SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003270_2.0
Identity
TranscriptIodothyronine deiodinase (DI)
SpeciesMus spretus (Western wild mouse)
Transcript IDSPT00003270
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003148_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003270_2.0 # Transcript # Iodothyronine deiodinase  (DI) # Western wild mouse (Mus spretus) # Full length # Reverse
GACTCGTGTGACTACATCCAACCACAGACTGAGCAGACAGCTCTTTCGTCAGTAGTTATC
ATTCGCACACCAGTGAGCTCTGAACATCTCGGTTTCCTCTTTCCGGTGCTGGTTACATGG
GCTGGTGAGTCTGGCGAAAAACCTGTTCCAAAAACTAAACAAAACTGGCCAACATTCCCT
ACCCCAAGACCTTTTGATTGCTTTGGTTATAAAGTACTAGGTACATAGGTCTTCTCATTC
CCGACTCCTGACACATCAAAATCACATGGCATGCTCTGGAGCAGTCTTGAGAGAATTTTA
TTTCCCATCCCCTTCTGTGGCTCTCTTTCATTTTTATGTTTACCTGTTCAAAATTTTTTT
TTCTCAAAACAGATGGGGGAGGGCAGATTGAGCCAAAATAGTGACTTCATTAAACATCTG
CTAGGTCTCCGAAGTCTCAGTAAATATTAAACGAACTCCCAAGAGCCCTGGTGCTGTTGC
CCGAGACAGGCAGCAAGCCCTGGCTTGCGTGAGCAGTCTTGTTTGGATATCTGTATGTGT
TTGCTTTTTGCTGGTTCAGACTCACCTTGGAACAGAGCTGAGTCTGTTAAGTCTGAGACC
TTGTGTCTGGTGTTATCTAGAACACAGGGTATGAAGAATAGAGCCGGTGCTTGTTCAACC
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TTCCAGTTAGCAGCTTTCCCAGCTCACGTAGCTGCAGATCCTTCCCTTCCTAAAGGGACC
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ATATCTAAATATACTTGGGTTCTGGTTTGGAGCCATATCATAAAGAAAGCTCCTAGAATT
TAAAGACTCCCAGTCAATTTCCACTAAAAGAGATGGTATTGAACATGTTCTGACAAGCGG
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CTCCGCAGTGGCCAAGGGATTCTAATTAAACTTATTTTCCAAACCATCAGTCAGAGGTCA
GGTGGAACTAATGTCCAGGTTGATCCTCTTACGATTTACATAATGAGAAGCCTGGTACAT
CAGCAAATCCCTCTGGCTGTGGATGGAAGCTACAGGGCATGCCAAGGGCAGCTTGTATCC
ACCTGAGAATTCTATGAATAGCATCAATACTGTCCCCCCCCCCACCTTCCCCTCCAGTAG
TTTGTGTGAGGCAGCCCCCACCTGTGACCTCACCACATTTTATGAATTTTATTCAAAATC
CCAAAGAGTCAAATACATTCACACAAAGGGAATCAACGAGTGTCTATTGATTATTAGAAG
AATTCAACTAACCTAATAGACCACTTAGAAGCTGATATTATCAAAAAATCAGGGGATACA
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ATGATTGACACTTTGGCAATAAGGAGCTAGAACCACCAATGGCTAGTTTGCCTCCACAGA
GGTCCACTGAATTTGTACAAAGTGTGTCTACATTTGCTGGGCAGGCTCTTCATTCAAGGA
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AGATGTCTTTCAAATGCTTAGTGTTTGAGAAATCCAGGTGCTATGGTAAGTTCTGAGAAT
