCCCCT
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TGGAACGTGTGTTTGTCCAGTTCACTGATGCATCTCGTGGACTTGGAACTGCGGTTGACA
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GGCTGCTAACTCTAAAGTGTCTGAGGCATTGCATTCTTGATTAAGCTGTCATAACAAAAG
GAATCCACTCCATTTCCTGATTTGTTGCCCCTGGGAAGAACATGTTCCATGTTTAGTTTA
GTTTTGAATCTTTGTCATCTATGGTGTGACAGTCACCGAATGCTTCACGGCTTCTGCTGT
TTGCAAGAATTTAGAATGTGATAGTGACCAGAATAAAGCTCAACTTTTCCTTCATGACAC
CAGCTTACCACCAACTTGCCTGAAGAAGTGAGGTGCTCCTGGTTCGATCCCCAAGTGTCA
CAGCCCAGCTGCATTTTCCAAGATGGGGGGTGAATTGCAGACCACACTCATGAAAACATC
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TGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGTGATCATGAGTCCCGTGAGGGATTCATGGTGGCTCA
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CAGAGAACATGGATCTGAAATTCGAGGAGTGGATTTTCCTGAGTCACATATAATAAGAAG
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CAGATTTCAAATGAAGACTAGCCCAGAGGAACAGGAACTTGAAAAGTGACACTTGATCAT
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GAGGCAGTGATGGCCATTTTCAGACCTTTTTCGAGTGTGAAGAATAGAATGTTGTAGTGG
TGCTGAATCTAGGATGAGAGTCTTGGCTGAGCCCCATTCCTGCTTGCTGGCTTGGCTCTG
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GTGGGGTCCCTGATGCCCCTCTGCAGCATCAGAGGAGCACCAAGAAAGCTGGGAGGATGA
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GTCTTCATGGTCGCTATACCAGAAGAACATGTGGAGGTTTTAAAAGTCATGAATGAATCG
TCTCTCTCCAGAGACCTTGATGTAGATGTATTGCAGGTGATGGACAATTATAGAAACAGC
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GGTTCATTGAAATAGATAGCATAGGCAGGCTCAGTTTGTAGCTGAGTGTGACTCACTTAG
TTAGGCATGGTAGAGTTCAGTTGAGAAGAGATGGTACCAGGCAGCTCACTGGAAGACACT
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GAGCTGTGAAGCAGAGTCACAGCATATGGTGATAAAGTAGAAACTGGGTATGGCCATAGA
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GGCTGACAGGCATTAGTGTCTTAAAGGAATTTGTGTCACTTCTGAGGGCTCACAGTAGGT
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GCATGGCTACAGTGCTCCAGAGCCACCTAGTGCATGACCATAGTGCTCCAGAGCCACCTA
GTGCATGACCATAGTGCTCCAGAGCCACCTAGTGCATGGCCATAGTGCTCCAGAGCCACC
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CACATGCTTGGAAAGAAAGGGTTAATGGAAAGGTCTGACGTTATGATATGATATATCTAG
AGCATATAAAAGATTGAGCTTAGCAATATTAGAATTAATTAGTTCAGTTAGTGTGAAAAT
CACATTTCTTACTTGCCAGCCATAACAAGCTAAAAATACAGTGAAAAATGACAAAAATGA
CGAGATGCCTTGGAGCAAAGCTAGCGGTGTACATGGGAAGACTGTTAGTGCTATGAATTA
GAGGGGTTGTCTCAATATTATGAAGAGGCCATATCTCAAGATTATCTCATGACTATGCAG
ACCCATCACAATCTGAGACCTTATTTTTTTTCCTTCAAAGCTCAAAAGTGATCATTTTAA
