SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003505_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesRousettus aegyptiacus (Egyptian fruit bat)
Transcript IDSPT00003505
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003383_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003505_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Egyptian fruit bat (Rousettus aegyptiacus) # Full length # Forward
ATCCCTGCTGGCTACTGCTTTGTAGAATTTGCAGATTTGGCCACAGCTGAGAAGTGTTTG
CATAAAATTAACGGGAAACCCCTTCCAGGAGCCACACCTGTAAGGACACTTAGATAATGA
TGATGTTGCCATTTTTATTCTCATCAACTCATTTATTGAATCCCTACTGTCTGTTTATAT
TATTTCATTTAATCCTATAACAACCCTGAACAGTAGGCATTGTTATCTTTGACAGACCAG
GAAACCGAAGCTCAGGGAAGTGGAATAACTTGCCCAAAGCAACACAGGTAGTAAGTGGCA
AAGACAGGCTGCAAACTGAAGATTGATTACCTCTGAAACCCATTCCCTTTCCACTCTGCA
CCGCCGCCTCCCTTAATGGAAGACTTGAAACTAGACTTCTTGCCTGTTTGAGAAAGTAGA
AAGGCTGGCAGTAGTGAGGACACATGTCAAGAGAGTTACATTCTGCTCTTCCCACAGTTA
CTTAGCTTACAGCTGCACCAAGCTGGCACACCTGGGCTCATAGAACCATGGAGCTGGCAG
TGCTCTTAGCGGTCATCCGTGCAACCCCCCCATTATATCAGGAGAAAAAGCTGAGGCTTA
GAGAGGGGGAGATGTTTTGGCCAAGGTAATTTATTTCAGTTTTTTTCAAATATTGTTTGA
CTCCCGAAACACCTTTCTCTGTTTTAATTTGTTTGTTTTTAAATTTCCAGGCAAAACGTT
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GGGATGACACCTTTTTGGTCCCCACTGGTGGACCTTCCCTGTGAGTCTTGTCCAGGCCAT
GTCTTCTCTAGCCTTCCACCCTGTTACTGCTCACAGGACTGAGGGTTTATTCCTTAAGAA
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TGTTCCAAATTAGCCTCAAAAGTTTTAGCTGAAATATTATATATAGTAGGCAAGATTTGG
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GCAGTACTACGTATCCATTTGTATAAGTCATATTGTACCAGAGTACTGACATGTCAAGAT
GCTGGCAGTGTTAAAAGTGAAAAAAATGCTAGAAACAAAACAAATGAATCATATTCAATT
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TACCTTTGAGTAGTAGGATTATTGGTAATTTTATTTTTCTTTGTCCTTTTGTATTTTCTG
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TCTTTTTTCTTTTTTGTTAAGAATTGTTTTAAAATGGGTTAGCAAACTATGGCTTGCTTT
GTATCACCTGTGAACTAAAAATGGTTTTTACATTTTTAGAGGATTGTGAAAACAGACAAA
AAGCGACTGAGACCGTAGGCACCCCACAAAACCTAAAATATTTACTATCTGGCCCTCTAC
AGAAAAAGTTGGCTGACTCCTAACGTTTGGGGAGATTTCATTTTCGCTAGTCTTTATGTC
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CTGCCCAGAATGCAGAATTTTTAGTTTTATATTTGAGCACCTCTGACCCTGTCCCACTAT
CTGCACTCATGTAATACTTGAAGCCAGACAGGCTCTGTTCAGTGGATGAAGGACTTGGGT
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TCCCTCTTTGTGGGGGACCTGACCCCAGATGTGGACGATGGCATGCTATATGAATTCTTC
GTCAAAGTCTACCCCTCCTGTCGGGGAGGCAAGGTGGTTTTGGACCAGACAGGCGTGTCT
AAGTAAGGCCTTACCTGTTCTTGATGCCTACCCTGTTAGTTTCAGCATTTTTCTCATAGG
