SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003440_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Transcript IDSPT00003440
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003318_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003440_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) # Full length # Forward
ATGCCTCCCATCGAGAACGACACCGGGAAGAATGAGCTCAAAACACGGATACAACAGCTG
ATTGACACCAACCAAGTGATGGTTTTCAGCAAAACCTACTGTCCGTACTGTGTCAAGGTA
AGGTGTTCATTTTGTCGAAGAGATGGGGGAGCTTGCTCGTGCCGGTCGGCAACTTCCATC
TTCCTCCCGCGAAGTACTCGGGGCTCGGCCTAATTACTGGTGTGTCCTTGCTGCGTTAAC
GCAGACTCAGGCTGATATAACAAGTTACAAAGCAACTAACGACGAGCCGTTCCCACATAT
AATATAAGAGTTATCAGGATAAGTTAGAAACATTATAGCTAGTCGCTTAAAGGGGTCGCA
GTTTTTAGAAAAGTTAGTTAGCTGCATAATTTATAGTTAATATTTAACCGTTAATTAGCC
TTAAAGTGTGGTTACAAAGCGACACTTCTTTCTTTGAACCTCGCGCTTTTATAATTTGGT
TTCTTGTAGTTTAGTTGTGTTGTATAAGTTCTACGCAGAAGAGGTTAGCTAACAATAAGA
GGATTGTAGGGTTTTAATGGATGTGAAGCATGTCATTGTTGTGAATAAAGTAGTTTTAAG
TGAGTCTTTTTCGGGTTATATTGGCGTCTTGTTTAATGTACCCTGGAAGAAACTGTCATC
ATTCTTCACTTCTGTGTCATTGTAGGTGAAAAACCTGTTCAAAGAGCTGAAAGTCGAGTA
TAATGTGGTGGAGTTGGATCTCATAGGTAAGATGGAGATGTTTTTGTTCAGTTTGTGGTA
CAGCTACGAGGCTATTTGCCATGTTTCATTTGGTTATATGTCACGAAATGTGTAGCATAG
TTCACTAGCAGGTTTCTTAACACTTAAACTTACTACATTACCTCACCTATAAGCAGTATA
TGAACACTGAATAAATGCTCAGTAGTGGACTGTAATGTACCTGTAAGCCAGTATAAGTGT
TTATGAATGTATTGATCACCAACTATAACTTGTGAGTGGAGGCTGGTATTTAAACTGATA
ATGACTGAGAATGAAGTAAAACACAGTTGTGATAACAATAAAAAAAATAATGAGAAGTTG
AAGGTGACATTATGGTGTTAAATAATTTATTCATGTCAATATAAAATGCATTTGGCAGCT
GTATGCCCTGCCTGATCCAGCAGGGATGCTTGTGTTACCCGTGGCTGCGTCGTGCTTTTC
CTTTGCAGCAACACAAAACATGCTGAGTCACTCAGTGTAGATATTTGGCCTTGTGCCATA
TCTGAGTAAACTCCAACTGCTGTGCTCTGAGTTATTCCTGTCAGTCTCAGCTGTATGTTG
GAGGACTTATTAAAATTTCCTCTTATTTTTAAGACGAGGTCATATCCTGCTGCTGAAGCC
AAAAATAGTAGATCCTCTGTTATTGACTAGCCCGTATCAACATGTTTCCTGGTGCAGCCG
GTGGTCAAAACATTACACTTTGGACGTCATCACAACAGATGGTCGTCTAGATTTTCTACA
CACGAGCAATAGTTCCATTATATTACTTTTGCATATCATTTGTATATTAAAAGTTACTCA
