SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003287_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesManis javanica (Pangolin)
Transcript IDSPT00003287
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003165_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003287_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Pangolin (Manis javanica) # Full length # Forward
TCACCTGTCCCTAAAAATGTGAGTATATCATCTTCTGAAGTTCTGTCTCCTGATCCTTCC
TGCAGAGAGAAACCCATCCATTCTACTACACAGGTATGCATCATTTGCATGGAGGCTCTC
TTCCCTGCCACCACATGTCTGTTTTTGCTCAGATCAAACAAAGCATTTCATTCTCTACTG
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GTTACTTGCAACTTACTTAGTGTAAGGTAGTATTTCAGAATCCGTTTTTTCCTTTCAACT
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TGAGTGCAAAGGTCCTATGCAGTCAGGGTTTGGGCTCGCTGGCTGTGGAGGTAGGAATGG
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GGAAGACTACTTGGACTGAACCTAATGGCTTGTGTGCTGCAGCACTCACAGTTCCCCCAG
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TCATGGGCCCTGGCTTCTGAAGGTGCCCTTTAAATTGTCTTGTGGTGCCCCAAGAATGCC
CCTGTCCTCCCAGGAGCTGTCTGGGCTCTGTTTCATGACTTAGCAGCCTGGCTCCTGGTG
CTGGCAGAAGGGTTTCTAGCTGTGCTGCCCAGCATCCAGCTTAGGGTCAAGCATGAGGCT
TTCCCACAACCTGGGGGCTCCCAAAGCTCTAAGAACATTCGTCCAAGGATAGTGAGGTTA
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TCTAGCCTGGGATCAGCATGTGTGACAGGGTATTTACTCCTCCTGAGTCCAGACAAATGG
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GGCTGTTTTGCATTATCTTGAGAACTTTTATGGGAGCTTATTATAGAAAGAAAACACAAG
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TGTGGTTTACTTAGGATGCCGAGGAATTTCCCAATCTGGCAGTTGCATCTGAAAGAAGAG
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TGCAGTAAGACTTGGTAACCACTCCATCAGAAAGCAGGCAAACACAAACTGCCAGAATTG
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TTCAAAGTGGGGTAATTATTTTCAAATTTGTGAAAGGCAAAATTCTGGATCCTTGTGTTA
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GCCCACCTGTGTTATACTTAGCACTCACCCTTTTCGTGAGCCCTTATCTGGTGGGACTCC
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AGCAGCATGCCCCTGTGGCCTTTTATGCAGTCTCAGACCCAGATCACAACTGTCTCAGAA
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TTTGGACATATGCCTCTGATTTCATGGCAGCTGGTTGGCTCACTTAGGCAGCTGGAGAAT
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AATACTTTACACGCTGTGGCATCTTATCTGTTACTCACAAAGTAGGTGTAACAGAAGCGT
GAGTGGTTTAATGTAAAACCCATGTTATGAGAAAAGAAGAAAGAAATAAACACTCATTCT
TTTAATTTTTTAAAGACTTTTATAGTCTGAATCTTTCATTTTATCTTTTATACAACTTTT
