SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003432_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein R (SelR)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Transcript IDSPT00003432
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003310_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003432_2.0 # Transcript # Selenoprotein R  (SelR) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) # Full length # Reverse
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ATAAAGTAACTCGTATGATTTGATCATCTGCCAATTGCTGCTCTTTGATAGACAAAACCC
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CTGATAAAAAAAGGGGACACACAGTTGGCCCATGTGTGTGTTAAGTCCTCAGCTGCTTTG
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GATGACAGCAAGCCTGGAATTGTTTGAAGCTGTGTTGGTTATTGAAACCACTGGAAACAC
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GCACGTCACTTCTGAGAGACAGACCAGGGACGTACGCCTAAAATATTCCAGAGGAATTGT
AAAAACGAGCTGGCAGTGTGGATTGTCTTGTTTATTTCGATGTGTTTGTAATAATGCTTC
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GAATATTATTCTGATTATTACTATTATCGTTTCTTAAAAACAAGTTAATGCTAAGAGTTT
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GCCCAATTAGGTACGCAAGGTGCAATGTCTTAAAACAGCTTAAAATGGATTTAATCTGCC
TGGAGACTGGTTACTTAAACCCTGTTTTACAATCCTTATTCCCCAATGGATAATGCTTGT
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AGAGGCTTGACATAAATTAGCTTTCATATAATATTTGAACTACAAATAGGTCATTAAAGA
AAAAATAAAATCAGTGCAACTATAGGTTAGATAATTTAGTTGTATGTAATAAGTTACATA
ATTTCTATTATCCATGTGATCTCTTTCCTTTCCTTGTTTACTTTTTCCTCTTGTTCTGTC
CTCCCCTCTTACCTTGAGATCATATTTTTTGTAGACAGAAAGGCGGTGAGAAAAGACGTT
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GCTGTCCTGGGAAGCTGTATGAATCTGTACCCTGACACTTTTTGACAAATTCAAAATCAA
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AAGTGTTTGCTGCAGGCCTGTGTGTCAGTTTGTAATACAGGTAGACAAAAAGACACACAG
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CTGCTGATAGTCTTGATGACGTAGCGTTTGTCATACGAGGTATGGAAACGAGCCCCGCTC
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TCCTTGTTGTCTGACCACCTCCCACTCTCCAGTCTAAACATGTGGGGTTCTGACCCCTAC
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GTCCTCTGCCCTAACTACCCTCTCCCCACTTCAAGTCACAGCATCCATTGCTTGTATTGA
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TGTGTATAGATTTAAAATTGGTTGCAGTCTTGTATCTGGAGGTTCCTTAAAGGCACAGAG
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GTAACTGTGGTGTGTTTCCAAGAAGCAACCATGAGAGGCACAAGGATAGGCTTGCACTTT
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GAAAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGACGTATGTACGCATGTATGAGTGAAAGCTAAGGTT
