SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003444_2.0
Identity
Transcriptseryl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (SARS2)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Transcript IDSPT00003444
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003322_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003444_2.0 # Transcript # seryl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (SARS2) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) # Full length # Reverse
CGGAGCAGTTTGTACGAACATGTCCGCGAAGGTTACAGCGACAAACCCGAGCTGGACATG
AGAGGAGTGTGTGAGGAGACCGACAAAGTCATAGCGAATGTGGAGAACAGGAAGGGCGAC
CTGCGAGGGGACGATGTCAGGAAAATTGTATGTGTTTCTTTTAATGTAAATTCAGTCCTG
TTTGTGACGCAGAACTTTATTTTCTGTCTTAAAGACGTATCTGGAGTTGACAGGTGGCTG
TGTGACTGCTAATGAGCAAATACACTGACTGCACCTGTTCAACCTACACATTCACATTCT
GTAAATAGCATTTTTTTTTAAATAAAGTATATCTTTATTATTAATTATGTGTCACATCTT
ATTCACATATACGTATTTGAATAATAATTAGTGTCTAATATGTTTTTTTCCCCACACAAA
TGTACAGTTAGCAAGTTAAAATGTTTTATAAGCACAGCTACTCCTCCTTCATTGAAAGCT
CCAGAGTCTAAGTCAAATATCCTTCATTTTAAAAGTTTACCTGCCTGAAATGAGATGTCT
CCTACTTCACATGACAGGTCCAATCTCAGCACATGTGCACTGAGGGGATGCAAGTTCCTA
CATTGCGCTTGATGCAGAAAGTCACAGTGTGACCGGCACCGAATGACCTGCAATGACACA
AAAACCTGCTCGTGCACATGCTTCTTCAGCCTTGTCAAACCAAGTGTGTGACAGGGATCT
TTAAACTGTCAAACTGCACTTGTCACTCCAGCAGGTCACAGTTAAAACACAATGAACTGC
TAAACATTGTTCAGATGGAGAACTTTATTCTGACTGACAAGGAACTTATGTGCAAGGCAT
TTTTAATTTATTATAAAGTAGTCATAAAAATGGAAGCTTAGGTGTGAATATTAACTATAA
GAACAATAGTCCTTCATGGAAATACAGGAACAAGTAAATAAAGAACTTTTAGAATCAGAC
TCAACTTTATTGGTCCACTATATTGACACACATTAAGGATACTTACAGTAAAACATTGTT
GTGAAATGAAAATGTACTCTACAGGATGTTAAGTTTTCAGTTGATCTTACTGATTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCCACGTTGTAGGTGTGTGTGTGGCAGGAGCTCCAGGCAG
TGAGGACAGAAATCTCTGGGCTGGAGGAGCAGAAGAGGCACATCAGTGAAACTGTCAAAG
CACTAGTGGTCAGTAAAGCATGTTACATTACTGGTCCCCGTCACAAGTAATCGTTTTGTC
TTATTTGATGTAAAAGTGTCAAGCTGCTCTCGTAATTGTGATATAAATAATCTTTTCCTC
ACAGGCCAAGAATGACAAGAAAGCCCTCGCCAGTGTAAGTTCAATTTTGGCACAATTTCA