GTAAGTTGCTACTATGAGCAAAGCTCCAAACCAAACCTAGAATTCACAGGTAGTACAAAT
ATTACTGCATGAAATGTAGTGTTTTACATGAACCTCTCTGTCCAGAGGATGGAACCAACT
ACCTTGAGATGCTGATCGAGATGACTGGACAGAAAACCGTCCCCAGCATCTTCATCAACA
AGACGCATTTCGGTGACTGTAGCAAAACAATGCAGGTGAGGAATAAATGTGTGTCAGTGA
ATTAACAGGACTGTTATACATCGCTGTAAATGGTTCAGGTCGCTCGTTCAGATTCCACAA
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TGATTTGCATGATTTGTCATCTCGCCCTGCCAACAACAGACAAACACTCAATAGGCCTTT
GTTGCAACAGCATGAATGGAAGGGGTGTAACCAAAAATGTCTAGGTGTGCCAAGAGGTCA
TGCGAATGAGCCATGCACTTTTTTTTTTTTTTTAATGAGTAAATACTGGAAATGTGAGAA
AATTATAACTTATAATTCCTTGGTGTCTTGATGCAGGATGATGGAGGGCTTGGTGGGGGG
AGCTGTTACTTTGTCTTGTAGTTTGTACATAGCTGCATGGACAGACAAACTTACACAAAT
ATAAAGTGGTACAACTCTCACTAGGATTTAGTGCCACATCCTGAGCAGTGGTGAATAGTA
GGCTCAGAAAATTGCCCCCACTGTACAGCGGAAACAAAGGCTGAACCTGCGACAGCGGCT
TCACCTCACTACACCGTCAACGTACATAAATGCTATGTTGATACAACATTATGTTAATGT
TTCTGTCAGGCTCACCAAGACGGCAGCCTGCAGCAGCTGCTGAGTGGAGAGAACAAGGCT
TATGACTATGACTTGATTGTCATCGGAGGAGGATCTGGAGGCCTCGCCTGCTCAAAGGTG
ACAGAATTAAGTGCAGCACACTCAGTGTTACCTGTTAAAGCTTTATTACATTGTATGTTG
CTGTTGTGTAGTTTTGTGGTTTTGCACAGAATTAAACTAAAGCTAATGTTGAAATGCTGC
AATCAGTAACCACAGTTATGAGCCAACGTTAGTACATTACAGATTTGTGCAATGCTGCGG
TAACACTGGTTCTTACAACAGGAAGCTGCCATGTTGGGGAAGAAGACCATGGTACTGGAC
TATGTCGTGCCCACACCGAAGGGAGCCTCCTGGGGTAAGACACTTCCACTTTAAGATGCA
TAGTTGGATGCTTGCGATGCAGCTTTTCTTTAAACCGTTCCTGTTTGCGTTGGTGTTCAG
GTCTCGGTGGAACATGTGTGAACGTGGGCTGCATTCCCAAGAAGCTGATGCACCAGACGG
CCTTGCTGGGCACCGCCATGCAGGACGCGCGCAAGTTTGGCTGGGAGTTTGACGAGACAG
GTGAGGGCTCAGAGCGACGACCCAGGAGGTCACGAAGGGGGGACATCGCACCGGCTTGCT
GTGGTAAATCAGTAGCTGTCAGTAGTCACTCGTTGTCATTACACTGAACCACTGACGGCC
ATCTGTCTGTACGCAGTGAAACACAACTGGGAGACGATGAAGTCGGCGGTGAACAACTAC
ATTGGCTCATTGAACTGGGGCTACAGGGTGGCACTGAGAGACAAGAACGTCAATTATGTC
AACGCCTATGCAGAGTTCATTGATCCTCATAAAATCAAGGTGAGCACTTGTGACATGAAG
GAACCTTGAATGTACAGATCTTTAACTGGGATTGCTGGTTTGGTTCCAGTCTTAGGAGAC
TGAACTCTATTTTCAAATAGAATGAGGGCTTCCCTCCTCTCTTGGTCAAGTTTCCACACC
CAAATTCATCTCTTTTCTTGATAAGCTGCTTTGAAATGGCGTCTACCCTGTTGGGTGACC
