SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003540_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesMiniopterus natalensis (Natal long-fingered bat)
Transcript IDSPT00003540
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003418_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003540_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Natal long-fingered bat (Miniopterus natalensis) # Full length # Forward
ATGTCTGTTGGTTTTGCTCATGGTAAGTTATCTATTAATGTTTCACTCTTCCAGTGAGAA
AGTAGAATTAATCTGTTGAGGCAGGAGGCTTCTTTTTTAGGTATATCAAAATATTCCTGC
CATTGAGCTTCTTAACATTTATAGCATACAAATTTTTTTTAGCAACAATTTAAAATGGTT
TTGAATTGAACAGCGTACACAAAATAGAATAAGGATGACCTTGTGAATCTATATTTAGAC
CTCCTTAAAGGTATTTTCAAAATCTTAATTATTAAAGTANTTATTAAAGTCTTACATGCT
TGTGGTAAAGAATTTAAAATATACACAAGTCATTTTGAGTTCCATTTTCTGGGATAATCA
TTATTAACCATTTCCTATCAAGTTTTCTAGACTTTATTTTGATGACATTCACATGTCTCC
TATAAAAACACCTGGTTGCATTGGCAGGAATATCTGCCTGAACTAGGAATAGCTGAAAAG
CAAGGTCTCTAGATAAATACCAAAGGAGGATTCCACATTGCAAAACTTTTTGAAATTGGC
TTTAATTATCACACACTCTCTGTATCTCACTTGGCGTTGGGTGGAGAACAGCGTAGGTGT
TTCAGAGCTTTTGCTGTTATGAACTGTGCTGCAGTGATCACCACACAACTATCCCTTTGT
ATTCTTGAAGATGAGTTTTTGAGGATAAACTCCTACAAGTGGAATGGCTGGATTAGAGAG
TCTGTACATTTAACATTTGGATAAAAAGGGCCATCTTTCTCTGAAAAAGGTCAAAAATCT
CTCTGTTGAACACTGTGCCACCATGCCCAAAATCCTATATGAGGCTGGTGTGCCCATGGC
TTCCTCCTACCCTACACTCTGCCCCCATCCATGAACCCCACACCTAAGAGGTCACTCTCC
TCCTACCCCCACACTGCTAGTGGTCTGCAACTCAGGACTGTTATGGGGATACATATCCAT
ATTTTCCCCCTTTCCCCTTTTCACAGCCTTTGAAAATTAATTTTATTCCTTTACTAGTCT
CAGTTCCATTCCAAATAATTTATTGTTTAAATAACTGCTAGAAATTGAGAATAAATAAGA
GGAAGTTTTATTTCTTGGGGCTTTTGTTCCTAAAGTACTTGAAATCTTTGGGAACTGGGG
AATATAAAACAAAAGGCTAAATTGATTTTTAAAGTACAGTTTTAGTATATATTAAGCTAT
TTGTCTTCATCAGTTAGACTTTCAATTGATAATAAAATTTTGCTTCATTTCTAATACAAA
TGCATTTCCCTGATCTTTTCTATTCTGGATAATTTTATACAGTTAAAAAATGCTTTGTTG
CCCTGGCTGGTTTTGCTCAGTGGTTAGAGTGTCAGCCTGCATACCAAAGGGTTGTGGGTC
TGATTGCCAGTCAAGGACATGCACTTGGGTTGAGAGTTCACTCCCCAGGCCTGGTTGGGG
CACATGGGGAAGGCAACCAGTTGATGTGTCTCTCTCACATCAATGTTTCTCTCTCTCCCT
CTCCTTCCCCCTTCCCCTCCTTCTCTCCCTCTCCCTCCCCCTTCCCCTCCTCCTCTCCCT
CTCTCTCTCCCTCCCCCTCCTCCTTCCCCTCTTCCACTTTCTCTGAAAAGTAATGGAAAA
AATATCCTTGGGTGAGGATTAACAACAACAACAAAATGCTTTATTTTATTATCATGTTTT
TGGAATTTTTTATTGTTGTTTTAGGTGTTTGTAATACTGATAACTTCAGTTTGTTATCCA
TTACAATTGACTATGGTCCATTTGGTTTTATGGAGGCCTATAACCCAGGTATGTATGATT
TATATGTATATATAAATATGCCTTATTTCACAAGTTTATTATAAACTGTTATACCTAATA
CAGTGATTGGGTAGTAAAAGAATTGGGGTCATTTATAGAATGGTAATTTTGTGTGTTACA
CAATCTTCTAGGTGCCATAGATAGGGATACAAAAATGAGCTCTTTGTAACCTTTACCCTC
AAGGAATTAGATATTAGTGAAGATAACATGAAGCACAGTAGGGAATATGTTATCAGACAG
ATGTGAGTTTGATTTCTGGCGTCTGACCCTTAATGGCTGTGTGCCCTTGGACAAGTTACT
TGACCTCTTACTTAGTAACCTATAAAATGGAGGTGACAATAATATAATACTTGACCCTGG
AAAGATCAGAGTGGGCTTTGTGGATGACATGCTACTTGAGTTTGAGTTTGAAGTATGTAT