GCTCTTTAACACTTTGTTATTGAATCAGTCTGTCATGGAGCACCGATCAGTGATAAATCA
GATTTTGGACCAGTCCTTGTTGTTTATCACGTAGCTTCCAGAGTACACCCAGGCTGTGCA
GAAGGGTCGAGAGATCCGCAACAGACTGAACCAGCTGTACCCCAAAGAGACTGAGCTGGA
TCAGGAACACTACGGACGAGCGCTCAGACTGCCCAACACCTCACACCCTGATGTGGTGAG
GATACACGCACATTTGTCCATAGAATCGGGGGAGGGACTTTCTATAAAGTATGTCCTTTT
AAAAAAAAAAAAAAAGTTTAAAATTTCCCAAAGTTCCTCTTTTTTTCCTTTTTCAGCCAG
TTGGAGATGAGAGCCAGGCGAGGGTGGTGGAGCTGGTTGGACAGAAACCAGGTGATTGAT
GTGATCTATGAGAACAGTAATCCTTAATAATCCTCAGAAACCTTTACTTTAGCCTTACCT
CTCTCTCTGCTGTAGAGTTTGACTTCAAGCCCAGGGGTCATGTAGAGCTGGGGGAGGAGT
TGGGTCTCATCAGACAAAGGTGACTTTCCACTTGTTGTACTGTTTGTGCATATTACTTTG
AACCTTTTGTTCATATGACTGAAATAAAACTGACGCCTGCAGCTTGAGAGCAAAGAAACA
AAAAAATGTAAAGACCAAAATGCCATTCTGTATGTATATGATAATGCCTAAATGATTAAT
ATTTGCCTGATATTAGGTCTAACCTCATTGATAGCTTTATTGTTGTCACACTTTGTGTAT
CTGTCCTCTCCTGCAGACATCTGGCTCATGTCTCAGGCCACAGGTCGTACTATCTGAGGG
GAACAGGGGCCAGACTTCAGACTGCACTCCAAAACTTTGCCCTTGACACGCTGCAGCGAC
GGGTAAGCTCATTTCTGGAAATATATAAAAAAGTTTGCAAAATAACTGTATATTAATATT
CTGTAAACATATAAAAACGTTTCCTTTCGACTCCCGCAGGGCTTCATTCCCATGGTTGTA
CCTGACATGCTGAAGGGGGCAGTATTTGTGAGTAGATAAAAGAATTTGACTGAGTAGAGG
ATACTAAACGTAATATCTAAAAATGAGATTTGAATGCACCTGCTTGAAATATTTAGTAAC
TTTGAATAAATGAATATAGCATTGGTGAGATTTGTCCCACTCTTCCTGTCCTCTCCTCTC
TTCTCTCCTCATTCTGTTTCGTCCACCTTCAGGAGGGTTGTGGGATGCAGCCCAACGCCC
ATCGTTCTCAAGTTTATTCACTGGACCCGGCACGTTTCCCGGACCTCAACCTGGCTGGAA
CTGGAGAGGTCGGGGTGGCAGGTGAAACACATTTTAACTTTTTTCTGTACAGACAACTTA
ATCGTATTCTTGTTGGTTCATGGAGTTTGGCGACCTGTCGTACAGTATTTTCCTACATTT
CTTTAACCTGAGCGCAGTTCGTAAGTTCACGACAAAATTCTGATAGACACCACAAGAACG
AATGCTAAGCTCACAGACACATCATACTCTGCTGCAGGGATACTTGACTTACTCTGCCCG
AGCCCCACTCTTGCAAAAAGACTGCAGGCCAGTTGAAAAACATTAATAATATTTATCACA
TAAAAAATAATTGTTGCTGTAGCAGAACAAGACAACCTCAAAGTCGTAATCTTTTCTTTT
CTTGAAGCTAGCATATTTTGAATAATGATGGTACCCTTACATTAGCAACCTTGCACACCC
TTGCACACAGCAGATTGAACACAGCGGTTTAGGACTGGTATGAGGTGACAAAATAAAGGC
ACTGTCAAGCTTTTGACGTTCCAAATCCAGTCGTAGCAAAGCTCAGGTGTCTGTGAACTT
TTTAAATCAAGTATCATCAGCAGCTCTTCTTACTGCACACATCAGTGGTAGGTTAATATG