TGGAGGTGTTACAGAGAGGCCATGTAGCGTTGTGGTTAAGAGCACAGGCTGTGGAGCCAA
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TAGGAGTGAATTCAGGATTAAATGATGTTATATAAATAAAGCAATAGGAGATGCTTTATA
GGTGTTTACTTATTACTTATTATTGTTACTTCAAAAGTGGAAAAACCTCAAGAAAGGCTC
ATTCTTGATCAGAGTAGTAGTTAAAAGCTCAGGCTTTGGGAGTATCACAGACCTATATTT
GAATCTTGCTTCTACTATGACTTTCGGCAAGTTATTAAATCTCTCTGAACTTTGATTCCC
TCTTCCTCCAATTGTTGAACTGTTCGATGAGATACCCTGGAAAAATGCTCAGCACAGTGC
CTGGGAAATAAGAAGTGCTCGTCAAATATTAACTATCATTTATTTTTTTCTCTCAAGTAG
AATTTGAATTCGGGAGATTAGGAACCTTGTCTGTGCATGACTACTGAGTTCCCATGCCTA
GTGCAATACTTGGCATCCAAGGCAGACGCGGTACATATTTGCTGAATGAATTTTTACAAT
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TGCCTCCCCGGATAGGGCTCTCATCCCTGCCCTCATAGTATGATGGGATTTTCTCTCCTT
TCTCAGCCCCTTTGCCATTCTTAGACTTTACCTTCATCCCATTTGTGATCTATATAGTTT
GTGTTTTTTTCCCTGCAGAGGCTATGGTTTTGTGAAATTCACAGATGAACTGGAACAGAA
GCGAGCCCTGACAGAGTGCCAGGGAGCAGTAGGACTGGGGTCTAAACCAGTGCGGCTGAG
CGTGGCAATTCCTAAAGCGTGAGTCCTATGCTTGCGGGGAAGGTAGCTGGCCTGTGGACT
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AGGCTTCAGGGAGTTGACTTCAGCTCACAACTAAGGAATGCCTGATACTTGCCAGGCTGT
GTGCTGGGTGTTGGAGATAAATGAGCATAGCCCTTCCCCTCCAGAAGCTTATAGTAGGGA
GAGAGCTGTGATTAGGGAAGGCAGATACATCCAGACATTGCTGATAGCAGTGCTAAAAAA
GCAGTTCAGCTACACATACTTAATGTCCCTGCTCTTTGCCCAGTAGTGCCACTGTTAGAA
ATTTATCCAGAGAATTAATAAGAATTGTGCAGAAGGAAAAAAATTATACTCAATTTGAGC
CTTATTTATATCAACGAAACCTACAGACCTATGGATGTCCCTTGCTATGGGAATGGCTAA
GAATTACTGAGCCAAACACTCTCTTATATGCATCACTGTTGTACCTGCATGTGAGGCAGA
AGACAACTCCAAGCAGGTTTCTCACTCAGATGTAAGACACTTCTCTGCATAGAATCTTCC
ATCATTTGGCCAAAGCAGTGGTTCTCATCTGGGAGTGATTTTATCTCCTAGCGACATTGC
AACATCTGGAGACAATTTCGGTTGTCACAACTCAAGGGGAAGGTGCTACTGGCATCTAAT
GAGTAGAGGCCAGAGATGCTCCTTACATCTGACAATGCACAGGATAGCCCCACAACAGAG
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AGCAAAAGATTTGGAGGTTCTTTGTGGTTTAACTGGTTTTAAAACAAAATCAGCCTAAGT
GTCTTCCTCCCTGAAATGTTATTTGTTCTAAACCACACACCCCCCACCCACTCACCCACA
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AGAAATTTCCTCATCCTAAAATGACTGATTATAATTTCTGAGTTCATTTCCAGGCTTCAT
AGACATTTCATGATATGTAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACTACA
TATGGGTCTGTTTACATGCAGTAGATTTATTTCTATATTAAGTTTTAATTACAATAACAA
AGTGGGGTTCTCCCCTCCCCAGTTAGTCAGCATATACACTTTTCTATATAATTCCACAAT
TATCATTATAATATTTGTATAGCTTCAGGGTATTCTTTTGATTGTATATTCTGTATAGCG
GTTCCCCTGATGTCGACGATTTGGTTGTTTCTGATGTGTTACCATTTATTTGGTCAACAA
TAACTGAATTTCTACAACTCTGTAGGCCCTATCCTAGACAAGAGAAGCAAAAACCCTTCT
GCAGGGAGGTTATATTCTATCTAGTTCTTCCCTGGATGTTGTTGTTGGTATTTGGTGCCT
