SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003380_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesParus major (Great Tit)
Transcript IDSPT00003380
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003258_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003380_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Great Tit (Parus major) # Full length # Forward
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AAAGCTTCAGATGAAGCAGGAGCCAGCTTAATTCCCTCTTCACTTGATGGTAGGGGTAAG
TTCTCCAAGCAAAAATTATTTGCCTGTGTTTTTAACTGCTTGTATCTCAGCCGTTTGGAA
AATGAAAGTGTTCTGAGGAGCTGTTGATGTGTAAAGTAAAAAAAGAATTTAGGAGCAAGC
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TCCCCTTATCCTTGTCTCTTGTTACCTGAGAGAAGAGGCCGACCCCCACCTGGCTACACC
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GCTCCATTGCCCTTCTCTGAATATGCTCCAGCACCATAATGTCCTTTTTGTAGTGAGGGG
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GCTCTCTGCCCATAAATCCAGATCCCTCTGCAGAGCCTTCCTACCAGATAACACTCCTGC
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GACTGGCCCCAATACCAAGTGCAGGGGAAAGTAAAGAAAACTAGCTTCAATATTAAGTCC
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TTCACGTAAGAAAAAGAACATGTGTTGGTTATTGGAAGTCTGTTGAGTCATATGCAGATT
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GCTGGCACTCTAGAGTTTAGTATGTACCTAAAATTTTTCCTGTGTCCTGTTATTTCTGTT
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AAAAAAGTAGTGGTTTCTAATGGGTTGACGGTGGCAGGCAATCAGATTCCCACAGAGCTG
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TACAGTTACAAGGGCACAGCTGCCTCACCATGGTCGGCACCAAGGGGCGTAGGGGAACCT
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CTGCTGCATTCATGGTTCTTCTTATCATTCCACCTTCCAACTGCTGCCTGTGTTTTTCAT
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GTAGTGAGTGACATTCTTGTACACTGAGACACTGGGAAGTATTTAATCTGCTAAGTTTGC
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TATCAGGTAATTGTGTTTTTATATATAATGTTATATTGTGTTTATGTATATAGTGTTGCA
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ATTTCAGTCCTTCCTCAGAAAGAATATGGCTCTGCTTTATTTGCTAGGCCTTGACTAATC
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TTCTCAATGTAATTTCCTGAAGCACCAGCAGATGGCTCTGCACAGCCGCATGTGTCTTGG
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TCCAGAGGCAGAGGGAAGCAGGATAGTGAACCAAAGGTACTTGAGAATTCTCTGCTCTCA
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TCAACTTTGAGGCTGGATTTTTTTTCAAATTCCTGGCCCTCAGAATGAGACATGAAGCAG