CAACATCTCAAGTAACAGCCAAGAAAACTTTATTGAACATTTCTAAATTGGTGTGCAGTT
AAGAAACAAACAAAACAATAACCCAGGTGAATCAGTTACTTTTTCACACAGTTCTCTTTT
AAACTGGAGGACAAGGCTGTAACGTCAAACGTTTCTTCATTTTCAAACAGCTCTTGATAC
TAAAAAAGAATATGCAGTCCATCATCATGATTTGAAGCTAATAAAAGACAGATCATGAAT
CAGACATGAGCACTGGAAGCATCCATTTTACTTGTGTAGTAAGTATCTGTGTGGTGCGTG
TCTCTGCTTTCCAGGTTATTTCATGGATCATGCAGTAAACTGGAAGGATCTGCCTGTCAG
GTAAGTAACACCTCTCTTAGATTTCTGCACACAGTGTTATTTAGTGACACCAGCTGACGC
GGTCTGTCCTCTCCTGCTGCAGGACGGTGTGCAGCAGCACCTGCTACAGAGCAGAGACGG
ACACGGGCAGAGAGACGTGGGGGCTGTACAGAGTCCATCACTTCAACAAGGTTACAAGGA
CAACGACATCATGTTAGAAACACAGGAGTGTATTCAGAAAAAAACTATGTCTATAAGTCC
ATTATTTCAAATGACATGTACAGGGCACATGTTTATATGTGTGTATTGCTGACTCTCTGT
TAGCTGAACAAGTGATTACAAATTATTCTAATATCATAAACTACCTACCCTATAATTATG
CTAATGAGCTTTGTAATTAACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTATCCAGATAGAGATGTTTGGAGTGACAGCAGATGAGACAGGAAGAG
AGAGCTCTCAGCTGCTGGAGGAGTTTGTCTCTTTGCAGAAAGAGATGTTTTCTGCACTGG
AACTACACTACAGGTTAGCACACACACACACACACACACACATTTCAATTTGCCATAATA
ATCATTTGTTTTTATGTGTTTTTACTCAGAGTGCTGGACATGCCGACACAGGAGCTGGGC
CCTCCAGCACACAGGAAGTACGACATTGAAGCGTGGATGCCTGGGAGGAACGGTTACGGA
GAGGTCAGCCTCATTATATCACCGCTACCTACTTACCTTACTTTGTCAGAGGCGTAGGAA
ATGACTGGAAGTGAACTAATATATCTGCTGACTATGACTTATGTAAACATGCCTTCCCTT
GTGAGTCAAAGCTGTTTACAGTCTGTATTGTGCTCAAACATACAATCTAGTCCACACAGT
GTCATCTCATCGTTCCTCTAAACCTCTGCAGTTAAACATTTGAAGAAAGAGAAACAAACA
CAAAGAGTTCCTTCATTCAACCTAAATGTTTTGAAGCCAAGCGAGTCCTCTCTGTGGTTT
AAGCCTCATGTTTGATTCATTATCTCGTACATTAATAATAGCAAACAGAATCTGTAGCCT
GAAGCTTTGTGGGTAAAATCCAGCAATAAGGAGGTAAGTGTTAAACATTTGGACTCAATT
TGGCAAGAAAAGAGAGAAGAAACATAACTGTAACTTCTGCTTCAATAAAAAAAAGGTAAT
GATGGTACTCAGGGTACTGTGAATGTCAACAAGTCTAATGTGGGAAGGAGATGACAGAGT
TTTGTTCCCACTGAGCTCCACAGAGACAGCTTGCTGTATCATGCTGCTGATTCTCATTGT
CTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTACATATACATATATATCAGATTTCCAGTGGGTCCAATT
GTACAGACTACCAGAGCCGACGTCTCAACATCCTGTATGAGAGAGAGGATGGCAGCCTGC
AGTACGCCCACACAGTAAGGCTGCAGATGAGGCAGACTGCTGTACATTCCTCCGGGTTTA
GCTTTCAGCAGTACACCACCTCCATGATGTGTTTTATTTTTATTTCTCTAGGTGAATGCT