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CTCCAGACCAGTGGTGTTCTCAGGTAAGAGGCTTCATCTCAGACGAGTGGTGCAGGGTCA
TTTCCAGGTGGGCCATTCTGTGACTACTTTATCTTGTAATCAAAGGTTGGGTTTTTTTGT
GATATCATTGATATACAATTAAATGAACAACATTGTGGTTAGTAGATTCTCCACATTATC
AAGTCCCCACCACATACCCCATTACTGTCACTGTCCATCAGTGCAGTAAGATGCTATAGA
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GTGCTAATGTAATGTGCCTTATTCCCCTTCTCTCTCCCTTCCCACCCCCACGTTCTCCAC
TCCCTGTCCCTTTCCCTTTGGCAACTGTTAGTTCATTCTTGGATAAATCTGCTGCTGTTT
TGTTCCTTCAGTTTTTGCTTTNTGCTGTTTTGTTCCTTCAGTTTTTGCTTTGTTCTTATG
CTCCACAGATGAGTGAAATCATTTGGTACTTGTCTTTCTCCACTTGACTTATTTCACTGA
GCGCAATACCCTCTAGCTCCGTCCATGTTGTTGCAAATGGTAGGATTTGTTTTNGTTGTT
GCAAATGGTAGGATTTGTTTTCTTCTTCTGGCTGAATAATATTCCATTGTGTATATGTAC
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GTTGTAAATAGTGCTGTGATAAACATAGGGGTTCATATGTCATTTTGAAACGGGAATCCT
GCATTCTTAGGGTAAATTCCTAGGAGTGAAATTCCTGGGTCAAATGGTATTTCTATTTTG
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TTTTCTATGTTGGCCATCCTAACTGGTGTGAGGTGATATCTCATTGTGGTTTTAATTTGC
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TCTTCTTTGGAGAATTGTCTGTTCACAATATCCTCCACCCATTTTTTAGTAGGGTTGTTT
GATTTTTGGGTGTTGAGGCATTTGAGCTATTTATATATTTTGGATGTTAACCCCTTGTCA
GATATGTCATTTACAAATATATACTCCCATACTGTAGGATGCCTTTTTGTTCTGCTGATA
GTGTCCTTNGTGTCCTTTGCTGTACAGAAGCTTTTTAGCATGATGTAGTCCCATTTGTTC
ATTTTTTATTTTGTTTCCCTTGCCCAAGCAGATGCGTTCAGGAAAAAGTTGCTCATGTTT
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GTTTTATGGTTTCATGACTTACACTGATGTCTTTGATCCATTTTGAGTTTACTTTTGTGT
ATGGGGTTAGACAATAATCCAGTTNTTTACTTTTGTGTATGGGGTTAGACAATAATCCAG
TTTCATTCTCTTGCACGTAGCTGTCCAGTTTTGCCAACACCAGCTATTGAAGAGGCTATG
TGCCCATTATATAGCCATGGCTCCTTTATCGTATATCAGTTGACCATATATGCTTGGGTT
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AATTGTCTAGATTACTGTGGCTTTGTAGTAGAGCATGTAGTCAGGGAGTGTAATCCCCCC
TCCTCCCGCCCCCATTTTATTCTTCCTTCTCAGGATTGCTTTCGCTATTCGGGGTCTTTT
GTGGTTCCATATGAATTTTAGAACTATTTGCTGTAGTTCATTAAAGAATGCTGTTGGTAT
TTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTAGGCAGGATGGCCATTTTGACATT
AATTCTTCCTACCCATGAGCATGGGATGTGTTTCCATTTATTGGTATCTTCTTTAATTTC
TCTGATGAGTGTCTTTTAGTTTTCAGAGTATAGGTCTTTCACTTCCTTGGTTAGGTTTAT
TCCTAGGTATTTTCTTCTTTTTGATGCAATTGTGTGGATTTGTTTTCCTGATTTCTCTTG
CTGTTAGTTCATCATTAGTTTATAGGAATGCAACAGATTTCTGTGTATTAATTTTGTATC
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TTATGTTGAGGTACTTGCCCTCTATACCCATTTTGTTGAGAGTTTTTATCATGAATGGCT