GCATCTGGGGAAGTGCCTTCAAGCACTAAGAATTGAGGATGATAAGAGTTCTTTTTGAGA
ATTAGACCATAAGAGCCAAGTGTGGAGAAATAAAACAGGAATATACAGAGTCAGGCCATG
GAGACTGCACCTTCTGTTACCTGAACATGGCAGGAGGGTGGTGGACATCCTTGGGAACAT
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TGGTAGTTCACCTCCTGCTTATCATTTGGTTTCTTCTCCGGCTTCACTGTGGGGATAGAA
TGCACCAGTAGTGAGGTCGTAGTGTGTCCCACACTGCGTGACAGTTAATCTTATAAACCA
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ATGTTCGTTTGATTTCTTGTCAACTAGAACTGCTGGTCACACCCCCAGGCCTGTTTTATA
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TGGTTAGCAGCAGCTGGGGCAGCTGTGCATTCAAGGTAAGAAAGCTTTCCGCTGTCTGTG
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AATTATGACTACTGTGATGACAGTAAAGGCTCCTGAGCACTTCTTTTATTTTTTTTGTGG
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TTCTTTGGGCCATGTTTTCCTGAGCCTTTGTGGCGACAGAAAAGCAACCCCCAGGATCTT
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GTCTTCTCTTTAAGGTCTTGGGCTCTGGAGCAAGATTGCCTGGGTTTGAATAATTTATTA
GCTGTGTGACTTGGGACAAATTAACTTCTCTGTACCTCAGTTTTCTCATCTGTAAAATAG
GGATATTGTATACTTATTGCACAGGTTTGTTATAAGGAGTAAATGAAGTTAATGTATGTA
AAGCACTTAGAAGAGTCCCTGGCCAGTTAATAAGTGTTAATGAAATGTTTGTTCACATTT
GTTTATTTTTGGTTCTTTCTTCATTTAAGGAGTCGTGTGAAGCCAGTGGAATATAGTCAG
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GGCTATGACCAGAACACAGGCAGCTACAGCTACAGTTATCCCCAGTATGGCTATACCCAG
AGCACCATGCAGGTAACTGTGCTTTGACTAGTCTGCTCTTTTGGGTTATGTTGTCCTTCA
GAGATGTGGCTCCTTCTCAGGGATCGGATCATTAAGGATGGCAGCTTGGGCTTCAGAAAA
AAAATATGGGGAAAGATGAAGCAACCTAGTTCCTCTTGTTGAAAATAAGCTATCCTGTTC
ATGGGTCAGGATTTCACCATCCTTCTCACCCACCTCTCTGGTCTCTTGACAGACTTATGA
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ATATGCGTCACCCAGTGGTGTGAGTGCAGATCTCAGGTAGCCCAGGGGAAAGCAACTGTA
TGAGGGAGGGAGCCAGCCACCCCCTGGATGAGTGGCATTCTACCCTAGGATGTAGGTCTT
TAGCAAAAAATACTATTGCCTTATATTTGTTTGACAGCTTGTAAAAATCATTTTGTGCTT
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TGACACTAACAGAAGAAAAAAGAAAGTAAAACTGAAGAAATTACTAACCATCAAACAAAT
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AACAGCAGTGACCTTGGGGAGTGGGCTGGGCAGAACACAGGCTCTCCAGTTAGTTGACAG
ATGGGAAACTGGCAGTGCAGGTGGTCTACTCAGGGTCACAGAGTGAGTGAGGGGCAAAGT
CAGGCCTAGAATCCCTGTCTTTCCATTCTCAGTCTCCGATTCTTCGATCCAGGAAGTACT
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TGTGAATAGACTTATTAGCCCATGCAAATTCTGCCCTTAATCAAGCCCTTTACTAATCTG
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GGAGCTTCTGAATGCTCAAAGCTTTTATAATTTAGATTAAAATTACAAGAGAAAGAAAGA
TCCTTCTGCTTGTAGGAATGGGCATAGTACTTATGGCAATGAGTAGTTTGGGAATGGAGA
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TACACCTCAGTCTTTCCCTGTGTGTCTCTGGCACCTCTTGAGTTGTAGTCCCTCCTGCAG