TATTTTTATTTTGGTTTCTTTATCTCGGTCAGGCTTGGCTTACCATTCAACTTCCCTTTT
TGGCTGCCTTTCAGCATCGTTGCCATTGTTGGCTTTCATCTGTGATCGGACCACTAGCTG
CACCCAGAGTCAAAGTTGTATATTGATGCTTGTATTTTCTGGCAGGCAACAAACAAACGG
GGAAAGGAGACATTTTACACAGCGGCTAAGTTTATCTTAGCTACGGGCGAGAGGCCGCGC
TACCTGGGCATCCCTGGAGACAAGGAGTACTGCATCACCAGGTGAGAGCACAATGCCAGC
TACAGGCTGACCTAATGACGCACTGTGTTACTGGAGAGCCCCATCCAGAGCTCATTCTTA
GACCAGAAGGTGGGTTCAGCAGATGTCTGAAGAGGCATGCGTGCTCTGTAAGAACACAAC
AAACACCCTTTAATGATCTGGACTCCTGTATGCGCCGCAGGTGGCTTTGCCTCAGAGCAT
CCATTAATCTCCCAGCTGTCTAAATGTAATGGAAGATTAGCCTCAGGTGTCTTTTGGTCA
TTATGCTGCTGTTTCGACAACCCACACATGGTCTCATGCTGCTCACTTAGTCTCACAAAG
CCTCAGAGTAAAGCTGAGAGGCACAACACCAGCCTGAGCTCTTCTGAATGGTCAATATTT
AGTATTGTGCACTATAATAATGTTTCCTATGGGTAGGCATGTTTGTTTACAGGATAAGCC
CAATAGTGTGGGGAGGGGAATGTCACTGTCTGCATGCTGCCGTCACTTAAAAGCAAATAG
ACATTTGAGAGTTTAGTAGCAGGGGAGCACTGCAGCTTCATGTTTGATTTCCTTTGTGTC
CGTCCGCTTCTTCCACCAGTGACGACCTCTTCTCGTTGTCCTACTGCCCGGGAAAGACCC
TGGTGATCGGGGCGTCGTACGTGGCGCTGGAGTGCGGCGGCTTCCTGGCCGGCCTGGGTC
TTGACGTCACCGTCATGGTCCGGTCCATCCTGCTGAGGGGCTTCGACCAGGACATGGCCA
ACCGCGCTGGAGAGCACATGGAGGAGCACGGCGTAAAGTTCCTCCGCAAATATGTCCCCA
TAAAGGTGAGCGTTAACCAAGTGCTGCCTCAACGAAAACACACACAGTAAGGTTTATCTC
TCAACTAGACATTTGACAGACATGTCTGTGTGTGTCAGGTGGAGGAGCTGGAAGCAGGCA
CTCCTGGCAGGCTGAAGGTGACAGCGAAGTCCACAGAAACCGATGAGATCATCGAGGGAG
AGTACAACACCGTATGTACTGATCAGTTCGTCCTACCTTTTAACTCTCCATCTGTTTCTG
GTGTTAGTTTTGTGGAGTGCCTCAGTCGAGGAGGTTATGTTTGTCCGTCAGCAGGATCAT
GGGAAGAAACACCGGCCCGATTTATCGTTTATCTTTAGTGAAAGGGCAGAAGGCACCAAT
TTTTTTACTTCACCAGCGTCTACGACAAAATATACTGAAGTCATCATCTTTATTTATTTA
TAAACATTATGAAAATGATTAAAATTCAACTATAACATGTTATTTCATCTATTTTCATTA
CTGAATATTTTCATTATTTATTTCATAATAACCATTTTAGCCTAAACCTAAACTTTTCTC
TCATGTCACTTTTCATAACAGAAGTGTCACCCACGCCCTCACTTTTCAGCCAATCGCATA
CCTTCTGCCTCTCTTGAGGTTACAAGCTCAGTGACTGCTACCAGTTAGCTTCTTTTAGCT
AGAGCAACAACAGTGCTATAGCTGCTCTGAATCCACCAACTAGAAACTGCTGTGCATTGA
AACAGCTTTTTAAACCTTAGCTTAAAAAAGATGCTAATGCTCCTCTCTTAAATCCGAATT