TGAACTCTTGCGTTATTTGGCTTAATATTTCCTAATTAAATCCCAGTAGTCCCAGTACAT
TCTGATAACAATGCAGTATGTTAGAACTGAAGAATTCTTGCTGTAGCTATGAATTTCAAA
GAGATACTGAATTTTCCTTGTCTGCTTAATGTCCCAGTCTGGATTAAGATATCCTTTAGT
AGTGTAAGGCTAGTCACTTGCATGTATTTTGCATAAGAAGATTAGTTTTTAAAGGTCATG
CCTCATGGTCTTTCGCAGCAGTCAGAAACAAAAAATACTGCGAGTGAAACTGAGCCTGAA
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ATTAGCACAGCTTTGTACAAATTTAAGTTCAATAATCCTAATTGTAGAGGATGTTAGTAC
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TTGGGGTATGGGGAATATACTGGGTGCTACAGTGTGCCACAGTTTTAAAGATTGTGGTAT
AGTATTACAGTTCTAGTTGTCTCACAGATAGAAGCAATTTCTGTGTAACACAGTTGACAG
TGCTTACATTTCTGATTTTTAATTTCAGTTTCCTTCCAAATTCATGTAACTATAATTGGC
ATATTAGTATTTCGAGACTTCTGTGTGTCAGTATTGCAAAGGCATGAGCCTTTTCCACAA
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TTAGCATGTGCATGTGTTGATTTACATGTTTGATCTAGTGTACAGAATACTCAGTCTCTG
AAATGACAGCATAAAGAAGCCTTTCTGGCTGGTTTCTGTTCTGTACATTTTAATGTGGAA
CATGTGAAGCAGAACTGTGTTTACATGGTTTCATTGTGTGGTTCCTTGTCCAGTAATGGC
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GCTATGCTACCATAAATGGTGTATGCTATGAATAGACGTTGTCTAAACTACAAAACATTG
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GTTTGCTGGGAATGCTTGTGTCCTCATCAGTTTGAAAAATGGGTGAGGTGCTTGTGTGGT
GCTCTTGAAATAATAAACTGTGAAGAGATGACACACATGGAACTTCTGGGCACCCAGGAG
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TTGAATATTGAAGCTGCTATTCACAGACATGTAAACAGAGCTGTGAAATACTAGGAAAAT
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TGTTTTCCCACATTCCTCCCATTCCTTAAAAAATAAACATATTTGAACTAAAAAAGATAG
ACAGAAGGCTCCAGAAATAATCAAAGGTATGAAGCAATTTCTGTGGGAGGTAAGACTGAA
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GAAAATAAAAAGGAAATCAATTGACCTTTCTCCTAATGTTTGATGTTCTTACAGATGGTA
ACAACAAATACAGGGAAGTGTAACCTCACACTGAGTGCTGCATTTTAATTATTCAGTTTA
CTTCAGCATGTTGCAAATGTCAGAAATTGCATTGCAGGAGCAACTGGACAGACTTAAATC
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TGGCTTACTTCCAAGCTTCTTTAAAATTTTCATTGGTTGAAGTGTGTCAGTCCCTGTGCT
AGAGCTTCCTAGCTTGGCATGTTTAAATAAAGCTTTTCAGGCTGGAAAAAATCTTGGTGT
GTTCAGTGCTACTGTACCACAATTAAAAAGGCCTCTCAGAAAGTGGGAGGAGAAGCAAAA
ACCTAGCTGGTGGATTGGGATCATTAGGATGGCGGCAGTAGGTATAGGGTGACAGGTACA
GGGTAAACTTCAGCCTGCCTGCACTTGATTAATTAAGATTCTGCAATGGATCCTCTGCTA
GTAAAACTTACTCCTGTGTGTAAGCCATAATAATTCTGAGTAATTGCTGTGTTTACTTCT
GTACTCTAGTAAATACTGCCTGTTTTGTTCTTTACCACTCACATGTTTAAGGCAGAATTG
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TAAAAACACTCCTTTAGGAACCTCTAATGATTTTTATCAGCTGACAACCATAATAAGCTG