AGCCCAGGTACTATGAATTCCTTCATTATCGTTCTCTTACCCAAAATGGTGGCTATGATT
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CTGACTTCTTTATTATGAATCTGATTCCTTGGGTGGAGGAGTCATCGGTGCCGTCTCCTT
CAGTACTCTGACAGAAATCCTTGCAATGTGGTTTGGAATTTCAGTACCACTGACCGTTTT
TGTCGCATACTTTGGAAGCAAGAAATTTAGGTGTCCAGTTCATGCAAACCAGATTTCCTG
TCAGATTTCTCAACAGGCTTTATAAAACCACTTCTTGGCATCATAACTAGGAGCATTTTA
TCTTTTGGTTATATACTTATTTAACTCCTGTTTATTCTAAACAGTATATATTCTTATCAG
ATGTACTTCATGTTTGGCTTCTTTTTCTTAGTCTTCATGATTCTCCTTATTACCTGTTCA
GAAGCTACAGTTGCACTGTGTTATATTCATTTATGTGCTGAGGACTATCATTGGTGGTGG
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TTCTTTTCCAAACTTCAAATCACGGGCATTGCAAGCACCATTTTGTGCTTCGGGTACATG
GTGATCATGGTCTTGATTTTCTTTCTTTTTACAGGCACAGTTGGGTTTCTTTTTTTTTCC
TGCTTCTGGTTTGTGACTAAAATCTAGTATGTTGAAAGTGGATTAAAGAGTGTCTCCCCA
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GTAAACACTTGCAGAATTCCTTCTTTAGGAAACCTCAGTTTAAGGCTTTAAGGCCTTCAA
TTGATTGGATAAGACCCACCCACACTATTGAGGATGATCTCCTTTATTTAAAGTCATCAA
TTGCAGATGTTAATCACATCTACAAAATACCTTCACAGCAACTTCTAGACTGGTGTTTGA
CCAAACAACTGGGCACCATAGCTCAGCCAAGTTCACAACTAAAATTTAACCATCGCACTA
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ATCATTAATTTTACTTGAAAGATTTAATCCCCAATGATGATAATCAGTACAGATGAAATA
TTCAATAGATTTGTTAAACGATAGTAGTCTTTTTTTATGTATAATTGACATACATTATTT
AACATTAGTGTTGTATTTGTATAATGTATCATGGTTCAATATTATACATATTGCAAAATG
ACCACAATAATTCTAGTTAACATAGTCACCATACACAGTTACAGTTGGCCTAGCACCATT
TATTGAAGATTGTTCTTTACCCATTGAATTGTCTTGGTACCCTTGTCGAAAAGTAGTTTA
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CGTAGGCTACTGCCAGTGTTTATTACTGTACTTTGCAATAAGTTTTGAAATGAGGAAGTG
TGAATCTTTAGATTTTGATTTGGCTGCTCCGGATCCCTTACATTTCCATAAAAATTTTAT
GATCACATTGTTATTTTCTGCCAAAACATACATAAAAAGGCAGCTGCAATTTTGATAGAT
AGCATTCAATCTGGGGAATTTTGCCATCTGATCAAAATTGTTTTTCATTTCAAGTACATG
GCATGTCTTTCTGTTTATTTAGGTCTCTTTTAATTTTAGTTTTAAAATGTGTTTTAATGA
ACCAGTGTGTTTGTGTGTATGCATTTCAGCACACGCATTTTGTGAGATCCATCCAAGTTG
TGTGTAGCCAAGGTTCCTTTTTCAATGCTATGTAATATTAAGAATGATGATTTTTCCAGA
CCCCAAATTGAAATAAGAATCACACCAGAAAATCCAGGGCATGTGATGGCTAGATATAGG
TGTAGCTTTTAATAGAAGTGGAACAGCCACCATTATTTGAGTACTATTATTTTCCACCAC
CTACATACATTATTCTGTTTTCATCCTCACAGGAAACCTGTGAGGCAGTTATAATCAGCC
TGTGAATGCAGAACTGACACAGGGCACCTGCCCTAGGAAACAGAAAATCTGAAGAGCGAG
GCGCTGAACCGAAGTCTCTTGTGGCTTCTGAGTACTTCTTTCCTTGATGCTTCCTAATTG
CATCTTTCCTTGATGCTTTCTCTTCCAGACCCCATGCCACAGCTGGATGTGACTGAGGCC
AACAAGGAGTTCATGGAACAGAGTGAGGAACTATATGATGCACTGATGGACTGTCACTGG
CAGCCCCTGGACACAGTGTCTTCAGAGATACCTGCCATGATG
Chart Advanced