CTATTTTAATAGTAGACAGGCCAGTTCAGTTTAGAGTAGACAGGCCAATTGAGTTTGAAA
GCATAAACTGATATCCCCATGTAAACATATCCTATGAGAGAAATCTTTATGTTCTAAGAA
AGGTAACTGCAAGGGATGTGTGTGTGTGTGTCCTTGTAAGAATGTATGTATATACATATT
TTTGTTTCCTTGGGAGAATTATAGCTATAACTCTTCAGAGGAATATATATTATAAAAGGC
ATATTAGGTAGGTGGGTACTGACAGCCTCATAGTATCTCTGAGTGAGCACAGTAGCTGAG
CATTGATTTTTTTTTTTCTCATCTCTGGATGAATGACTTCTTGTTAATTTTACAAAAGGC
ACGTCGTAGGAATTCATAGCAGTTTGCATTGAGATAAATAGGTTATACAATTACAGGCTT
ATCATACCTGGGAGACCAACCCATTCTACACAGTGTAAGATTCCTGAGCTCTGCTAATCA
CTTTCTTCCTGGACCCTTCAAGGGTTTTTCTTCCAGTGTTTTGGACATGCTCTATTGAAC
ACGTCTGCGTTCCTGACAGTCAGCCTAGATCTTTGTATAGTTGCTTCCTCTTCTTCCTTC
CTCCATTGGCCTATTCTCCAAAAGGCAAATGGTACACGCATACAACCTTCTCTTTCTTTA
AAAATGTAGCACAACTGGGTGATTTTTTTTCCCCATTATCCCTTTTCCCCAGACAACTAG
CATGGCATTAGCCAAAACTCATCCCCCCACCCACTCTCTGACTTTCTGCTTCGCTATCAC
ACATGGAAACCAAAGGGGTCATTCGCCGACGACGGTGTGGGTGTGGGGCAGCCAATTTTC
CATTTTACTTCTTTAGGGAGCCACATCAATCGCAACAGCATTTTGAAGATGAAGATGAGT
GAGGGATCGCTCATAAGCCTCAAGTGAAGGCCTTGACATCTGAAGAGTCTGAAGTAATCG
ATCTTCAATATGATTCTACAGAAGTTCATTAGACACTGTTGCATTTTGGGAATTCACTGT
GTTTCCTTGTGGGTGTGTCTTTTACAGAATTTAAAACACTGGAGAACTTAGATGCTGCCA
AAAACATTAGCCATAGTGCTGCTTCCATGACTAAACAATATATGGGTTAGCGATCTGACT
TATTTCTTGCTCCCATTTTTAAAAACAAGACTCTTGTTTTATGCATACCCACTTCCTATT
TTCCACATTTGCGACAATATATTTTAACAATGTACTTTTAAATTTCAATTGTCTTTTTCC
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CATGTAACTATAACCATATGTTGAGATCTTAATGTCTTTGAGTTTAAAAAATAATTACAA
TACATTGGTTGATCTGTTGGTGTGTTTTGGTTTTGGGTTTTTGTGGAGTTTTTTTTTATG
TTGTGATCTTTAGGTATTGCTTGTAGGTACAGCTGTGTCTCTTGTATTTTAAGAGATATG
TATTCATATCTAGTTTTTATCATAGTTATGTACACAGCTATTAAGTGTCAACTAATGGGT
TAATCCCAGTTGAACAAAAAAGAACCAAGTCCAAATTCAAATGTCAAAGGAAATTCCATT
TAACCAAATTCCTGTGGTACCAAGAATAAGCTTGTGTAAGCCCTCAAAACTATAGCTAGA
GATTCTCAGAATAAATTGCTCTCATGTTTATGTGAAGAAATCCCTTATCATTACAGTTCT
TTTACTGGAGGAGAAGGCAGAAACTGAATGGTTAGGGTACCTGCCTCTTACACCCTTCAC
TCAGCACCCAAAAAAAAACAATGCTACGGAGGTTAGGAATGGAGCTGGGTGTAGCATTGT
GACTGTAGGAATTTGGCAGGAACAACACATCAGCACCAGACCCCCTGGAGTTTTCTCTGA
ACGGATATTATCCACTGAAATGGGTATATCTCAATTAGTCCCATAAAGTACTTCTCTCCA
CATTAAAAACGTTCACCTGTCTTTATCTTTTGCCCACTTCCTTTCAGTGTAGGAGTATTG