ACATGTCGCTCCTGCAGGGAGGATAATCTTAATATCCTGCATCTGTGATGCACTGCTGTT
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ACAGATCTGAGTCTTATGTATGACCATGACTAAACTCAATGTTGTGTACTTTCAGGTGTG
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GCTTGTGTATGTGTTATGCGTTGTTGGCTGCAGGCAGGGGTGCTGGCAGTGTTGCAAGAC
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TATAGTCCCAGATGTACATTTTATGCTTCATACACTGCTCGTAGCTAGGATTGTGAACAG
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GGCCTCAGCGTGACTGACTGACCCATGAAAGCATTTGGCATACTTCAGGTGGTCATTAAG
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TGTTTTAGACCAGTATCAATACAATACATGTTCAAGACTTTGAAGTGGATGATTACAGCT
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CTTAATCCCACGGCGTCTCAAATTAATATATCCCTTTATTTAGAACTACAGTTTGAGGAT
TACAAAATAGTCTGGAAGGCATTCACTTATGCAAGTTAACAGCCCAATCAGAGATGCCGG
GGCCAGTTCCCCAAACATCTTCTGGGATAAATTCTTTCTCAGTGGAATAGTGTGTCAATG
CCTTTCTGCTTTTCCACTAGCCTATTCTGATGATTGATGTAATTTTTGTGTCCAGCTCAA
TGAGATGCTTCTTAGAATGTTGATGGCAGTGGAAATGCCAGCACAAATATAGAATTACTA
CATAATTAATTGAAAAATAAATTAGCAGCATAAATAGGTCTGCTTTAGACCAGTTGCAGA
GGTGACAGTGTCCTTGTTGAAAATAATATCAATCCTGTACTATAGGTATTGTTTATTGGC
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TGCTGCCTAAAAAAAATATAAATAAATAAATAATAATAAAAAAGGAAACTTTAAATATAC
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CTTTGGCTTGCCTGGTCAATTATAAAACAAATCTTATGCTGAAGTCTGCAAAAGCTTGTC
CAGTGATGGGCAAAGGTCTGCCTTTGTACACTATTCCAACTCTGCCTTTAACCAGCTCAG
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ATGTTTGCACTGTTATTGCTGCAGTGGCAAATGTTCCTGCTTGCTTTTGACGGTCACTGT
TGTGTATGTGTTTTTTCTTCTTTTGGATAGTTGTCATAGCACTGATTAACATAAAGGCCT
GCTGGGCTTTCTAGCTTAAGCATGGTGCAGTTCTTATGTTTTGTTTAATCAGATGCCTCC
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GCTGTTGCTCCATTGGACAGGAAGTTGGTAAAGAGAGCGTGCTCTGTCAGCAGCATGGCA
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GAGACATTTGACAGTGAACAGGGAAGCTATGACTGTGATCTTTTTTTATCTTTTCTCATT
TCTGATTATCTCAGTTACTGACTTGCAAGCAACAACTTGAATGCGTCACCAGTGTAAAAA
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CCCCTCTTCCAATGAGTCCTTCAATATCAGTGTCCTCATGCTGTGTCTGATGCAGTCTTT
ATTCATACATTTTGTTTTGCTAAATGTTGAAACATATGTGATGAAATGACCACATTTAAA
CCAAATGCTTGCATGGCCAACCGATATCAGTGGGTCGAACTGGTGGCTGTTCCTATTTTG
CACTTCATGGTTCACTTGCACACAGTGTTGTGGTTTCAGGGTCAACAATACATGTAAAAC
GTGTGACTGATTCAGTTTTTAATTTACACTGAAATTGCGCTCTAGGCCACTTAGCAATAC
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CTGATTTCCTACAATGCTGCTGAGGACAACAGAATGTCTTGAAAATAGCAGGAGTCATGG