CTTTTGGAAGCACTTTTGTTACAAGCTGTTTTAGCCCTGAATTAGCTGCTGCATAGAAGA
TTTAACCATTGTTATACTTGTCATAGCTGGTGGCACACCCTTGGCTTCTGAATTTTTGTA
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AAAGGGAGTTTTGAAAATATGGACTTGATTGTTCTTGTGAAATCATTGTCTGGTTTATTT
GTTTAGGATGTTGAGGAGTTTCCTCATCTGGCAGCTGCCTCAGATAGGAGAAACAGGATA
GGACCTCAGAAACCCTCCTTCACTTCTGCAGTCAGAAAGCAGTCTGAAGTAAGTAGCCTT
GTGATATTATGTGATCAACATGTCAGTTATGAACCCAAGTTGTTTGGGGTGTTTTTTACA
TGAGTGAGATAAATCTCAGGAATTAATTTAGAAATGCATTCAATATGTGAATGAATCCTA
TGCATAAATCACAAGGATTAAAAACGTGATTGTTCTGTGAAAGCAAGTAAAGTAAATAAT
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CCTTCGCTTTACTTCCCAGTGAATTTTAGTGGTTTAAAAACAATCCCAAAACACAAGAGA
AGAAAACCATTGTTTACTTTGTTTGAGGGAATAAATAGCTTTGACAGAGAGGGGTGAGTA
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ATGCTTGTAACAAATATTTGAAAATCAAGCTGCCTTGCTAGTTTTTTCTTCTAAATCTGA
AAGAATCCCACATGAATGTAAGTAATGTGGCAGTCAGTAAATGGTCACCCTTCTAGAAGG
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CCACCTTTTATCATAAGAGAGGTGTTCCAGCTCTCTGACCATTTCTGTGACCCTCCTCTG
GACCTGCTGTAGCATGTCCATGTCTTCCTTGTGCTGGGAAATACCAAAACTGGATGCAGT
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GGGCCACACTTCTTTATACACAGTCCAGGGTATGTTTGGCTTTCTGGGCTGGGAGTGCCC
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TACTTGAACTTGGCCTCGCTGAACTTCCTGAGTTTCACACAGTCACACCCTCAAGTCTGT
CGAGAAGGCCATCCATCATTTTGGATGGCATTCCCTTCCCTGAAGTGTACTGCTCAGCTT
GGTGTCATTCACAGACATGCTGAAGGTACACTTGGTTTGAATTTAGTATCATCTTCACCA
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CATTTCCAAGATCCATCTCTCTGAAGAGCCTTGTGATAGTCGGTCTCCCTCTCTGGATGA
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GAAAACTCAGGTAAGTGAACTCATGTTTGAAGAGAAGTTCACAACTCAAATGGATGAAAG
AAATGAGCCTGTTTAAATATAAGACTTGAGTCCATGCTCATCTGGGATTCTGCATTCATA
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TTAGGAAGTAGTTTTGTGTTGGTGTGTAGGTTCTGGCACAGCTCTGATGCAAGGTGAGAT
CGCAGCTGAAGACAGAGGGTGTCATGTTCTGTAACCCTGTTGTAACAGAAATTAAAATTA
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GTTTTGCTGTGGTAGTTTGTTTGTTCATAGTCTTTACCACACTATTCATTTGTAATCTTT
TTATTTTCTGCATTAAATATGGCTCATGGCTTTTTCCTTCTCTTCAAAGCACAGAGCAAG
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ATCTTTAAGGAAACTTTAAATTTTCTTCTTTTAAATGAGCCTTTTATCTCTTTCAAAGAT
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GTACTTTTATGCTTTGTTGCAGTAGCATTTTCAAAAGTTGCCTGAACTGTTTCTGTTTTT
TTTTATATTTTTGACGTTAAAGTTGATGTTTATTTGAAGATCATTCAGTAAACATTAAAG