GTTGAATTTTGTCAAATGCTTTTTCAGCATCTATGGAGATGATCATGTGGTTTTTGTCCT
TGTTGTTGATATAGTGGATGATGATGGTGGATTTTCGAAAGTTGTACCATCCTTGCATCC
CTGGAATAAATCCTACTTGATCATGATGGATGGTCTTTTTGATGTATTTTTTAATTCGGT
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CTGTTTCTTCCTGGGTCAGCATTGGAAGATTGTATTTTTCTAGAAAGTTGTCCATTTCTT
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GTTAGTGAACTTTTTTTTTCCTTGATAAGTCTGGCTAGGCATTTATCTCTTTTGTTTATT
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GTTTTTATTTGGTCATTGATCCATTGATTATTTATGTTATTATGCTTCCATGTATTTGTG
GGCTTTTTTATTTTCTGTGTGTAATTTATTTCTAGTTTCATACCTTTGTGATCTGAGAAG
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TTCCCTGTACACTTGAGAAGATGTGTATTCTGTTGCTTTTGGATGGAGTGTTCTGTAGTT
GTCCATTAGGTCCATCTGTTCTAATATATTGTTCAGTGTTTCTGTGTCCTTACTTATTTC
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TTTGTGGGAAGTAAATTCTCTCAGCTTTTGCTTATCTGAAAATTGTTTACTCCCTCCTTC
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ATGATAGCCTGATGGGTTTTCCTCTGTATGTCATCTTATTTCTCTCTCTGGCTGCTTTTA
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CTCTGTCTTCTTCTTTTGGTACCCCTATAATGCGACTATTGTTCCGTTTGAATTGGTCAC
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TTTTATTCCTCTTCTCTAATTTCTATTCCATTTACCGTCTCTTCTTCTACATCTAATCTG
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TCTGTCCTAAATTTTTCCTGAGTTCTTGAATACTTTTCTTTACCTACATGAGCATGTTTA
TGATTTTGATTTTGAACTCTCTTTCAGGAAGATTGGTGAGTGCAGTTTCCTTTGGCCCTC
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GTGGCGTCCTCTAGTGCCCAAAAGTGCTAGTCTGTGGAGCTGCTGAGCCCCTGGGTTGAG
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TCCTGGTTGCAGTCCCTGTCACCAGTGTCATAGCCAGTGGGCCAAGCACACAGGTGTAAG
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CCTATCCCTTCTCCTGTGCCACAAGCTCTGTGCAGACCCTGTCCCTTCAGCAGCCCTCTC
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ATCCCCATCCTCTACAAATGGTTGGAATCTCAGTCTCTCAAATATTCCACCTGTCTTAGC
TTTCCAACCCCACTAATCTCCAGAACACCATGCAATGTAGGTTTGTTCTCCAAAGCAGAT
CTCCAGGGCTGGGTGTTCAGCAGTCCTAGGCTTCCACCCCCTCCCCGCCCCGTTTTTCTT
CCTCCTACAGGTGAGCTGGGGTGTGGGAAGGGCTTGGGTCCTAGCAGATCAGGGCTTTGG
TACGTTACCCTGTTTTGTGATGTCTGCTCTGTTCTCCAGGTGTATGCAGTCTGGTGCAGC
CTTCTTTCCTGTTTCTCTTTTAGGATTTGTGATATTAACTATATTTTCGTAATATATGTG
GTTTGGGGAGGAGTTCTCTGTCTCACCTCTCATGTTGCCATCTTTAATTGATCTCTCAAG
TTATTTATATCTAATCAAAATAGTATGATACTGGGATAAGGATAGATAGCTATGAGAGGA
AGAGGATTGAGAGTGCAGAAGTAAACCCACATATCTGTGGCCAGTTGATCTTTGACAAGG