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TGAGAGGGCAATGGAACATGTGCTCTGAAGAAGCAACTCCTTCCTCTATACCTAATTACT
AGATATTATAGTCTAAGTGGATTTGATAAAAGTGGAATCATGAACATGCAATTAACCAAT
ATGTAGATGGGTAAACATACAAAAAAAGCTGTGCTCCAATCAATATAGCACAGCAATTTG
TACCACAGCAGCACCCTGACTGTGTTTGACCTGAATGGAATGGAACCTTAATTAGTATCA
TTAGTAACACCTGTGTTTACCTACTATTTCATGTCAAAATGGCTGCTGTGAAAAGGTCTA
TAGCTTTGAAACTTATCAGCATACACATCAAAATGCTTTCTAAAATAAGACTAAGACGCA
CGCACACACACACAGTCTTGTACTTCATGTTCTGAAATAATTGCTGACCACAACATGACA
TGATCTGCATAAATAAAGATAATCATATGCAGTATAGATACACCCAGCTAAATGGACATT
TGCCCTTTAACAGCCACATAGTCAGCACCAAAGGTCACCTACAGCTGTAGTAGATTGTAC
TGAGTGTGGACTTGACCTTTCACTGACCAATTAACAAGGCCATTACATCATCTCCTGACC
TGTTATGAATCCCAGAACCATAGTATGTAGCAAGTTAAACAATATCGAACTCAAGCCCTT
TTAGGTGGAACACCCAAATCACAGTACAACAATTGTATCTGGGTGTGTATATCGTTCATT
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ATCAGTGGGGTTTTTTTTAGCAATAAATCTGCAACTGCAAGGAAAAGCCTGGTAAATCAC
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GGCATTTAAAATGTTTGAAATTTAATTCTAGGAAACATGAGTACATGATCTGCTTTAAAC
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ACCTAATTCTGTGCAGAAACTTTGACAATGCCAGTGACAGAGGTAGTCCTTACTCCCTTT
CCTCCCTCTGCTCACAATCCCAGTGTGGAGAGGTCAGTCATAATGAGGCCACACTGAAGA
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TTCAATTAAAAGCTGATGGTAGTCACTAGGGCTGGGCGATAAAAACAATCTCGATATGGA
ATTGTAATAATTTATGTCAATACCAATAACTGATTTTTCTCAATATAGATAGATCTAATA
GCCGATTAGGCAGCCAGAAATAAATGAGATAACTGAGTCAGTTTTCAGTCTTTGGCTTGC
ATGTGAAAATACACAACCATTACCTACCGAAAAGCTTTGTTTGAGCCAACGTTACCAGTG
AAGAAACTGAATGTAAAAGTGGATTTCCTCTGGTGAGAGGAAAAAATGAGTGGAACCCAG
GGGCACAAAAGTCACTTTTGCATCTCTCTTGCTCTCGCTCTCGCTCTGCTTGTTGGTGGG
GCCAAGCTCCTCCAAAGAGAGAGTGGACTGCAGTGTAACTTCAGAGCAGAGCTCACAGTG
GAGGAAATGAAACAGACAATACTTTACAGGGGTAAATGACAACAATTCTCATTATCTAAC
AAAAGGGAAACAAGCATATGAAAAACTATGGCCGCTCTGCCCACAGTAACTTGCTGCCCC
GTCTTCATCTACACCCTGTTTTACAGTCTTACAGAGCTTGTTATGCTACAGTGTTGAAAG
TGAACTTGTGTCATCCTCCAAATCTGAAGAAATTGTTGACAAAAAGGGACCACGAAGCGG
TTTGCATATTGCAATAGTAACAAAGCACAGATTCAGACAGTAACATATGCTGTCAGTCAG
TGCAAACCAAGACACAATACATCTTTTCTATCAGCTGAAAAGCCATTATTCTAATAGGCT
ACAAAGCAAACTAACTTGTGCTTTTTTGTTAAGGCAGATAAAGTTAAAGGTTTACATTTA
GAAGTATTATAGTTTAATCACAAAATATATTACAAGGTTAATTAAGGATAATTACCGGTA
ATTAAGGTGACAAATTGTTTTCAGTGTCAACATCTACGTGAAACAGACATGCTCCCATCT
CTGTTGGAACACTAAATGACTTACTGCTAAGGTGGAAATAGGTAACCAATAAATTATAGT
TGTCATCAACAGTTAGATACACATGCAGACAGCTCAGTAAGTCTGTTGTGATGTCAGTGC
TATGAAAGGCCAGCTATTAAAGGATATAGTGGTTTAGACTGACTGAGCAACAAACAGTCT