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CCTTTGTATTCTGAAGTGGAGACCCTTACTAACTGGTGCTGAACTTGTTCAGGAATCATC
CAGGAGCAGTGGTAAGAAGAGTCAAATTCCAGTGCAGTTGGATTTGGGTGGCATGCTTGC
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TTCAGGTATTGGTTACTATGAAATTTCCTTTCTTTTACCTTAAGCTGTTTTTAAGTATTC
AGGCATTAAATGTAGTCTGATTTCTGATCTGTGATGATCTCTGTGCAGGCAAGAGCACAA
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CTGAATTGTTTGACAGAAGACTTATGGAAAGAGATACCTTAAGGACACTGATTTGTGAAA
GAGTGCCTTGTATAAATCTCAGGCATGACTGAAAAACAGCTTTGACAGAAATACCAGTGT
TTGGAGATTTTTGCTCTCCGTTGAGTATATGTGTTAATGTTCTGATCTGAAAGGACAGGA
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TGAGATTTTCCTTCACTAAGCTGAGAGAACTTACAAGATGCTTTTTTAAAATACTTCTTT
TTTTTCAGTTAATCTCCTTTTATTTTCATTTGGGTCAATCAGACTTAATGCTGCAGAGGT
GCTAATAAGCAGTTTTGTTTCTATAAAATTATACAGTGCATAGATTGATGAGTAGATGGT
GGGCCACAAAGGTATGGGTCAAAATACTTGTTTTCAAATAATAAGTTTCCTGTGCCTGAA
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TGATATACACATGAAGGAAATATGTATCTTCAGGGTTATTAAATGCTTATTTTTTGCTGC
AAATCCAGCTTCAGTTTTTGTAGCCACCTGTGCTGCACATTCTTGGTAATGTTCTCAGTT
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TGTTTACAGTAAGAGTACTGCATGTCATGTGGGAGGATCTGCATATAAATACTGTGGAAG
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AGGTTGCCTGAGTCACAGAGGGAGGTGTCAAGCTGGTTCCACTGATACTTACTTAGTCAT
CATCTCCATTGACTTGCTAATGTGAACTGCTTTATATTGCAGGAAACTGAAGTTTGACAA
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GAGGTCATAGTGTGGAAGACCCAGGTTTAGTCATTTGTCCAGTCATTTAAAGCTTCTGTG
CTCTGAGCCCTCTGAAAAGTGCAAATAAAGTGGACATCTTCAGCAATCTTTGCAGGTTAA
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GGAGGAGGAAATGCCACCACCATGAAACCTAAAAATTCCTGAAGCCATTCATTCGATGAA
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CAGTTTTGAAATTGGATTCTAGTTCAGGTATTCATTTTAGTCATCTGATGCAGTTTTCTG
CTTAAATCTCAGTTGGTGGTGCCATACCATTGTTGTCTAAAGACCCTGCTACAGCCACAA
GAAGTCACCGTTTAAACCAAGGAAAGATGCCTCATAATCCCTTGGATTCCAGTGCTCCTT
TGGTAAAGAAAGGGAAACAGAGAGAAGTACCTAAACCAAAGAGACCAACACCTCTTAAAA
AGGTCCTTGTTTTTTTTATTTTAAATAGTAAAAGTATAGGGTAATATATTACTCTGGGAG
TCCGTTAAGCCCTCTCATCTGCATCCCAGTGTCCACTTGTCTGAAATCAGTTTTAGCTTT
TCTTGGTTTCAGAGGGGAGGGGTAGAAGAGGGTAATCTTGCTAAATGGTATACAAATTCC
CAAAAAATACACTTTCTCTGTTGAATCAGTTGATAGCTGATTAAGTGCCACTGTGGAAGT
GTCCACATGTAATTGGTACACAGGGTACCAGTATGCATGCAAAGAAACATTACTAGGTTT
GGGAAAGATGACCTTATTTGCAGGTCTGGGGAGAATGGATCAAATGGAGGTCATAGTTAA
TGTTTTTCTGCTCTTACAAGCTGGAGCTCCAGCTAATTCTTTAGCAACAAGTGTTAGGTC