CTACACATCTCCTTTTCCTGTGCATCCTGCCTGTGCTACTTTTAGTTAACGCCTTTGTTT
TCCCAGCTGTGTACATGCCTCAATGCTGATGCTGTTGAACAACACTCATTACCTACAGCT
TCCAGGTAAAAACACTATGCAATTTCCTCATCTTTCTGCTTCCTCTGTCTTTGCTTGTCA
CACTTGGGAATTCGAGGCTACAGAGACTAACTGGGACATTGCATGGCTGGAACTAACACT
TCAGTCCTAACTGCATGGCATGGCTTCAAGATCACATTGTAAGTATGAATCTGGGGGACT
TTCCATTTGGGTTTGTTTCTGGTGACTAAAGCTGAGACAATACACTTAATCAGATCATAG
GTAGTAGCTCCCTTAACAATAAGTATTCTGAGAATTTATGGTCCTCTGGTCCCAGAGCAC
ACGCAGGACAGAATCACTTCTTTCGCAAGCAAGAATGAATACAGGCTGCAACAGGGTTTC
TTGCACTCCAGTTTGGATCAATTCGCTCAGAAGGGAGGTAAAAGGGCTGCTATTTAGCCA
GATGTCATTTGTGTACTAGAGAAAGTATTGAGATGTTAAGAGGTTCAAGGTCTTCTGACA
GGTGTGTCCCCGTCTTTCGGTGAGGCAATGGGATTCAGTTGAAATAATAGATTCAGTTCA
GTTCTCAACTTCTTTTACATATTTCTTTAAAATAATAAACTCTATTACAATCACACTTGT
ATCCAGCTAATCTAGAATTCATCTCTTGCTGAAATTCTTCTCCAGCCAACTTCGGACTTC
TTGTAGGTTATAGCTGAAGGGGCCCTTCCCTCCTAAGTAAGCAATTTTCCGTCTCTGCAC
GATGCACACACGTTCAAAGGCTACCCCGTAAGCTACGTTGGCATTATTGTCCATGCGGTC
AGCCACAACTTGACACTGGGGCGGCAAGGAGAAACGCTCCAGGAGCTGGTGAGCTGCTGC
ACATCGGTCCTCTTGGTTCCGGTGCTTCTTAACCTCAAAAGACAGAGAGGAGTCCCCAGG
CACTGCCCAGCCATCCGAAGGGTGAGCCTCATCAATGTATACCAACAGGAAGTCAGCCAC
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GGTGGCTGAACCAAAGTTGACCACCAGTGGGCGCTCTGCACTGGCAAAGTCAAGAAGGTG
GCATTCGGCCCCATCAGCGGTCTTCTCCGAGGCATAATTGTTACCTGATTCGGGATTGGA
GACGTGCACCACACTGGAATTGGGAGCATCTTCACCCAATTTAACCTGATAGTGAACAGA
GAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAGAGAAAAAGAAAAAAGAATTAGCACACTAACAC
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GTTGATTCTGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGCTATTCTTACTTTTCTGCCAGTG
CCTAGCAAGCATTATAGAATGAATGATTAATTGAGTTCGTTTTAAAAGTTAAAAGTAAAT
GGTTCACTTTAAGACAAATTATCTTGGTTTTGAAATAGAATGTCTCCTTCTGAATTCTAA
AAGACTCAGGAAAGACCGGAGTTTTTACACACAGGCTTAATTTATTTTCTCTTTTCCCTC
TTTTAAATAATAACTCCATTTATTTATTTACTAACTTACTCATTTAGTCTCCCCCCCTCT
CTCTCTCTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTAT
GTATGTATGTCTCATAACACTTGTGGTAGTCAGAGGACAACTTGTTGGAGTCAGTTCTCT
CCTTCCACCATGTGGCTCCTTGAAATTCAAACTCAGCTCATCAGACTTGGCAGCAAGCAT
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CAAGTGGGTTCTGTGTCTGGGCAGAGCTGGACATTCTCTAATCCATCCTTTGTAAGTGTG