AGCGCGAGTACAAGAGAGTCTGCGTTACATCATTTCACCATCAGATGAACATTTACGCTA
CAAGGCCTGATCACCTGCACACATGGAAAACATCCTCTAAGTGGACTCCAGAAAGTAACA
TAAACAGAACTGTTACTCAGCTGTGATGTCTGCAGCTGTTTGTGTTCGTTTAGGAGCATA
TTCAGGCTGTCAGTCAGCTAACAAGGTCAGTCTAGATTATTCCTCAGCATCAAAATGAGC
GAGTCAACCAGCTAACATTAGCTACTGCTGTTAACAGTCTCTTCTCTTTTTATGCTGAGT
CATAAATGAACCTATAGCCCTGTCTAGCTTGCAGCATGCAAAATAAATAAAAGGTTTCAG
GTTAGTTTCAGTGTCTGTACTGTTTGTTAACAGCAGCAGCCAGTTGCTGCAGGGGTTATT
TACTCGACATCGTTCCGGGAGCAGTCACCAGTTTTAAAAAAAAAACAGAGAGATAATTAA
AATGAAAGTGGTGAAATCAAATTTAATGATATCGAAGTGATTTAAAATAATTCAGAAATG
AGCTGTATGTTCTGATGTTCAGCTGTCACAAACAGGTGTGTCTAAATAATCAGTTGAAAC
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TCTCCAGGCTACATTTAGTCATCCGTGTGTAAATAAAAAGCAGAAACTTCCTTGCAGGAA
TGACCCGAGAACTTCCTTTTAAACTTAACAATCCATTTCCTCATTCTCCAGGTCTTGATA
GCAGTGGGCCGAGACGCGTGCACGGACAAGATTGGCCTGGACAAGACAGGGGTCAAAGTC
AACCCTAAGTAAGTTTATCATCTCGTATTTTTTTTTTTCCCATTCCTTCCTACATGTGTC
CATCCCATCAGATTGGGCGGCCTGTTCCTTTAAGACTCACGGTACAGTCACAGTGATTCA
GCATTTATTGCCATCCCATGGCTCTCTGCAGGGGTGGTGTGTGAGTGCGTCGGGGGATTT
GGTAGGGAGAGAGGAGGGAGGGTGTCTTGTTGCCAACATGAGAACACTCACCGCATCAGC
AGCGTAAAATCAAATATGTAAGAGCTTTTCACGCTGGTGTCATTACGCTGCACTGTCCGC
TCAGTGTGCGTCTTTCATCAGGACATTTCCTGTTTCTCTTTGTAATTTCAGAGCAGAAGT
TAGCAAAGTAGTGTTCAAAGAAGTCACACTTTTGCAATATAATACTTTTTCCCATATTAC
ACGCTCAGCCTCGTCTATGAGGATGTGATCTTTCCTCTCTTTTGTGAATGACTGAACGTT
TCAGCCTATGAGGCCAACAGGGATTAAGCGTGCATGAGGCCAGCTTAAAAGAGCACTCTG
CGAGTCATATGCCCCGGTCTTATGACCTAAGTAGTATTCAGATGAAGCAGACACACAGTC
TGAGGGGCCACCGGGTTCATCAGCACGTTTGCTCTGCTGCTGCACAGTGTAGGATGTATC
GTGGTTTATAAAAAAATAGTACTACAGTGGTGTCTGCCTATTCTGCCCAACACGACCTTA
GACCCACTTCCCACTCGATTTCTGCCTCGTCGATGGACAGTCATAAAGTTTACCCATAAG
TACCCGAGATATTTAGAGTAAAGATTATTTCACTCTGCAACAATGGAGTGAAATTGAACC
AAAGTGCGGTTTGTTCTTCTTCACTGACCTCCAGGAATGGAAAAATCCCAGTGAACGATG
AAGAGCAGACCAACGTGCCCCACATCTACGCCATTGGAGACATTCTGGAAGGCAAGTGGG
AGCTGACACCTGTCGCCATCCAGGCTGGCAAGCTGCTGGCACGACGCCTCTACGCAGGCG
CCAAACTCAAGGTACACTCCCTCAGCACCGTGAAAACACAGTGAATGTGGTAGCATTAGC