GTGGTGACCTGGAAATTCTTGTAGGTTAGACATGTATTCTTCTATTAGGCAAATATTCAT
ATTATAAAGTATTTTCATGTGTATGGACATTAAATATTTATATTACTTTTTAGTTAAATG
TTTAATGTCAGAAAGAGTTTTATCTAATAAATGTAAATTTATTAAGTTTAAGTATAAACT
TAAAAATGAGGAAAATAGCTCACTGTATAAGGATAGTATTTTTGTTTTAAACAGATTTTG
TACCAAACACATCTGATGATGAAAGAAGATATAAAATAGGAAACCAGGCCAATATTGGGA
TGTTTAACTTAAATAAATTGTTACAAGCTCTAAACCCATTACTGGATCCAGGGCAAAAGC
AGCTGTGAGTAAATCCTAATTAAATCTATATAAAAATATAGTTGTATAATGATCATTTTT
TGAAATGCAAGAAAGTAACATCTTAAAAACCAGCTTATTTAGTCTTTAATAATGACAGTA
TTCCAACTCTGTATTTTTCTCTAGTACAGTTTTTGCTTTTTTCCATAGTTTTCGGGATAA
GTTGTTTTCCTGTTTATTGCTTTTTAGATGTTGCAAAATTTTAATTTCTTCTTTGATCTA
AGGGTTATTTATCACTATTTCTTAATTTCTAAGTAGTTGAACTTATGTCCATATTTTTGT
GATCAAAGAATGTGTTTAGTAAAATCTATTCAAAATGTGTTGAGGGTTTATATAGCCCTG
CTTTACCTCAAGAGTGAGGGCTGAAGCCTTGCTCTTACCCTGTAGGTCTGCCTGTGTCTT
CCAGGACCCAGCAGCTACTAGGCCAGGGTTATGTTAAAATATTTGTTGATGTACCATTGG
ACATTGAATTTCTTGAGGGCAGGGCCACGTTTTATTCATTTCTGTGTCTTTAATTTACTT
GCTAGAAGATAAAACATATTTTGTTTTCCACTTTCCTCCCCCTACCCCCAATCTAAAATT
TACTGTTCCAGTACAAGATTCCAAATGGAAGACAAGGCATATAGTGATTTTATTAATCTT
AGGTAGCAAAAAATTACTACAATAAAGATAAAAAAGTTTTATGACCCATGTATGGCTTTC
TTAATTAATTTAAAACTATATTGGTAATACAGTCACATAGTTCAAAATCAAAATGATATA
AAATGATATTCATTCAGCAGCTTCATCCCATTGATGGAGACAAGCAGGTTGTCTCCATTG
ATTTTACATCTCATTTGCCCTGCAGAGTTCATTCATTCATTCAACAAATATTTGTTGAGC
TCTTCAGTATGTGCTAGACACTGTTCTAAGTGCTACGATGATAGCAGTGAATAAAACAGC
ACAATAAACACCCTCATAGTGCTTACTTCTGGTGGGAGAGACAGTCAATAAACAGAATAA
ATAAGTTATGTAACATATTATAAGGAGATAAGTACTATGGAGGAAAATAAAGCAGTGGGT
AGGGAATATAGGGAGGGGGAGGCAGGGTTTACAGTTTTAAAAGGATGGTCAGCAGAAATC
CTGAGCAAAGACTTGAAGGAGTCACAGGGACAAACCCTTCAGAGATACCTGGGGGGAAGC
ACTACGGGCAAAGGAATAGCCTGTGCGAGGGCCCTGAGGTGGGAGTGTGCGGGGTGTTTA
AGGAACAGCAAGGTGGTTGCCGCAGAATGAGCAAGGGGAAGAGTCGTAGGTGAGGTCAGG
AAGGTAAAGGGAGCCTAGCTTCAGAATGTGTTGAGTTTTATGTAATTGAAAATATCTTTA
AGAATGTTAAGAAATAGAAACTATTTGTTTAAAGATGGGTTTAAGGTTAAAAACTCTAAT
TTTTATATTTTTATGAAATATTTCACTATATATGTTCATACATTCAGACACGTAAAATAT
TGTGTTGGGTGAGTTACTTGTAATGCATTATTTTTGGTCTAAGATTTTAAAAATACACCA
AAAAACCCATTTATATCAATATTTATCCTGTAAGCTAATTGTATATAGTGTTTCAGAAGT
GACATGGTTTGATTTGTACTGTATTCAGATCTTTGAGAGAGTAAATTAGTATTGATAATT
TTCTCTAAGATATGATATACAATAAATCACCAAACCAGAATCAGTAGCACATAATCTAAT
GTTATTTAATACATGAGAAAGTTCATTTTGTTCTTGTAATTCAAGAATGCTAATTTTAAA
TCAACTTTTAACTGTTCTTTTTTCCTTCCTATAGCGCGGCTCAGATTCTTGAGGGGTATC
CTGTCCTTTATTACNTTCTTGAGGGGTATCCTATCCTTTATTACACAAGGTTTGTCCTTT
TTGAATATAGATGTTAAAGCATCCTGGTTGGTTTGAGGACAGTTCTTAAAATAGTGAGAA
ATTTAATAACATTAAATTGACATTTCTTCTTTTAGATTTGGAGAATTATTCAAAGCCAAA
TTGGGATTACTTGGAGAAAGGGAGGGTGATAATGATTTAATTGCATTTCTCTTACACGTG
AGTTTATAATTTAATCTTATTTCTGATTAACATTTGAATTACTAATTAGCATCTTTTCAG
TGAACTGAGATTGATAAATATACTTATTTTCATTAGCTCATGGAAAAGACAGAAGCTGAT
TTTACCATGACATTTCGGCAGCTCAGTGAGATTACTCAAAGCCAGTTACAGGAGCTCAAT
ATTCCTCAGGTATTAATT
Chart Advanced