ATTCCTCCCACTTGTTCTGGTCAGTGTTTTCCCATCTGGAAAAAGTCAACCATCATGGCT
GTTTTCCTTATGTGGATCTGGAGAGTGGGATGAGAATAGGAACTCTACATCTGACGGTGT
GTAGATACGAGCCGCCATTGTCAGACATTACCCCATCATATGAGACACACTGCTACTCCT
CTTGAGACATCCCATGCTCAAGATTAGAAAATAAAAATGAGCGAGTTGTTCTGTGAAGAG
ATTTATGCTCCCTTCTACAGGGTGCGACCTCTGCAGGTTCCTGTGACCACTGCTTACATT
ATACATACACACTATGGCTGGAACCTCAAATCTGCCTTTGAGAGTCAAATAAGAAATTTT
TCACTTTCCCTGTATTTGGGGTTTTCCCCTCAGTTTTATCTAGGAAGACCCAAACAAACC
ATGGATTTTTGCCATAGGATAAGTGATTAACAGAATAGTAAGTATTCAAATACGAGGCAT
GTTGACTTAAATTGTTCCATGCTCCCCCGCAGCACATGGTTTACATAGTTGATCGTAGAA
TTCTGAAAAGTTAGTGGCCTTTGGATCTGTAAACTGATAATAAAAAGCAGGCAACAGAAA
AGAGCCAATTACTTCATTCTGAATTAGCTCAATTGGATTTCCCTCTAGGATGGTTTAATC
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AATATTACAAAACTCTTCCAACTGGATTGACTTTCTTCTCTCATATAAATAGTCACATAT
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CGAGAAAGAATCAAAGTTCCTTCTTTCTCAAAACTTTTTGCAGGGCAGGTGTGAAATAGG
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TTAATCCTACTCATCTTTGAAGCACTAAAGTACACCTTAAGCTTAAAGACATATATTTGA
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TCTTTCCCTGCCAGCATCAGCTGCCTAAAGAGAATCCTGCCTAGTATTTAATGCCCAAAC
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TCCACAGCCTAAGAGGAGTTTTGGAGTATCATATCACGCACTCTTATGACAAGAAGGGAA
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TCTGGGTTAAGTTCCCTTTTTTTGGTTATTCTTCTTTTTTTGACTTGTACCTTGAAAATG
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GGCCTTCTTCTCTCTTTAAAGAGCCACTTTTCACTGCAGAAGCCCAGTGTCAAAAGGCTT
GAGGTGAATAAAGAGGAGGAGAGTGTTAAAGAGACCCTTTCAAAACCAAAATTGTATGTT
CCCATGAGCATGGTTTTCTGTGCCACTGAAAGATTGGCTATGCAGAAACGAGCCTGCTTG
CCAGTGTCTATACTGTCTGCTTACTTTTACACTTCATTTAGGAGCCAGGCTCCCAGAGAG
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GTTTCTATTAGCAATATTTCATTCTGTTCTTCTTTCTTCCCATCACTCCAGCTCTGGCCT
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GACACTCACTAAGCAAGACAGTTGGGAGAACTGAATGATGTGTCTGTTTGAAACCCATGT
TAGACACACCTCCCCATCCTGGACAAATCTGCTTTGAGAGTTGCAGTTGCCCAATAATGC
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GAAACAGTCACACCTAAAGGCAGTGTGTCATGACCGACACAGCATTTGGCAAATGACTTG
ACCTTTTTGAGAGGCTCTGGGTGAGATTCTAAGACTACCACCTCCACCATGATGCCTAAC