CAGCTGGTGATTTCTGTTGTATCTTCGTTACATCTTCTATACAGAGGATTTTTTTAACTT
TAGTTCTGCCCTTGTAGTTTATCTCTACTTAATATTTTCTCCACCCATACACTCACTGGT
AATCATGGTGAAAGTTCTTTTCTATGAAAATTGAGAAATTATCCTTCCTTCTTTTAATGT
GCAAATAAAAAGTTGTAAACTTCAGATGCTAGTGCTGAACCTCTTTATAAATGTTTTTTG
TGTAAATATGTAGCAAGAGTAATGCTTTGTTATCCGCATGACATCAAATTGGTTTGGTTT
TGATATATATTTTTAGATAATTTTGAAAGAAAGAGAACAAAGAAAACAGCAGCACCTGTT
AGAACAAAAAGCAGAACCAAAAGATGAAGATAACATTTGTCAGACAGCAGGAAATGCTAC
TGAAAATGCAGCAGTTCTACAGGACAGTCAAGCAGGTATCTTTTGGGAGAACCTGTAATA
CAGTATGTAGCTGGAAATTCGAACACATTTAGTTCTTTAGAAAATAAGTACAAAATAGTG
CCAAGTGATAGCTGCAACCTTAGAGTTGTCTGAGATTCACCTCAGGCTTATCTTGACTGT
AAAGCAGGCCAAAGCTGAAAGTCAGTAACAGGGATTCTGATTACTGTTCCAAACTTTTAT
GCCTGTTTGTTTTATGATATGTTGTGAGGAGAGTTCCCACCTACCTCTGGCAATTAATGA
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CCCTATTACTACAGACTGTTCTAATACTAAAGTAGTGACTCTTCCATACATGCTTGACAG
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ATAGTTGTTCCGGTAACACAAGTTGCTGAAGTGTTTCCAGAGCACACGGGGATCAAGGAG
TCTAAAGAAGGTCCTGTGACTTCAAAGCAGCTAACTGCCACTCTTCCAAAAATACACAGC
AGGAATTTTAGAGAGTAAGTATTGATTTTATTGATGGCTCATTTTGCACAGTACCACCAA
TATGGCATTTTTCAAACAAGGTAATTCAGTTGCATTCTCTGCAAAAGTAACTGTAGTTTA
GACTGAAGGCACTAAATTTTTTTCTTTCAGTCTTTCTGTAAGCTGACACACAAAGAAATT
ATAAACTTAGTGTGTTTTGTGATTCTCGCTTGAAAATGCATGTTCCTTGAAGGGAAAAAA
ACCAAAATTCACTAGAGGCTAAAGGAAGAAAAGAAGCTGCTGTTAAGGTATAAGTACTTT
AAATGATGGGCTAACAGCTTAAATAAGATGTGTGCTACTTTATTTCTTAAAAAATATTTT
TAGTTGTAGTTTGGTTTTATATTGCCAGACCAAATAGCAAAAATATAGAGAAACCAGATG
ACATTTTCATATTGTGGCCAGGCAAAGAAATAAAGGTAATACTTTTGAGCTATTGTGTGC
AAACAGTTTCAGCTAAATGTTTAAGATGATGTGTGTACACGTTTCTTTATAAAAAAGAAA
TAGCCATTACTACATTTGAAGAAGTCCAGTAATGAGAGGTTAAAACAGTTTCCTGGGGAA
AGCAGTGTTTTAACTTCTAGTTCTCCTCCCATAAAACAAATCCACAGCTGGTGGTTTTTT
TTGCAGTTCATGTCATAGTAATGGTTAATAGTGATACAACCATACTTTCTGTGTTAACTC
TTAATTTAACTTCTAATTGCAATAAAAATTGCTTAATTTGTGTCTATGCAACAGTGTTTT
ACTGACAGCACACTTTGGGTTGAATACATGAAGGATGACTCAGTTTACAGGATGTAGAGC
ATTCAGCAAGGCTTAGATTATTTTCTTTAGGTTTTTTAGTGTTCCAGTAGATCTGTTGTC
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TGGAAATAATTGTATCTCTAAGATTCAGGATAGATGTTGTGATCTTTTCTCATGAAGTGA
ATTTGCCACTAGGAAATCCTTCTGTTGACAATGCAGATGATACATCTTTAGTTTTTCTCT
TTGATACCTTTCTTCACTGGAAAATTCTTTGTGTAAAAGTGGGGTGGGGTGAAATAATTT
TAAATTCTGATCTTCCCTAGCCTGTACTAGAAGAATGAATTACATTGTTTTGTATCCTTT
CCTTATGAACAACACAAAGCCATAGTCAGAATAAGTGGAAAAGGATACAGATGAATGTAG
GGAAGAGGAATGTAATCCAGTTTTCCATGTTTATTACACATAGCCTTGAACTTACAGAAA