ACAGCGTGTGCCATCCCCCGAACCATCATCGCTATCCTTGAGACTCATCAGACCAAAGTA
AGACACCAACACAAGGGTACACTTCACGCATTAGGGTTTTTTTAAGGCATGTTTTCTGTC
TTTGAGTTGTCCTGGAAGATGACATAACAGATTTAAATGTCTTTAAACTGTCTAGATAAG
GTTGTAATGAGCAACAAAGTGATACTCTGGATGTTATTTGAGGCATAATATGCATCACAA
GCCCCCAGAACAATTTCTGTCTGATGCCTCTACAGCTGAATCTGTGGCTCTGTACGGGGG
AAGACGTAAAATAAATTTCTTATTTGTAGTTTTTATGCATATACCCAACTGACAGTGACT
GGGAAAAAAAAGCTGAAAATCATTGGAAACTACAAAATGTCTGCAATTAAAACACAGCCA
AATTCTTTCTTTTAAAGTCAAAGTTTTAATGAGATTTTAGTTTTATCCTCTTGTATTATC
TCTTCCAACCAAACGTTCCCCTGTCCACCTTCCACCATGTTAAATGTGTTATTTCTCTGC
ATGCACCTGTGTGCAGAGTATGGTGTTGAAGTGGCTCCCCCTTGTGATTGTTGTGAGTCA
GAACACTTTTATGTTATTTCAAATTGTGTACTGTATTTCATTAGAAATGCTGAAATAAAA
CTGAAAATGTCTATGTTACTAAACAGTTTAACAATTCAACATCATTGAGACAGAAAATTT
ACAAATATATGATCAGTTTGCACATTTTTACACATGAAATTAATCTCCGCTTTTATCCCA
TCCAGCTGGCACCTGTTGGAACACACATGCACAGGAACACACACACACATAGTGATAGAA
GCCATATACACACACACTGGAGCGGTAGGCAGCAATTCACAGTGCCCGGGCAGCAGATGG
TGGGGGGTACGGTGCCTTGCTCAGGGGCACCTCAGCCGTGGCAAGGAGGTGGACTGCCAC
CCCCACCAGCTGTCAGTCCACCTTCCAATCCTGTAGCAGCGAGCCACTGAGCCACGGCCA
CCCTCTATTTATTTATTTAGAATATGGCAGAAATGCCATTTTGCATTCATAACTATGTGT
TCATCAGTGTATAATCACCTGAAAATAACAATCATTGTGTTTTTGTTACCTTAGAATGAG
CCTTTTATATCTACAGAAGCCATAGATCACTTGAACCGCCATGTATCTACAGTAGCCCAG
AGCGGACAAACTAAAGACTGGCATTTCACAGCCACCGCCATAGTTTCTCCTTCACACTAG
AAAGGACAGGGCGAGACGAGGGGGTTGCAAGCAGAAATGACACTGCTTAATGCCACTACG
TCCTACACACTGGACCTTTAGGTCATTAGAGAAAAATGGCTAAATAATTGTTGTAAATAG
TACCCTAAACTAGATAAATAATTAAATACTGTAATGAATTTTAAATGTCCAGTGTGCAAC
ACTTAGGATAATCTATCAGCAGAAATGGAATAGTTTATCCTCCATGTTTGGAAGGGGTGA
GATGAACGGTATTCAGTTGGTTGAAATCAGCAAATACACTGCTAGATGCCACTTAATCCT
ACACACTGGACCTTTTTTAAAAAATATATATTTTTATAGTCTTAGGCGTTTACTGCAACC
CAATAGGTGGAAACCAGCCAATCCAAAAACATTTCGGCATATTTATTTTGAACTAAAATC
CACTTGACTTAACTTGACAGTGTTATTAATGATGCTAACTTTGGTTTTCTTTTCTCTTCC
ACCCTCTCCTCTTTTCTTTTCATCTCTCCAGGAGGGAACAGTACGCGTCCCACGAGCACT
GCAGCCTTATCTGGGTCTAGAAGTGATCGAAAAGCCAAAGTACACTCCACTGAAATATAT
CGGACCCAACCAGCCCAATCGACCGCCCAGACCT
Chart Advanced