SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003347_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003347
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003225_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003347_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
CACTCGGCCTTTTACCCGGCCGGCTACCAGGCTCCAGAAACTCGTGGCCTGGACCGCAAT
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TCTCTCTCTCTCTCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTGTGCTAGTGTTAATTTTAGTGGGTA
AATGGATGTCTGACTCCTCCCTGTGTATCAAAGAGAGGATTGAGCAGCTCTCTTTGATTC
TGTGGGTGAGACTGGAATCCTAGAGGCATCAGCTGAATGGCTGCAGTGGATTAGAAGCAC
TCACCCTTCCTTATCATGATGCGTTTCCCATTAAACCCCAGCCAATGGGGGTGGGAGAAG
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Chart Advanced