AGTTTATATTGAAAATAAACTTGTGAGACGAGCTGAGCTTTCTCAGAACAGAGGGTGACT
TTTCTCATCCGGTTTGTTCGGAAGGAACAGACACAGAGTGGAACACAGCCAGGCCCTAGA
TTTGGCCAGTCAGTCTCCCTGGAAAACTCAGGGGATCTGGGACGTGGTTACGGGATATGC
AGGCTGATGCACGGCCATGTTTGGGACCCTGCTTTTTACAGTAGAAGTCATTTGGCTTGC
GAAGAGAATGTATAGGACCCTGCAGTCAGAGTTCCCTAGAGAGGGAAGGTCTTTAAGGGG
TGGGGCTTAGAAATGTGCCTCTGTAAAGAACTTTGCATCTGAGAGTATATAAAAACAGCC
TTTCCAGGATGCAAACGCCTAGGGCTCTCCTTACCCTAGCTAGTGTCCTGGGAAGGCCCC
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GTGTGGAGAAATGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAATGACAGAGGCAGGCCATGACCCTT
GGCTGCTGATTTTTTCTGGACTGTCATCTAGTTATGACCAGATTCCCCAGGCAGGCAGGT
CCTTATGCCATATAAATGTGGAACTATGCAGTTGTGTATGAGCTTCTAGATCCAGCTTTT
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AACAGGGAGGGATGGGTATCTTGGGAGGCTTAGGAAGTGGGGATTCCCCATCCCTAGGCG
ATATGAATTTTGAAGTTTGTCATGACTACCTCAACTCACTGCTTTTCAGGCAGCCATCAT
CTGTAGGTGACACAGATCTGACTCTTCAGGAGTCTTTGCTACCTCTGCCCCTTGTCAAGA
ACTCTGATGGTTCCCAAAGCCCTGACCTTGGCTTCAGGGCTTGGCCTCTGATTGTCCATT
TCATCCAGAGCAGCCCTGCCTCCTTTGCTACCAAGGCCTCTGTTGGAACCTGGCTCCCCT
CTTCTGTAGCCTGGCCCGCTGGCTGCTCTCCCAGCTCCACCTCTGTTGCAGCTGTTATAG
CAGTGGGTGCTCCACAGTCTGCTGTCCCTGCTGCTGTTCTCAGTTCAGCCCACTCTACTA
AAAATACACAAGGTAGCCACCTCGAGATAAGTGTTTTACTTGGCCTAATATTACAACCCT
AAGGGAGGCAGCACAGGAGAGGTCTCCCACACCCTGACTGGCCGAATGAGAGGAACACTC
TTATGTCCAGAGAAGGGACATTGCCACCACCAGAACAAACCTTCCACACAAAGGAAAGCC
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TGTCCCACTTGGGCCTCAGAAAGTGGCTGCAGAGTCATCAAGTGGTCACCAAGGCTCAGG
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GGCTGGAGCTGGAACAGGCAGCTGTGGTGGTTGTACAGTTTCTTTAAGGTATCTGTAGAG
TGTTCAAAATGGCTGTGGTGGCATCCTGCTGGCTGTATGTCCTCTTGCTTATGGCAGCCA
GGGCACAAGGGACATTGTAACAGCTGCCAAGGAGGGAGTCAGGTCACCCATCTCCCAACT
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CTGTGTCTGTCTCAACTGGAGGACTTCTTCCTACCCAAGGGGCTGGGAGAAGCATACGCC
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GAGAAAGGCGTGACCTATGTCAACTCCTTCGGGGAGTTTGTGGACCTGCATAAAATAAAG
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CCTCAAGTGTGTGCTTTTCAGACCTCTGGTTGTTGGTTACATGTCACGTTAAATTGTAAG
CGTGTGCATTTCAAAGAACTTTTAATTTAAAGGTATTGTTTGCCTTTCATTTCATTGTTA
CTCAAAATATTGAAACAGCTTGAAGTGCAAATGACTAAAAATAAGTATTTCAGCAGCTGG
AAGCTTTTAGAAAATGAAAACATAACTTCCAGTCTGCAGTATTCACGGGGTGGCTTACCG
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GGCTGCTGAGGCTAGCCCTGCTGCTGTTGGGTTTCCCTGTCACACTCTCACTCTGTGCCC
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