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TACTGTATACAAAAATTACCTCAGAATAGATCAGCAGTCTAGATACAAGAGCTAACCTTC
ATGAACTAGGATTAGACAATTAATTTTTACATAGGACTCCAAAGCACAGACGACAAAAGC
AAAAATTGATGTATTATGTTTCATTTAAATTAAAATCTTGTGTACCAGAGGACATTATCA
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TGATAAGGGTTTACCGTCCAAGTGTAAGAACTTCTGCAACTCAACAAATACCCATTAAAA
AGGGGGCAAAGGACTGGAAAAGACATTTCTCCACAAGCTTGTGTGCAGCTGGCCAATAAC
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GATAGTTCTTTATTCCTGCTACGGTAGCTATAATCGAAATCATGGAAAATAGCAAGTGTT
AGGAAGGATTTGGAGTATTTGGAACCCTTGTTATATTGCTTGTAGAAATGTAAAATGGTA
CAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCGGTTTCTCAGAAAGCTAAATATAGAGTTGCCATAT
GGTCCAGCAATTCCACTCCTCTGTATGTACCCAAAAAAACTAAAAACACAGATTTAGGCG
CTTGTACTGCTGGTGTTCATGGCAGCATTGTGCATTAATAGCTCAAAGGTGGAAACGCTC
AAAATGTGTATCAACACATTAATGGATGATGAAAATTTATGTGCATGCTAATGGAGTATT
ACTCAGCCTTAAAAAAGAAGGAAATTCTGACATATGCCAAGACATGGATAAACTTAAAAA
CATTATGCTCAGTGAAAGAAGTCAGAGCCAAAAGGACAAATATGTATGACTCCACTTACA
TACAATGCCTAAAATAGTCCAATTCATAGAAAGTAGATTAGAGGTTAGTAGGGGTAAGGG
GTTGGACAATGGGAGATACTGTTTAACAGGGACAAGTTTTCAGTTTGGGGATGAGAAACT
TTTAGAAATGGATTGTGGGGGTTGTACAACATCGTGAATGTAATTGATGCCACTGAATTG
TGCACTTAAGGACAGTTAAAATAGTCTAAGCTTTTATGTTGCATGTGTTTACCACAAAAT
TCTTTTTAAATTGCTAAAGTTATTTATTTATTTTTTAATTTTGGTATCATTAATCTACAA
TTACATGANTATTTATTTTTTAATTTTGGTATCATTAATCTACAATTACATGAAAGACAT
TATGTTTACTAGGCTCCCCCCTTCACCAAGTCCCCCCAACATACCCCTTCACAGTCACTG
TCCATCAACTTAGTAAGATGCTGTAAAATCACTACTTGTCTTCTCTGTGTTGCATAGCCC
TCCCCGTGCCCCCTCACACTATACATGCTAATCATATTGCCCCCTTTCTTTTTCCCCACC
CTTATCCTTCCCTTCCCACCTATCCTCCCCAGTCCCTTTCCCTTTGGTAACTGTTANATC
CTCCCCAGTCCCTTTCCCTTTGGTAACTGTTAGTCCATTCTTGGATTCTGTGATTCTGCT
GCTGTTTTGTTCCTTAAGTTTTCCTTTTTTCTTATACTGCACATATGAGTGAAATCATTT
GGTACTTATCTTTCTCCACCTGGCTTATTTCACTGAGCATAATACCCTCTAGCTCCATCC
ATGTTGTTGCAAATGGTAGGATCTTTTTTTTTCTTATGGCTGAGTAATATTCCATTGTGT
ATATGTACCACATCTTTATCCATTCATCTACTGATGGACACTTAGGTTGCTTCCATATCT
TGGCTATTGTAAATAGTGCAGCAATAAACATAGGGGTGCATCTGTCATTTTCAACCTGGA
GTGCTGCATTCTTAGGGTAAATTCCTAGAAGNTTAGGGTAAATTCCTAGAAGTGGAATTC
CTGGGTCAAATGGTAAGTCTATTTTGAGCATTTTGAGGAACCTTCATACTGCTTTCCATA
ATGGTTGAACTAATTTGCATTCCTACCAGCAGTGTAGGAGGGTTCCCCTTTCTCCACAAC
CTCGCCAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAACATTTGTTGTTGTTGGTCTTTTGGAT
GGTAGCCATCCTTACTGGTATGAGGTGATATCTCATTGTGGTTTTAATTTGCATTTCTCT
AATGACAAACGATGTAGAGCATCTTTTCATGTGTCTGTTGGCCATCTGGATTTCTTCTTT