TATGGTATACGGCCTGTCCTGATGGGTGAATCAAGCGGCTCAGCAACATGTGCAACACAT
TGCATTTGAGCAAGTAGTGTGCCACGACACAGTGACTCTGTAGTCTGTAGTCAAGGACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACAGGCATGTTTGTATGCATGTAGGAGCGAACAAAAAAGAAAATGCTTTGTTTAAAGCTT
TTTGAAGGCACACACTGGAACAAAAACCACAAGACGCTCTCCACAAGTTCCCCTATTTGT
CATTACCTCAGGGTGCCACGATGTAAGGCTCCAGCTTTTCTGTTTTCCTCACCTTTACTC
ATCACACATATTAGCTGTAGGTCACTCCTGCAGATATTTATAGAATCCCCTTCTTATGCA
ATGCACAGAACCAGACACAGCTACTCTGAGTCACACAGAGAAGCAGGACACAGTAAAGAA
AGGGGAGAGAGAGAGAGATAAGGGGAAAAGAAAGCCAGCTAGACAGGATGACACAAAAAG
AGGGAATGAACAAAACAGTGAATCAACCTAGTAGATGGGGAGAGTTTAATGGAGGTACTG
AAAGAGAGGAGGGACACAAAGCAAAACAAAGGAAGCAAAGGCTTAAAATCTAGACTTGCA
TAATATTTGCCTTAACTATACAAAATGTTGGAAAATAAAATAAATAAAAAACTATTTGCC
ATATAATGAGAGGCAAAAAGATAATGTACCAAAAGTGACACACCTCTAACACACATGTTG
TGGACCATTTGAAACAATTACCATACTTCAAAATGTGTTCGTCACATGCTTTAAAAGTGC
TATGTCCCTCCCTATGTCAAGGTTTTTACAGGAAACACAAATTTACGTGTTTGTTGTTTC
TATGTTACCTTGACATAGGGAAGGACTTGTTGTGAATATTGATTCGTGTTTACAATAGCC
AGTAGCAAGTGTGTGTTAAACACCTGCCGCTATGCACTGCAGCTGGTGCTATGAGCTAGT
GCCAGCCTCTACCTTCCAGTGTACATTGCCGGACCCGGGCCTGACCACAACCTCCAAAAC
CAGTGGTGGCCAGTCTGGCAGAAAAGTAGCCTACAAAGGTGGTTTTCTTACTGGGTTTGG
CTCCTGGCACCCTTGGGCTGAGCCAGTTAACTTAGCTGACTGAGCTAACTACAGTTAGCG
GTTTGGTACTTAGCAATCTTTCCCTCAGGAAAGTCTGGAAATCACCTTGGTAGTTCACTG
TTTACTCCCTGTTGATCTCATACGCTGTGCTCAAACACTAGTCTGGCATCTGAGCGCAGT
TCAATTGCCTGCTAACGGTAGATACAGTTAGAAGTTGTTGATTCGAAGTTAGCTACTCTA
GCAAGTAGTAAGGCCAAAACTATTTGTCCATCAGAAAGCGCTGTAAATCAGGAGTTAAAA
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TTCAGTTCCACTTGAATCATTGAATTAAGTTATTAATTTAATTCATTTATTAATTCAGTA
AAAAGTGAGGCTCTGCCATGGATGGATCACTCGTAGACTGTATCAAACAGGAATCTCTGC
TCTGACGGTGTCAAGCAAGAAAGTATTTCACTGGATGCAGAATTCAGTCTCCATATTACT
GAGAAGAATACCCAAATGTTTTTTTTGGGTCAATGTTGGTCCAGATACATGTGTATAGAT
GACATATGTATTAAAACCACACTTAAAAATATCAATTTTGACTTCATGAGGAAGTGCATC
TGAGCCTTCGTCTTCGTCTTCTTCCGCTCATCCAAGGTCGGGTTGCGAGGGCAGCTGCTT
CAGTAGGGAAGCCCAGACTTCCCCCTCCCCGGCCACTTCGTCCAGCTCTTCCAGGGGAAC
CCCAAGGCGTTCCCAGGCCAGCCGAGAGACATAGTCTCTCCAGCGTGTCCTGGGTCTTCT
CCGGGGCCGCCTCCCAGAGGGACGTGCCTGGAACACCTCACCAGGGAGATGTCCAGGAGG
CATCCTCACTAGATGCCCGAGCCACCTCAACTGGTTCCTCTCGATGCGGAGGAGCAGCGT
CTCTACTCCGAGCTCCCTGCGGATGGCCGAGCTTCTCACCCTATCTCTAAGGGAGAGCCC
AGCCACCCTGTGAAGGAAGCTCATTTCAGCCGCTTGTATTCGCGATCTCATTCTTTCGGT
CACTACCCAAAGCTCGTGACCATAGGTGAGGGTAGGAATGTAGACCGACCGGTAAATCGA
GAGCTTCACCTTTCGGCTCAGCTCCTTCTTCACCACGACGGACCGGTGCAGAGTCCGCAT
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