SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003347_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003347
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003225_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003347_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Reverse
CCCATCCTTACAAGTAACATCAACTTCTCCCACCCCCATTGGCTGGGGTTTAATGGGAAA
CGCATCATGATAAGGAAGGGTGAGTGCTTCTAATCCACTGCAGCCATTCAGCTGATGCCT
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TCCCTTGCTACAGTACAGTTAGCTAGGTAGTTCCTCACACTGTCCGTGCAGCGGGGTGTT
GTGTGGCCTGACTCACCTAACCGGGGACCATGTGAGACCGGAGCTAGCTGACCGAACTCC
GAGGCCTCGTCCCCGGCTCCTGTCCCCATTCCGTCCTGTTCCGGCTGAACCTCGGGCTCC
AGTCCCTGCAGGAGTTTGAGCAGTGTCTCCTGCGGGACTTTGCACCCTCATCCTTTCATA
TCGGAAAAGGCCGTGAGCCGAAAATTGCGGTCCAGGCCACGAGTTTCTGGAGCCTGGTAG
CCGGCCGGGTAAAAGGCCGAGTG
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