AAGTGTAGCAGCTGAAGAACATTAGAGGGAAAATCAGCAGATATATTCTGTATAAAATCT
GATCCACTTTCACCAAAGTCTCTGAATAAAGTTCTAAAGTTGTGCCTTTTATACAGTAAT
CAGTGAGGCCAGGCCATAGATGCATGTAGCAGGCCTCGACCACTCCTAGATTATATCAAA
CAGGAAGCATGTCGCTCCAGCAGCATCACAAGAGAACACAACAACAACTTTTTACCGTTT
TCCAGGAAATGACGATCTCCGATATCTTTAGACGTAGAATTAGTTTTCAGTCTGAACTGC
TCTGTCGTGTCGAACCTGAGATTCAAAGTTATGACACAATGAAGCACGCAAAACACAGAT
ATTAATACTTTAAGTTCTGATGTCATTTTAATTGTATTGCCTGTGTGTGTTATGTGACAG
CTGAAGGCTTCATATAACAAAGTCTAATTCATTTTGTGTGTGTGTTTGTGCAGTGTGACT
ACATCAACGTTCCCACCACCGTCTTCACCCCGCTGGAGTACGGTGCCTGCGGTCTGTCAG
AGGAGAGAGCCACCGAGCTGTACGGGCAGGACAACATCGAGGTAACACACACACACACAC
ACACACACACACACACACACACTCATCTGAATAATTTATTAACTATCTGGCTCGTCTGAA
CCTTGTGACAGGCTGCAGTGAACTCTGAGACAAGAGTTCTTCTTTGTAATCAGTGAAGAC
GGACACACACACACACACACACACATTTGTAGTGTTTCTTCTTGAAACTTACATTTGTGT
GTACACTTTGACTCAGTTGGCTCACGTGAAAGCTGAAGTGTGTTCAGTGGAGGAAGATCC
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TGATCAGGAAAATGTACTCAATTAAAAGTAAATACTCAATTCTATTATATGTTAGAATAT
TGTATTGTTAGAATATTATGATTTATTTCATGTTAAAAGCAGGATTTGACTGTCGGTCGT
TGAGGTGTGGCTCACTTTGTGCACTGCAACTAATGATTATTTTCTCAATTATTCAGTCAA
TCTAGGTTTCATATTTTTGCTATTTTTGCATTATTCATTATGTTCTGCCGTTTTACTAAT
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AAAAAAACTCGAGTACATATTTCCGGTCCACGGCGCTGTGTGTTGCGTTTGAGCTGTTGG
AGAAGTTACTGCGTTATTTGTTCTGTCTGAGGCTTCCTCTAGTTGGTGCTTGTCATTCTG
TCTTCAGTGACTTGTTGGTGCATGCAGGTTGAGCAGCGTGACAGCCAGAAAATATAAAAT
TTCAGAGCACTACTGTAATATTAGCTCCTCGGTACACACCGACAAACAACAAAATGAACT
TCCTTGTAAAGTTTAAGGTTCAGCAGAAGTTGCAGACATGTTAGATTTGTGTTATTACAT
GAGTCATTAGTAATAAGTATTGCCAGTTGAATGTAGCTCGTTACTGTTGACGCTGTGATA
AATGATGACTGTGGTTCTGGTGTGTTTTCTGGTGTGTGTTCAGGTGTTCCACAGTCTGTT
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CTGCAATAAACTGGACAGCGTAAGATTTTTATTTATTTATTTTTTTTAACACATCAGTTG
CCCGGAGCAACCGACAGCTTGTACCCCATGTTGTGTCACATGACCGACCTCGTTTTGTTG
TAAATGCTTTAGGACCGAGTCATTGGGTTCCACTATCTGGGTCCAAATGCCGGAGAGGTG
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ATCGGCATCCACCCGACCTGTGCTGAGGTAAGACTCATCACATGCTACAACTCTACTACA