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CAAAAATGCTTCAGAAGAAAAAGATAATGCACATACCTATTTCTTGGGCTAAAATGTATA
TTTATAGATATAGATATATAGATTTATTGTACATGTATCTGTTTTTGATATCATTTGATT
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GAAATCCTAAGTAAATTTTTGTTTCATGTATATAACAAAGTGTGTTTGGAGTGGAAACAG
AAAAAAATACAAAGACATAGAATAGAATTTAAAATGTATATTTAATGTATTACATATTTA
AATGTTACGTATTTGTAATTTTAATGAGTCTAACTATTTGATTGCTCCTTTCTTCCAGTT
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TGGTTCGTTTCCAAGATCGCTTGTATCAGAAAGACCCAGTAAAAGCCAAGATAAAACGCA
GGCTTGTTATGGGTCTTAGAGAAGTTCTGAAACATCTGAAGCTGAAGAAACTGAAGTGTG
TCATCATCTCTCCTAACTGTGAAAAGATTCAGTCAAAGGGTAAATAAGTTCTTAACGGGA
AAAAAAAAGTTTGTTTAATAAAAGAAATACAAAAGAGAAGGTTCAGTATATTGACAGCAA
TATTATTATTGGAGGAATTTATTTGAGTATCCTTTGAAATCCAGCCACATGTAGTTGCCT
TCCTTGCTCAGATTGTTTACTGCTGTGCAGCTGAACTGTGAGCTGAGTCAAGACTATCTG
GGGTGGGAGAAGTTACCTGAGATTAGGGTCTTTTTAGTTACTGATTGGCTGTGCTGCTGC
ATAAAAAATTGCACTGCACAGCTGAGACAATCCAAAAGCTTCTGATGCCAGATCTGCCAT
TGCAGGGGGTCCCACTTTATCAATCTCTTTAGGACATGGAGTGACAATAAATCACTAGTG
ATAGTTTCCTAAAAGTTGTCATTATTGGCATTAATTTATTGTAATTGTTGTAATTATTGT
AATTTAAACAATTCCTTAACAGCTGGGTCTTTTTTGATACTAGATTAGACTGTACTTCAT
ATATAGTAAAATATGGAATAGTAGCAGTCTAAAATTAATGCTAAGCATTAAGAAAAAAAT
GTCAAGTTGTCCTTTAAAAATGGATATTCACTGGTATTATTGTGATCTCTTGTTTATTTT
TCCTATAAGGTGTAGTTTCAGAATGCACCCATAATCTTGGGAAATTTTTTTGCCTTGTGT
TAACAGTATGGCTCTTTAGCTCCAATCAGCCTGATTGTATTGTCTGTTTCAGGTGGGCTG
GATGAGACTCTACACAACATTATCGACTGTGCCTGTGAGCAGAATATCCCGTTTGTTTTT
GCCCTTAATCGCAAGGCTCTGGGCCGCTGTGTGAACAAAGCAGTGCCTGTGAGTGTGGTG
GGAATTTTCAGTTATGATGGGGCTCAGGTAAGCTGAAACAAGGCACTTCATGTTTTTGTT
CAGCTTCACTTCGTACTTGGAAGAGGAGATGAAAATACTGTGATTTTTAAGGGTTTTTTT
GTTTGTTTTGCTTTTGCAGACTTACACGCCATCACAGGTCATACACATAGCTTATGTGAA
AAACAGATTTTAGAAGTACAGGCAGTTAGCACTGTTAAAAAAATTACTCTTGCCGTCTCT
TCCTGATATCCTCTTCATCTTTATCTCCCTCAATATTTCAAGAGAACTGCTGTTTTTATA
AATGCTGATAAATGCTGCTTTTTTCATGTCTTCATACATACTAAGCTGCTCAACTTTTAT
ATATGAACCTACACATTCTGAATAAGGAATATTCATTAGATTTTCAAGATGTTAAAATTT
ACTGTATGATTTAAACTCAGTTATTTTATATTGCCATAGGACCATTTTCATAGAATGGTA
CAGCTGACAGCAGAGGCTAGGAAGGCCTACAGAGATATGATAGCAGCTTTAGAGGAAGAA
GCTAAAGCAGGACTAAGAGAAACCCAACCCAGCGTCTTAACTTCTGAACCTGAAAAAAGT
GGCCTGTTAGAAACTTGTAAAACATCTTCCAGAGACTCAGATGAGGATGTACCAAATTAC
AGTAAGTATTTACTGACTTGTTTTTTGTCACATTTTCATTCATTGTGCTTATTAGTTCTC
TGATCTTTCACTGAACTGAATGACATCTGCTCTAGTCATTATTAAGGAGGGAAGGAGGGG
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