GAACTCAGAGAGAGAAGAGGACAGAATTTAGCTCACATTGTACTCTTGATGTCTCCCTAC
ATCTCACACCCAGCCCATCCTTGTTCTTGTTTTCCTGAGGTTTCTTTTGCACATAGTAGC
TATTGTACAAATCATTAAATGCAAGCAAACAAAAAAACAAAAAACATAAGCCAGGAACTT
GGTACTAATCAAATCAGTGGGCAGAGACAAAGAACTAGAAAAGAGGAATACACAAACCAT
ATGCCAAAAGTCAAAGCAAACCACTCAATCCCCATGAACACAAATAACAACATATGACAA
CACAATGGAACACTATACATTAGTGAAAAAAGATCTAACAAAGTTTATTATAGAGGCATT
TGCTTGCTTTTTCCATGTCCACTTCAATTATCTGCTTGATGACCAAAACAACCTCACTTA
ATGTTTATGGGGGCTTTGGTAGCCTACAAAGTTGATGTGGAGATAATATTTATATTCTGG
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TACCTAAGACATAGATATGCTTGAGGGGATTGACAAATCAATAATATTTTAATATGCAGC
TAAAACATCCCATTCCTCTAAACTCCTGACACCTAAATCATACATACGAATGTCACATCC
TGTGTGCACATCTGTGGGAATGGCAGGATCTCTGGGTATCTCCATGGCCATACATTTCAC
TTACAGGTATGACATAACTGAGCCTCCAGGCATCCACCTCTATCCTGACGAGGGCATTCC
TTGCTAAGAGGAGGCTTGACTTGTCATTCTATGCTCCCTCCGCAGAGCATGACAGGCCCT
TCTTTAGGTTCTTTGCAATAATGCCAGGAATCACACGTTAGTCCCTGAAGAAAACCATAC
TTTTCTTCCTCAACATTTGCTTTCCAGTGAAACACCCTGCCCCGATTCTTTATCCCTCCC
CATCTCCCCGCCCCCTGCACCTGGATTTATTTTTTCCACTGTTTACTGGGGAAGGACTCC
TTCCCTTCCTCGTCTGCTGTTCGGAGTTCCCATCATGATGCTCACCCTTCCACCTGCCCC
AAGAGCAGCACTCGATTGAACGTCTGGCTTCGCTCCTCCTCCACACTCCCTTCTCTGACA
AGCTCTTTCAGTGCTGCTAGGAACACATTTCCTCTTTTTATAGAAACTTATTTCGTCCAC
ATGAATTCATTCTTTCTAATACCCAGGATGGTTCAGAAGCCTAAGGGATGGACGACCGTA
CAAAAGTATTCATCCCACTTTACCCTGACTGATATGGTTTGAAAATGTTCCTCTAAACAT
GTCCTGGCAGCAGAAAGGCTGGAATACCGGAAGTTTTCGCATCCATGCATCAATCACTCA
TCCCAGTGTTTCAAAAGCTGATGGGAATACACTGTCCCCAGGTAAGGGAGGTCACCTCTC
TAATGTCCAAGGCCTGACATAGGAATGCATTATAGACCCATCACTTCTTTGTATGGGAAT
TTATTTGTAGATTCGGTCTCACACACCAAGTCTGGGTTTCTGACAACCTATCCCTAGATC
TTTCTTTTGCAAACTGACACTTAGTAACGAGGAGTCCACAAATTCCAACTAAGTAGGTGG
TCATGCTCAGCTTGCTTTCATTTGTTCTTAACTCCCTAAGAAATGGAGGGGCTAGAGTGA
GGTCACAGCCATCGTCATCATCATTATCATCATCACCACCACCACCATCATCCTCATCCA
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AGTCACCAAGAGTCCCGGTGGCTCCGTGTCTGTCACTCCCAAATCTAACCTGTGCAACAG
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AAGCTCAGTGGCTGCAGCTCACCTGTTTGTAGGCATCTAGGAGGAAGCTGTTCCAGACAC
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CCAT
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