AGAGAACTGTCTACTCAGCTCCTCTGCCCATTTTTTAATTGGTTTATTTGCTTTTTGTTT
GTTGNNNTTTGTTGAGGTGTGTGAGCTCTTTATATATTTTGGATGTCAACCCTTTATTGG
ATCTGTCATTTACGAATATATTCTCCCATAGTGTTGGATACCTTTTTGTTCTATTGATGG
AGTCCTTTGCTGTACAGAAGCTNGATACCTTTTTGTTCTATTGATGGAGTCCTTTGCTGT
ACAGAAGCTTTTCAGCTTGATATAGTCCCACTTGTTCATTTTTGCTTTTGTTTCCTTTGC
CCGGGGAGATATGTTCAACAAGAGGTCACTCATGTTTATGTCTAAGAGATNTCATGTTTA
TGTCTAAGAGATTTTTGCCTATGTTTTTTTCTAAGAGTTTTATGGTTTCATGACTATGTT
CAAGTCTTTGATCCATTTCGAATTTACTTTTGTGTGTGGAGTTAGTGATCCAGTTTCATT
CTCTTACATGTAGCTGTCCAGTTTTGCCAGCACCATCTGTTGAAGAGACTGTCATTTCCC
CATTGTATGTCCATGGCTCTTTTATTGAATATTAGTTTACCATATATGTTTGGGTTAATG
TTTGGAGTCTCTATTCTGTTCCATTGGTCTGTGACTCTGTTCTTGTGCCAGTCCCAAATT
GTCTTGATTACTGTGGCTTTGTAGTAGAGCTTGAAGTTGGAGAGTGAGATCCCCCCCCAA
CTTTATTCTTCCTTCTCAGGATTGCTTTCACCATTCGGGGTCTTTGGTGTTTGCATATGA
ATTTTTAAACTATTTGTTCCAGTTCATTGAAGAATGCTGTTGGTAATTTGATAGGGATTG
CATCAAATTTGTATATTGTTTTGGGCAGGATGGCCATTTTGACAATATTAATTCTTCCTA
GCCAGGAGCATGGGATGAGTTTCCATTTGTTAGTGATCTCTTTAATTTCTCTTAAGAGTG
TCTTATAGTTTTCAGGGTATAGGTCTTTCACTTCCTTGGTTAGGTGTATTCCTAGGTATT
TTATTCTTTTTGATGCTATTGTGAATGGAATTGTTTTCCTGATTTCTATTTCTATTAGTT
CATTGTTAGTGTATAGGAAAGCCACAGATTTCTGTGTATTAATTTTGTATCCTGCAACTT
TGCTGAATTCTGATATTAGTTCTAGTAATTTTGGAGTGAAGTCTTTAGGGTTTTTTATGT
ACAATATCATGTCATCTGCAAATAGTGACAATTTAACTTCTTCTTTACCAATCTGGGTTC
CTTGTATTTCTTTGTTTTGTCTAATTGCCATGGCTAGGACCTCCAGTACTATGTTGAATA
ACAGTGGGGAGAGTGGGCATCCCTGTCTTGTTTCCGTTCTCAGAGGAAAAGCTTTCAGCT
TCTCACTGTTCAGTATGATATTGGCTGTGTGTTTATCATATATGGCCTTTATTATGTTGA
GGTACTTGCCCTCTATGCCCATTTTGTTGAGCGTTTTTATCATGAATGGGTGTTGAATTT
TGTTGAATGCTTTTTCAGCATCTATNAATGCTTTTTCAGCATCTATGGAGATGATCATGT
GGTTTTTGTCTTTCTTTTTGTTGATGTGGTGATGATGTTGATGGATTTTCCAATGTTGTA
CCATCCTTGCATCCCTGAGATGAATCTCACTTGGTCATGGGGATCCTTTTGACGTATTTT
TGAATTCAGTTTGCTAATATTTTGTTGAGTATTTTTGCATCTGCGTTCATTGGGATATTG
GTCTGTAGTTTTCTTTTTTGGTGGGGTCTTTGCCTGGTTTTGGTATTAGGGTGATGTTGG
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GAATGAGTATTATGTCTTCTCTGTATGTCTGATAAAATTCCGAGGTAAATCCATCTGGCC
CCTGGGGTTTTGTTCTTGGGTAGTTTATTGATTACCATTACTTGGTAATCAATTGATTAC
CATTGATTACTGCAGTTTCATTGCTGGTAATTTGTCTGTTCAGATTTTCTGGGTCAGTCT
TGGAAGGTTGTATTTTTCTAGGAAGTTGTCCGTTTCTCCTAGGTTTTCCAGTTTGTTAGC
ATATAGGTTTTTATAGTATTCTCTAATAATTCTTGGTTTTTCTGTGGGGTCAGTCATGAT
TTTTCCTTTCTTGTTTCTGATTCTGTTGATGTGTTTTGATTCTCTTTTNGTCATGATTTT
TCCTTTCTTGTTTCTGATTCTGTTGATGTGTTTTGATTCTCTTTTTCTCTTAATAAGTCT
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