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TTCGTTCTAGATGAGTCTGCACTGGGTTCTCGGACTTTAACTGTGGCTGACTAAAACGAT
TGCCTTCTGGAAAAATGCAACATTTTTTTAACTTCTAAGAATGCAGCAGCGTGACTCGCC
TGTCAGTGCTTCTTGATGTGGTAGGACTCAGTACTTCTGCTAACTCAGATGATGTCCTCA
CCGCTGTACAATTCCATCAGGTTGCTGTGATCTCTAAAATCTTTTTTTTCTTCTCATTAC
TCACTCCACAACATTAGAAAACCGCAAATTATGAGTCATGACTTCCTCTTTTATTGTCAT
TTTTGTCAACACAGCATGTGTCACTGTTTACACACCGTTAGAATCCTTATGTTTGTTTTT
TTGGTTAGGTGTATGTAAACATCTAGAATAAAAAACAGAATAGATACTTTATTGATCACT
CACACACACACAACACTGGTGAGACGGTGGAGTGAACAGCAGCCACACATGGTGGTGCCC
CGGGAGCAGTTAGGGGTTGGGTACCTTTCTCAAGGTGAGCTGAGACCTCTCACTCCATAC
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AGACTGAGCTACTGCTACTCTGATCCTAAATCTGGATGTGGCATGTGAACGCCTCCATCC
AGGTTTCTCAACATTATGTGAGAAACTGTTAGAATCAGGTGTACAGGTACATGAGTAAAC
AGGTTTTTCACGAGCCATTGAAACCAGCTTTGGTCAGATTTCCAGGTTATAAACTCTCCT
TTGCTTCCTGCTGAAATATGTAACCCTCCCTCACTTGGCTGGATTTTCACTCTTAATTCT
GTGTGAATGATCTCGGTGTGCCAGACACCGATCTGATCATGAAACACGGCGTCCACAGGC
GACGACCTAAAGTATTAACATGTTTCTGTCATGCTGTGGATGAGCATTTGAATCAGGCTT
AGTTCAGATGATCTTAATCTGAATGAATATTTTGAATCCCTTTTCTTCTGCGTACCGTAC
TACCACACATGCTGTGCATTAATTAGCCCTCATCATTACACATTCGTTATGTTAATGTGC
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TCCAGGCAGCCTTAAAACTGTTAATTCCTGCAAGTTTCAAGAACACACATGTAAAATCTG
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CACTCTGGAGGTGACCAAGAGCTCCGGTGGAGACATCACCCAGTCCGGCTGCTGAGGTTA
AACCCTGCTCGTTTAGCGGGCTGCTCTCGTGTTAGACTCTTGTACCACCCCCTCCTCTCC
TCTTAGCTCCCAGTCAACCTTTAAGCTCAGCCGCGCCTCCGGCCGCTCACTTTACAGAGC
GGTTGTTTCTCAGGACAAACCTAACACCGCGGCAAACATCTGAATCGGTGACCAGCACTG
ATTCAGGCTCGCTGGGAGCTAAGAGGCGACTGACAGAAGCCAGAGCTGATGACGTGCGAG
TCTCCAGCTCTGGCTGAGGAGTTTGATACGAGGGCAGCCTGCTGAACAGCGGGGTTACTC
TGCTGCTTTTTTGTACTGGACTCCAACAGTGTGTCCTTCTCAGAGGAGCACCAACACACA
CTACCACTGAGTATGTGTATGTTTGGGCTGTTTGTGACGTCCTGGCCCGTAACCTTAAAT
ACTGAGGTGGGCGAGGATCGATGTCCCTCTGCAGAAGCAC
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